Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PMPPSEFLDKLMGKVSGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYSEYPDDSLDLD
PSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRISKNGNVLYSIRITLVLACPMDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDL
IFEWDEKGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINM
DAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFIARQHKELLMRKLFISRAKR
IDTVSRVAFPLVFLIFNIFYWITYKIIRSEDI

The query sequence (length=352) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6vm0:A 362 359 1.0000 0.9724 0.9805 0.0 5bkf:A, 5bkf:B, 5bkf:C, 5bkf:D, 5bkg:A, 5bkg:B, 5bkg:C, 5cfb:A, 5cfb:B, 5cfb:C, 5cfb:E, 8dn2:A, 8dn2:C, 8dn2:D, 8dn5:D, 8dn5:B, 8dn5:C, 8dn5:A, 8fe1:A, 8fe1:B, 8fe1:D, 8fe1:C, 3jad:A, 3jad:E, 3jad:B, 3jad:C, 3jad:D, 3jaf:A, 3jaf:B, 3jaf:C, 3jaf:D, 3jaf:E, 7m6n:A, 7m6n:B, 7m6n:D, 7m6n:E, 7m6n:C, 7m6o:A, 7m6o:E, 7m6o:B, 7m6o:C, 7m6o:D, 7m6p:A, 7m6p:E, 7m6p:B, 7m6p:C, 7m6p:D, 7m6q:A, 7m6q:B, 7m6q:E, 7m6q:C, 7m6q:D, 7m6r:A, 7m6r:E, 7m6r:B, 7m6r:C, 7m6r:D, 7m6s:A, 7m6s:B, 7m6s:C, 7m6s:D, 7m6s:E, 7mly:A, 7mly:B, 7mly:C, 7mly:D, 6plo:A, 6plo:B, 6plo:C, 6plo:D, 6plo:E, 6plp:A, 6plp:B, 6plp:C, 6plp:D, 6plp:E, 6plq:A, 6plq:B, 6plq:C, 6plq:D, 6plq:E, 6plu:A, 6plu:B, 6plu:E, 6plu:C, 6plu:D, 6plv:A, 6plv:B, 6plv:C, 6plv:D, 6plv:E, 6plw:A, 6plw:B, 6plw:C, 6plw:D, 6plw:E, 6plx:A, 6plx:E, 6plx:B, 6plx:C, 6plx:D, 6ply:A, 6ply:B, 6ply:E, 6ply:C, 6ply:D, 6plz:A, 6plz:B, 6plz:C, 6plz:D, 6plz:E, 6pm4:A, 6pm4:E, 6pm4:B, 6pm4:C, 6pm4:D, 6pm5:A, 6pm5:B, 6pm5:C, 6pm5:D, 6pm5:E, 6pm6:A, 6pm6:B, 6pm6:D, 6pm6:E, 6pm6:C, 5tin:A, 5tin:C, 5tin:E, 5tio:C, 5tio:A, 5tio:B, 5tio:E, 7tu9:A, 7tu9:D, 7tu9:C, 7tu9:B, 7tvi:A, 7tvi:D, 7tvi:C, 7tvi:B, 7u2m:A, 7u2m:B, 7u2m:C, 7u2m:D, 7u2m:E, 7u2n:A, 7u2n:B, 7u2n:D, 7u2n:E, 7u2n:C, 7u2o:A, 7u2o:B, 7u2o:C, 7u2o:D, 7u2o:E, 6ubt:A, 6ubt:E, 6ubt:B, 6ubt:C, 6ubt:D, 6ud3:A, 6ud3:E, 6ud3:C, 6ud3:B, 6ud3:D, 5vdh:A, 5vdh:B, 5vdh:C, 5vdh:E, 5vdi:A, 5vdi:C, 5vdi:D, 5vdi:E, 6vm0:E, 6vm0:B, 6vm0:D, 6vm0:C, 6vm2:A, 6vm2:E, 6vm2:B, 6vm2:D, 6vm2:C, 6vm3:A, 6vm3:E, 6vm3:B, 6vm3:C, 6vm3:D
