Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PKPILYYDERSPPVRSCLMLIKLLDIDVELRFVNLFKGEQFQKDFLALNPQHSVPTLVHGDLVLTDSHAILIHLAEKFDE
GGSLWPQEHAERMKVLNLLLFECSFLFRRDSDFMSAIVRQGFANVDVAHHERKLTEAYIIMERYLENSDFMAGPQLTLAD
LSIVTTLSTVNLMFPLSQFPRLRRWFTAMQQLDAYEANCSGLEKLRQTMESVGSFQFP

The query sequence (length=218) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6t2t:A 229 218 0.9954 0.9476 0.9954 3.09e-164 7dax:A, 7dax:B, 7day:A, 7day:B, 7daz:A, 7daz:B, 7db0:A, 7db0:B, 7db1:A, 7db1:B, 7db2:A, 7db2:B, 7db3:A, 7db3:B, 7db4:A, 7db4:B, 6ken:AA, 6ken:BA, 6keo:AA, 6keo:BA, 6kep:AA, 6kep:BA, 6ker:AA, 6ker:BA
2 7ebt:B 222 216 0.4220 0.4144 0.4259 1.98e-53 7ebt:A, 7ebt:C, 7ebt:D, 7ebu:A, 7ebu:B, 7ebu:C, 7ebu:D, 7ebv:A, 7ebv:B, 7ebv:C, 7ebv:D, 7ebw:A, 7ebw:B, 7ebw:C, 7ebw:D
3 3vwx:C 220 215 0.3532 0.3500 0.3581 9.63e-39 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
4 4png:B 223 207 0.3349 0.3274 0.3527 3.77e-36 4png:A
5 3wyw:B 214 215 0.3211 0.3271 0.3256 4.83e-34 3wyw:A
6 4hi7:A 220 214 0.3165 0.3136 0.3224 4.90e-34 4hi7:B
7 5zwp:A 207 207 0.3028 0.3188 0.3188 4.45e-33 5zwp:B
8 7rhp:A 215 209 0.3165 0.3209 0.3301 5.18e-33
9 4gsn:B 220 200 0.3028 0.3000 0.3300 5.23e-33
10 3zmk:B 222 203 0.3073 0.3018 0.3300 8.99e-33 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
11 1jlv:A 207 206 0.2936 0.3092 0.3107 9.42e-33 1jlv:B, 1jlv:C, 1jlv:D, 1jlv:E, 1jlv:F
12 1pn9:A 209 205 0.2982 0.3110 0.3171 3.19e-32 1pn9:B
13 3mak:A 208 209 0.2890 0.3029 0.3014 1.28e-31 3ein:A
14 5ft3:B 221 209 0.3165 0.3122 0.3301 2.62e-31 5ft3:A
15 1r5a:A 214 207 0.3119 0.3178 0.3285 2.26e-30
16 4pnf:B 221 208 0.3028 0.2986 0.3173 6.30e-30 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
17 4i97:A 207 206 0.2615 0.2754 0.2767 1.59e-28 4i97:B
18 9f7k:A 222 200 0.2890 0.2838 0.3150 3.76e-28 9f7k:B
19 3gh6:A 209 210 0.2706 0.2823 0.2810 4.12e-26
20 4e8h:B 216 193 0.2523 0.2546 0.2850 2.93e-25 4e8h:A, 4e8h:C, 4e8h:D
21 3f63:A 218 190 0.2706 0.2706 0.3105 1.97e-23 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
22 1v2a:B 209 183 0.2523 0.2632 0.3005 5.58e-22 1v2a:A, 1v2a:C, 1v2a:D
23 2c3q:A 239 170 0.2477 0.2259 0.3176 1.17e-17 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
24 4mpg:B 252 189 0.2661 0.2302 0.3069 9.72e-16 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
25 3qaw:A 219 164 0.2156 0.2146 0.2866 5.56e-14
