Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PGIAWIALLLLVIFYVFAVMGTKLFAQSFPEWFGTLGASMYTLFQVMTLESWSMGIARPVIEAYPWAWIYFVSFILVSSF
TVLNLFIGIIIESMQSAHHAEDGERTDAYRDEV

The query sequence (length=113) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5hk7:A 139 108 0.9027 0.7338 0.9444 1.60e-68 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
2 7pgg:A 147 108 0.6283 0.4830 0.6574 1.87e-50 7pgg:B, 7pgi:E
3 6sxc:A 271 113 0.5221 0.2177 0.5221 3.38e-41 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
4 5ek0:A 250 107 0.4956 0.2240 0.5234 1.04e-38 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
5 5klb:A 267 107 0.4690 0.1985 0.4953 9.79e-37 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
6 6n4i:C 226 94 0.4690 0.2345 0.5638 1.04e-36 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
7 4dxw:A 210 88 0.3628 0.1952 0.4659 1.47e-20
8 8j7m:A 257 103 0.2743 0.1206 0.3010 9.26e-12 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
9 7wli:A 1135 105 0.2301 0.0229 0.2476 2.65e-10 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
10 7wli:A 1135 130 0.2920 0.0291 0.2538 1.31e-08 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
11 7wli:A 1135 70 0.2035 0.0203 0.3286 5.09e-04 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
12 7wli:A 1135 107 0.2124 0.0211 0.2243 0.019 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
13 9ayh:A 1056 141 0.3186 0.0341 0.2553 3.43e-10 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
14 9ayh:A 1056 98 0.2301 0.0246 0.2653 2.96e-09 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
15 9ayh:A 1056 59 0.1947 0.0208 0.3729 0.005 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
16 9ayh:A 1056 89 0.1947 0.0208 0.2472 1.2 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
17 8j7h:B 290 68 0.2212 0.0862 0.3676 4.56e-09 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
18 6kzo:A 967 100 0.2212 0.0259 0.2500 4.79e-09
19 6kzo:A 967 74 0.1947 0.0228 0.2973 3.27e-08
20 6kzo:A 967 69 0.1858 0.0217 0.3043 2.59e-05
21 6kzo:A 967 59 0.1947 0.0228 0.3729 0.006
22 6kzp:A 1014 99 0.2212 0.0247 0.2525 9.57e-09
23 6kzp:A 1014 71 0.1947 0.0217 0.3099 3.25e-08
24 6kzp:A 1014 69 0.1858 0.0207 0.3043 2.67e-05
25 6kzp:A 1014 70 0.2035 0.0227 0.3286 0.003
26 7w9l:A 1420 152 0.3363 0.0268 0.2500 9.62e-08 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
27 7w9l:A 1420 126 0.3097 0.0246 0.2778 1.55e-07 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
28 7w9l:A 1420 50 0.1327 0.0106 0.3000 0.52 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
29 7w9l:A 1420 72 0.1593 0.0127 0.2500 1.0 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
30 7xm9:A 1230 152 0.3363 0.0309 0.2500 1.07e-07 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
31 7xm9:A 1230 126 0.3097 0.0285 0.2778 2.29e-07 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
32 7xm9:A 1230 50 0.1327 0.0122 0.3000 0.65 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
33 7xm9:A 1230 72 0.1593 0.0146 0.2500 1.1 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
34 8wea:A 1206 133 0.2832 0.0265 0.2406 1.48e-07
35 8wea:A 1206 81 0.2478 0.0232 0.3457 5.37e-07
36 8wea:A 1206 90 0.2035 0.0191 0.2556 0.015
37 8xmn:A 1277 126 0.3097 0.0274 0.2778 1.83e-07 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
38 8xmn:A 1277 152 0.3274 0.0290 0.2434 8.57e-07 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
