Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PLGSLMNIVLHKEDKGLGFSIAGGVGNQHIINDNGIFVTKIIEGGAAFQDGRLEVGDRITKVNTLSLENVTHEEAVAILK
ETADVVSLVVVKP

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8bq8:C 93 93 1.0000 1.0000 1.0000 4.05e-62 8bq8:A, 8bq8:B
2 2ka9:A 189 93 0.6559 0.3228 0.6559 3.44e-35 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
3 2ka9:A 189 85 0.4946 0.2434 0.5412 5.17e-23 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 7pc3:A 405 89 0.6237 0.1432 0.6517 3.08e-32 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
5 8cn1:H 101 85 0.4946 0.4554 0.5412 4.70e-25 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 6xa7:B 96 93 0.4086 0.3958 0.4086 4.44e-20 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
7 8c1t:A 90 88 0.4409 0.4556 0.4659 8.31e-20 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
8 7p73:A 420 83 0.4086 0.0905 0.4578 1.67e-17 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
9 2m0z:A 97 90 0.3978 0.3814 0.4111 1.36e-16 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 3jxt:A 96 86 0.4086 0.3958 0.4419 8.71e-16 3jxt:B
11 4wyu:A 201 79 0.3763 0.1741 0.4430 6.36e-14 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
12 4wyu:A 201 89 0.3333 0.1542 0.3483 2.00e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
13 1n7t:A 103 84 0.3656 0.3301 0.4048 6.19e-13 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
14 2exg:A 101 99 0.4086 0.3762 0.3838 1.64e-12 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
15 5heb:A 119 88 0.3656 0.2857 0.3864 3.49e-12 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
16 3ch8:A 190 79 0.3548 0.1737 0.4177 6.74e-12 2qbw:A
17 5wou:A 95 88 0.3656 0.3579 0.3864 2.04e-11
18 8bv7:A 95 60 0.3118 0.3053 0.4833 2.30e-11 8buw:A, 8buw:B
19 4xhv:A 94 80 0.3656 0.3617 0.4250 3.15e-11
20 8bp4:A 93 89 0.3226 0.3226 0.3371 3.74e-11 8bp4:C, 8bp4:B
21 6q0m:B 94 93 0.3656 0.3617 0.3656 4.55e-11
22 2l4t:A 124 100 0.3978 0.2984 0.3700 7.22e-11 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
23 8b82:A 108 88 0.3226 0.2778 0.3409 9.98e-11 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
24 2kaw:A 90 79 0.3333 0.3444 0.3924 9.98e-11 6lcb:A, 2mx6:A
25 7qqm:A 413 82 0.3548 0.0799 0.4024 1.18e-10
26 7qct:A 90 91 0.3118 0.3222 0.3187 2.00e-10 7qct:B
27 1l6o:A 95 65 0.2796 0.2737 0.4000 5.19e-10 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
28 6zbq:A 89 52 0.2258 0.2360 0.4038 9.37e-10 6zc4:A
29 7weg:B 96 79 0.3226 0.3125 0.3797 2.16e-09 7weg:A
30 2i0i:A 81 82 0.3656 0.4198 0.4146 4.01e-09 2i0i:B, 2i0i:C
31 7p70:A 407 82 0.3871 0.0885 0.4390 4.57e-09 7pc4:A, 7qql:A
32 6gbe:A 119 91 0.3226 0.2521 0.3297 6.61e-09
33 2qt5:A 194 85 0.2903 0.1392 0.3176 1.34e-08 2qt5:B
34 2qt5:A 194 88 0.3118 0.1495 0.3295 2.03e-06 2qt5:B
35 2koh:A 111 67 0.3118 0.2613 0.4328 1.57e-08 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
36 2os6:A 89 86 0.3011 0.3146 0.3256 2.36e-08
37 2pdz:A 86 85 0.3871 0.4186 0.4235 2.97e-08
38 4e34:A 87 90 0.3656 0.3908 0.3778 3.34e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
39 7d6f:A 87 86 0.3011 0.3218 0.3256 1.79e-07
40 2r4h:C 98 88 0.2473 0.2347 0.2614 2.15e-07
41 7pc5:A 405 76 0.2903 0.0667 0.3553 2.73e-07
42 6x23:A 89 87 0.2581 0.2697 0.2759 3.03e-07
43 3tsz:A 341 74 0.3011 0.0821 0.3784 3.71e-07 3shw:A
44 7x2e:A 163 77 0.2903 0.1656 0.3506 1.07e-06 2kbs:A
45 5zys:A 90 80 0.2688 0.2778 0.3125 1.18e-05
46 2m0u:A 117 88 0.2796 0.2222 0.2955 1.97e-05
47 2kpl:A 129 78 0.2366 0.1705 0.2821 2.10e-05
48 5n7d:A 423 78 0.2366 0.0520 0.2821 3.37e-05 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
49 7qqn:C 414 75 0.2796 0.0628 0.3467 3.86e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
50 4xh7:A 110 81 0.2581 0.2182 0.2963 4.57e-05
51 6nid:B 88 58 0.2043 0.2159 0.3276 7.06e-05 6nid:A, 6nid:C
52 1n7f:A 86 57 0.1935 0.2093 0.3158 1.20e-04 1n7f:B
53 1ihj:B 95 68 0.2473 0.2421 0.3382 1.33e-04 1ihj:A
54 1b8q:A 127 76 0.2473 0.1811 0.3026 2.32e-04
55 3vqg:A 85 62 0.1935 0.2118 0.2903 2.75e-04
56 1rzx:A 98 92 0.2688 0.2551 0.2717 4.47e-04 5i7z:A, 1x8s:A
57 7pcb:A 415 91 0.3011 0.0675 0.3077 5.33e-04 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
58 6kz1:A 97 74 0.2581 0.2474 0.3243 7.08e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
59 2ejy:A 85 54 0.1935 0.2118 0.3333 0.001
60 3r0h:D 199 85 0.2688 0.1256 0.2941 0.001 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
61 2egn:A 83 52 0.2151 0.2410 0.3846 0.010
62 4wsi:A 372 58 0.1398 0.0349 0.2241 0.012 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
63 6ar4:B 87 82 0.2473 0.2644 0.2805 0.026 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
64 1zub:A 109 66 0.2258 0.1927 0.3182 0.044
65 3cyy:B 81 57 0.1720 0.1975 0.2807 0.065 3cyy:A
66 6yx0:B 112 104 0.2903 0.2411 0.2596 0.070 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
67 1u38:A 89 45 0.1398 0.1461 0.2889 0.085
68 5ez0:D 95 98 0.2473 0.2421 0.2347 0.23 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
69 2m0v:A 128 57 0.1828 0.1328 0.2982 0.55
70 5f67:A 98 59 0.2043 0.1939 0.3220 0.74 5f67:B
71 5h3h:B 269 31 0.1398 0.0483 0.4194 0.75 5h3h:A
72 6hks:B 94 73 0.2151 0.2128 0.2740 1.2 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
73 5oak:A 90 56 0.1613 0.1667 0.2679 1.9 5oak:C
74 3bpu:A 86 79 0.2258 0.2442 0.2658 2.4
75 5ha5:D 244 51 0.2043 0.0779 0.3725 7.3 5ha5:B, 5ha5:C
76 7yp9:D 1285 53 0.1720 0.0125 0.3019 7.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218