26 7rka:A 211 188 0.2156 0.2227 0.2500 1.09e-13
27 8ai8:A 183 195 0.2339 0.2787 0.2615 1.49e-12 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
28 4kdx:A 207 162 0.2294 0.2415 0.3086 1.78e-12 4kdx:B
29 4ivf:F 227 214 0.2523 0.2423 0.2570 2.92e-12 4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H
30 4f0c:A 228 199 0.2064 0.1974 0.2261 3.22e-11 5o00:A
31 4nhw:D 217 157 0.1927 0.1935 0.2675 9.87e-10 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
32 5uun:A 286 169 0.2018 0.1538 0.2604 1.07e-09 5uun:B, 5uuo:B, 5uuo:A
33 6ezy:B 212 157 0.2248 0.2311 0.3121 1.43e-09 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
34 1fw1:A 208 211 0.2477 0.2596 0.2559 1.73e-09
35 4mzw:A 270 100 0.1606 0.1296 0.3500 5.19e-09 4mzw:B
36 4pua:A 261 108 0.1651 0.1379 0.3333 6.09e-09
37 5f06:A 213 214 0.2431 0.2488 0.2477 8.10e-09 5f06:B
38 3lsz:A 223 162 0.2064 0.2018 0.2778 8.40e-09 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
39 3m3m:A 201 194 0.2202 0.2388 0.2474 9.55e-09
40 5hfk:A 207 186 0.2064 0.2174 0.2419 1.28e-08 3gx0:A, 5hfk:B
41 5a4u:A 211 202 0.2248 0.2322 0.2426 2.66e-08 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
42 4q5q:A 218 145 0.1697 0.1697 0.2552 4.26e-08 4q5q:B
43 4l8e:A 203 208 0.2018 0.2167 0.2115 7.37e-08
44 1jzr:A 234 192 0.2385 0.2222 0.2708 8.14e-08 1k0a:A, 1k0a:B, 1k0b:A, 1k0c:A, 1k0c:B, 1k0d:A, 1k0d:B
45 3c8e:A 284 171 0.2110 0.1620 0.2690 1.18e-07 3c8e:B
46 8agq:A 213 148 0.2110 0.2160 0.3108 1.75e-07 5f07:A
47 4zba:A 222 161 0.1697 0.1667 0.2298 2.83e-07 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
48 4iel:B 206 190 0.2248 0.2379 0.2579 3.24e-07 4iel:A
49 1jzr:C 255 235 0.2615 0.2235 0.2426 3.34e-07 1k0b:C, 1k0c:C, 1k0c:D, 1k0d:C
50 2cz2:A 212 196 0.2248 0.2311 0.2500 4.38e-07
51 4ikh:A 227 223 0.2248 0.2159 0.2197 4.42e-07
52 6nv6:B 207 203 0.2248 0.2367 0.2414 4.76e-07
53 5f05:C 211 145 0.1972 0.2038 0.2966 6.14e-07 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
54 3uar:A 203 182 0.2156 0.2315 0.2582 7.16e-07
55 4pxo:A 216 85 0.1560 0.1574 0.4000 9.20e-07 4pxo:B
56 4hz2:B 206 162 0.2248 0.2379 0.3025 1.28e-06 4hz2:A
57 6tah:B 213 169 0.1972 0.2019 0.2544 1.89e-06 4ecj:A, 4ecj:B, 6tah:AAA, 6tah:CAA, 6tah:DAA
58 4mf6:A 240 227 0.2156 0.1958 0.2070 1.97e-06 4mf5:A
59 4ri6:A 214 209 0.2018 0.2056 0.2105 1.98e-06 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
