BioLiP

>protein
PLGSVSEACPVCEKTVQNPCVLETGYVACYPCAISYLVNNEGHCPVTNKKLLGCTYNKHTNKWEVVTGIRKLI

The query sequence (length=73) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7t9x:A	73	73	1.0000	1.0000	1.0000	3.73e-49	7t9x:B
2	7t92:B	360	68	0.2877	0.0583	0.3088	1.08e-06
3	7oik:A	4426	39	0.1507	0.0025	0.2821	0.056	7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
4	2eci:A	86	56	0.2877	0.2442	0.3750	0.12
5	3hcs:A	157	56	0.2877	0.1338	0.3750	0.22	3hcs:B, 3hct:A, 3hcu:A, 3hcu:C, 8hz2:A, 8hz2:B, 2jmd:A, 7l3l:B, 7l3l:D
6	5dka:A	96	40	0.1918	0.1458	0.3500	0.56	5dka:B, 8gbq:B, 8gcb:B
7	7dvq:M	191	31	0.1370	0.0524	0.3226	0.95	8i0r:K, 8i0s:K, 8i0t:K, 5z56:M, 5z58:M
8	4r8p:L	254	45	0.1918	0.0551	0.3111	1.2	2ckl:B, 8grm:N, 2h0d:B, 7nd1:A, 8pp7:L, 8pp7:N, 4r8p:N, 3rpg:C, 4s3o:B, 4s3o:E
9	4d11:C	436	27	0.1507	0.0252	0.4074	1.5
10	6ff4:t	172	31	0.1233	0.0523	0.2903	1.8	8ch6:Z, 6ff7:t, 7qtt:Z
11	4r7e:A	69	43	0.1781	0.1884	0.3023	1.9	8ieg:A, 8ieg:B, 8t3t:K, 8t3t:L, 8t3w:K, 8t3w:L, 8t3y:K, 8t3y:L
12	5vo0:D	159	56	0.2740	0.1258	0.3571	1.9	5vnz:A, 5vnz:D, 5vo0:A
13	7xyz:B	456	27	0.1233	0.0197	0.3333	2.6	7xv2:A, 7xyy:A, 7xyy:B, 7xyz:A, 7xyz:C, 7xyz:D, 7xz0:A, 7xz0:B, 7xz1:A, 7xz1:B, 7xz2:A, 7xz2:B, 7xz2:C, 7xz2:D
14	5j3x:B	389	52	0.1507	0.0283	0.2115	3.4	4a4b:A, 4a4c:A, 1b47:A, 1b47:B, 1b47:C, 3bum:B, 3bun:B, 3buo:B, 3buo:D, 3buw:B, 3buw:D, 3bux:B, 3bux:D, 2cbl:A, 1fbv:A, 4gpl:B, 5hkx:A, 5hky:A, 5hkz:A, 5hl0:A, 5j3x:A, 5j3x:C, 5j3x:D, 5j3x:E, 5j3x:F, 2k4d:A, 5o76:A, 5o76:C, 3ob1:B, 3ob2:B, 3plf:B, 3plf:D, 7siy:A, 6xar:A, 6xar:B, 2y1m:A, 2y1m:B, 2y1m:C, 2y1m:D, 2y1m:E, 2y1m:F, 2y1n:A, 2y1n:C, 1yvh:A
15	7sdb:A	288	13	0.0822	0.0208	0.4615	3.6	7sdd:A, 4tvv:A, 4tvv:B, 4tvv:C, 4tvv:D
16	3zni:A	390	52	0.1370	0.0256	0.1923	3.8	4a49:A, 5axi:B, 5axi:A, 5axi:C, 9fqh:A, 9fqi:A, 9fqj:A, 9fqj:B, 8gcy:A, 2ldr:A, 3pfv:A, 3pfv:B, 8qng:A, 8qnh:A, 8qni:A, 8qtg:A, 8qth:A, 8qtj:A, 8qtk:A, 8vw4:A, 8vw4:B, 8vw5:A, 8vw5:B, 3zni:E, 3zni:I, 3zni:M
17	1zu1:A	127	22	0.1370	0.0787	0.4545	4.3
18	3h7c:X	369	57	0.2329	0.0461	0.2982	4.5	3h7k:A, 2q3u:A, 2q3u:B, 1vkp:A, 1vkp:B
19	5olm:B	132	45	0.2055	0.1136	0.3333	5.4	5jpx:A, 5olm:A
20	2vf8:B	835	42	0.2055	0.0180	0.3571	5.6	2vf7:A, 2vf7:C
21	6wi7:A	206	46	0.1918	0.0680	0.3043	7.6	2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
22	6njc:A	201	18	0.1096	0.0398	0.4444	9.2	6njc:B, 7pzg:AAA, 7pzg:BBB, 7pzg:CCC, 7pzg:DDD, 7pzh:AAA, 7pzh:BBB, 7pzh:CCC, 7pzh:DDD, 7pzh:EEE, 7pzh:FFF, 7pzh:HHH, 7pzh:GGG
23	2vf7:B	813	40	0.1918	0.0172	0.3500	9.9	2vf8:A

[Back]