BioLiP

>protein
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHV
IAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIE
IGVVGGEEDGVANEINEKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLP
ADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAE
ASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH

The query sequence (length=345) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4del:A	345	345	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4a22:A, 4a22:B, 4def:A, 3ekl:A, 3ekz:A, 3elf:A
2	4lv4:A	320	345	0.9275	1.0000	0.9275	0.0
3	3qm3:A	350	335	0.4029	0.3971	0.4149	2.13e-75	3qm3:B, 3qm3:C, 3qm3:D, 3qm3:E, 3qm3:F, 3qm3:G, 3qm3:H
4	1dos:A	358	337	0.3971	0.3827	0.4065	1.07e-72	1b57:A, 1b57:B, 1dos:B, 5vjd:A, 5vjd:B, 5vje:A, 5vje:B, 1zen:A
5	7rgn:A	340	340	0.3681	0.3735	0.3735	1.32e-59
6	5gk5:C	335	335	0.3565	0.3672	0.3672	1.19e-58	5gk3:A, 5gk3:B, 5gk4:A, 5gk4:B, 5gk5:A, 5gk5:B, 5gk5:D, 5gk5:E, 5gk5:F, 5gk5:G, 5gk5:H, 5gk6:A, 5gk6:B, 5gk7:A, 5gk7:B, 5gk8:A, 5gk8:B, 1gyn:A
7	7v6g:B	338	342	0.3826	0.3905	0.3860	1.42e-56	6lnk:A, 6lnk:B, 7v6f:A, 7v6f:B, 7v6g:A, 7yva:A, 7yva:B
8	3q94:A	285	332	0.2783	0.3368	0.2892	5.88e-23	3q94:B
9	4to8:A	279	319	0.2667	0.3297	0.2884	1.50e-21	4to8:B
10	8q5a:A	276	283	0.2464	0.3080	0.3004	8.58e-19	8q58:A
11	1rv8:B	305	339	0.2783	0.3148	0.2832	1.90e-17	1rv8:A, 1rv8:C, 1rv8:D, 1rvg:A, 1rvg:B, 1rvg:C, 1rvg:D
12	3gay:A	319	351	0.2551	0.2759	0.2507	2.06e-17	3gak:B, 3gay:B, 3gb6:A, 3gb6:B, 2isv:B, 2isw:A, 3ohi:A, 3ohi:B
13	8q59:A	280	277	0.2319	0.2857	0.2888	5.35e-17	8q57:A, 8q57:B, 8q59:B
14	3pm6:A	287	266	0.2290	0.2753	0.2970	5.98e-17
15	3n9s:A	307	342	0.2493	0.2801	0.2515	1.39e-13	3c4u:A, 3c4u:B, 3c52:A, 3c52:B, 3c56:A, 3c56:B, 3n9r:A, 3n9r:B, 3n9r:K, 3n9r:P, 3n9r:U, 3n9r:Z, 3n9r:e, 3n9r:j, 3n9s:B, 5uck:A, 5uck:B, 5ucn:A, 5ucn:B, 5ucp:A, 5ucp:B, 5ucs:A, 5ucs:B, 5ucz:A, 5ucz:B, 5ud0:B, 5ud2:A, 5ud2:B, 5ud3:A, 5ud3:B, 5ud4:A, 5ud4:B, 5vjf:A, 5vjf:B
16	1gvf:B	275	325	0.2290	0.2873	0.2431	4.35e-13	1gvf:A
17	2isv:A	298	335	0.2377	0.2752	0.2448	1.44e-12	3gak:A
18	5ud0:A	282	338	0.2406	0.2943	0.2456	1.46e-09	5ud1:A, 5ud1:B
19	6ofu:B	264	266	0.1884	0.2462	0.2444	5.98e-08	6ofu:A, 6ofu:C, 6ofu:D
20	3pm6:B	264	265	0.1971	0.2576	0.2566	7.41e-06
21	4q7f:A	510	66	0.0551	0.0373	0.2879	0.39	3qfk:A
22	2wnw:B	445	123	0.0754	0.0584	0.2114	2.7	2wnw:A
23	2yxx:A	385	87	0.0696	0.0623	0.2759	3.0
24	3c5q:A	394	53	0.0493	0.0431	0.3208	3.1	2qgh:A
25	5nr8:A	377	46	0.0406	0.0371	0.3043	6.3	1hki:A, 1hkj:A, 1hkk:A, 1hkm:A, 6jjr:A, 6jk6:A, 5nra:A, 5nrf:A, 1waw:A, 1wb0:A, 6ze8:A, 6ze8:B, 6ze8:C, 6ze8:D, 6ze8:E, 6ze8:F
26	8iyk:L	232	35	0.0435	0.0647	0.4286	8.7	8iyk:N, 8iyk:f, 8iyl:L, 8iyl:G, 8iyl:d, 8k35:J, 8k35:G, 8k35:N, 8xcg:L, 8xcg:N, 8xcg:f
27	1gl6:B	420	48	0.0435	0.0357	0.3125	9.0	1gki:A, 1gki:B, 1gki:D, 1gki:E, 1gki:F, 1gki:G, 1gl6:A, 1gl6:D, 1gl6:E, 1gl6:F, 1gl6:G, 1gl7:A, 1gl7:B, 1gl7:D, 1gl7:E, 1gl7:F, 1gl7:G
28	4mlm:A	188	84	0.0638	0.1170	0.2619	9.2	4mlm:B, 4mln:A, 4mln:B, 4n6w:A, 4n71:A, 4n71:B, 4n71:D, 4n71:E

[Back]