2 5tin:B 343 347 0.8750 0.8980 0.8876 0.0 5cfb:D, 7kuy:A, 7kuy:B, 7kuy:C, 7kuy:D, 7l31:A, 7l31:B, 7l31:C, 7l31:D, 5tin:D, 5tio:D, 5vdh:D, 5vdi:B
3 8fe1:E 346 344 0.5426 0.5520 0.5552 8.90e-129 5bkg:E, 8dn5:E, 7l31:E, 7mly:E, 7tu9:E
4 7kuy:E 338 345 0.5312 0.5533 0.5420 1.83e-125 5bkf:E
5 8dd2:A 334 342 0.4432 0.4671 0.4561 9.43e-101 6a96:B, 4cof:B, 4cof:C, 4cof:D, 4cof:E, 6d6t:A, 6d6t:C, 6d6u:A, 6d6u:C, 8dd2:C, 8dd3:A, 8dd3:C, 6dw1:B, 6dw1:E, 7pbd:E, 7pbz:B, 7pbz:C, 7pbz:E, 7pc0:C, 8pvb:A, 6qfa:B, 6qfa:A, 6qfa:C, 6qfa:D, 6qfa:E, 8sgo:A, 8sgo:C, 8si9:A, 8si9:C, 8sid:A, 8sid:C, 7t0z:C, 8vqy:A, 8vqy:C, 8vrn:A, 8vrn:C, 6x3s:A, 6x3s:C, 6x3t:A, 6x3t:C, 6x3u:A, 6x3u:C, 6x3v:A, 6x3v:C, 6x3w:A, 6x3w:C, 6x3x:A, 6x3x:C, 6x3z:A, 6x3z:C, 6x40:A, 6x40:C
6 9eqg:E 345 344 0.4432 0.4522 0.4535 2.32e-100 7a5v:A, 4cof:A, 9eqg:B, 8foi:B, 8foi:E, 8g4n:E, 8g4n:B, 8g4x:B, 8g4x:E, 8g5f:E, 8g5f:B, 8g5g:E, 8g5g:B, 8g5h:B, 8g5h:E, 6hug:E, 6huj:E, 6huj:B, 6huk:B, 6huk:E, 6huo:B, 6huo:E, 6hup:B, 6hup:E, 7pbd:B, 7qn7:B, 7qn7:C, 7qn7:D, 7qn8:A, 7qn8:B, 7qn8:C, 7qn8:D, 7qn9:B, 7qn9:C, 7qn9:D, 7qna:B, 7qnb:B, 7qnc:B, 7qnc:C, 7qnc:D, 7qnd:A, 7qnd:B, 7qnd:C, 7qnd:D
7 6dw0:E 319 340 0.4261 0.4702 0.4412 3.11e-97 6dw0:B
8 3rhw:A 340 330 0.4205 0.4353 0.4485 8.12e-97 3rhw:E, 3rhw:B, 3rhw:C, 3rhw:D, 3ri5:A, 3ri5:E, 3ri5:B, 3ri5:C, 3ri5:D, 3ria:A, 3ria:B, 3ria:C, 3ria:D, 3ria:E, 3rif:A, 3rif:B, 3rif:E, 3rif:C, 3rif:D
9 7qn7:A 335 343 0.4091 0.4299 0.4198 3.80e-93 7qn9:A, 7qna:A, 7qnc:A
10 5o8f:B 332 342 0.4261 0.4518 0.4386 1.22e-91 5o8f:C, 5o8f:D, 5o8f:E, 5o8f:A
11 7t0z:E 334 332 0.3864 0.4072 0.4096 1.24e-91 6d6u:E, 8dd2:E, 8dd3:E, 6dw0:D, 9eqg:C, 8foi:D, 8g4n:D, 8g4o:D, 8g4x:D, 8g5g:D, 8g5h:D, 6hug:C, 6huj:C, 6huo:C, 6hup:C, 7qne:C, 8sgo:E, 8si9:E, 8sid:E, 7t0w:E, 8vqy:E, 8vrn:E, 6x3s:E, 6x3t:E, 6x3u:E, 6x3v:E, 6x3w:E, 6x3x:E, 6x3z:E, 6x40:E
