Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PMTLGYWNIRGLAHSIRLLLEYTDSSYEEKKYTMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGTHKITQSNAILRYIA
RKHNLCGESEKEQIREDILENQFMDSRMQLAKLCYDPDFEKLKPEYLQALPEMLKLYSQFLGKQPWFLGDKITFVDFIAY
DVLERNQVFEPSCLDAFPNLKDFISRFEGLEKISAYMKSSRFLPRPVFSKMAVWGNK

The query sequence (length=217) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2ab6:A 217 217 0.9954 0.9954 0.9954 1.16e-163 2ab6:B, 2ab6:C, 2ab6:D, 2c4j:A, 2c4j:B, 2c4j:C, 2c4j:D, 3gur:A, 3gur:B, 3gur:C, 3gur:D, 1hna:A, 1hnb:A, 1hnb:B, 1hnc:A, 1hnc:B, 1hnc:C, 1hnc:D, 5hwl:A, 5hwl:B, 1xw5:A, 1xw5:B, 1ykc:A, 1ykc:B
2 2f3m:A 218 217 0.8479 0.8440 0.8479 9.40e-141 2f3m:B, 2f3m:C, 2f3m:D, 2f3m:E, 2f3m:F, 1xw6:A, 1xw6:B, 1xw6:C, 1xw6:D, 1xwk:A, 1xwk:B, 1xwk:C, 1yj6:A, 1yj6:B, 1yj6:C
3 5fwg:A 217 217 0.7650 0.7650 0.7650 8.07e-132 5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
4 1b4p:A 217 217 0.7604 0.7604 0.7604 9.61e-131
5 7opy:F 217 217 0.7512 0.7512 0.7512 4.31e-127 7opy:A, 7opy:B, 7opy:C, 7opz:C, 7opz:A, 7opz:B, 7opz:D
6 1c72:A 217 216 0.6406 0.6406 0.6435 6.09e-104 1c72:B, 1c72:C, 1c72:D, 1gsu:A, 1gsu:B
7 5an1:A 219 210 0.4931 0.4886 0.5095 1.70e-74 5an1:B, 5an1:C, 5an1:D, 5an1:E, 5an1:F, 5an1:G, 5an1:H, 7so8:A, 7so8:C, 7so8:E, 7so8:G, 7so8:H, 7so8:F, 7so8:B, 7so8:D
8 2fhe:A 216 216 0.4608 0.4630 0.4630 4.26e-66 2fhe:B
9 4q5q:A 218 211 0.4516 0.4495 0.4645 4.49e-66 4q5q:B
10 3iso:A 218 214 0.4378 0.4358 0.4439 1.51e-59 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
11 1fhe:A 214 215 0.4562 0.4626 0.4605 3.99e-56
12 4ai6:A 2650 212 0.4332 0.0355 0.4434 1.83e-46 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
13 4q5n:A 220 225 0.3641 0.3591 0.3511 1.36e-38 4q5n:B
14 2gsr:A 207 211 0.3456 0.3623 0.3555 1.80e-34 2gsr:B
15 8c5d:A 209 211 0.3134 0.3254 0.3223 1.37e-31 8c5d:B, 1glp:A, 1glp:B, 1glq:A, 1glq:B, 2glr:A, 2glr:B, 1gsy:A, 1gsy:B, 1gti:A, 1gti:B, 1gti:C, 1gti:D, 1gti:E, 1gti:F, 3o76:A, 3o76:B, 2oa7:A, 2oa7:B, 2oac:A, 2oac:B, 2oad:A, 2oad:B
16 6llx:B 215 211 0.2995 0.3023 0.3081 2.59e-29 10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
17 5d73:A 207 209 0.3226 0.3382 0.3349 6.12e-28 5d73:B
18 1tu7:A 208 209 0.3180 0.3317 0.3301 5.31e-25 1tu7:B, 1tu8:A, 1tu8:B, 1tu8:C, 1tu8:D
19 6n69:B 199 200 0.2673 0.2915 0.2900 1.08e-16 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
20 4ofm:B 206 208 0.2673 0.2816 0.2788 2.91e-16 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
21 5b7c:A 206 206 0.2442 0.2573 0.2573 5.29e-16
22 4ec0:B 200 198 0.2442 0.2650 0.2677 1.51e-15 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
23 2vcz:C 177 196 0.2350 0.2881 0.2602 5.50e-15
