BioLiP

>protein
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFH
ETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSA
LAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACT
QKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENL
KAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY

The query sequence (length=363) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ald:A	363	363	0.9835	0.9835	0.9835	0.0	6ald:A, 6ald:B, 3dft:A, 3dft:B, 3dft:C, 3dft:D, 3lge:A, 3lge:B, 3lge:C, 3lge:D, 2ot0:A, 2ot0:B, 2ot0:C, 2ot0:D, 2ot1:A, 2ot1:B, 2ot1:C, 2ot1:D, 2quv:A, 2quv:B, 2quv:D, 5tle:A, 5tle:B, 5tle:C, 5tle:D, 5tlh:A, 5tlh:B, 5tlh:C, 5tlh:D, 5tlw:A, 5tlw:B, 5tlw:C, 5tlw:D, 5tlz:A, 5tlz:B, 5tlz:C, 5tlz:D, 3tu9:A, 3tu9:B, 3tu9:C, 3tu9:D, 6xmh:A, 6xmh:B, 6xml:A, 6xml:B, 6xmm:A, 6xmm:B, 6xmo:A, 6xmo:B, 1zai:A, 1zai:B, 1zai:C, 1zai:D, 1zaj:A, 1zaj:B, 1zaj:C, 1zaj:D, 1zal:A, 1zal:B, 1zal:C, 1zal:D
2	1fdj:A	363	362	0.7080	0.7080	0.7099	0.0	1fdj:B
3	6rng:B	334	329	0.5895	0.6407	0.6505	3.79e-146	6rng:G
4	5tkl:A	350	339	0.5537	0.5743	0.5929	3.00e-130	5tk3:A, 5tkc:A, 5tkn:A, 5tkp:A
5	2eph:D	351	345	0.5344	0.5527	0.5623	5.91e-123	2pc4:D, 4tr9:A, 4tr9:B, 4tr9:C, 4tr9:D
6	3mmt:A	341	335	0.4904	0.5220	0.5313	5.60e-113	3mmt:B, 3mmt:C, 3mmt:D
7	2qdg:A	366	332	0.4628	0.4590	0.5060	3.53e-105	2qap:A, 2qap:B, 2qap:C, 2qap:D, 2qdg:B, 2qdg:C, 2qdg:D, 2qdh:A, 2qdh:B, 2qdh:C, 2qdh:D
8	3mbf:A	337	322	0.3526	0.3798	0.3975	3.62e-79	3mbd:A, 3qrh:A
9	6zga:A	751	96	0.0826	0.0399	0.3125	0.40	4bzi:A, 4bzi:D, 4bzi:G, 6gni:A, 1m2o:A, 1m2o:C, 2qtv:A, 6zga:E
10	6bq1:E	1510	35	0.0413	0.0099	0.4286	2.5	6bq1:A
11	7sqm:A	346	86	0.0689	0.0723	0.2907	2.7	7avq:A, 3dlz:A, 3e7v:A, 3f2n:A, 9flb:A, 9flc:A, 9flo:A, 9flq:A, 9flt:A, 3fmd:A, 6g34:A, 6g35:A, 6g36:A, 6g37:A, 6g38:A, 6g39:A, 6g3a:A, 5htb:A, 5htc:A, 3iq7:A, 7ops:A, 4ouc:A, 4qtc:A, 8rdk:A, 2vuw:A, 6z56:A, 6z57:A, 6z58:A, 6z59:A, 6z5a:A, 6z5b:A, 6z5c:A, 6z5d:A, 6z5e:A
12	7ne2:D	292	55	0.0413	0.0514	0.2727	3.0	7ne2:A, 7ne2:B, 7ne2:C
13	6e4v:A	672	39	0.0303	0.0164	0.2821	4.1
14	7tau:A	951	31	0.0331	0.0126	0.3871	5.1	7tau:C, 7tau:D, 7tau:E, 7tau:F, 7tau:H, 7tau:I, 7tau:G, 7tau:K, 7tau:L, 7tau:J, 5tx1:A, 5tx1:C, 5tx1:D, 5tx1:E, 5tx1:F, 5tx1:H, 5tx1:I, 5tx1:G, 5tx1:J, 5tx1:L
15	5f1a:A	553	122	0.0909	0.0597	0.2705	6.4	5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
16	7kp8:A	140	33	0.0358	0.0929	0.3939	8.8	7kp8:B, 7kp8:C

[Back]