60 4zb6:D 220 194 0.1972 0.1955 0.2216 6.17e-06 4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
61 4kh7:B 212 179 0.1881 0.1934 0.2291 1.02e-05 4kh7:A
62 1bye:A 213 191 0.2110 0.2160 0.2408 1.21e-05 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
63 4iw9:B 215 176 0.2156 0.2186 0.2670 2.06e-05 4iw9:A, 4iw9:C
64 4zb8:A 220 193 0.1881 0.1864 0.2124 9.66e-05 4zbd:A, 4zbd:B
65 1pmt:A 201 180 0.2064 0.2239 0.2500 1.15e-04 2pmt:A, 2pmt:B, 2pmt:C, 2pmt:D
66 4qq7:A 204 100 0.1468 0.1569 0.3200 1.58e-04 4qq7:B
67 3n5o:A 228 185 0.2248 0.2149 0.2649 1.86e-04
68 7dwe:A 212 178 0.1972 0.2028 0.2416 5.58e-04 7dwg:A
69 1c72:A 217 159 0.1927 0.1935 0.2642 8.80e-04 1c72:B, 1c72:C, 1c72:D, 1gsu:A, 1gsu:B
70 2v6k:A 214 185 0.2156 0.2196 0.2541 0.001 2jl4:A, 2jl4:B, 2v6k:B
71 3erg:A 208 203 0.2248 0.2356 0.2414 0.001 3erg:B, 3ibh:A
72 4jbb:A 208 128 0.1468 0.1538 0.2500 0.001
73 8ix7:B 221 181 0.1835 0.1810 0.2210 0.002 8ix7:A
74 5elg:A 212 190 0.2156 0.2217 0.2474 0.002
75 4nhz:H 246 107 0.1422 0.1260 0.2897 0.002 4nhz:A, 4nhz:B, 4nhz:C, 4nhz:D, 4nhz:E, 4nhz:F, 4nhz:G, 4nhz:I, 4nhz:J, 4nhz:K, 4nhz:L, 4nhz:M, 4nhz:N, 4nhz:O, 4nhz:P
76 4g9h:A 202 157 0.1560 0.1683 0.2166 0.003 4g9h:B, 4gci:A, 4gci:B
77 4xt0:A 243 58 0.0963 0.0864 0.3621 0.003
78 4mk3:A 203 173 0.1789 0.1921 0.2254 0.003
79 4q5f:D 206 171 0.2018 0.2136 0.2573 0.004 4q5f:A
80 4gf0:A 208 51 0.0826 0.0865 0.3529 0.005 4gf0:B
81 4nax:A 237 177 0.1743 0.1603 0.2147 0.006 4nax:B
82 4pqh:A 214 192 0.2018 0.2056 0.2292 0.007 4pqh:B
83 5agy:A 219 151 0.1422 0.1416 0.2053 0.009 5agy:B, 4chs:A, 4chs:B, 4top:A, 4top:B, 2vo4:A, 2vo4:B
84 7y55:A 224 163 0.1606 0.1562 0.2147 0.012 7y55:B, 7y55:C, 7y55:D
85 4hoj:A 197 74 0.0963 0.1066 0.2838 0.013
86 1f2e:A 201 165 0.1972 0.2139 0.2606 0.017 1f2e:B, 1f2e:C, 1f2e:D
87 2aaw:C 211 157 0.1743 0.1801 0.2420 0.017 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
88 8a0p:A 216 179 0.1972 0.1991 0.2402 0.019 8a08:A, 8a0i:A, 8a0o:A, 8a0q:A, 8a0r:A, 7zvp:A, 7zzn:A
89 4ai6:A 2650 154 0.1881 0.0155 0.2662 0.019 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
90 3ppu:A 314 99 0.1147 0.0796 0.2525 0.028
91 2x64:B 207 33 0.0734 0.0773 0.4848 0.029 2x64:A, 2x64:C, 2x64:D, 2x64:E, 2x64:F
92 1b48:A 221 202 0.2339 0.2308 0.2525 0.035 1b48:B
