BioLiP

>protein
PGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWAEKLDRLTSTATKDPGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLV
LKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADYYH
TELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMA

The query sequence (length=231) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4bta:A	237	234	0.9957	0.9705	0.9829	1.08e-169	4bt9:A, 4btb:A, 2v5f:A
2	6evm:A	95	92	0.2468	0.6000	0.6196	1.66e-37	6evl:A, 6evn:A, 6evo:A, 6evp:A
3	1na0:B	119	83	0.1212	0.2353	0.3373	8.32e-04	1na3:A, 1na3:B
4	1na0:B	119	35	0.0736	0.1429	0.4857	0.063	1na3:A, 1na3:B
5	3kd7:A	102	79	0.1169	0.2647	0.3418	0.002	3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
6	3kd7:A	102	35	0.0736	0.1667	0.4857	0.11	3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
7	3kd7:A	102	74	0.0996	0.2255	0.3108	0.16	3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
8	8chy:A	272	85	0.1212	0.1029	0.3294	0.021	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
9	8chy:A	272	85	0.1212	0.1029	0.3294	0.021	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
10	8chy:A	272	85	0.1212	0.1029	0.3294	0.021	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
11	8chy:A	272	85	0.1212	0.1029	0.3294	0.021	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
12	8chy:A	272	85	0.1212	0.1029	0.3294	0.021	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
13	8chy:A	272	84	0.1212	0.1029	0.3333	0.042	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
14	8chy:A	272	76	0.1082	0.0919	0.3289	0.077	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
15	2r9z:B	453	81	0.1039	0.0530	0.2963	3.7	2r9z:A, 2rab:A, 2rab:B
16	3fp2:A	483	31	0.0519	0.0248	0.3871	5.1	3fp4:A, 3lca:A
17	8k0e:A	646	46	0.0606	0.0217	0.3043	5.8	8k0f:A, 8k0m:A, 8k17:A, 8kc9:A
18	7y47:B	767	40	0.0649	0.0196	0.3750	6.0
19	8c9s:A	223	71	0.0779	0.0807	0.2535	6.3	8c9s:B
20	5lwv:A	711	38	0.0606	0.0197	0.3684	6.5	5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
21	3tr6:A	222	31	0.0519	0.0541	0.3871	7.7
22	7yeh:A	1020	38	0.0606	0.0137	0.3684	7.8	4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
23	3dlj:A	471	53	0.0519	0.0255	0.2264	9.4	3dlj:B

[Back]