BioLiP

>protein
PLELRPGEYRVLLCVDIGETRGGGHRPELLRELQRLHVTHTVRKLHVGDFVWVAQETNPRDPANPGELVLDHIVERKRLD
DLCSSIIDGRFREQKFRLKRCGLERRVYLVEELSLPESTLLQAVTNTQVIDGFFVKRTADIKESAAYLALLTRGLQRLYQ
GHTLRSRPWGTPPNPLCSLLTFSDFNA

The query sequence (length=187) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4p0q:A	285	194	0.9893	0.6491	0.9536	1.20e-129	9f99:A, 9f99:G, 9f99:C, 9f99:E, 9f9a:A, 9f9a:G, 9f9a:C, 9f9a:E, 9f9k:A, 9f9l:A, 9f9l:C, 9f9m:A, 9f9m:C, 4p0p:A, 4p0r:A, 4p0r:C, 4p0s:A, 4p0s:G, 4p0s:E, 4p0s:C
2	1j24:A	133	86	0.1497	0.2105	0.3256	0.001	1j25:A
3	2bgw:A	219	93	0.1711	0.1461	0.3441	0.092
4	8u2o:A	289	60	0.0963	0.0623	0.3000	1.0	9cmz:A, 9cmz:B, 9cmz:C, 8u2o:B
5	7oni:H	380	72	0.1123	0.0553	0.2917	2.4
6	4ecg:A	368	37	0.0588	0.0299	0.2973	4.5
7	6en3:A	934	94	0.1283	0.0257	0.2553	6.0	8a49:C, 4nuy:A, 4nuz:A
8	7a62:C	393	33	0.0642	0.0305	0.3636	6.9	7a62:A, 7a62:B, 7a62:D, 8abx:A, 7ah4:A, 7ah4:B, 7ah5:A, 7ah5:B, 7ah6:A, 7ah6:B, 6azu:A, 6azu:B, 6azu:C, 6azu:D, 6azv:A, 6azv:B, 6azv:C, 6azv:D, 6azw:A, 6azw:B, 7b1o:A, 7b1o:B, 6cxu:A, 6cxu:B, 6cxv:A, 6cxv:B, 2d0t:A, 2d0t:B, 2d0u:A, 2d0u:B, 6dpq:A, 6dpq:B, 6dpr:A, 6dpr:B, 7e0o:A, 7e0o:B, 7e0p:A, 7e0p:B, 7e0q:A, 7e0q:B, 7e0s:A, 7e0s:B, 7e0t:A, 7e0t:B, 7e0u:A, 7e0u:B, 6e35:A, 6e35:B, 6e40:A, 6e40:B, 6e40:C, 6e40:D, 6e41:A, 6e41:B, 6e41:C, 6e41:D, 6e42:A, 6e42:B, 6e42:C, 6e42:D, 6e43:A, 6e43:B, 6e43:C, 6e43:D, 6e44:A, 6e44:B, 6e44:C, 6e44:D, 6e45:A, 6e45:B, 6e45:C, 6e45:D, 6e46:A, 6e46:B, 6e46:C, 6e46:D, 5ek2:A, 5ek2:B, 5ek3:A, 5ek3:B, 5ek4:A, 5ek4:B, 5etw:A, 5etw:B, 6f0a:A, 6f0a:C, 8fur:A, 8fur:B, 8fur:C, 8fur:D, 8i7l:A, 8i7l:B, 6kof:A, 6kof:B, 6kps:A, 6kps:B, 6kw7:A, 6kw7:B, 7m63:A, 7m63:B, 7m7d:A, 7m7d:B, 6mq6:A, 6mq6:B, 7nge:A, 7nge:B, 7nge:C, 7nge:D, 6o3i:A, 6o3i:B, 7p0n:A, 7p0n:B, 7p0n:C, 7p0n:D, 7p0r:A, 7p0r:B, 7p0r:C, 7p0r:D, 4pk5:A, 4pk5:B, 4pk6:A, 4pk6:B, 6pu7:A, 6pu7:B, 6pz1:A, 6pz1:B, 6r63:A, 6r63:B, 7rrb:A, 7rrb:B, 7rrc:A, 7rrc:B, 7rrd:A, 7rrd:B, 4u72:A, 4u72:B, 4u74:A, 4u74:B, 6ubp:A, 6ubp:B, 6v52:A, 6v52:B, 5whr:A, 5whr:B, 6wjy:A, 6wjy:B, 5wmu:A, 5wmu:B, 5wmv:A, 5wmv:B, 5wmw:A, 5wmw:B, 5wmx:A, 5wmx:B, 5wn8:A, 5wn8:B, 6wpe:A, 6wpe:B, 6x5y:A, 6x5y:B, 5xe1:A, 5xe1:B, 7yxt:A, 7yxt:B, 7yxt:C, 7yxt:D, 7z2l:A, 7z2l:B, 7z2l:D, 7z2l:C, 7zv3:A, 7zv3:B
9	5tth:B	621	104	0.1604	0.0483	0.2885	7.5	6d14:B, 7exp:B, 4ipe:B, 4iyn:B, 4j0b:B, 5tvu:B, 5tvw:B, 5tvx:B
10	1s7g:A	252	60	0.0963	0.0714	0.3000	8.5	1ma3:A, 1s7g:B, 1s7g:C, 1s7g:D, 1s7g:E, 4twj:A, 1yc2:A, 1yc2:B, 1yc2:C, 1yc2:D, 1yc2:E
11	4jrf:A	479	16	0.0481	0.0188	0.5625	9.8

[Back]