Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PKTEKGKESLNKILDASVELIADKGFLSTSINDITSKAGVAYGLFYFYFKSKHDILDEIIRQFNRNMRYYLKTYTQNLDS
RIDVEKVGMKKFLEWMNENKKYYKIFIETQVHRPDIYKWHFMKLAERYTTGLSEAMRRGEIINVDPELLSYVLIGIAHML
GKRYVLWSNSGLTLKQQRDLDLIIENMLTPR

The query sequence (length=191) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6en8:C 191 191 1.0000 1.0000 1.0000 4.85e-142 6el2:A, 6el2:B, 6en8:D, 6en8:F, 6en8:A, 6en8:B, 6en8:E
2 2eh3:A 171 182 0.2618 0.2924 0.2747 1.24e-09
3 3whc:A 190 70 0.1309 0.1316 0.3571 1.29e-08 1vi0:A, 1vi0:B, 3whb:A, 3whb:B, 3whc:B, 3whc:C, 3whc:D, 3whc:E, 3whc:F
4 5gpc:A 190 76 0.1309 0.1316 0.3289 4.17e-08 5gpc:B, 5gpc:C, 5gpc:D
5 4l62:A 190 126 0.1832 0.1842 0.2778 2.47e-07 4l62:B, 4l62:C, 4l62:D, 4l62:E, 4l62:F, 4l62:G, 4l62:H, 4l62:I, 4l62:J, 4l62:K, 4l62:L, 4l62:M, 4l62:N, 4l62:O, 4l62:P
6 8svd:T 197 65 0.1099 0.1066 0.3231 4.53e-07 8sua:A, 8svd:A, 8svd:G, 8svd:F, 8svd:E, 8svd:I, 8svd:J, 8svd:K
7 5h58:B 204 77 0.1204 0.1127 0.2987 1.00e-06 5h58:A, 5h58:C, 5h58:D, 4pxi:A, 4pxi:B, 4pxi:C, 4pxi:D
8 8sva:A 200 65 0.1152 0.1100 0.3385 1.15e-06 8suk:D, 8suk:C, 8sva:F, 8sva:G, 8sva:T, 8t5y:A
9 4w97:A 196 53 0.0890 0.0867 0.3208 2.68e-06
10 5mym:C 205 180 0.2147 0.2000 0.2278 4.23e-06 4dw6:A, 5eyr:A, 5ezg:A, 5ezh:A, 5f04:A, 5f08:A, 5f0c:A, 5f0f:A, 5f0h:A, 5f1j:A, 5f27:A, 3g1l:A, 3g1m:A, 3g1o:A, 6hnx:A, 6hnz:A, 6ho0:A, 6ho1:A, 6ho2:A, 6ho3:A, 6ho4:A, 6ho5:A, 6ho6:A, 6ho7:A, 6ho8:A, 6ho9:A, 6hoa:A, 6hob:A, 6hoc:A, 6hod:A, 6hoe:A, 6hof:A, 5ioy:A, 5ioz:A, 5ip6:A, 5ipa:A, 5j1r:A, 5j1u:A, 5j1y:A, 5j3l:A, 4m3b:A, 4m3d:A, 4m3e:A, 4m3f:A, 4m3g:A, 5mwo:A, 5mxk:A, 5mxv:A, 5myl:A, 5mym:B, 5myn:A, 5myr:A, 5mys:A, 5myt:A, 5myw:A, 7ngd:A, 7ngg:C, 7ngi:A, 7ngj:A, 7ngk:A, 7ngm:A, 7ngn:A, 7ngo:A, 7ngr:A, 7ngs:A, 7ngt:A, 7ngu:A, 7ngw:A, 7ngx:A, 7ngy:A, 5nim:A, 5nio:A, 5niz:A, 5nj0:A, 5nz0:A, 5nz1:A, 5nz1:C, 5nz1:D, 3o8g:A, 3o8h:A, 3q0u:A, 3q0v:A, 3q0v:B, 3q0w:A, 3q3s:A, 6r1p:A, 6r1s:A, 3sdg:A, 3sfi:A, 3tp0:A, 1u9n:A, 1u9o:A, 1u9o:B
11 4i6z:B 200 45 0.0995 0.0950 0.4222 1.82e-05 4i76:A
12 5dy0:A 220 50 0.1047 0.0909 0.4000 2.24e-05 5dy0:B, 5dy0:C, 5dy0:D, 5dy1:A, 5dy1:B, 6gy3:A, 6gy3:B