93 5ech:B 214 147 0.1422 0.1449 0.2109 0.059 5ech:C, 5ech:E, 5ech:F, 5eci:B, 5eci:C, 5eci:E, 5eci:F, 5eck:B, 5eck:C, 5eck:E, 5eck:F, 5ecl:B, 5ecl:C, 5ecl:E, 5ecl:F, 5ecm:B, 5ecm:C, 5ecm:E, 5ecm:F, 5ecn:B, 5ecn:C, 5ecn:E, 5ecn:F, 5eco:B, 5eco:C, 5eco:E, 5eco:F, 5ecp:B, 5ecp:C, 5ecp:E, 5ecp:F, 5ecq:B, 5ecq:C, 5ecq:E, 5ecq:F, 5ecr:B, 5ecr:C, 5ecr:E, 5ecr:F, 5ecs:A, 5ecs:B
94 6m1t:A 201 161 0.1927 0.2090 0.2609 0.066 6m1t:B
95 2ycd:A 213 83 0.1009 0.1033 0.2651 0.072
96 6zb6:C 227 165 0.1789 0.1718 0.2364 0.097 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
97 3tou:A 212 170 0.1789 0.1840 0.2294 0.11 3tou:B
98 5f8b:A 215 167 0.1606 0.1628 0.2096 0.13 5fhi:A
99 4f0b:A 220 219 0.1881 0.1864 0.1872 0.14 4f0b:B
100 4g0k:A 327 146 0.1606 0.1070 0.2397 0.15 4g0k:B, 4g0l:A, 4g0l:B, 3r3e:A, 3r3e:B
101 3ubl:A 212 131 0.1422 0.1462 0.2366 0.20 3ubl:B
102 6hiv:DB 1111 77 0.1239 0.0243 0.3506 0.23 6hiw:DB, 6hiz:DB, 7pua:DB
103 1tu7:A 208 72 0.0963 0.1010 0.2917 0.28 1tu7:B, 1tu8:A, 1tu8:B, 1tu8:C, 1tu8:D
104 6wmt:S 202 123 0.1330 0.1436 0.2358 0.35 6weg:D
105 7aia:AAA 259 77 0.0963 0.0811 0.2727 0.43
106 5d9v:A 211 126 0.1468 0.1517 0.2540 0.43 5d9w:A, 5d9x:A
107 5lol:A 207 126 0.1468 0.1546 0.2540 0.60
108 3wb2:A 160 68 0.1009 0.1375 0.3235 0.63 5d5q:A, 5d5q:B, 5d5q:C, 5d5q:D, 3wb0:A, 3wb0:B, 3wb0:C, 3wb0:D, 3wb2:B, 3wb2:C, 3wb2:D
109 4q5n:A 220 79 0.1239 0.1227 0.3418 1.0 4q5n:B
110 5j4u:A 218 157 0.1422 0.1422 0.1975 1.0 5j5n:A, 5j5n:B
111 3ic4:A 92 61 0.0688 0.1630 0.2459 1.5
112 5mye:A 212 158 0.1743 0.1792 0.2405 1.8 5n9u:A
113 3pr8:A 218 155 0.1651 0.1651 0.2323 1.8 3pr8:B, 3pr8:C, 3pr8:D
114 6gcb:A 293 55 0.0734 0.0546 0.2909 2.1 6gcb:B, 6gcc:A, 6gcc:B
115 2nto:A 201 37 0.0642 0.0697 0.3784 2.2 2pvq:A
116 5kej:A 222 83 0.1009 0.0991 0.2651 3.7 5g5f:A, 5kej:B
117 3iso:A 218 199 0.2064 0.2064 0.2261 4.2 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
118 5ewk:A 165 58 0.0688 0.0909 0.2586 4.2 5ewy:A, 5tlb:A
119 5d73:A 207 167 0.1468 0.1546 0.1916 5.1 5d73:B
120 7dw4:A 220 66 0.0872 0.0864 0.2879 7.1 7dw1:A, 7dw1:B
121 6to3:AAA 190 126 0.1284 0.1474 0.2222 7.3
122 6ks6:h 527 43 0.0688 0.0285 0.3488 8.6 6ks6:H, 4v81:G, 4v81:g, 4v8r:AH, 4v8r:Ah, 4v8r:BH, 4v8r:Bh, 4v94:G, 4v94:O, 4v94:g, 4v94:o, 7ylw:H, 7ylw:h, 7ylx:H, 7ylx:h, 7yly:H, 7yly:h
123 6wkr:C 606 51 0.0872 0.0314 0.3725 9.6 4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
124 5hyn:A 581 51 0.0872 0.0327 0.3725 9.8 5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218