12 8oq6:A 336 332 0.3778 0.3958 0.4006 1.51e-91 8op9:A, 8op9:B, 8op9:E, 8op9:C, 8op9:D, 8oq6:B, 8oq6:C, 8oq6:D, 8oq6:E, 8oq7:A, 8oq7:B, 8oq7:C, 8oq7:D, 8oq7:E, 8oq8:A, 8oq8:E, 8oqa:A, 8oqa:B, 8oqa:C, 8oqa:D, 8oqa:E, 8rh4:A, 8rh4:E, 8rh4:B, 8rh4:C, 8rh4:D, 8rh7:E, 8rh7:D, 8rh7:A, 8rh7:B, 8rh7:C, 8rh8:A, 8rh8:B, 8rh8:E, 8rh8:C, 8rh8:D, 8rh9:B, 8rhg:A, 8rhg:E, 8rhg:B, 8rhg:C, 8rhg:D
13 9eqg:D 353 351 0.4205 0.4193 0.4217 1.75e-86 6d6t:B, 6d6t:D, 6d6u:B, 6d6u:D, 8dd2:D, 8dd2:B, 8dd3:D, 8dd3:B, 6dw0:A, 6dw0:C, 6dw1:C, 6dw1:A, 9eqg:A, 8foi:A, 8foi:C, 8g4n:A, 8g4n:C, 8g4o:C, 8g4x:A, 8g5f:C, 8g5g:A, 8g5h:C, 6hug:A, 6hug:D, 6huj:A, 6huj:D, 6huk:A, 6huk:D, 6huo:A, 6huo:D, 6hup:A, 6hup:D, 6i53:A, 6i53:D, 7pbd:A, 7qne:A, 7qne:D, 8sgo:B, 8sgo:D, 8si9:B, 8si9:D, 8sid:B, 8sid:D, 7t0w:D, 7t0z:D, 7t0z:B, 8vqy:B, 8vqy:D, 8vrn:D, 8vrn:B, 6x3s:D, 6x3s:B, 6x3t:D, 6x3t:B, 6x3u:D, 6x3v:D, 6x3w:D, 6x3w:B, 6x3x:D, 6x3x:B, 6x3z:D, 6x3z:B, 6x40:D, 6x40:B
14 7qnd:E 324 338 0.4091 0.4444 0.4260 6.62e-86 7qnc:E
15 8bha:A 336 341 0.4062 0.4256 0.4194 1.01e-85 8bgi:A, 8bgi:E, 8bgi:B, 8bgi:C, 8bgi:D, 8bha:E, 8bha:B, 8bha:C, 8bha:D, 8bhb:A, 8bhb:E, 8bhb:B, 8bhb:C, 8bhb:D, 8bhg:A, 8bhg:E, 8bhg:C, 8bhg:D, 8bhi:A, 8bhi:E, 8bhi:B, 8bhi:C, 8bhi:D, 8bhk:A, 8bhk:B, 8bhk:C, 8bhk:D, 8bhk:E, 8bhm:A, 8bhm:E, 8bhm:B, 8bhm:C, 8bhm:D, 8bho:A, 8bho:E, 8bho:B, 8bho:C, 8bho:D, 8bhq:A, 8bhq:E, 8bhq:B, 8bhq:C, 8bhq:D, 8bhr:A, 8bhr:E, 8bhr:B, 8bhr:C, 8bhr:D, 8bhs:A, 8bhs:E, 8bhs:B, 8bhs:C, 8bhs:D
16 8g4x:C 343 343 0.4006 0.4111 0.4111 2.10e-85 8g5f:A, 8g5g:C, 8g5h:A
17 8bhg:B 334 344 0.3835 0.4042 0.3924 2.87e-80 6dw1:D
18 6d6t:E 302 256 0.2926 0.3411 0.4023 2.70e-61
19 6cdu:A 314 326 0.3324 0.3726 0.3589 9.88e-53 6cdu:B, 6cdu:E, 6cdu:C, 6cdu:D, 6cdu:F, 6cdu:J, 6cdu:G, 6cdu:H, 6cdu:I