13 3hth:B 173 120 0.1204 0.1329 0.1917 3.93e-05 3hth:A, 3hti:A, 3htj:A, 3htj:B
14 6srn:A 187 51 0.0785 0.0802 0.2941 4.19e-05
15 7ju3:B 203 90 0.1257 0.1182 0.2667 6.56e-05 8fw0:A, 8fw0:B, 8fw0:C, 8fw0:D, 8fw3:C, 8fw3:D, 8fw3:A, 8fw3:B, 8fw8:B, 8fw8:C, 8fw8:D, 7jnp:A, 7jnp:B, 7ju3:A, 8ssh:C, 8ssh:D, 8ssh:A, 8ssh:B
16 3p9t:A 213 105 0.1414 0.1268 0.2571 7.02e-05
17 5fmp:A 184 64 0.1047 0.1087 0.3125 8.19e-05 5aqc:A, 5aqc:B, 5cw8:A, 5cw8:B, 5cxi:A, 5cxi:B, 5fmp:B, 5ua1:B, 5ua1:A, 5ua2:A
18 6yl2:B 192 152 0.1780 0.1771 0.2237 8.36e-05 6yl2:A
19 6wp9:E 218 82 0.1257 0.1101 0.2927 1.08e-04 6wp9:A, 6wp9:B, 6wp9:C, 6wp9:D, 6wp9:F, 6wp9:G, 6wp9:H, 6wpa:A, 6wpa:B
20 3lsj:A 205 112 0.1257 0.1171 0.2143 1.33e-04 3lsj:B, 3lsp:A, 3lsr:A
21 7eqf:A 184 108 0.1204 0.1250 0.2130 1.89e-04 7eqf:B, 7eqf:C, 7eqf:D
22 3aqt:B 196 113 0.1152 0.1122 0.1947 2.21e-04 3aqt:A
23 6o6n:A 195 113 0.1204 0.1179 0.2035 0.001 6o6p:A, 6o6p:B
24 6hs0:B 201 162 0.1675 0.1592 0.1975 0.002 6c31:E, 6c31:F, 6c31:G, 6c31:H, 6c31:A, 6c31:B, 6c31:C, 6c31:D, 6hrw:A, 6hrx:A, 6hrx:B, 6hry:A, 6hry:B, 6hrz:A, 6hs0:A, 6hs1:B, 6hs2:B, 5icj:A, 5icj:B, 5n7o:A, 5n7o:B
25 5x3r:A 203 156 0.1675 0.1576 0.2051 0.002 7amn:B, 7amn:A, 7amt:B, 7amt:A, 5x3r:B, 5x3r:C, 5x3r:D
26 6ayh:A 192 49 0.0890 0.0885 0.3469 0.002
27 7xaq:B 201 145 0.1832 0.1741 0.2414 0.002 8hjb:A, 7xaq:D, 7xaq:H, 7xaq:A, 7xaq:G, 7xaq:C
28 6g8g:A 195 109 0.1309 0.1282 0.2294 0.004 6g8g:B, 6g8g:C, 6g8g:D, 6g8h:CCC, 6g8h:BBB
29 3ang:C 201 50 0.0838 0.0796 0.3200 0.008 3ang:D, 3ang:A, 3ang:B, 3anp:C, 3anp:D, 3anp:A, 3anp:B
30 5vl9:C 191 61 0.0838 0.0838 0.2623 0.009 5vl9:B, 5vl9:A, 5vl9:D, 5vlg:A, 5vlg:B, 5vlg:C, 5vlg:D, 5vlg:E, 5vlg:F, 5vlg:G, 5vlg:H, 5vlm:A, 5vlm:B, 5vlm:C, 5vlm:D, 5vlm:E, 5vlm:F, 5vlm:G, 5vlm:H
31 4jl3:C 182 58 0.0785 0.0824 0.2586 0.009 4jl3:A, 4jl3:B, 4jl3:D
32 3qbm:A 199 51 0.0785 0.0754 0.2941 0.011 3qbm:B
33 7xxn:A 198 131 0.1309 0.1263 0.1908 0.013 7xxt:A
34 8fgw:A 1081 106 0.1414 0.0250 0.2547 0.024
35 3hgy:A 202 55 0.1099 0.1040 0.3818 0.026 2qco:A, 3qqa:A
