BioLiP

>protein
PGATLCLGHHAVPNGTIVKTITNDRIEVTNATELVQNSSIGEICDSPHQILDGENCTLIDALLGDPQCDGFQNKKWDLFV
ERSKAYSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFNNESFNWTGVTQNGTSSACIRRSSSSFFSRLNWLTHLNYKYPALNVTM
PNNEQFDKLYIWGVHHPGTDKDQIFLYAQSSGRITVSTKRSQQAVIPNIGSRPKIRDIPSRISIYWTIVKPGDILLINST
GNLIAPRGYFKIRSGKSSIMRSDAPIGKCKSECITPNGSIPNDKPFQNVNRITYGACPRYVKHSTLKLATGMRNVPE

The query sequence (length=317) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6wzt:A	494	315	0.9558	0.6134	0.9619	0.0	6aos:A, 6aot:A, 6aou:A, 6aov:A, 6bkr:A, 6bks:A, 6bkt:A, 6cex:D, 6cex:B, 3eym:B, 3eym:D, 3eym:F, 8faw:A, 1hgg:B, 1hgg:D, 1hgg:F, 1hgh:B, 1hgh:D, 1hgh:F, 1htm:B, 1htm:D, 1htm:F, 6nsa:A, 6nsb:A, 6nsf:A, 6nsg:A, 5t6n:B, 5t6n:D, 5t6n:F, 8tj6:B, 8tj9:A, 8tja:A, 8tjb:A, 4uny:D, 4uo0:D, 8uwa:B, 4wea:A, 2yp3:A, 2yp4:A, 2yp5:A, 2yp8:A, 2yp9:A
2	8tj8:A	317	317	0.8991	0.8991	0.8991	0.0
3	8tj4:A	317	317	0.8423	0.8423	0.8423	0.0	8tj4:C, 8tj4:E, 8tj4:G, 8tj6:A, 8tj6:C, 8tj6:E, 8tj6:G, 8tj7:A
4	5xrs:G	321	315	0.8297	0.8193	0.8349	0.0	5xrs:A, 5xrs:C
5	1hge:A	328	315	0.7886	0.7622	0.7937	0.0	1hge:C, 1hge:E, 1hgg:A, 1hgg:C, 1hgg:E, 1hgh:A, 1hgh:C, 1hgh:E, 1hgi:A, 1hgi:C, 1hgi:E, 1hgj:A, 1hgj:C, 1hgj:E, 4hmg:A, 4hmg:C, 4hmg:E, 5hmg:A, 5hmg:C, 5hmg:E
6	4wa2:A	491	314	0.7666	0.4949	0.7739	0.0	6bkq:A, 6bkq:C, 6bkq:E, 6cex:A, 6cex:C, 6cex:E, 1mqm:A, 1mqm:D, 1mqm:G, 1mqn:A, 1mqn:D, 5t6n:A, 5t6n:E, 5t6n:C, 6tzb:A, 6tzb:C, 6tzb:E, 2vir:C, 2vis:C, 2vit:C, 5vtq:A, 5vtq:C, 5vtq:E, 5vtr:A, 5vtr:C, 5vtr:E, 5vtv:A, 5vtv:C, 5vtv:E, 5vtw:C, 5vtw:E, 5vtw:A, 5vty:A, 5vty:C, 5vty:E, 5vu4:A, 5vu4:C, 5vu4:E, 4wa2:B, 4wa2:C, 4wa2:E, 6y5j:E, 2ypg:A, 2ypg:C, 2ypg:E
7	4uny:C	330	315	0.7476	0.7182	0.7524	0.0	4unx:A, 4unx:C, 4unx:E, 4uny:A, 4uny:E, 4unz:A, 4unz:C, 4unz:E, 4uo1:A, 4uo1:C, 4uo1:E, 4uo2:A, 4uo2:C, 4uo2:E, 4uo5:A, 4uo5:C, 4uo5:E, 4uo6:A, 4uo7:A, 4uo7:C, 4uo7:E, 4uo8:A
8	5xla:A	490	316	0.5237	0.3388	0.5253	1.23e-123	3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
9	6twi:E	323	317	0.3943	0.3870	0.3943	3.42e-77	4cyw:A, 4cyw:C, 4cyw:E, 4cyz:A, 4cyz:E, 4cz0:A, 4cz0:E, 4cz0:C, 4d00:A, 4d00:C, 4d00:E, 4qy1:E, 4qy1:G, 4qy1:I, 4qy1:U, 4qy2:E, 5tgu:C, 5tgu:E, 5tgu:A, 5tgv:A, 5tgv:C, 5tgv:E, 5th1:A, 5th1:C, 5th1:E, 5thc:E, 5thc:C, 6tva:A, 6tva:C, 6tva:E, 6tvb:A, 6tvb:C, 6tvb:E, 6tvd:A, 6tvd:C, 6tvd:E, 6tvd:G, 6tvd:I, 6tvd:K, 6tvf:A, 6tvf:C, 6tvf:E, 6tvf:G, 6tvf:K, 6tvf:I, 6tvr:K, 6tvs:C, 6tvs:E, 6tvs:K, 6tvt:A, 6tvt:C, 6tvt:E, 6twi:A, 6twi:C, 6twv:C, 6twv:E, 6twv:K, 6twv:G, 6twv:I, 6txo:A, 6txo:C, 6txo:E, 6ty1:A, 6ty1:C, 6ty1:E, 6ty1:G, 6ty1:I, 6ty1:K, 4xqo:A, 4xqo:C, 4xqu:A, 4xqu:C, 4xqu:E