20 5osa:A 313 337 0.3097 0.3482 0.3234 2.26e-45 5osa:C, 5osa:E, 5osb:A, 5osb:E, 5osb:B, 5osb:C, 5osb:D, 5osc:A, 5osc:B, 5osc:C, 5osc:D, 5osc:E
21 8d68:A 311 316 0.2358 0.2669 0.2627 1.61e-21 4a97:A, 4a97:E, 4a97:B, 4a97:C, 4a97:D, 4a97:F, 4a97:J, 4a97:G, 4a97:H, 4a97:I, 4a98:A, 4a98:E, 4a98:B, 4a98:C, 4a98:D, 4a98:F, 4a98:J, 4a98:G, 4a98:H, 4a98:I, 8d63:A, 8d63:B, 8d63:C, 8d63:D, 8d63:E, 8d64:A, 8d64:B, 8d64:C, 8d64:D, 8d64:E, 8d65:A, 8d65:B, 8d65:C, 8d65:D, 8d65:E, 8d66:A, 8d66:E, 8d66:B, 8d66:C, 8d66:D, 8d67:A, 8d67:B, 8d67:C, 8d67:D, 8d67:E, 8d68:B, 8d68:C, 8d68:D, 8d68:E, 8f32:E, 8f32:D, 8f32:C, 8f32:B, 8f32:A, 8f33:E, 8f33:D, 8f33:C, 8f33:B, 8f33:A, 8f34:E, 8f34:D, 8f34:C, 8f34:B, 8f34:A, 7l6q:A, 7l6q:E, 7l6q:B, 7l6q:C, 7l6q:D, 5lg3:A, 5lg3:B, 5lg3:C, 5lg3:D, 5lg3:E, 5lg3:F, 5lg3:G, 5lg3:H, 5lg3:I, 5lg3:J, 5lid:A, 5lid:C, 5lid:E, 5lid:F, 5lid:H, 3rqw:A, 3rqw:B, 3rqw:C, 3rqw:D, 3rqw:E, 3rqw:F, 3rqw:G, 3rqw:H, 3rqw:I, 3rqw:J, 6ssi:A, 6ssi:B, 6ssi:C, 6ssi:D, 6ssi:E, 6ssp:F, 6ssp:H, 5sxu:A, 5sxu:B, 5sxu:C, 5sxu:D, 5sxu:E, 5sxu:F, 5sxu:G, 5sxu:H, 5sxu:I, 5sxu:J, 5sxv:A, 5sxv:B, 5sxv:C, 5sxv:D, 5sxv:E, 5sxv:F, 5sxv:G, 5sxv:H, 5sxv:I, 5sxv:J, 4twd:A, 4twd:B, 4twd:C, 4twd:D, 4twd:E, 4twd:F, 4twd:G, 4twd:H, 4twd:I, 4twf:A, 4twf:C, 4twf:B, 4twf:D, 4twf:E, 4twf:F, 4twf:G, 4twf:H, 4twf:I, 4twf:J, 8twv:A, 8twv:E, 8twv:B, 8twv:D, 8twv:C, 8twz:A, 8twz:B, 8twz:C, 8twz:D, 8twz:E, 6v03:A, 8vuw:A, 8vuw:E, 8vuw:B, 8vuw:C, 8vuw:D, 2yoe:B, 2yoe:C, 4z90:F, 4z91:A, 4z91:B, 4z91:C, 4z91:E, 4z91:H, 3zkr:A, 3zkr:B, 3zkr:C, 3zkr:E, 3zkr:F, 3zkr:G, 3zkr:H, 3zkr:I
22 4ire:B 313 322 0.2102 0.2364 0.2298 8.12e-20 6emx:A, 6emx:B, 6emx:C, 6emx:D, 6emx:E, 4f8h:A, 4f8h:B, 4f8h:E, 4f8h:C, 4f8h:D, 4hfc:A, 4hfc:B, 4hfc:C, 4hfc:D, 4hfd:A, 4hfd:B, 4hfd:C, 4hfd:D, 4hfd:E, 4hfe:D, 4hfh:A, 4hfh:B, 4hfh:C, 4hfh:D, 4hfh:E, 4hfi:A, 4hfi:E, 6hj3:A, 6hj3:E, 6hj3:B, 6hj3:C, 6hj3:D, 6hja:A, 6hja:B, 6hja:C, 6hja:D, 6hja:E, 6hji:A, 6hji:C, 6hji:D, 6hji:E, 4il4:A, 4il4:D, 4il4:E, 