Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PLPPGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDP

The query sequence (length=31) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5dws:C 40 31 1.0000 0.7750 1.0000 1.42e-18
2 5cq2:A 76 31 1.0000 0.4079 1.0000 3.72e-18 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
3 5cq2:A 76 31 0.5484 0.2237 0.5484 2.18e-05 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
4 1i5h:W 50 31 0.7097 0.4400 0.7097 3.42e-13
5 2djy:A 42 31 0.6774 0.5000 0.6774 6.65e-11
6 2lb1:A 35 31 0.6452 0.5714 0.6452 8.52e-11 2ltx:A
7 7lp3:A 37 31 0.6452 0.5405 0.6452 1.19e-10 7lp3:C
8 2kxq:A 90 31 0.6774 0.2333 0.6774 2.80e-10 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
9 2kxq:A 90 30 0.4516 0.1556 0.4667 4.17e-05 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
10 2laj:A 40 30 0.6129 0.4750 0.6333 1.99e-09
11 4lcd:A 419 31 0.6129 0.0453 0.6129 5.43e-09 4lcd:B
12 7lp2:E 37 30 0.5806 0.4865 0.6000 8.80e-09 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
13 2n8t:A 39 30 0.5161 0.4103 0.5333 1.15e-08
14 2jmf:A 43 31 0.6129 0.4419 0.6129 1.58e-08
15 2m3o:W 43 30 0.5806 0.4186 0.6000 1.67e-08 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
16 2nc3:A 33 30 0.5806 0.5455 0.6000 2.59e-08 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
17 8sg2:A 163 31 0.6452 0.1227 0.6452 3.91e-08 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
18 6jjy:A 128 31 0.5161 0.1250 0.5161 1.66e-07 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
19 6jjy:A 128 30 0.5161 0.1250 0.5333 4.22e-05 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
20 2ltv:A 36 31 0.4516 0.3889 0.4516 4.05e-07 2law:A
21 6jjz:B 96 31 0.5161 0.1667 0.5161 1.46e-06 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
22 6jjz:B 96 30 0.4839 0.1562 0.5000 0.005 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
23 1jmq:A 46 31 0.5161 0.3478 0.5161 1.59e-06 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
24 2ez5:W 46 31 0.4839 0.3261 0.4839 2.32e-06
25 1eg4:A 260 26 0.3226 0.0385 0.3846 0.013
26 2oei:A 37 30 0.4194 0.3514 0.4333 0.22 2ho2:A
27 2vqd:A 447 19 0.3548 0.0246 0.5789 0.51
28 8pxx:A 99 26 0.2903 0.0909 0.3462 0.95 2dyf:A
29 7kct:A 453 21 0.3548 0.0243 0.5238 1.7 7kbl:A, 7kbl:B, 7kc7:A, 7kct:B
30 2jup:W 37 26 0.2581 0.2162 0.3077 1.9 2rly:W, 2rm0:W
31 1dv2:A 450 19 0.3548 0.0244 0.5789 2.1 1dv1:A, 1dv2:B, 3g8c:A, 3g8c:B, 3g8d:B, 2j9g:A, 2j9g:B, 3jzf:B, 3jzi:A, 3jzi:B, 6oi9:A, 6oi9:B, 3rup:A, 3rup:B, 3rv3:A, 3rv3:B, 3rv4:A, 2v58:A, 2v58:B, 2v59:A, 2v59:B, 2v5a:A, 2vr1:A, 2w6m:A, 2w6m:B, 2w6n:A, 2w6n:B, 2w6o:A, 2w6o:C, 2w6p:A, 2w6q:A, 2w6q:B, 2w6z:A, 2w70:A, 2w70:B, 2w71:A, 2w71:C