10	7t1v:A	315	315	0.4038	0.4063	0.4063	8.10e-77	7t1v:C, 7t1v:E
11	5tg9:A	325	322	0.3912	0.3815	0.3851	3.39e-75	5tg9:C
12	4n5k:A	318	316	0.3659	0.3648	0.3671	3.90e-73	4bsb:A, 4bsc:A, 4bsd:A, 4bse:A, 4bsf:A, 4bsh:A, 4bsi:A, 6d8d:A, 6d8d:C, 6d8d:E, 4dj7:A, 4dj7:C, 4dj7:E, 4dj8:A, 4dj8:C, 4dj8:E, 6idb:A, 6idz:A, 4kom:A, 4kon:A, 4lkg:A, 4lkg:C, 4lkg:E, 4lkh:A, 4lkj:A, 4lkk:A, 4ln6:A, 4ln6:C, 4ln6:E, 4ln6:G, 4ln6:I, 4ln6:K, 4ln8:A, 4ln8:C, 4ln8:E, 4ln8:G, 4ln8:I, 4ln8:K, 4n5k:C, 4n60:A, 4n60:C, 4n61:A, 4n61:C, 4n62:A, 4n62:C, 4n63:A, 4n63:C, 4n64:A, 4n64:C, 5t6s:A, 5t6s:C, 5t6s:E, 5t6s:I, 5t6s:K, 5t6s:G, 5vjl:A, 5vjm:A
13	3m5h:A	310	321	0.4006	0.4097	0.3956	7.61e-73	3m5h:C, 3m5h:E, 3m5i:A, 3m5i:C, 3m5i:E, 3m5j:A, 3m5j:C, 3m5j:E
14	6cf7:A	322	324	0.3722	0.3665	0.3642	1.51e-71	6lks:A, 6lks:K, 6lks:G, 6lks:I
15	1rv0:L	324	324	0.3785	0.3704	0.3704	2.07e-70	1rvt:H, 1rvt:J, 1rvt:L
16	5e34:A	323	323	0.3722	0.3653	0.3653	8.92e-70	5e35:A
17	8vql:A	325	327	0.3659	0.3569	0.3547	1.30e-68	1rvx:A, 1rvx:C, 1rvx:E, 1rvx:G, 1rvx:I, 1rvx:K, 1rvz:A, 1rvz:C, 1rvz:E, 1rvz:G, 1rvz:I, 1rvz:K, 8sd2:A, 8sd4:A, 8vqm:A, 8vqn:A, 8vqq:A, 5w5s:A, 5w5u:A, 5w6i:A, 5w6r:A, 5w6r:C, 5w6r:E, 5w6r:G, 5w6t:A, 5w6u:A, 6wcr:A
18	8txm:A	326	327	0.3754	0.3650	0.3639	5.88e-68	4jtv:A, 4jtv:C, 4jtv:E, 4jtv:I, 4jtv:K, 4jtv:G, 4ju0:A, 4ju0:C, 4ju0:E, 4ju0:G, 4ju0:I, 4ju0:K, 4lvh:G, 4lvh:J, 3ube:A, 3ube:C, 3ube:E, 3ube:I, 3ube:K, 3ube:G, 3ubj:C, 3ubj:G, 3ubj:I, 3ubj:K, 3ubn:A, 3ubn:C, 3ubn:E, 3ubn:G, 3ubn:I, 3ubn:K, 3ubq:C, 3ubq:I, 3ubq:K, 6xq0:D, 6xq0:A
19	3htp:A	324	324	0.3628	0.3549	0.3549	1.54e-66	4gxx:A, 3htq:A, 3htt:A, 4juh:A, 4juj:A, 4juj:C, 5vmc:A, 5vmc:C, 5vmc:E, 5vmf:A, 5vmf:C, 5vmf:E, 5vmg:A, 5vmg:C, 5vmg:E, 5vmj:A, 5vmj:C, 5vmj:E, 2wrg:J, 2wrh:H, 2wrh:J, 2wrh:L
20	6n41:A	483	322	0.3533	0.2319	0.3478	7.78e-65	6cf7:B, 7jpd:D, 8sd2:B, 8sd4:B, 7uyi:E, 8vql:B, 8vqm:B, 8vqn:B, 8vqq:B, 5w5s:B, 5w5u:B, 5w6i:B, 5w6r:B, 5w6r:D, 5w6r:F, 5w6r:H, 5w6t:B, 5w6u:B, 6wcr:B, 2wrg:M
