BioLiP

>protein
PLAAGAVILRRFAFNAAEQLIRDINDVASQSPFRQMVTPGGYTMSVAMTNCGHLGWTTHRQGYLYSPIDPQTNKPWPAMP
QSFHNLCQRAATAAGYPDFQPDACLINRYAPGAKLSLHQDKCEPDLRAPIVSVSLGLPAIFQFGGLKRNDPLKRLLLEHG
DVVVWGGESRLFYHGIQPLKAGFHPLTIDCRYNLTFRQAGK

The query sequence (length=201) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2fdj:A	207	201	0.9950	0.9662	0.9950	4.49e-151	3bi3:A, 3bie:A, 3bkz:A, 2fd8:A, 2fdf:A, 2fdg:A, 2fdh:A, 2fdi:A, 2fdk:A, 3i2o:A, 3i3m:A, 3i3q:A, 3i3q:B, 3i49:A, 4jht:A, 3khb:A, 3khb:B, 3khc:B, 3khc:A, 4nid:A, 4nig:A, 4nih:A, 4nii:A, 7nro:A, 3o1m:A, 3o1o:A, 3o1p:A, 3o1r:A, 3o1s:A, 3o1t:A, 3o1u:A, 3o1v:A, 4rfr:B, 3t3y:A, 3t4h:B, 3t4v:A, 6y0q:A, 6ypv:A, 4zhn:A
2	5xoi:A	227	227	0.3632	0.3216	0.3216	2.01e-20	5xeg:A
3	6imc:D	340	98	0.1791	0.1059	0.3673	3.08e-15	6imc:A, 6imc:B, 6imc:C, 6ksf:A, 6l94:A
4	8k62:A	326	98	0.1642	0.1012	0.3367	1.55e-14	6ie2:A, 6ie2:B, 6ie2:C, 6ie2:D, 6ie2:E, 6ie2:F, 6ie2:G, 6ie2:H, 6ie3:A
5	3tht:B	312	125	0.1990	0.1282	0.3200	0.001	3thp:A, 3tht:A, 3tht:C, 3tht:D
6	4npl:A	213	96	0.1393	0.1315	0.2917	0.29	4npl:B, 4npm:A, 4npm:B
7	6riw:A	923	71	0.0995	0.0217	0.2817	0.54
8	4yn3:A	596	31	0.0498	0.0168	0.3226	7.2	3vta:A, 3vta:B
9	3pa1:A	315	27	0.0597	0.0381	0.4444	8.9	5bsx:A, 5bsy:A, 6gw1:A, 6gw1:B, 6gw2:A, 6gw2:B, 6gy9:A, 6gy9:B, 5hza:A, 5hza:B, 5hzb:B, 5hzb:A, 3ony:A, 3ony:B, 3ony:C, 3pa1:B, 3pa2:A, 3pa2:B, 3q38:A, 3q39:A, 3q39:B, 3q3a:B, 3q3a:A, 3ry8:A, 8y6c:B, 8y6c:A, 8y6d:B, 8y6d:A, 4z4r:A, 4z4r:B, 4z4s:A, 4z4s:B, 4z4t:A, 4z4t:B, 4z4u:A, 4z4u:B, 4z4v:A, 4z4v:B, 4z4w:A, 4z4w:B, 4z4y:A, 4z4z:A, 4z4z:B
10	6dju:F	531	55	0.0846	0.0320	0.3091	9.0	6w6g:F
11	6otf:B	521	27	0.0597	0.0230	0.4444	9.7	6otf:A, 6otf:C, 6ouc:A

[Back]