39 8xmn:A 1277 50 0.1327 0.0117 0.3000 0.57 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
40 8xmn:A 1277 72 0.1593 0.0141 0.2500 0.98 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
41 8eoi:K 1116 81 0.2478 0.0251 0.3457 4.71e-07
42 8eoi:K 1116 141 0.2832 0.0287 0.2270 2.00e-06
43 8eoi:K 1116 78 0.1770 0.0179 0.2564 0.018
44 8eoi:K 1116 102 0.2478 0.0251 0.2745 2.5
45 8fhs:A 1282 137 0.2832 0.0250 0.2336 5.44e-07 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
46 8fhs:A 1282 81 0.2478 0.0218 0.3457 5.65e-07 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
47 8fhs:A 1282 78 0.1770 0.0156 0.2564 0.017 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
48 8t6l:A 1237 152 0.3540 0.0323 0.2632 5.81e-07 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
49 8t6l:A 1237 127 0.2743 0.0251 0.2441 5.11e-05 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
50 8t6l:A 1237 70 0.1593 0.0146 0.2571 1.5 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
51 8t6l:A 1237 26 0.0885 0.0081 0.3846 3.6 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
52 6uz3:A 1126 152 0.3540 0.0355 0.2632 5.89e-07 7fbs:A
53 6uz3:A 1126 127 0.2743 0.0275 0.2441 5.61e-05 7fbs:A
54 6uz3:A 1126 60 0.1239 0.0124 0.2333 2.5 7fbs:A
55 6uz3:A 1126 26 0.0885 0.0089 0.3846 3.5 7fbs:A
56 8f6p:A 1091 152 0.3540 0.0367 0.2632 6.94e-07
57 8f6p:A 1091 127 0.2743 0.0284 0.2441 5.76e-05
58 8f6p:A 1091 69 0.1416 0.0147 0.2319 0.26
59 8f6p:A 1091 26 0.0885 0.0092 0.3846 3.4
60 6jp5:A 1274 60 0.2212 0.0196 0.4167 9.00e-07 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
61 6jp5:A 1274 136 0.2832 0.0251 0.2353 2.52e-06 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
62 6jp5:A 1274 86 0.2035 0.0181 0.2674 0.005 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
63 7eeb:A 258 101 0.2655 0.1163 0.2970 1.01e-06
64 8fhd:A 1294 125 0.3097 0.0270 0.2800 1.04e-06
65 8fhd:A 1294 83 0.2566 0.0224 0.3494 2.03e-06
66 8fhd:A 1294 78 0.1858 0.0162 0.2692 0.21
67 7jpx:A 1116 60 0.2212 0.0224 0.4167 1.13e-06 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
68 7jpx:A 1116 136 0.2832 0.0287 0.2353 3.31e-06 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
69 7jpx:A 1116 72 0.1504 0.0152 0.2361 0.081 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
70 8ouo:A 648 102 0.2832 0.0494 0.3137 1.17e-06
71 7xlq:A 1319 109 0.2566 0.0220 0.2661 1.28e-06 8epl:A, 7yg5:A
72 7xlq:A 1319 80 0.2212 0.0190 0.3125 5.69e-06 8epl:A, 7yg5:A
73 7xlq:A 1319 127 0.2655 0.0227 0.2362 2.36e-05 8epl:A, 7yg5:A
74 8ouo:B 625 102 0.2832 0.0512 0.3137 1.34e-06 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
75 8gz2:B 1174 125 0.3097 0.0298 0.2800 1.56e-06 8gz1:B
76 8gz2:B 1174 83 0.2566 0.0247 0.3494 2.39e-06 8gz1:B
77 8gz2:B 1174 74 0.1770 0.0170 0.2703 2.1 8gz1:B
78 6j8e:A 1139 126 0.3009 0.0299 0.2698 2.12e-06 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
79 6j8e:A 1139 153 0.3451 0.0342 0.2549 2.98e-06 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
80 6j8e:A 1139 75 0.1681 0.0167 0.2533 2.0 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
81 8e59:A 1230 139 0.2743 0.0252 0.2230 2.66e-06 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
82 8e59:A 1230 88 0.2389 0.0220 0.3068 8.35e-06 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
83 8e59:A 1230 90 0.1858 0.0171 0.2333 0.008 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