21	6ntf:A	491	324	0.3659	0.2363	0.3580	1.49e-62	5ajm:A, 4bgx:A, 4bgy:A, 4bh0:A, 4bh0:C, 4bh0:E, 4bh1:A, 4bh1:C, 4bh1:E, 4bh3:A, 4bh4:A, 6cf5:A, 6cf5:C, 6cf5:E, 6cfg:A, 4cqq:A, 4cqr:A, 4cqu:A, 4cqw:A, 4cqw:C, 4cqw:E, 4cqx:A, 4cqx:C, 4cqx:E, 4cqy:A, 4cqy:C, 4cqy:E, 4cqz:A, 5e2z:C, 5e2z:A, 5e2z:E, 5e30:C, 5e30:A, 5e30:E, 6e7h:C, 2fk0:Q, 1jsn:A, 1jso:A, 4k63:A, 4k63:C, 4k63:E, 4k63:G, 4k64:A, 4k64:C, 4k66:A, 4k66:C, 4k67:A, 4k67:C, 4k67:E, 4k67:G, 4kdn:A, 4kdn:C, 4kdo:C, 4kdo:A, 4n5z:A, 6p3s:U, 6p3s:H, 6vmz:A, 6vmz:C, 6vmz:E, 8zdw:H, 8zdw:C, 8zdw:A, 3znk:A, 3znk:C, 3znk:E, 3znl:A, 3znl:C, 3znl:E, 3znm:A, 3znm:C, 3znm:E, 3zp0:E, 3zp1:E, 3zp2:E, 3zp3:E, 3zp6:E, 3zpb:E
22	5bqy:A	324	323	0.3754	0.3673	0.3684	1.68e-62	5bqy:E, 5bqz:A, 5bqz:E
23	6iig:A	495	322	0.3754	0.2404	0.3696	9.38e-62	6cfg:B, 6ijt:A, 6in5:A, 6vmz:B, 6vmz:D, 6vmz:F, 5z88:A
24	8zdv:A	320	317	0.3470	0.3438	0.3470	1.27e-61	8zdv:B, 8zdv:C
25	4wss:E	489	323	0.3849	0.2495	0.3777	1.70e-60	4wss:C, 4wss:F
26	5t0b:A	330	328	0.3691	0.3545	0.3567	6.23e-60	5br3:A, 5br3:C, 5br6:A, 5br6:C, 5t0d:A, 5t0e:A, 4wsu:A, 4wsu:C, 4wsv:A, 4wsv:E, 4xke:A, 4xkf:A, 4xkg:A, 4yy1:A, 4yy1:C, 4yy7:A, 4yy7:C, 4yya:A, 4yyb:A
27	1jsh:A	317	322	0.3659	0.3659	0.3602	2.35e-57	1jsi:A
28	2wr1:B	490	319	0.3502	0.2265	0.3480	3.22e-55	2wr1:C, 2wr2:B, 2wr2:C, 2wr3:A, 2wr4:A, 2wr7:A, 2wrb:A, 2wre:A, 2wre:B, 2wre:C, 2wrf:F, 2wrf:D
29	4kps:A	324	324	0.3218	0.3148	0.3148	4.69e-49	4kps:E
30	4mc5:C	497	325	0.3091	0.1972	0.3015	5.53e-35	8gv7:A, 4k3x:B, 4k3x:D, 4k3x:F, 4mc5:A, 4mc5:B, 7wvg:A
31	4m44:A	343	342	0.2713	0.2507	0.2515	8.36e-11	7kqg:A, 4m44:C, 4m44:E, 2rft:A, 2rfu:A
32	4nrk:C	341	342	0.2681	0.2493	0.2485	2.64e-10	4nrk:A, 4nrk:E, 4nrl:A, 4nrl:C, 4nrl:E
33	8hfd:A	452	77	0.0757	0.0531	0.3117	0.84	3e74:B, 8hfd:B, 8hfd:C, 8hfd:D
34	3e74:A	429	77	0.0757	0.0559	0.3117	0.90	3e74:C, 3e74:D
35	7ohx:t	202	76	0.0662	0.1040	0.2763	2.0
36	4lks:A	157	28	0.0442	0.0892	0.5000	2.3	4lks:C, 4lqr:A, 4p5y:A
37	4czw:A	609	68	0.0599	0.0312	0.2794	3.0
38	2cir:A	288	76	0.0694	0.0764	0.2895	3.3	2ciq:A, 2cis:A
39	1rmg:A	422	58	0.0568	0.0427	0.3103	5.0
40	6a48:A	651	55	0.0505	0.0246	0.2909	7.4
41	6bq1:E	1510	146	0.1009	0.0212	0.2192	8.4	6bq1:A
42	1sgl:A	206	37	0.0410	0.0631	0.3514	8.9
43	2qw5:A	327	20	0.0315	0.0306	0.5000	9.3	2qw5:B

[Back]