Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PLGSVRWARALYDFEALEEDELGFRSGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAP

The query sequence (length=59) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2w10:B 62 59 1.0000 0.9516 1.0000 6.55e-39 2d0n:A, 2d0n:C, 1h3h:A, 1oeb:B, 1oeb:A, 1uti:A, 2w10:A
2 1uj0:A 58 54 0.4915 0.5000 0.5370 2.14e-17
3 5ixf:A 68 54 0.4746 0.4118 0.5185 2.59e-17
4 8dgo:B 218 53 0.4407 0.1193 0.4906 3.08e-16 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
5 8dgo:B 218 51 0.3390 0.0917 0.3922 4.33e-07 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
6 2sem:B 59 55 0.3898 0.3898 0.4182 6.10e-16 1sem:A, 1sem:B, 2sem:A, 3sem:A, 3sem:B
7 2xmf:A 60 58 0.4407 0.4333 0.4483 2.97e-14
8 1ssh:A 60 57 0.4576 0.4500 0.4737 6.76e-12
9 4x1v:A 59 53 0.3390 0.3390 0.3774 1.41e-11 3u23:A
10 6ipz:Z 63 52 0.4237 0.3968 0.4808 4.72e-11 1a0n:B, 1azg:B, 4eik:A, 1fyn:A, 8kdx:A, 3ua7:A, 3ua7:D, 3ua7:C, 4znx:A, 4znx:D, 4znx:B, 4znx:C
11 1zsg:A 65 50 0.3559 0.3231 0.4200 3.66e-10 2p4r:A, 5sxp:B, 5sxp:D, 5sxp:A, 5sxp:C
12 2drk:A 59 49 0.3729 0.3729 0.4490 4.64e-10 2drm:A, 2drm:B, 2drm:C, 2drm:D
13 2d1x:C 66 61 0.4068 0.3636 0.3934 8.61e-10 2d1x:A, 2d1x:B, 2d1x:D, 5nv1:A, 7pll:A, 3ulr:B
14 6b27:A 118 48 0.3220 0.1610 0.3958 1.28e-09 6b27:B, 6b27:C, 6b27:D, 6b27:E, 6b27:F
15 7a2w:A 61 59 0.3898 0.3770 0.3898 1.87e-09 7a2x:A, 7a2y:A, 7a2z:A
16 7uy0:A 448 52 0.4068 0.0536 0.4615 2.40e-09 7uy0:B, 7uy3:A
17 2ak5:B 64 50 0.3390 0.3125 0.4000 2.68e-09 2df6:A, 2df6:B
18 6f55:A 67 51 0.3898 0.3433 0.4510 4.69e-09
19 4hvw:A 61 52 0.3220 0.3115 0.3654 9.96e-09 6xx2:A, 6xx3:A
20 1gbr:A 74 57 0.3729 0.2973 0.3860 1.01e-08
21 4lnp:A 61 54 0.3051 0.2951 0.3333 1.10e-08
22 7ud6:A 265 52 0.4068 0.0906 0.4615 1.44e-08 3a7d:A, 2cl5:A, 2cl5:B, 5fhq:A, 5fhr:A, 5fhr:B, 6gy1:A, 1h1d:A, 3hvh:A, 3hvi:A, 3hvj:A, 3hvj:B, 3hvk:A, 1jr4:A, 5k01:A, 5k03:A, 5k05:A, 5k05:B, 5k09:A, 5k09:B, 5k09:C, 5k09:D, 5k09:E, 5k09:F, 5k09:G, 5k09:H, 5k09:I, 5k09:J, 5k09:K, 5k09:L, 5k09:M, 5k09:N, 