32 6ojh:A 445 19 0.3548 0.0247 0.5789 2.1 4mv1:A, 4mv3:A, 4mv4:A, 4mv8:A, 6oi8:A
33 1dv1:B 428 19 0.3548 0.0257 0.5789 2.1
34 4rzq:A 422 19 0.3548 0.0261 0.5789 2.1 4mv6:A, 4mv7:A, 4mv9:A
35 3jzf:A 380 19 0.3548 0.0289 0.5789 2.1
36 3b69:A 626 29 0.3226 0.0160 0.3448 2.2 2ah2:A, 1ms0:A, 1ms0:B, 1ms1:A, 1ms1:B, 1ms8:A, 1ms8:B, 1ms9:A, 1ms9:B, 3pjq:A, 1s0i:A, 1s0j:A
37 5l9w:b 649 14 0.2258 0.0108 0.5000 2.4
38 8hz5:A 350 21 0.3548 0.0314 0.5238 2.4
39 5wb2:A 421 15 0.2258 0.0166 0.4667 2.7 7rkm:R, 4xt1:A
40 6jiy:A 3521 17 0.2903 0.0026 0.5294 3.3 6ji8:A, 6ji8:D, 6ji8:G, 6ji8:J, 6jii:B, 6jii:E, 6jii:H, 6jii:K, 6jiu:A, 6jiu:D, 6jiu:G, 6jiu:J, 6jiy:D, 6jiy:G, 6jiy:J, 6jv2:A, 6jv2:C, 6jv2:E, 6jv2:G
41 6jrs:A 3488 17 0.2903 0.0026 0.5294 3.3 6jrs:D, 6jrs:G, 6jrs:J
42 6jgz:B 3485 17 0.2903 0.0026 0.5294 3.3 6jg3:A, 6jg3:B, 6jg3:C, 6jg3:D, 6jgz:D, 6jgz:F, 6jgz:H, 6jh6:B, 6jh6:D, 6jh6:F, 6jh6:H, 6jhn:A, 6jhn:C, 6jhn:E, 6jhn:G, 6ji0:A, 6ji0:C, 6ji0:E, 6ji0:G, 6jrr:A, 6jrr:C, 6jrr:E, 6jrr:G
43 5go9:A 3423 17 0.2903 0.0026 0.5294 3.3 5go9:B, 5go9:C, 5go9:D, 5goa:A, 5goa:B, 5goa:C, 5goa:D
44 7vml:A 4044 17 0.2903 0.0022 0.5294 3.4 7aih:UA, 7am2:UA, 7ane:UA, 5dat:l1, 5gak:r, 6hd7:r, 6j3z:19, 6j40:19, 6j40:39, 5mc6:AZ, 6n8k:s, 6n8l:s, 6n8m:S, 6n8n:S, 6n8o:S, 7nrc:Lt, 6o1o:F, 6o1o:G, 6o1o:H, 6qik:p, 6qtz:p, 6ri5:p, 7rr5:L1, 6rzz:p, 6s05:p, 5t62:S, 5t6r:S, 6tnu:BT, 7vml:B, 7vml:C, 7vml:D, 7vmm:A, 7vmm:B, 7vmm:C, 7vmm:D, 7vmn:A, 7vmn:B, 7vmn:C, 7vmn:D, 7vmo:A, 7vmo:B, 7vmo:C, 7vmo:D, 7vmp:A, 7vmp:B, 7vmp:C, 7vmp:D, 7vmq:A, 7vmq:B, 7vmq:C, 7vmq:D, 7vmr:A, 7vmr:B, 7vmr:C, 7vmr:D, 7vms:A, 7vms:B, 7vms:C, 7vms:D
45 8uxh:A 4004 17 0.2903 0.0022 0.5294 3.5 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
46 8dvv:A 3886 17 0.2903 0.0023 0.5294 3.5 8dvv:B, 8dvv:C, 8dvv:D
47 7ua3:A 4443 17 0.2903 0.0020 0.5294 3.6 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
48 8uxl:A 4232 17 0.2903 0.0021 0.5294 3.6 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
49 8dtz:A 4061 17 0.2903 0.0022 0.5294 3.6 8dtz:B, 8dtz:C, 8dtz:D
50 8dty:A 4004 17 0.2903 0.0022 0.5294 3.7 8dty:B, 8dty:C, 8dty:D
51 6wou:A 3921 17 0.2903 0.0023 0.5294 3.7 6wou:B, 6wou:C, 6wou:D, 6wov:A, 6wov:B, 6wov:C, 6wov:D
52 7e8e:D 459 30 0.2581 0.0174 0.2667 4.8 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
53 7qep:L3 363 19 0.2258 0.0193 0.3684 5.2
54 6rm3:LB0 368 17 0.2258 0.0190 0.4118 7.0
55 7dm1:B 334 28 0.2903 0.0269 0.3214 8.9 7dm1:A, 7dm2:A, 1pc3:A, 1pc3:B
56 8hz4:A 456 13 0.2581 0.0175 0.6154 9.3 8hz4:B, 8hz4:C, 8hz4:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218