24 2aaw:C 211 210 0.2535 0.2607 0.2619 1.22e-13 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
25 1f3b:A 222 209 0.2903 0.2838 0.3014 1.24e-13 1ev4:A, 1ev4:C, 1ev4:D, 1ev9:A, 1ev9:C, 1ev9:D, 1f3a:A, 1f3a:B, 1f3b:B, 5lcz:A, 5lcz:B, 1ml6:A, 1ml6:B
26 1m0u:A 203 218 0.2627 0.2808 0.2615 1.77e-13
27 4q5r:A 202 201 0.2488 0.2673 0.2687 1.36e-12 4q5r:C, 4q5r:D, 4q5r:B, 4q5r:F, 4q5r:E
28 1zl9:A 207 211 0.2488 0.2609 0.2559 4.23e-12 1zl9:B
29 4q5f:D 206 204 0.2535 0.2670 0.2696 1.25e-11 4q5f:A
30 6zj9:A 220 209 0.2857 0.2818 0.2967 1.48e-11 6zjc:B, 6zjc:A, 6zjc:D, 6zjc:C
31 3w8s:A 205 188 0.2396 0.2537 0.2766 1.52e-11
32 2on5:A 206 207 0.2442 0.2573 0.2560 1.57e-11 2on5:B, 2on5:C, 2on5:D, 2on5:E, 2on5:F, 2on5:G, 2on5:H
33 5h5l:B 199 210 0.2488 0.2714 0.2571 4.47e-11 5h5l:A
34 6ato:A 221 206 0.2765 0.2715 0.2913 7.96e-11 4acs:A, 4acs:B, 4acs:C, 4acs:D, 6ato:B, 6atr:A, 6atr:B, 7bib:A, 7bib:B, 1gse:A, 1gse:B, 1gsf:A, 1gsf:B, 1gsf:C, 1gsf:D, 1guh:A, 1guh:B, 1guh:C, 1guh:D, 4hj2:A, 4hj2:B, 3i69:A, 3i69:B, 3i69:C, 3i69:D, 3i6a:A, 3i6a:B, 3i6a:C, 3i6a:D, 3i6a:E, 3i6a:F, 3i6a:G, 3i6a:H, 3ik9:A, 3ik9:B, 3ik9:C, 3ik9:D, 3ik9:E, 3ik9:F, 3ik9:G, 3ik9:H, 5jcu:A, 5jcu:B, 5jcu:C, 5jcu:D, 1k3l:A, 1k3l:B, 1k3y:A, 1k3y:B, 3ktl:A, 3ktl:B, 3l0h:A, 3l0h:B, 1pkw:A, 1pkw:B, 1pl1:A, 1pl1:B, 1pl2:A, 1pl2:B, 2r3x:A, 2r3x:B, 2r6k:A, 2r6k:B, 1tdi:A, 1tdi:B, 1usb:A, 1usb:B, 2vct:A, 2vct:B, 2vct:C, 2vct:D, 2vcv:A, 2vcv:B, 2vcv:C, 2vcv:D, 2vcv:E, 2vcv:F, 2vcv:G, 2vcv:H, 2vcv:I, 2vcv:J, 2vcv:K, 2vcv:L, 2vcv:M, 2vcv:N, 2vcv:O, 2vcv:P, 2wju:A, 2wju:B, 2wju:C, 2wju:D, 2wju:E, 2wju:F, 2wju:G, 2wju:H, 6yaw:A, 6yaw:B, 1ydk:A, 1ydk:B
35 1b48:A 221 206 0.2442 0.2398 0.2573 3.34e-10 1b48:B
36 3vpq:A 203 209 0.2673 0.2857 0.2775 1.16e-08 3vur:A
37 2c80:A 208 170 0.2304 0.2404 0.2941 1.18e-08 2c80:B, 2ca8:A, 2caq:A, 2f8f:A, 2f8f:B, 1oe7:A, 1oe7:B, 1oe8:A, 1oe8:B
38 1u3i:A 208 167 0.2074 0.2163 0.2695 1.18e-07
39 3ik7:A 221 209 0.2396 0.2353 0.2488 1.13e-06 1gul:A, 1gul:B, 1gul:C, 1gul:D, 1gul:E, 1gul:F, 1gul:G, 1gul:H, 3ik7:B, 3ik7:C, 3ik7:D
40 1vf1:A 226 208 0.2442 0.2345 0.2548 4.68e-06 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
41 2wb9:A 210 220 0.2719 0.2810 0.2682 1.28e-05 2wb9:B, 2wdu:A, 2wdu:B
42 6ezy:B 212 117 0.1382 0.1415 0.2564 2.42e-05 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
43 4hi7:A 220 145 0.1567 0.1545 0.2345 5.35e-05 4hi7:B
44 6to3:AAA 190 152 0.1797 0.2053 0.2566 9.50e-05
45 8ai8:A 183 147 0.1751 0.2077 0.2585 1.70e-04 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
46 2hnl:A 202 214 0.2258 0.2426 0.2290 2.66e-04 2hnl:B
47 1bye:A 213 168 0.2028 0.2066 0.2619 6.83e-04 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
