BioLiP

>protein
PKSMQCKVILLDGSEYTCDVEKRSRGQVLFDKVCEHLNLLEKDYFGLTYRDAENQKNWLDPAKEIKKQVRSGAWHFSFNV
KFYPPDPAQLSEDITRYYLCLQLRDDIVSGRLPCSFVTLALLGSYTVQSELGDYDPDECGSDYISEFRFAPNHTKELEDK
VIELHKSHRGMTPAEAEMHFLENAKKLSMYGVDLHHAKDSEGVEIMLGVCASGLLIYRDRLRINRFAWPKVLKISYKRNN
FYIKIRPGEFEQFESTIGFKLPNHRAAKRLWKVCVEHHTFFRLL

The query sequence (length=284) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5rym:A	284	284	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3bin:A, 5ryn:A, 5ryo:A, 5ryp:A, 5ryq:A, 5ryr:A, 5rys:A, 5ryt:A, 5ryu:A, 5ryv:A, 5ryw:A, 5ryx:A, 5ryy:A, 5ryz:A, 5rz0:A, 5rz1:A, 5rz2:A, 5rz3:A, 5rz4:A, 5rz5:A, 5rz6:A, 5rz7:A, 5rz8:A, 5rz9:A, 5rza:A, 5rzb:A, 5rzc:A, 5rzd:A, 5rze:A, 5rzf:A, 5rzg:A, 5rzh:A, 5rzi:A, 5rzj:A, 5rzk:A, 5rzl:A, 5rzm:A, 5rzn:A, 5rzo:A, 5rzp:A, 5rzq:A, 5rzr:A, 5rzs:A, 5rzt:A, 5rzu:A, 5rzv:A, 5rzw:A, 5rzx:A, 5rzy:A, 5rzz:A, 5s00:A
2	8cir:B	345	295	0.3169	0.2609	0.3051	1.87e-38	8cir:A, 8cis:A, 6txs:AAA
3	2ems:A	316	295	0.3204	0.2880	0.3085	4.16e-38	2d10:A, 2d10:B, 2d10:C, 2d10:D, 2d11:A, 2d11:B, 2d11:C, 2d11:D, 2emt:A, 2emt:B, 1gc6:A, 1j19:A, 3x23:A, 2yvc:A, 2yvc:B, 2yvc:C, 2zpy:A
4	6cds:A	325	296	0.3169	0.2769	0.3041	1.09e-36	6cds:B, 7lwh:A, 4p7i:A, 4p7i:B, 3wa0:A, 3wa0:B, 3wa0:C, 3wa0:E, 3wa0:F, 4zri:A, 4zri:B, 4zrk:A, 4zrk:C, 4zrk:B, 4zrk:D
5	6mfs:A	370	204	0.1725	0.1324	0.2402	5.20e-11	2g35:A, 2k00:A, 1mk7:B, 1mk7:D, 1mk9:B, 1mk9:D, 1mk9:F, 1mk9:H, 2mwn:B, 1y19:B, 1y19:D, 1y19:F, 1y19:H, 1y19:J, 1y19:L
6	8tec:A	448	63	0.0528	0.0335	0.2381	5.2	8tee:A, 8tee:B
7	6ck1:A	375	26	0.0458	0.0347	0.5000	6.8	6ck1:B, 6ck1:C, 6ck1:D
8	3c3x:A	310	71	0.0634	0.0581	0.2535	7.4	3c3x:B, 2qw8:A, 2qw8:B, 2qx7:A, 2qx7:B, 2qzz:A, 2qzz:B, 2r2g:A, 2r2g:B, 2r6j:A, 2r6j:B
9	5o6c:A	252	119	0.1127	0.1270	0.2689	7.5	6t7f:A
10	8jqt:A	271	145	0.1056	0.1107	0.2069	7.8
11	6td3:B	333	54	0.0563	0.0480	0.2963	9.3	5acb:C, 5acb:D, 6b3e:A, 6b3e:C, 8bu1:B, 8bu1:E, 8bu1:H, 8bu2:B, 8bu2:E, 8bu2:H, 8bu3:B, 8bu3:E, 8bu3:H, 8bu4:B, 8bu4:E, 8bu4:H, 8bu5:B, 8bu5:E, 8bu5:H, 8bu6:H, 8bu6:E, 8bu6:B, 8bu7:B, 8bu7:E, 8bu7:H, 8bu9:B, 8bu9:E, 8bu9:H, 8bua:B, 8bua:E, 8bua:H, 8bub:B, 8bub:E, 8bub:H, 8buc:B, 8buc:E, 8buc:H, 8bud:B, 8bud:E, 8bud:H, 8bue:B, 8bue:E, 8bue:H, 8buf:B, 8buf:E, 8buf:H, 8bug:B, 8bug:E, 8bug:H, 8buh:B, 8buh:E, 8buh:H, 8bui:B, 8bui:E, 8bui:H, 8buj:B, 8buj:E, 8buj:H, 8buk:B, 8buk:E, 8buk:H, 8bul:B, 8bul:E, 8bul:H, 8bum:B, 8bum:E, 8bum:H, 8bun:B, 8bun:E, 8bun:H, 8buo:B, 8buo:E, 8buo:H, 8bup:B, 8bup:E, 8bup:H, 8buq:B, 8buq:E, 8buq:H, 8bur:E, 8bur:B, 8bur:H, 8bus:E, 8bus:B, 8bus:H, 8but:B, 8but:E, 8but:H, 6ckx:A, 6ckx:C, 4cxa:A, 4nst:A, 4nst:C, 7nxk:A, 7nxk:C, 8p81:A, 6td3:E, 6td3:H
12	7bre:A	179	20	0.0387	0.0615	0.5500	9.8	7bre:D, 5f6l:B, 7w6a:A, 7w6j:A, 4x8n:A, 4x8p:A

[Back]