BioLiP

>protein
PLNYILLNLAVADLFMVFGGFTTTLYTSLHGYFVFGPTGMPGPTPSGTNVGSSGRSPSV

The query sequence (length=59) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8rjc:B	59	59	1.0000	1.0000	1.0000	3.43e-36	8rjd:B
2	2g87:A	348	39	0.6610	0.1121	1.0000	2.66e-20	4a4m:A, 8a6c:A, 8a6c:B, 8a6d:A, 8a6d:B, 8a6e:A, 8a6e:B, 4bey:A, 3c9l:A, 3c9m:A, 3dqb:A, 5dys:A, 5en0:A, 1f88:A, 8fcz:A, 8fcz:B, 6fk6:A, 6fk7:A, 6fk8:A, 6fk9:A, 6fka:A, 6fkb:A, 6fkc:A, 6fkd:A, 6fuf:A, 2g87:B, 1gzm:A, 1gzm:B, 2hpy:A, 2hpy:B, 1hzx:A, 2i35:A, 2j4y:A, 2j4y:B, 4j4q:A, 1jfp:A, 1l9h:A, 1ln6:A, 7mt8:R, 7mt9:R, 7mta:R, 7mtb:R, 6nwe:A, 3oax:A, 3oax:B, 6oy9:R, 6oya:R, 2ped:A, 2ped:B, 6pel:A, 6pgs:A, 6ph7:A, 3pqr:A, 3pxo:A, 4pxf:A, 6qno:R, 5te5:A, 7tut:B, 1u19:A, 1u19:B, 5wkt:A, 4x1h:A, 2x72:A, 7zbc:A, 7zbc:B, 7zbe:A, 7zbe:B
3	1f88:B	305	39	0.6610	0.1279	1.0000	3.29e-20	1hzx:B, 1l9h:B
4	8iu2:R	298	36	0.3051	0.0604	0.5000	2.67e-04
5	7b6w:AAA	438	38	0.2542	0.0342	0.3947	0.005
6	5yc8:A	384	37	0.2881	0.0443	0.4595	0.023	5zk3:A, 5zk8:A, 5zkb:A, 5zkc:A
7	6oij:R	293	36	0.2881	0.0580	0.4722	0.049
8	3uon:A	438	37	0.2881	0.0388	0.4595	0.056
9	7wc5:A	363	30	0.2034	0.0331	0.4000	0.056	6a93:B, 6a94:B, 8jt8:A, 7vod:A, 7voe:A, 7wc6:A, 7wc7:A, 7wc8:A, 7wc9:A, 6wgt:B, 6wh4:B
10	6wh4:A	378	30	0.2034	0.0317	0.4000	0.063	6a93:A, 6a94:A, 7wc4:A, 6wgt:A, 6wgt:C, 6wh4:C, 8zmg:A, 8zmg:B
11	7ran:A	269	30	0.2034	0.0446	0.4000	0.17	8v6u:A, 6wha:A
12	7xw9:R	288	39	0.2373	0.0486	0.3590	0.18	7wkd:R, 7x1t:A, 7x1u:A
13	7w55:R	303	40	0.2881	0.0561	0.4250	0.22	7w57:R, 7xk8:R
14	6ol9:A	416	36	0.2881	0.0409	0.4722	0.23
15	8ia7:R	276	34	0.2542	0.0543	0.4412	0.38	7f8v:R, 7f8w:R, 7xow:R, 7xox:R
16	6oik:R	278	38	0.2881	0.0612	0.4474	0.46	4mqs:A, 4mqt:A, 7t8x:A, 7t90:A, 7t94:A, 7t96:A, 6u1n:R
17	6tcl:L2	167	25	0.1864	0.0659	0.4400	1.3	6jeo:aL, 6jeo:bL, 6jeo:cL, 6jeo:dL, 6k61:L, 6k61:l, 6tcl:L1, 6tcl:LL, 6tcl:L
18	6xyw:Ba	195	28	0.2203	0.0667	0.4643	1.5
19	7ddz:A	437	35	0.2373	0.0320	0.4000	1.7
20	7yon:R	302	35	0.2373	0.0464	0.4000	2.6	7yoo:R
21	7d7q:B	310	28	0.2034	0.0387	0.4286	2.9	7cj3:A, 7cj3:B, 7d7q:A
22	5dld:A	379	27	0.1864	0.0290	0.4074	2.9
23	8jw0:l	253	25	0.2034	0.0474	0.4800	3.9
24	7xwo:B	272	32	0.2542	0.0551	0.4688	4.2
25	7ymj:A	280	34	0.2034	0.0429	0.3529	5.0	8thk:R, 8thl:R, 7ym8:A, 7ymh:A
26	6kux:A	375	36	0.2034	0.0320	0.3333	5.7	6kuy:A
27	8jjr:l	253	25	0.2034	0.0474	0.4800	5.7
28	5zhp:A	394	26	0.2034	0.0305	0.4615	5.9	4u15:A, 4u15:B, 4u16:A, 4u16:B, 5zhp:B
29	4u14:A	436	26	0.2034	0.0275	0.4615	6.4	4daj:A, 4daj:B, 4daj:C, 4daj:D
30	7f61:A	301	36	0.2881	0.0565	0.4722	6.6	8yuu:R, 8yuv:R
31	8jze:l	250	25	0.2034	0.0480	0.4800	7.1	8jzf:l
32	8jbf:B	282	34	0.2034	0.0426	0.3529	8.4	8jbg:B, 8jbh:B
33	5te8:B	471	16	0.1356	0.0170	0.5000	9.0	5a1p:A, 5a1r:A, 6bcz:A, 6bd5:A, 6bd6:A, 6bd7:A, 6bd8:A, 6bdi:A, 6bdk:A, 6bdm:A, 4d6z:A, 4d75:A, 4d78:A, 4d7d:A, 6da2:A, 6da3:A, 6da5:A, 6da8:A, 6daa:A, 6dac:A, 6dag:A, 6daj:A, 6dal:A, 8dyc:A, 8ewe:A, 8ewl:A, 8ewp:A, 8ewq:A, 8ewr:A, 8ews:A, 5g5j:A, 4i3q:A, 4i4g:A, 4i4h:A, 2j0d:A, 4k9t:A, 4k9u:A, 4k9v:A, 4k9w:A, 4k9w:B, 4k9w:C, 4k9w:D, 4k9x:A, 7ks8:A, 7kvh:A, 7kvi:A, 7kvk:A, 7kvk:B, 7kvm:A, 7kvn:A, 7kvn:B, 7kvo:A, 7kvo:B, 7kvp:A, 7kvq:A, 7kvq:B, 7kvs:A, 7lxl:A, 6ma6:A, 6ma7:A, 6ma8:A, 3nxu:A, 3nxu:B, 4ny4:A, 6oo9:A, 6ooa:A, 6oob:A, 8so1:A, 8so2:A, 8spd:A, 5te8:A, 5te8:C, 3tjs:A, 1tqn:A, 3ua1:A, 7ufa:A, 7ufb:A, 7ufc:A, 7ufd:A, 7ufe:A, 7ufe:B, 7uff:B, 6une:A, 6ung:A, 6unh:A, 6unk:A, 2v0m:A, 2v0m:B, 2v0m:C, 2v0m:D, 5vc0:A, 5vcc:A, 5vcd:A, 5vce:A, 5vcg:A, 1w0e:A, 1w0f:A, 1w0g:A
34	7f8x:A	443	34	0.2203	0.0293	0.3824	9.5	7f8u:A, 7f8y:A

[Back]