Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PKALIVYGSTTGNTEYTAETIARELADAGYEVDSRDAASVEAGGLFEGFDLVLLGCSTWGDDSIELQDDFIPLFDSLEET
GAQGRKVACFGCGASSYEYFCGAVDAIEEKLKNLGAEIVQDGLRIDGDPRAARDDIVGWAHDVRGAI

The query sequence (length=147) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7ddz:A 437 146 0.9796 0.3295 0.9863 4.34e-100
2 5tgz:A 439 146 0.9796 0.3280 0.9863 6.67e-100 7v3z:A, 5xr8:A, 5xra:A
3 5zkp:A 436 146 0.9796 0.3303 0.9863 8.27e-100
4 7k15:A 455 146 0.9796 0.3165 0.9863 9.79e-100
5 7epe:A 389 146 0.9796 0.3702 0.9863 1.06e-99 7epf:A
6 6li0:A 441 146 0.9796 0.3265 0.9863 1.74e-99 6li1:A
7 5v57:A 645 146 0.9796 0.2233 0.9863 3.32e-96 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
8 4heq:A 145 143 0.5646 0.5724 0.5804 3.61e-54 4heq:B
9 3kap:A 147 142 0.4694 0.4694 0.4859 1.21e-44 3kaq:A
10 3f6r:A 147 142 0.4558 0.4558 0.4718 8.11e-42 3f6r:B, 3f6r:C, 3f6r:D, 3f6s:A, 3f6s:G, 3f6s:B, 3f6s:D, 3f6s:E, 3f6s:F, 3f6s:H, 3f6s:I, 3f90:A, 3f90:B, 3f90:D, 3f90:E, 3f90:F, 3f90:H, 3f90:I, 3f90:G
11 6gaq:A 146 134 0.3673 0.3699 0.4030 2.21e-22 6gaq:B
12 6fsg:A 147 129 0.2925 0.2925 0.3333 6.11e-20 6fsi:A, 6ft1:A
13 1czh:A 169 117 0.2925 0.2544 0.3675 2.46e-14 1czk:A, 1czl:A, 1czn:A, 1czo:A, 1czr:A, 1czu:A, 1d03:A, 1d04:A, 6kif:P, 6kif:X, 6kif:p, 1ofv:A
14 5lji:A 145 124 0.2721 0.2759 0.3226 6.15e-14 5lji:C
15 2fax:A 138 140 0.3061 0.3261 0.3214 6.84e-14 2fdx:A, 1fla:A, 1fld:A, 1fln:A, 2flv:A, 2fox:A, 1fvx:A, 2fvx:A, 3nll:A, 4nll:A, 5nll:A, 4nul:A, 5nul:A, 6nul:A, 5ull:A
16 2mok:A 176 118 0.3265 0.2727 0.4068 2.79e-13 1ag9:A, 1ag9:B, 1ahn:A
17 2mt9:A 173 117 0.2585 0.2197 0.3248 4.74e-09
18 8v2y:B 151 115 0.2449 0.2384 0.3130 9.91e-08
19 3esx:B 169 149 0.3061 0.2663 0.3020 1.62e-07 3esx:A, 3esy:A, 3esy:B, 3esy:C, 3esy:D, 3esz:A, 3esz:B, 1flv:A, 5ljp:A, 1obo:A, 1obo:B, 1obv:A, 1rcf:A, 2v5u:A, 2v5u:B, 2v5v:A, 2v5v:B
20 6j79:A 816 143 0.2653 0.0478 0.2727 7.33e-07 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
21 8snz:A 167 117 0.2517 0.2216 0.3162 1.89e-06 8snz:B, 8v2y:A
22 2fz5:A 137 117 0.2653 0.2847 0.3333 4.17e-06
23 4oxx:A 153 155 0.3401 0.3268 0.3226 4.56e-06
24 5veg:B 149 128 0.2109 0.2081 0.2422 9.47e-06 5veg:A, 5veg:C
25 5wid:A 144 128 0.2517 0.2569 0.2891 1.81e-05 5wid:B, 5wid:C
26 2bf4:A 645 120 0.2449 0.0558 0.3000 5.41e-04 2bf4:B, 2bn4:A, 2bn4:B, 2bpo:A, 2bpo:B
27 6efv:A 530 127 0.2517 0.0698 0.2913 7.98e-04 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
28 3fjo:A 603 120 0.2449 0.0597 0.3000 0.001 3qfs:A, 3qft:A