5k09:O, 5k09:P, 5k09:Q, 5k09:R, 5k09:S, 5k09:T, 5k09:U, 5k09:V, 5k09:W, 5k09:X, 5k0b:A, 5k0b:B, 5k0b:C, 5k0b:D, 5k0b:E, 5k0b:F, 5k0b:G, 5k0b:H, 5k0c:A, 5k0c:B, 5k0e:A, 5k0f:A, 5k0f:B, 5k0g:A, 5k0l:A, 5k0l:B, 5k0l:C, 5k0l:D, 5k0n:A, 5k0n:B, 5k0n:C, 5k0n:D, 6lfe:A, 5lqa:A, 5lqc:A, 5lqj:B, 5lqj:C, 5lqj:D, 5lqk:A, 5lqn:A, 5lqr:A, 5lqu:A, 5lqu:B, 5lr6:A, 5lr6:B, 5lr6:C, 5lr6:D, 3nw9:A, 3nwb:A, 3nwe:A, 3oe4:A, 3oe5:A, 3ozr:A, 3ozs:A, 3ozt:A, 4p58:A, 5p8w:A, 5p8w:B, 5p8w:C, 5p8x:A, 5p8y:A, 5p8z:A, 5p90:A, 5p91:A, 5p92:A, 5p93:A, 5p94:A, 5p95:A, 5p96:A, 5p97:A, 5p98:A, 5p99:A, 5p9a:A, 5p9b:A, 5p9c:A, 5p9d:A, 5p9e:A, 5p9n:A, 5p9o:A, 5p9p:A, 5p9q:A, 5p9r:A, 5p9r:B, 5p9s:A, 5p9t:A, 5p9u:A, 5p9v:A, 5p9w:A, 5p9x:A, 5p9y:A, 5p9z:A, 5pa0:A, 5pa1:A, 5pa2:A, 5pa3:A, 5pa4:A, 5pa5:A, 5pa6:A, 5pa7:A, 5pa7:B, 4pyl:A, 4pyn:A, 4pyo:A, 4pyo:B, 4pyq:A, 4pyq:B, 3r6t:A, 3s68:A, 3u81:A, 1vid:A, 7xgi:A, 7xjb:A, 7xjb:B, 7xjb:C, 7xjb:D, 2zth:A, 2zvj:A
23 7pvt:C 56 52 0.3220 0.3393 0.3654 3.28e-08 7pvt:A
24 2bz8:B 57 46 0.2712 0.2807 0.3478 4.41e-08 2bz8:A
25 4wci:C 63 59 0.3729 0.3492 0.3729 5.14e-08 2j6f:A, 2j6o:A, 2j7i:A, 2j7i:B, 4wci:A, 4wci:E
26 8hlo:A 67 56 0.3390 0.2985 0.3571 1.06e-07 2rqu:A
27 2rpn:A 59 54 0.3559 0.3559 0.3889 1.15e-07
28 5xhz:A 60 53 0.2712 0.2667 0.3019 1.41e-07 5xhz:B
29 4f14:A 56 51 0.3051 0.3214 0.3529 1.57e-07
30 6a9c:B 66 50 0.3051 0.2727 0.3600 1.81e-07
31 2jma:A 62 48 0.2712 0.2581 0.3333 1.99e-07 5ihk:A, 3thk:A, 3thk:B, 1u06:A
32 1wlp:B 138 51 0.3051 0.1304 0.3529 2.69e-07 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
33 1wlp:B 138 48 0.2881 0.1232 0.3542 4.54e-04 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
34 1y57:A 452 52 0.3220 0.0420 0.3654 2.71e-07 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
35 1b07:A 59 55 0.3051 0.3051 0.3273 5.22e-07 6atv:A, 1cka:A, 1ckb:A, 5ih2:A, 5ih2:B, 5l23:A, 5ul6:A
36 1w70:A 60 50 0.3051 0.3000 0.3600 5.51e-07 1w70:B
37 2oi3:A 86 51 0.3729 0.2558 0.4314 6.35e-07 2oj2:A
38 7pvx:A 60 52 0.3220 0.3167 0.3654 7.91e-07 7pvx:C