4il9:A, 4il9:B, 4il9:C, 4il9:E, 4ilb:A, 4ilb:B, 4ilb:C, 4ilb:E, 4ilc:B, 4ilc:C, 4ilc:E, 4ire:A, 4ire:C, 4ire:D, 4ire:E, 5iux:A, 5iux:E, 5iux:C, 5iux:D, 5l47:C, 5l4h:C, 5l4h:D, 5l4h:E, 5mur:B, 5mur:E, 5mvm:A, 5mvm:E, 5mvm:B, 5mvm:C, 5mvm:D, 5mvn:B, 5mvn:C, 5mvn:D, 5mvn:E, 5mzq:A, 5mzq:B, 5mzq:C, 5mzq:D, 5mzq:E, 5mzr:A, 5mzr:C, 5mzr:D, 5mzr:E, 5mzt:A, 5mzt:E, 5mzt:B, 5mzt:C, 5mzt:D, 3p4w:A, 3p4w:B, 3p4w:C, 3p4w:D, 3p4w:E, 3p50:A, 3p50:B, 3p50:C, 3p50:D, 3p50:E, 4qh1:A, 4qh1:E, 4qh1:B, 4qh1:C, 4qh1:D
23 6fli:A 310 314 0.2045 0.2323 0.2293 6.40e-18 6fli:B, 6fli:C, 6fli:D, 6fli:E, 6fvs:D
24 7ql6:C 427 264 0.1790 0.1475 0.2386 2.37e-13 8esk:B, 8f2s:B, 8f6y:B, 8f6z:B, 7ql5:C, 7smq:B, 7sms:B
25 8zfk:D 412 293 0.1903 0.1626 0.2287 6.51e-13 8zfk:E, 8zfk:A, 8zfk:B, 8zfk:C
26 7ekp:A 396 263 0.1960 0.1742 0.2624 8.65e-13 8cau:A, 8cau:B, 8cau:C, 8cau:D, 8cau:E, 8ci1:A, 8ci1:B, 8ci1:C, 8ci1:D, 8ci1:E, 7eki:A, 7eki:B, 7eki:C, 7eki:D, 7eki:E, 7ekp:B, 7ekp:C, 7ekp:D, 7ekp:E, 7ekt:A, 7ekt:E, 7ekt:B, 7ekt:C, 7ekt:D, 7koo:A, 7koo:B, 7koo:C, 7koo:D, 7koo:E, 7koq:A, 7koq:B, 7koq:C, 7koq:D, 7koq:E, 7kox:A, 7kox:B, 7kox:C, 7kox:D, 7kox:E, 8ut1:A, 8ut1:B, 8ut1:C, 8ut1:D, 8ut1:E, 8utb:A, 8utb:B, 8utb:C, 8utb:D, 8utb:E, 8uzj:A, 8uzj:B, 8uzj:E, 8uzj:C, 8uzj:D, 8v80:A, 8v80:B, 8v80:C, 8v80:D, 8v80:E, 8v82:A, 8v82:B, 8v82:E, 8v82:C, 8v82:D, 8v86:A, 8v86:E, 8v86:B, 8v86:C, 8v86:D, 8v88:A, 8v88:B, 8v88:C, 8v88:D, 8v88:E, 8v89:A, 8v89:B, 8v89:C, 8v89:D, 8v89:E, 8v8a:A, 8v8a:B, 8v8a:E, 8v8a:C, 8v8a:D, 8v8c:C, 8v8c:D, 8v8c:E, 8v8d:A, 8v8d:B, 8v8d:E, 8v8d:C, 8v8d:D
27 8v8c:B 374 262 0.1960 0.1845 0.2634 1.20e-12 8v8c:A
28 6pv7:A 387 267 0.1790 0.1628 0.2360 1.68e-12 6pv7:D, 6pv8:A, 6pv8:D
29 7qko:A 396 339 0.2216 0.1970 0.2301 2.47e-12 8esk:A, 8esk:D, 8f2s:A, 8f2s:D, 8f6y:D, 8f6y:A, 8f6z:D, 8f6z:A, 7qko:D, 7ql5:A, 7ql5:D, 7ql6:A, 7ql6:D, 7smm:A, 7smm:D, 7smq:D, 7smq:A, 7smr:A, 7smr:D, 7sms:A, 7sms:D, 7smt:A, 7smt:D, 6uwz:A, 6uwz:D, 7z14:D, 7z14:A