48 9f7k:A 222 151 0.1659 0.1622 0.2384 0.002 9f7k:B
49 8agq:A 213 135 0.1705 0.1737 0.2741 0.003 5f07:A
50 6zb6:C 227 166 0.1705 0.1630 0.2229 0.017 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
51 4png:B 223 146 0.1382 0.1345 0.2055 0.042 4png:A
52 4ri6:A 214 117 0.1382 0.1402 0.2564 0.057 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
53 5a4u:A 211 67 0.0922 0.0948 0.2985 0.38 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
54 8ix7:B 221 122 0.1244 0.1222 0.2213 0.80 8ix7:A
55 2c3q:A 239 47 0.0737 0.0669 0.3404 0.86 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
56 4zb6:D 220 93 0.1290 0.1273 0.3011 1.3 4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
57 4mpg:B 252 147 0.1613 0.1389 0.2381 1.4 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
58 3vwx:C 220 160 0.1705 0.1682 0.2313 1.4 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
59 4xeb:A 430 61 0.0829 0.0419 0.2951 2.2
60 5f05:C 211 170 0.1751 0.1801 0.2235 2.3 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
61 4i97:A 207 106 0.1152 0.1208 0.2358 2.7 4i97:B
62 6iil:A 341 42 0.0599 0.0381 0.3095 2.9 6iik:A, 6iik:B, 6iil:B, 6iim:A, 6iim:B, 6iin:A, 6iin:B
63 1h46:X 431 61 0.0783 0.0394 0.2787 4.8 1z3t:A, 1z3v:A, 1z3w:A
64 4iw9:B 215 22 0.0461 0.0465 0.4545 4.9 4iw9:A, 4iw9:C
65 8y6o:U 458 129 0.1567 0.0742 0.2636 5.2 8h6e:4T, 8h6j:4T, 6qw6:U, 6qx9:U
66 1w6s:C 596 53 0.0691 0.0252 0.2830 5.9 1h4i:A, 1h4i:C, 1h4j:A, 1h4j:C, 1h4j:E, 1h4j:G, 1w6s:A
67 4hqs:A 135 26 0.0461 0.0741 0.3846 6.1
68 4zba:A 222 118 0.1336 0.1306 0.2458 6.1 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
69 4yan:A 252 120 0.1244 0.1071 0.2250 6.6 4yan:B, 4yan:C, 4yan:D
70 4nhw:D 217 174 0.1797 0.1797 0.2241 6.7 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
71 5ech:B 214 165 0.1613 0.1636 0.2121 6.8 5ech:C, 5ech:E, 5ech:F, 5eci:B, 5eci:C, 5eci:E, 5eci:F, 5eck:B, 5eck:C, 5eck:E, 5eck:F, 5ecl:B, 5ecl:C, 5ecl:E, 5ecl:F, 5ecm:B, 5ecm:C, 5ecm:E, 5ecm:F, 5ecn:B, 5ecn:C, 5ecn:E, 5ecn:F, 5eco:B, 5eco:C, 5eco:E, 5eco:F, 5ecp:B, 5ecp:C, 5ecp:E, 5ecp:F, 5ecq:B, 5ecq:C, 5ecq:E, 5ecq:F, 5ecr:B, 5ecr:C, 5ecr:E, 5ecr:F, 5ecs:A, 5ecs:B
72 3p5r:A 750 80 0.0922 0.0267 0.2500 6.8 3p5p:A, 3p5r:B
73 5hvo:A 459 110 0.1290 0.0610 0.2545 8.2 5hvo:B, 5hvo:C, 5hvo:D
74 3anl:A 400 31 0.0599 0.0325 0.4194 8.4 3anl:B, 3anm:A, 3anm:B, 3ann:A, 3ann:B, 2egh:A, 2egh:B, 1jvs:A, 1jvs:B, 1ono:A, 1ono:B, 1onp:A, 1onp:B, 1q0h:A, 1q0l:A, 1q0q:A, 1q0q:B, 3r0i:A, 3r0i:B, 1t1r:A, 1t1r:B, 1t1s:A, 1t1s:B
75 4kgi:C 206 93 0.1106 0.1165 0.2581 9.4 1a0f:A, 1a0f:B, 4kgi:A, 4kgi:B, 4kgi:D, 1n2a:A, 1n2a:B
76 6nv6:B 207 29 0.0599 0.0628 0.4483 9.9

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218