39 6pbc:A 1070 50 0.3220 0.0178 0.3800 1.49e-06
40 7z3j:A 1119 50 0.3220 0.0170 0.3800 1.56e-06 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
41 1wa7:A 60 51 0.3390 0.3333 0.3922 1.63e-06
42 4e6r:A 58 46 0.2881 0.2931 0.3696 1.72e-06
43 3vs7:B 427 51 0.3729 0.0515 0.4314 1.76e-06 4lud:B, 4lud:A, 4lue:B, 4lue:A, 3vs1:A
44 1qcf:A 450 51 0.3729 0.0489 0.4314 1.77e-06 1ad5:B, 1ad5:A, 2c0i:A, 2c0i:B, 2c0o:A, 2c0o:B, 2c0t:A, 2c0t:B, 5h09:A, 5h0b:A, 5h0e:A, 5h0g:A, 5h0h:A, 2hck:B, 2hck:A, 2hk5:A, 3vry:A, 3vry:B, 3vrz:A, 3vrz:B, 3vs0:A, 3vs0:B, 3vs1:B, 3vs2:A, 3vs2:B, 3vs3:A, 3vs3:B, 3vs4:B, 3vs4:A, 3vs5:A, 3vs5:B, 3vs6:A, 3vs6:B, 3vs7:A, 5zj6:A, 5zj6:B
45 4iim:A 57 50 0.3051 0.3158 0.3600 3.01e-06 4iim:B
46 8gmb:A 438 49 0.3220 0.0434 0.3878 5.15e-06 6aua:A, 6aub:A, 6bik:A, 6bke:A, 6bkh:A, 6bkw:A, 6bln:A, 5bpy:A, 5bpy:B, 5bq0:A, 6di0:A, 6di1:A, 6di3:A, 6di5:A, 6di9:A, 8dso:B, 8e2m:A, 6e4f:A, 8ejb:A, 6ep9:A, 5fbn:C, 5fbn:D, 5fbo:A, 8fd9:A, 8ff0:A, 8flg:A, 8flh:A, 8fll:A, 8fln:A, 8flv:A, 8gc7:A, 8gc8:A, 3gen:A, 6hrp:A, 6hrt:A, 6j6m:A, 5j87:A, 5j87:B, 5j87:C, 5j87:D, 5jrs:A, 5kup:A, 7kxl:A, 7kxm:A, 7kxn:A, 7kxo:A, 7kxp:A, 7kxq:A, 7l5o:A, 7l5p:A, 7l5p:B, 7lty:A, 7ltz:A, 6mny:A, 7n4q:A, 7n4r:A, 7n4s:A, 7n5o:A, 7n5r:A, 7n5x:A, 7n5y:A, 6n9p:A, 6nfh:A, 4nwm:A, 4nwm:B, 6nzm:A, 6nzm:D, 6o8i:A, 3ocs:A, 3oct:A, 6omu:A, 4ot5:A, 4ot6:A, 4otf:A, 4otq:A, 4otr:A, 5p9f:A, 5p9g:A, 5p9h:A, 5p9i:A, 5p9j:A, 5p9k:A, 5p9l:A, 5p9m:A, 3pix:A, 3piy:A, 7r60:A, 7r61:A, 4rfy:A, 4rfz:A, 4rg0:A, 4rx5:A, 6s90:A, 6s90:B, 8s9f:B, 8s9f:A, 5t18:A, 6tfp:A, 6tfp:B, 6tfp:C, 6tfp:D, 6tfp:E, 8tu3:A, 8tu4:A, 8tu5:A, 8u2d:A, 8u2e:A, 5u9d:A, 5vfi:A, 5vgo:A, 6vxq:A, 6w06:A, 6w07:A, 6w7o:A, 6w7o:B, 6w8i:C, 6w8i:A, 6w8i:B, 6x3n:A, 6x3o:A, 6x3o:B, 6x3p:A, 6xe4:A, 4y95:A, 4y95:B, 4y95:C, 4y95:D, 7yc9:A, 4yhf:A, 4yhf:B, 4z3v:A, 4zly:A, 4zlz:A, 5zz4:A, 5zz4:B, 5zz4:C, 5zz4:D, 5zz4:E, 5zz4:F
47 8t7c:A 1001 53 0.3220 0.0190 0.3585 8.85e-06
48 8bq3:A 60 50 0.2881 0.2833 0.3400 9.34e-06
49 4iio:B 57 50 0.2881 0.2982 0.3400 1.97e-05