84 7xsu:A 1085 148 0.3451 0.0359 0.2635 3.37e-06
85 7xsu:A 1085 123 0.2655 0.0276 0.2439 9.26e-05
86 7xsu:A 1085 26 0.0885 0.0092 0.3846 3.6
87 7xsu:A 1085 58 0.1239 0.0129 0.2414 3.9
88 8epm:A 991 93 0.2389 0.0272 0.2903 7.28e-06
89 8epm:A 991 127 0.2655 0.0303 0.2362 4.59e-05
90 8epm:A 991 60 0.1770 0.0202 0.3333 2.38e-04
91 7vfs:A 1266 79 0.2124 0.0190 0.3038 7.37e-06 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
92 7vfs:A 1266 115 0.2478 0.0221 0.2435 7.89e-06 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
93 7vfs:A 1266 104 0.2212 0.0197 0.2404 1.36e-04 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
94 7mix:A 1326 79 0.2124 0.0181 0.3038 7.46e-06 7miy:A
95 7mix:A 1326 115 0.2478 0.0211 0.2435 7.68e-06 7miy:A
96 7mix:A 1326 104 0.2212 0.0189 0.2404 1.39e-04 7miy:A
97 6agf:A 1138 152 0.3363 0.0334 0.2500 7.78e-06
98 6agf:A 1138 126 0.2743 0.0272 0.2460 2.69e-05
99 6agf:A 1138 69 0.1770 0.0176 0.2899 1.2
100 8x90:A 1377 79 0.2035 0.0167 0.2911 1.03e-05 8x91:A, 8x93:A
101 8x90:A 1377 94 0.2389 0.0196 0.2872 3.32e-05 8x91:A, 8x93:A
102 8x90:A 1377 125 0.2566 0.0211 0.2320 3.77e-05 8x91:A, 8x93:A
103 8f0p:A 1116 151 0.3363 0.0341 0.2517 4.49e-05 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
104 8f0p:A 1116 73 0.1504 0.0152 0.2329 0.008 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
105 8f0p:A 1116 129 0.3009 0.0305 0.2636 0.032 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
106 6a91:A 1323 145 0.3009 0.0257 0.2345 4.52e-05 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
107 6a91:A 1323 73 0.1504 0.0128 0.2329 0.010 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
108 6a91:A 1323 129 0.3009 0.0257 0.2636 0.019 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
109 7sx3:A 1386 121 0.2389 0.0195 0.2231 2.93e-04 7sx4:A
110 7sx3:A 1386 63 0.1681 0.0137 0.3016 0.002 7sx4:A
111 7sx3:A 1386 70 0.1504 0.0123 0.2429 0.046 7sx4:A
112 7sx3:A 1386 63 0.1770 0.0144 0.3175 0.072 7sx4:A
113 7cu3:A 1277 121 0.2389 0.0211 0.2231 3.04e-04
114 7cu3:A 1277 63 0.1681 0.0149 0.3016 0.002
115 7cu3:A 1277 104 0.1858 0.0164 0.2019 0.038
116 7cu3:A 1277 63 0.1770 0.0157 0.3175 0.080
117 6xiw:A 1256 128 0.2566 0.0231 0.2266 3.10e-04
118 6xiw:A 1256 63 0.1681 0.0151 0.3016 0.002
119 6xiw:A 1256 70 0.1504 0.0135 0.2429 0.049
120 6xiw:A 1256 63 0.1770 0.0159 0.3175 0.081
121 7we4:A 1122 154 0.3097 0.0312 0.2273 0.001 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
122 7we4:A 1122 68 0.1416 0.0143 0.2353 0.79 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
123 7we4:A 1122 129 0.2743 0.0276 0.2403 2.8 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
124 6c9a:B 723 80 0.1504 0.0235 0.2125 0.005 6c9a:A
125 6c9a:B 723 126 0.2124 0.0332 0.1905 1.7 6c9a:A
126 6e1p:A 646 82 0.1770 0.0310 0.2439 0.038 6cx0:A, 5e1j:A, 6e1n:A, 6e1n:B, 6e1p:B
127 6e1k:A 536 82 0.1770 0.0373 0.2439 0.042 6e1k:B, 6e1m:A, 6e1m:B
128 7fhk:A 663 79 0.1770 0.0302 0.2532 0.045 5dqq:A, 7fhk:C, 7fhl:A, 7fhl:C, 7fhn:A, 7fhn:C, 7fho:A, 7fho:C, 5tua:A
129 7tj9:A 1111 143 0.2832 0.0288 0.2238 0.090
130 7tj9:A 1111 114 0.2655 0.0270 0.2632 1.0
131 6v1q:A 538 116 0.1947 0.0409 0.1897 0.13 6v1q:B
132 6v1q:A 538 26 0.0973 0.0204 0.4231 6.9 6v1q:B
133 5w3s:A 485 68 0.1593 0.0371 0.2647 1.0 5w3s:B, 5w3s:C, 5w3s:D
134 1fo2:A 456 44 0.1327 0.0329 0.3409 2.5 1fo3:A, 5kij:A, 5kk7:A, 5kk7:B, 1x9d:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218