BioLiP

>protein
PLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKYSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGK
MITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSR

The query sequence (length=110) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5cxt:K	113	110	1.0000	0.9735	1.0000	7.14e-82	5cxt:A, 5cxt:C, 5cxt:E, 5cxt:G, 5cxt:I, 5cxt:M, 5cxt:O, 5cxt:Q, 4oz1:B, 4oz1:A, 4ru2:A, 4ru2:C, 4ru2:E, 4ru2:G, 4ru2:I, 4ru2:K, 4ru2:M, 4ru2:O, 4ru2:Q
2	6slo:A	214	94	0.2455	0.1262	0.2872	1.59e-06	6lur:B, 6lur:C, 6lur:D, 6lur:A, 6lur:E, 6slo:C, 6slo:D
3	7sn6:B	105	98	0.2455	0.2571	0.2755	5.87e-06	1o0p:A, 1opi:A, 7sn6:A
4	7evo:D	200	77	0.2182	0.1200	0.3117	1.98e-05	8hk1:D, 6n3e:A, 6n3f:C, 6nsx:A
5	6hip:A	104	99	0.2455	0.2596	0.2727	2.05e-04	6hip:B, 5lso:A, 5lso:B, 2peh:A, 2peh:B
6	1jmt:A	98	36	0.1545	0.1735	0.4722	0.010
7	7c06:A	193	67	0.1727	0.0984	0.2836	0.21	7c06:G, 7c06:D, 7c06:J, 7c06:M, 7c06:P, 7c06:S, 7c06:V, 7c06:Y, 7c07:A, 7c07:G, 7c07:D, 7c07:J, 7c07:M, 7c07:P, 7c07:S, 7c07:V, 7c07:Y, 7c08:A, 7c08:G, 7c08:D, 7c08:J, 7c08:M, 7c08:P, 7c08:S, 7c08:V, 7c08:Y, 4yh8:A
8	5acf:A	235	63	0.1727	0.0809	0.3016	2.1	5acg:A, 5ach:A, 5aci:A, 5acj:A, 8e1w:A, 5n04:A, 5n05:A, 7nim:A, 7nin:A, 5nkw:A, 5nln:A, 5nlo:A, 5nlp:A, 5nlq:A, 5nlr:A, 5nls:A, 7pqr:A, 7ptz:AAA, 7pxi:A, 7pxj:A, 7pxk:A, 7pxl:A, 7pxm:A, 7pxn:A, 7pxr:A, 7pxs:A, 7pxt:A, 7pxu:A, 7pxv:A, 7pxw:A, 7pyd:A, 7pye:A, 7pyf:A, 7pyg:A, 7pyh:A, 7pyi:A, 7pyl:A, 7pym:A, 7pyn:A, 7pyo:A, 7pyp:A, 7pyq:A, 7pyu:A, 7pyw:A, 7pyx:A, 7pyy:A, 7pyz:A, 7pz0:A, 6ydg:A
9	7qde:B	169	38	0.1000	0.0651	0.2895	2.1	7qdd:B
10	2yfn:A	719	79	0.1636	0.0250	0.2278	2.4	2yfo:A
11	1lrt:A	338	49	0.1636	0.0533	0.3673	4.5	1lrt:B, 1lrt:C
12	1me7:A	365	49	0.1636	0.0493	0.3673	5.3	1lrt:D, 1me8:A, 1me9:A, 1meh:A, 1mei:A, 1mew:A, 1pvn:A, 1pvn:B, 1pvn:C, 1pvn:D
13	7olc:LG	235	19	0.0818	0.0383	0.4737	5.5	8i9p:LG, 8i9r:LG, 8i9t:LG, 8i9v:LG, 8i9w:LG, 8i9x:LG, 8i9y:LG, 8i9z:LG, 8ia0:LG, 7old:LG, 8oo0:LG, 8pv1:LG, 8pv2:LG, 8pv3:LG, 8pv4:LG, 8pv5:LG, 8pv6:LG, 8pv7:LG, 8pv8:LG, 8pvk:LG, 8pvl:LG, 7z3n:LG, 7z3o:LG
14	3a9l:A	207	58	0.1091	0.0580	0.2069	5.6	3a9l:B
15	2h89:D	102	24	0.0909	0.0980	0.4167	7.8	2fbw:D, 2fbw:Q, 2h88:D, 2h88:Q, 6myo:D, 6myp:D, 6myq:D, 6myr:D, 6mys:D, 6myt:D, 6myu:D, 2wqy:D, 2wqy:Q, 1yq3:D, 1yq4:D
16	6s1c:F	299	33	0.1000	0.0368	0.3333	7.8
17	3bg6:A	577	29	0.0909	0.0173	0.3448	8.2	3bg6:B, 3bg6:C, 3bg6:D, 3bg6:E, 3bg6:F, 3bg6:G, 3bg6:H, 3bg7:A, 3bg7:B, 3bg7:C, 3bg7:D, 3bg7:E, 3bg7:F, 3bg7:G, 3bg7:H, 3bly:A, 2f5v:A, 2f6c:A, 3fdy:A, 2igk:A, 2igk:B, 2igk:C, 2igk:D, 2igk:E, 2igk:F, 2igk:G, 2igk:H, 2igm:A, 2igm:B, 2igm:D, 2igm:C, 2igm:E, 2igm:F, 2igm:G, 2igm:H, 2ign:A, 2ign:B, 2ign:D, 2ign:C, 2ign:E, 2ign:F, 2ign:H, 2ign:G, 2igo:A, 2igo:B, 2igo:D, 2igo:C, 2igo:E, 2igo:F, 2igo:H, 2igo:G, 3k4b:A, 3k4c:A, 3k4c:B, 3k4c:C, 3k4c:D, 3k4j:A, 3k4k:A, 3k4l:A, 3k4l:B, 3k4m:A, 3k4m:B, 3k4m:C, 3k4m:D, 3k4m:E, 3k4m:F, 3k4m:G, 3k4m:H, 3k4n:A, 3k4n:B, 3lsh:A, 3lsh:B, 3lsh:C, 3lsh:D, 3lsi:A, 3lsi:B, 3lsk:A, 3lsk:B, 3lsk:C, 3lsk:D, 3lsm:A, 3lsm:B, 4moe:A, 4moe:B, 4moe:C, 4moe:D, 4mof:A, 4mog:A, 4moh:A, 4moi:A, 4moi:B, 4moj:A, 4moj:B, 4moj:C, 4moj:D, 4mok:A, 4mok:B, 4mok:C, 4mok:D, 4mol:A, 4mol:B, 4mol:C, 4mol:D, 4mom:A, 4mom:B, 4mom:C, 4mom:D, 4moo:A, 4mop:A, 4mop:B, 4mop:C, 4mop:D, 4moq:A, 4moq:B, 4mor:A, 4mor:B, 4mor:C, 4mor:D, 4mos:A, 3pl8:A, 1tt0:A, 1tt0:B, 1tt0:C, 1tt0:D, 1tzl:A, 1tzl:B, 1tzl:C, 1tzl:D, 1tzl:E, 1tzl:F, 1tzl:G, 1tzl:H
18	3esb:A	199	53	0.1455	0.0804	0.3019	8.4	3ef3:A, 3esa:A, 3esa:B, 3esc:A, 3esd:A, 1oxm:A, 1oxm:B, 1xzc:A, 1xzk:A, 1xzk:B, 1xzl:A, 1xzm:A
19	8twa:B	171	33	0.1000	0.0643	0.3333	8.9

[Back]