50 5ypr:A 267 53 0.2712 0.0599 0.3019 2.42e-05 7f7g:A, 7f7g:B, 7f7i:A, 7f7i:D, 7f7i:B, 7f7i:C, 7f7i:E, 7f7i:F, 5gnv:A, 1jxm:A, 3wp0:A, 3wp1:B, 5ypo:B, 5ypo:A
51 2o9v:A 67 52 0.2881 0.2537 0.3269 3.54e-05 4ln2:A
52 5qu2:A 56 49 0.3559 0.3750 0.4286 4.05e-05 5qu2:B
53 2rol:A 64 54 0.3051 0.2812 0.3333 1.62e-04
54 4cc3:C 64 52 0.2542 0.2344 0.2885 2.66e-04 4cc2:A, 4cc2:C, 4cc3:A, 4cc3:E, 4cc3:G, 4cc7:A, 4cc7:C, 4cc7:K, 4cc7:E, 4cc7:G, 4cc7:I, 4cc7:M
55 1jeg:A 60 52 0.3051 0.3000 0.3462 3.89e-04
56 2fo0:A 466 51 0.3220 0.0408 0.3725 7.99e-04 1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
57 8ssn:B 386 51 0.3220 0.0492 0.3725 8.50e-04
58 5mo4:A 429 51 0.3220 0.0443 0.3725 0.001 3cs9:B, 3cs9:C, 2hz0:B, 6npe:B, 6npu:B, 6npv:B, 3pyy:B, 8ssn:A
59 3uat:A 276 43 0.2203 0.0471 0.3023 0.002
60 2kym:A 120 54 0.3051 0.1500 0.3333 0.003
61 5i22:A 81 72 0.3729 0.2716 0.3056 0.005 1mv0:B
62 2rqw:A 105 55 0.3051 0.1714 0.3273 0.008
63 3tvt:A 255 48 0.2542 0.0588 0.3125 0.008
64 1lck:A 164 51 0.2881 0.1037 0.3333 0.010 1bhf:A, 1cwd:L, 1cwe:A, 1cwe:C, 1fbz:A, 1fbz:B, 2iim:A, 1ijr:A, 1lcj:A, 1lkk:A, 1lkl:A, 1x27:A, 1x27:B, 1x27:C, 1x27:D, 1x27:E, 1x27:F
65 7tzk:A 64 52 0.2373 0.2188 0.2692 0.023 7tzk:B
66 2lcs:A 67 53 0.2881 0.2537 0.3208 0.13
67 4wsi:A 372 20 0.1186 0.0188 0.3500 0.43 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
68 1zuk:A 65 54 0.2203 0.2000 0.2407 1.1 1zuk:B
69 5v2p:A 287 54 0.2373 0.0488 0.2593 1.7 4dey:A
70 8e0e:A 322 54 0.2373 0.0435 0.2593 1.8 1t0j:B, 1t3l:A, 5v2q:A
71 3b7r:L 610 25 0.1525 0.0148 0.3600 2.2 5aen:A, 7auz:A, 7av0:A, 7av1:A, 7av2:A, 8ava:A, 8awh:A, 3b7s:A, 3b7t:A, 3b7u:X, 5bpp:A, 3cho:A, 3chp:A, 3chq:A, 3chr:A, 3chs:A, 4dpr:A, 6enb:A, 6enc:A, 6end:A, 3fh5:A, 3fh7:A, 3fh8:A, 3fhe:A, 3fts:A, 3ftu:A, 3ftv:A, 3ftw:A, 3ftx:A, 3fty:A, 3ftz:A, 3fu0:A, 3fu3:A, 3fu5:A, 3fu6:A, 3fud:A, 3fue:A, 3fuf:A, 3fuh:A, 3fui:A, 3fuj:A, 3fuk:A, 3ful:A, 3fum:A, 3fun:A, 5fwq:A, 1gw6:A, 1h19:A, 1hs6:A, 7kze:A, 7kze:B, 7kze:C, 4l2l:A, 7llq:A, 7llq:B, 7llq:C, 4mkt:A, 4ms6:A, 5n3w:A, 5ni2:A, 5ni4:A, 5ni4:B, 5ni4:C, 5ni6:A, 5nia:A, 5nid:A, 5nie:A, 5nie:B, 5nie:C, 6o5h:A, 6o5h:B, 6o5h:C, 8qow:A, 8qpn:A, 8qq4:A, 2r59:A, 4r7l:A, 4rsy:A, 4rvb:A, 8rx3:A, 8rx7:A, 8rx9:A, 1sqm:A, 8twx:A, 8twx:B, 8twx:C, 3u9w:A, 2vj8:A
