BioLiP

>protein
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFH
ETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSA
LAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACT
QKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENL
KAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY

The query sequence (length=349) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ald:A	363	348	0.9771	0.9394	0.9799	0.0	6ald:A, 6ald:B, 3dft:A, 3dft:B, 3dft:C, 3dft:D, 3lge:A, 3lge:B, 3lge:C, 3lge:D, 2ot0:A, 2ot0:B, 2ot0:C, 2ot0:D, 2ot1:A, 2ot1:B, 2ot1:C, 2ot1:D, 2quv:A, 2quv:B, 2quv:D, 5tle:A, 5tle:B, 5tle:C, 5tle:D, 5tlh:A, 5tlh:B, 5tlh:C, 5tlh:D, 5tlw:A, 5tlw:B, 5tlw:C, 5tlw:D, 5tlz:A, 5tlz:B, 5tlz:C, 5tlz:D, 3tu9:A, 3tu9:B, 3tu9:C, 3tu9:D, 6xmh:A, 6xmh:B, 6xml:A, 6xml:B, 6xmm:A, 6xmm:B, 6xmo:A, 6xmo:B, 1zai:A, 1zai:B, 1zai:C, 1zai:D, 1zaj:A, 1zaj:B, 1zaj:C, 1zaj:D, 1zal:A, 1zal:B, 1zal:C, 1zal:D
2	1fdj:A	363	341	0.7135	0.6860	0.7302	0.0	1fdj:B
3	6rng:B	334	329	0.6132	0.6407	0.6505	2.42e-146	6rng:G
4	5tkl:A	350	346	0.5788	0.5771	0.5838	7.34e-131	5tk3:A, 5tkc:A, 5tkn:A, 5tkp:A
5	2eph:D	351	345	0.5559	0.5527	0.5623	5.81e-123	2pc4:D, 4tr9:A, 4tr9:B, 4tr9:C, 4tr9:D
6	3mmt:A	341	335	0.5100	0.5220	0.5313	2.95e-113	3mmt:B, 3mmt:C, 3mmt:D
7	2qdg:A	366	332	0.4814	0.4590	0.5060	2.46e-105	2qap:A, 2qap:B, 2qap:C, 2qap:D, 2qdg:B, 2qdg:C, 2qdg:D, 2qdh:A, 2qdh:B, 2qdh:C, 2qdh:D
8	3mbf:A	337	322	0.3668	0.3798	0.3975	2.73e-79	3mbd:A, 3qrh:A
9	7sqm:A	346	86	0.0716	0.0723	0.2907	2.4	7avq:A, 3dlz:A, 3e7v:A, 3f2n:A, 9flb:A, 9flc:A, 9flo:A, 9flq:A, 9flt:A, 3fmd:A, 6g34:A, 6g35:A, 6g36:A, 6g37:A, 6g38:A, 6g39:A, 6g3a:A, 5htb:A, 5htc:A, 3iq7:A, 7ops:A, 4ouc:A, 4qtc:A, 8rdk:A, 2vuw:A, 6z56:A, 6z57:A, 6z58:A, 6z59:A, 6z5a:A, 6z5b:A, 6z5c:A, 6z5d:A, 6z5e:A
10	6bq1:E	1510	35	0.0430	0.0099	0.4286	2.4	6bq1:A
11	7ne2:D	292	55	0.0430	0.0514	0.2727	2.9	7ne2:A, 7ne2:B, 7ne2:C
12	6e4v:A	672	39	0.0315	0.0164	0.2821	3.7
13	7tau:A	951	31	0.0344	0.0126	0.3871	4.9	7tau:C, 7tau:D, 7tau:E, 7tau:F, 7tau:H, 7tau:I, 7tau:G, 7tau:K, 7tau:L, 7tau:J, 5tx1:A, 5tx1:C, 5tx1:D, 5tx1:E, 5tx1:F, 5tx1:H, 5tx1:I, 5tx1:G, 5tx1:J, 5tx1:L
14	5f1a:A	553	122	0.0946	0.0597	0.2705	5.5	5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
15	7kp8:A	140	33	0.0372	0.0929	0.3939	9.0	7kp8:B, 7kp8:C

[Back]