29 8dme:A 1034 143 0.2993 0.0426 0.3077 0.003 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
30 5k9b:A 179 154 0.2653 0.2179 0.2532 0.004 1yob:A, 1yob:B
31 1tll:A 630 162 0.2925 0.0683 0.2654 0.020 1f20:A, 1tll:B
32 6t1t:A 635 148 0.2381 0.0551 0.2365 0.11 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
33 3hr4:A 189 31 0.0952 0.0741 0.4516 0.15 3hr4:C, 3hr4:E, 3hr4:G
34 7d3e:C 1380 24 0.0816 0.0087 0.5000 0.22 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
35 5gxu:A 552 152 0.2789 0.0743 0.2697 0.32 5gxu:B
36 7ou8:AAA 714 49 0.1156 0.0238 0.3469 1.1 5abe:A, 5abe:B, 5abf:A, 5abf:B, 5abg:A, 5abg:B, 5abh:A, 5abh:B, 4ais:A, 4ais:B, 4aiu:A, 2chn:A, 2chn:B, 2cho:A, 2cho:B, 5fky:A, 5fky:B, 5fl0:A, 5fl0:B, 5fl1:A, 5fl1:B, 2j47:A, 2j4g:A, 2j4g:B, 2jiw:A, 2jiw:B, 7k41:A, 5mi4:A, 5mi5:A, 5mi6:A, 5mi7:A, 7ou8:BBB, 4ur9:A, 4ur9:B, 2vvn:A, 2vvn:B, 2vvs:A, 2w4x:A, 2w66:A, 2w66:B, 2w67:A, 2w67:B, 2wca:A, 2wzh:A, 2wzi:A, 2wzi:B, 2x0h:A, 2x0h:B, 2xj7:A, 2xj7:B, 2xm1:A, 2xm1:B, 2xm2:A, 2xm2:B
37 2m6s:A 149 77 0.1633 0.1611 0.3117 1.2
38 2a5l:B 175 50 0.1020 0.0857 0.3000 2.4 2a5l:A, 1zwl:A
39 6kr3:B 836 24 0.0612 0.0108 0.3750 2.9 5k5m:A
40 6kr2:A 857 24 0.0612 0.0105 0.3750 2.9 6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
41 7aih:L 178 48 0.0952 0.0787 0.2917 3.0 7am2:L, 7ane:L
42 3edo:A 151 84 0.1293 0.1258 0.2262 3.1 3edo:B
43 8t13:B 877 24 0.0612 0.0103 0.3750 3.2 3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
44 4h2d:A 158 118 0.2041 0.1899 0.2542 3.5 4h2d:B
45 7zlt:C 415 74 0.1769 0.0627 0.3514 3.5 3ivy:A, 3iw0:A, 3iw1:A, 3iw2:A, 7qke:A, 7qnn:A, 7qwn:A, 7qwn:B, 7qwn:C, 7r1i:A, 7r1i:B, 7r1i:C, 7r3u:A, 7r3u:B, 7r3u:C, 2x5l:A, 2x5w:A, 2xc3:A, 2xn8:A, 7yxf:A, 7yxf:B, 7yxf:C, 7zgl:A, 7zgl:B, 7zgl:C, 7zic:A, 7zic:B, 7zic:C, 7zlt:A, 7zlt:B, 7zlz:A, 7zlz:B, 7zlz:C, 7zqr:A, 7zqr:B, 7zqr:C, 7zsu:A, 7zsu:B, 7zsu:C, 7zt0:A, 7zt0:B, 7zxd:A, 7zxd:B, 7zxd:C
46 6hiv:AV 181 48 0.0952 0.0773 0.2917 4.5 7aoi:AV, 6hix:AV, 6yxx:AV, 6yxy:AV
47 1p9e:A 294 68 0.1293 0.0646 0.2794 4.9 1p9e:B
48 2pij:A 59 38 0.0952 0.2373 0.3684 6.0
49 2aph:A 165 80 0.1361 0.1212 0.2500 7.2 2aph:B, 1sk4:A, 1twq:A
50 8pz4:A 466 84 0.1429 0.0451 0.2500 8.4 7acg:A, 4afk:A, 4azl:A, 4azl:B, 4b61:A, 4b61:B, 8q2o:A, 3rbh:A, 3rbh:B, 8rqp:A, 4xnk:A, 4xnl:A
51 8g64:A 169 62 0.1156 0.1006 0.2742 9.6
52 4xpw:A 131 57 0.0952 0.1069 0.2456 10.0 4xpx:A, 4xpy:A, 4xq1:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218