72 7q6n:D 204 45 0.2373 0.0686 0.3111 2.3 3b6i:A, 3b6i:B, 3b6j:A, 3b6j:B, 3b6k:A, 3b6k:B, 3b6m:A, 3b6m:B, 4dy4:A, 4dy4:C, 5f12:A, 5f12:B, 7q6n:A, 7q6n:B, 7q6n:C, 2r96:A, 2r96:C, 2r97:A, 2r97:C, 4yqe:A, 4yqe:B, 3zho:A, 3zho:B
73 6umq:A 415 52 0.2881 0.0410 0.3269 3.3 6umq:B
74 6ks6:b 518 30 0.2203 0.0251 0.4333 3.9 6ks6:B, 4v81:B, 4v81:J, 4v81:b, 4v8r:AB, 4v8r:Ab, 4v8r:BB, 4v8r:Bb, 4v94:B, 4v94:J, 4v94:b, 4v94:j, 7ylw:B, 7ylw:b, 7ylx:B, 7ylx:b, 7yly:B, 7yly:b
75 6g4g:B 759 12 0.1017 0.0079 0.5000 4.0
76 6g4g:C 742 12 0.1017 0.0081 0.5000 4.2
77 6g4g:D 781 12 0.1017 0.0077 0.5000 4.2 6g4g:A
78 6lx2:A 523 46 0.2542 0.0287 0.3261 4.5 6lx1:A
79 4wyd:A 430 19 0.1695 0.0233 0.5263 4.9 3bv0:A, 3bv0:B, 4cxq:A, 4cxq:B, 4cxr:A, 4cxr:B, 6ge8:A, 6ge8:B, 5kgs:A, 5kgs:B, 5kgt:A, 5kgt:B, 3lv2:A, 3lv2:B, 4mqp:A, 4mqp:B, 4mqq:A, 4mqq:B, 4mqr:A, 4mqr:B, 5te2:B, 5te2:A, 3tft:A, 3tft:B, 3tfu:A, 3tfu:B, 4w1v:A, 4w1v:B, 4w1w:A, 4w1w:B, 4w1x:A, 4w1x:B, 4wya:A, 4wya:B, 4wya:C, 4wya:D, 4wyc:A, 4wyc:B, 4wyd:B, 4wye:A, 4wye:B, 4wyf:A, 4wyf:B, 4wyg:A, 4wyg:B, 4xew:A, 4xew:B, 4xjl:A, 4xjl:B, 4xjm:A, 4xjm:B, 4xjo:A, 4xjo:B, 4xjp:A, 4xjp:B
80 8j0t:C 534 43 0.2881 0.0318 0.3953 5.2 8j0s:A, 8j0s:B, 8j0s:C, 8j0t:A, 8j0t:B, 8jr0:A, 8jr0:B, 8jr0:C
81 6f2t:B 722 12 0.1017 0.0083 0.5000 5.5 6f2t:A, 6f2v:A, 6f2v:B, 6f2y:A, 6f2y:B, 6f30:A, 6f30:B, 6f33:A, 6f33:B
82 7zol:B 1702 33 0.1695 0.0059 0.3030 5.7 7zoq:B
83 2bgj:A 260 30 0.2203 0.0500 0.4333 6.1 2bgi:A, 2bgj:B, 2bgj:C, 2bgj:D, 4k1x:A, 4k1x:B, 2vnh:A, 2vni:A, 2vnj:A, 2vnk:A, 2vnk:B, 2vnk:C, 2vnk:D
84 2djh:A 96 16 0.1186 0.0729 0.4375 7.2 2a8k:D, 2a8k:C, 2a8k:B, 2a8k:A, 3vj7:A
85 1r8d:A 109 29 0.2034 0.1101 0.4138 7.5 1r8d:B
86 8tzb:A 920 29 0.1864 0.0120 0.3793 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218