30 9awk:A 402 260 0.1676 0.1468 0.2269 2.54e-12 9avu:A, 9avu:C, 9avv:C, 9awj:A, 9awj:C, 9awk:C
31 8f6y:C 409 318 0.2244 0.1932 0.2484 2.67e-12 8f6z:C, 7smm:C, 7smq:C, 7smr:C, 7sms:C, 7smt:C
32 8frw:A 395 312 0.2131 0.1899 0.2404 6.34e-12 8aw2:A, 8aw2:E, 8aw2:B, 8aw2:C, 8aw2:D, 8c21:B, 8c21:C, 8cc6:A, 8cc6:B, 8cc6:C, 8cc6:D, 8cc6:E, 8cc7:A, 8cc7:B, 8cc7:C, 8cc7:D, 8cc7:E, 6dg7:A, 6dg7:B, 6dg7:C, 6dg7:D, 6dg7:E, 6dg8:A, 6dg8:E, 6dg8:B, 6dg8:C, 6dg8:D, 8frw:E, 8frw:B, 8frw:C, 8frw:D, 8frx:A, 8frx:E, 8frx:B, 8frx:C, 8frx:D, 8frz:A, 8frz:B, 8frz:C, 8frz:D, 8frz:E, 8fsb:E, 8fsb:A, 8fsb:B, 8fsb:C, 8fsb:D, 8fsp:A, 8fsp:B, 8fsp:C, 8fsp:D, 8fsp:E, 8fsz:A, 8fsz:E, 8fsz:B, 8fsz:C, 8fsz:D, 6hin:A, 6hin:B, 6hin:C, 6hin:D, 6hin:E, 6hio:A, 6hio:B, 6hio:E, 6hio:C, 6hio:D, 6hiq:A, 6hiq:E, 6hiq:B, 6hiq:C, 6hiq:D, 6his:A, 6his:E, 6his:B, 6his:C, 6his:D, 6np0:A, 6np0:E, 6np0:B, 6np0:C, 6np0:D, 6w1j:A, 6w1j:E, 6w1j:B, 6w1j:C, 6w1j:D, 6w1m:A, 6w1m:E, 6w1m:B, 6w1m:C, 6w1m:D, 6w1y:A, 6w1y:E, 6w1y:B, 6w1y:C, 6w1y:D, 6y1z:A, 6y1z:B, 6y1z:D, 6y1z:E, 6y1z:C, 6y5a:A, 6y5a:E, 6y5a:C, 6y5a:B, 6y5a:D
33 6pv7:B 388 312 0.1875 0.1701 0.2115 1.20e-11 6pv7:C, 6pv7:E, 6pv8:B, 6pv8:C, 6pv8:E
34 6v4s:E 591 341 0.2074 0.1235 0.2141 3.03e-11 6v4a:A, 6v4s:B, 6v4s:A, 6v4s:D, 6v4s:C
35 9ftg:A 559 327 0.1960 0.1234 0.2110 3.24e-11 9ftg:B, 9ftg:D, 9ftg:E, 9ftg:C
36 7q3g:A 517 327 0.1960 0.1335 0.2110 3.59e-11 7q3g:E, 7q3g:D, 7q3g:C, 7q3g:B
37 8ssz:B 384 304 0.1960 0.1797 0.2270 5.76e-11 6cnj:B, 6cnj:C, 6cnj:E, 6cnk:C, 6cnk:E, 5kxi:B, 5kxi:E, 8st0:B, 8st2:C, 8st2:E, 8st3:B, 8st3:E, 8st4:B, 8st4:E, 6ur8:B, 6usf:E
38 8c20:D 355 278 0.1903 0.1887 0.2410 5.77e-11 8c20:B
39 8f6y:E 412 265 0.1847 0.1578 0.2453 4.42e-10 8esk:E, 8f2s:E, 8f6z:E, 7ql5:E, 7smq:E, 7sms:E, 7smt:E
40 8ssz:A 393 260 0.1790 0.1603 0.2423 8.50e-10 8ssz:D, 8st0:A, 8st0:D, 8st1:A, 8st1:B, 8st1:D, 8st2:A, 8st2:B, 8st2:D, 8st3:A, 8st3:D, 8st4:A, 8st4:D