36 6ko7:C 186 83 0.1099 0.1129 0.2530 0.13 6ie8:A, 6ie9:A, 6ko7:A, 6ko7:B, 6ko7:D, 6ko9:A, 6ko9:B, 6ko9:C, 6ko9:D, 7n4w:A, 7n4z:A, 7n4z:C, 7n4z:B, 7n4z:D, 7n53:A, 7n53:B, 7n54:A, 7n54:B, 7n54:C, 7n54:D, 3vvy:A, 3vvy:B, 3vvy:C, 3vvy:D, 3vvz:A, 3vvz:B, 3vvz:C, 3vvz:D, 3vw0:B, 3vw0:D, 3vw1:B, 3vw1:D, 3vw2:A, 3vw2:B, 3vw2:C, 3vw2:D
37 5fgl:B 206 69 0.0890 0.0825 0.2464 0.17 5fgl:A, 5fgl:C, 5fgl:D, 5fgl:E, 5fgl:F
38 1jt0:A 188 50 0.0785 0.0798 0.3000 0.25 3bqz:A, 3br0:A, 3br1:A, 3br2:B, 3br2:A, 3br3:A, 3br5:A, 3br6:A, 3bt9:B, 3bt9:A, 3btc:A, 3bti:A, 3btj:B, 3btj:A, 3btl:A, 2g0e:D, 2gby:A, 1jt0:B, 1jt0:C, 1jt0:D, 1jt6:B, 1jt6:A, 1jtx:A, 1jty:A, 1jum:A, 1jup:A, 1jus:A, 3pm1:A, 1qvt:A, 1qvu:B, 1qvu:A, 1rkw:A, 1rpw:B
39 6z1b:B 202 50 0.0838 0.0792 0.3200 0.30 4jyk:A, 4jyk:B, 3loc:A, 3loc:B, 3loc:C, 3loc:D, 4xk4:A, 4xk4:B, 4xk4:C, 4xk4:D, 6z1b:A
40 5euf:B 416 68 0.0995 0.0457 0.2794 0.36 5euf:A
41 2i10:B 182 50 0.0785 0.0824 0.3000 0.38 2i10:A
42 3zqg:A 208 61 0.0733 0.0673 0.2295 0.54 4ac0:A, 2ns8:A, 2ns8:B, 2ns8:C, 2ns8:D, 6sy4:A, 6sy6:A, 3zqh:A, 3zqi:A, 3zqi:B
43 4aux:A 207 129 0.1361 0.1256 0.2016 0.79 4abz:AAA, 4b1r:A, 4b3a:A, 4d7m:A, 4d7n:A, 2fj1:A, 3fk7:A, 3fk7:B, 5fkk:A, 5fkk:B, 5fkl:A, 5fkm:A, 5fkn:A, 5fkn:B, 5fko:A, 6fpl:A, 6fpm:A, 2o7o:A, 1ork:A, 6qjw:A, 6qjx:A, 1qpi:A, 6rbl:A, 6rbm:A, 6rcr:A, 6rgx:B, 2tct:A, 2trt:A, 4v2g:A, 4v2g:B, 2vke:A, 2vkv:A, 2x6o:A, 2x9d:A, 2xb5:A, 2xpu:A, 2xpv:A, 2xpw:A, 2xrl:A, 6yr1:AAA, 6yr2:AAA, 6yr2:BBB
44 2y31:A 242 56 0.0733 0.0579 0.2500 0.85 2y30:A, 2y30:B, 2y31:B, 3zql:A, 3zql:B, 3zql:C, 3zql:D
45 3zqf:A 183 89 0.1099 0.1148 0.2360 1.0 6sy4:B, 6sy6:B
46 7acm:B 178 57 0.0838 0.0899 0.2807 1.5 7acm:A
47 8dh6:b 236 25 0.0576 0.0466 0.4400 1.6 8e7s:P, 8e7s:p, 8ec0:P, 6giq:b, 6hu9:b, 6hu9:n, 6t0b:b, 6t0b:o, 6t15:b, 6ymx:b, 6ymy:b, 7z10:b
48 6ywe:T 180 61 0.0942 0.1000 0.2951 2.8 6yws:T, 6ywv:T, 6ywx:T, 6ywy:T
49 4u8u:C 151 24 0.0576 0.0728 0.4583 5.6 4u8u:G, 4u8u:K, 4u8u:R, 4u8u:V, 4u8u:Z, 4u8u:g, 4u8u:k, 4u8u:o
50 8oo2:A 177 42 0.0628 0.0678 0.2857 5.9 8oo2:B
51 8a8j:B 341 47 0.0733 0.0411 0.2979 6.1 8a8j:A, 8a93:A, 8a93:B, 8bpr:A, 8bpr:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218