41 9avu:B 413 272 0.1761 0.1501 0.2279 1.09e-09
42 8byi:A 320 284 0.1875 0.2062 0.2324 1.10e-09 8byi:B, 8byi:C, 8byi:D, 8byi:E
43 6usf:A 464 260 0.1790 0.1358 0.2423 1.17e-09 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
44 9avv:D 429 267 0.1477 0.1212 0.1948 3.78e-09 9avu:D, 9awj:D, 9awk:D
45 8bla:A 211 150 0.1136 0.1896 0.2667 7.34e-08 8bla:E, 8bla:B, 8bla:C, 8bla:D, 8blb:A, 8blb:E, 8blb:B, 8blb:C, 8blb:D
46 5fjv:B 207 183 0.1335 0.2271 0.2568 3.90e-07 5fjv:A, 5fjv:E, 5fjv:C, 5fjv:D
47 6hy7:A 210 128 0.0966 0.1619 0.2656 5.95e-06 4uxu:A, 4uxu:B
48 9awj:B 408 253 0.1364 0.1176 0.1897 2.52e-04
49 8eiz:A 315 135 0.0938 0.1048 0.2444 0.040 8eiz:B, 8eiz:C, 8eiz:D, 8eiz:E
50 1w2t:A 432 105 0.0710 0.0579 0.2381 0.27 1w2t:B, 1w2t:C, 1w2t:D, 1w2t:E, 1w2t:F
51 5afm:B 207 166 0.1193 0.2029 0.2530 0.35 5afh:A, 5afh:B, 5afh:C, 5afh:D, 5afh:E, 5afj:A, 5afj:B, 5afj:C, 5afj:D, 5afj:E, 5afk:A, 5afk:B, 5afk:C, 5afk:D, 5afk:E, 5afl:A, 5afl:B, 5afl:C, 5afl:D, 5afl:E, 5afm:A, 5afm:C, 5afm:D, 5afm:E, 5afn:A, 5afn:B, 5afn:C, 5afn:D, 5afn:E, 5oug:A, 5oug:E, 5oug:B, 5oug:C, 5oug:D, 5ouh:A, 5ouh:B, 5ouh:C, 5ouh:D, 5ouh:E, 5oui:A, 3sq6:A, 3sq6:B, 3sq6:C, 3sq6:D, 3sq6:E, 3sq6:F, 3sq6:G, 3sq6:H, 3sq6:I, 3sq6:J
52 8h59:A 375 59 0.0568 0.0533 0.3390 2.4
53 6h57:A 795 65 0.0483 0.0214 0.2615 2.8
54 3av4:A 1140 27 0.0341 0.0105 0.4444 3.2 3av5:A, 3av6:A, 4da4:B, 5gut:A, 5guv:A, 3pt9:A, 6w8v:B, 6w8w:A, 6w8w:B, 5wy1:A
55 5w4y:A 450 62 0.0483 0.0378 0.2742 3.2 5w4y:B, 5w4z:A, 5w4z:B
56 7d63:RZ 839 66 0.0511 0.0215 0.2727 4.0 7d4i:RZ, 7d5t:RZ, 7mqj:A
57 6nwo:D 165 108 0.0710 0.1515 0.2315 4.5 6nwh:A, 6nwh:B, 6nwj:A, 6nwj:B, 6nwm:A, 6nwm:B, 6nx3:A, 6nx3:B, 6nx3:C, 6nx3:D, 6nx3:E, 6nx3:F
58 6zqg:JD 829 66 0.0511 0.0217 0.2727 4.9
59 3bs0:A 414 36 0.0398 0.0338 0.3889 5.3 3brz:A, 3bs0:B
60 4qqb:A 169 33 0.0369 0.0769 0.3939 8.1 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218