Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PFTKMTRPSSDLTAFREHFAKAKHIAIITGAGVSAESGVPTFRGPGGFWRKWQAQDLATPEAFSRDPSLVWEFYHYRREV
MRSKMPNPAHLAIAECEARLGQQGRSVVIITQNIDELHHRAGSKHVYEIHGSLFKTRCMSCGEVKANHKSPICPALDGKG
APDPNTKEARIPVELLPRCERKSCNGLLRPHVVWFGETLDSDILTAVERELEKCDLCLVVGTSSIVYPAAMFAPQVASRG
VPVAEFNMECTPATQRFKYHFEGPCGSTLPPALE

The query sequence (length=274) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6eo0:B 275 274 1.0000 0.9964 1.0000 0.0 6enx:A, 6eo0:A, 6eo0:C, 6eo0:D, 6fky:A, 6fky:B, 6fkz:A, 6fkz:B, 6flg:A, 6flg:B, 5ojo:A, 5ojo:B, 4utn:A, 4utn:B, 4utr:A, 4utr:B, 4utv:A, 4utv:B, 4utx:A, 4utx:B, 4utz:A, 4utz:B, 4uu7:A, 4uu7:B, 4uu8:A, 4uu8:B, 4uua:A, 4uua:B, 4uub:A, 4uub:B
2 6eqs:D 275 273 0.7518 0.7491 0.7546 6.17e-155 6ace:A, 6acl:A, 6aco:A, 6acp:A, 2b4y:A, 2b4y:B, 2b4y:C, 2b4y:D, 5bwl:A, 6eqs:A, 6eqs:B, 6eqs:C, 4f4u:A, 4f4u:B, 4f56:A, 4f56:B, 4g1c:A, 4g1c:B, 8gbl:A, 8gbl:B, 8gbn:A, 8gbn:B, 4hda:A, 4hda:B, 6ljk:A, 6ljm:A, 6ljn:A, 2nyr:A, 2nyr:B, 3rig:A, 3rig:B, 3riy:B, 3riy:A, 7x3p:A, 5xhs:A
3 1ici:A 256 251 0.3796 0.4062 0.4143 5.90e-61 1ici:B, 1m2g:A, 1m2h:A, 1m2j:A, 1m2k:A, 1m2n:A, 1m2n:B, 4twi:A
4 1s7g:A 252 259 0.3759 0.4087 0.3977 1.37e-49 1ma3:A, 1s7g:B, 1s7g:C, 1s7g:D, 1s7g:E, 4twj:A, 1yc2:A, 1yc2:B, 1yc2:C, 1yc2:D, 1yc2:E
5 6rxj:A 235 253 0.3467 0.4043 0.3755 2.85e-48 6rxj:B, 6rxk:A, 6rxl:A, 6rxm:A, 6rxm:B, 6rxm:C, 6rxm:D, 6rxm:E, 6rxm:F, 6rxo:A, 6rxo:B, 6rxp:A, 6rxp:B, 6rxq:A, 6rxq:B, 6rxq:C, 6rxq:D, 6rxr:A, 6rxr:B, 6rxr:C, 6rxr:D, 1s5p:A
6 6rxs:A 218 253 0.3066 0.3853 0.3320 4.92e-34
7 3u31:A 263 264 0.2847 0.2966 0.2955 1.08e-33 3jwp:A, 3u3d:A
8 2h59:A 246 244 0.2810 0.3130 0.3156 2.54e-32 4buz:A, 4bv2:A, 4bv2:B, 3d4b:A, 3d81:A, 2h2d:A, 2h2f:A, 2h2g:A, 2h2h:A, 2h2i:A, 2h4f:A, 2h4h:A, 2h4j:A, 2h59:B, 3jr3:A, 3pdh:A, 1yc5:A
9 5oj7:A 286 275 0.2664 0.2552 0.2655 3.29e-26 5ojn:A
10 5btr:A 370 263 0.2701 0.2000 0.2814 1.58e-21 5btr:B, 4i5i:A, 4i5i:B, 4if6:A, 4ig9:A, 4ig9:E, 4ig9:C, 4ig9:G, 4kxq:A, 4zzh:A, 4zzi:A, 4zzj:A
11 4iao:B 429 290 0.2956 0.1888 0.2793 3.54e-20 2hjh:A, 2hjh:B, 4iao:A
12 3zgo:A 318 220 0.2117 0.1824 0.2636 1.20e-16 7bos:A, 5d7o:A, 5d7o:B, 5d7p:A, 5d7p:B, 5d7q:A, 5d7q:B, 5dy4:A, 5dy5:A, 5fyq:A, 5g4c:B, 5g4c:A, 1j8f:A, 1j8f:B, 1j8f:C, 4l3o:A, 4l3o:B, 4l3o:C, 4l3o:D, 6l65:A, 6l66:A, 6l71:A, 6l72:A, 5mar:A, 5mar:B, 5mat:A, 5mat:C, 6nr0:A, 6nr0:B, 8owz:A, 8py3:A, 6qcn:A, 6qcn:B, 4r8m:A, 4r8m:B, 4rmg:A, 4rmh:A, 4rmj:A, 4rmj:B, 7t1d:A, 7t1d:B, 4x3o:A, 4x3p:A, 8xe7:A, 5y0z:A, 5y0z:B, 4y6q:A, 4y6q:B, 4y6q:C, 5yql:A, 5yqm:A, 5yqn:A, 5yqo:A, 3zgo:B, 3zgo:C, 3zgv:A, 3zgv:B
13 8bbk:A 274 223 0.2409 0.2409 0.2960 2.29e-16 8bbk:B, 8bbk:C, 8bbk:D, 8bbk:E, 8bbk:F, 4bn4:A, 4bn5:A, 4bn5:B, 4bn5:C, 4bn5:D, 4bn5:E, 4bn5:F, 4bn5:G, 4bn5:H, 4bn5:I, 4bn5:J, 4bn5:K, 4bn5:L, 4bv3:A, 4bvb:A, 4bve:A, 4bvf:A, 4bvg:A, 4bvh:A, 4bvh:B, 4bvh:C, 5bwn:A, 5bwo:A, 4c78:A, 4c7b:A, 9cbt:A, 9cbt:B, 8ccw:A, 8ccz:A, 8ccz:B, 5d7n:A, 5d7n:B, 5d7n:C, 5d7n:D, 5d7n:E, 5d7n:F, 4fvt:A, 4fz3:A, 3glr:A, 3gls:A, 3gls:B, 3gls:C, 3gls:D, 3gls:E, 3gls:F, 3glt:A, 3glu:A, 5h4d:H, 5h4d:A, 4hd8:A, 8hlw:A, 8hly:A, 8hn9:A, 8hn9:B, 6iso:A, 6iso:B, 6iso:E, 6iso:G, 4jsr:A, 4jt8:A, 4jt9:A, 4o8z:A, 8v15:A, 8v15:C, 8v2n:A, 5y4h:A, 5ytk:A, 5ytk:D, 5ytk:E, 5ytk:F, 5ytk:B, 5ytk:C, 5z93:A, 5z94:A, 5z94:B, 5zgc:A, 5zgc:B, 5zgc:C, 5zgc:E, 5zgc:D
14 5ol0:A 283 246 0.2664 0.2580 0.2967 8.17e-16
15 5y5n:A 288 219 0.2117 0.2014 0.2648 1.79e-15 7bot:A, 5fyq:B, 4rmi:A, 8tgp:A, 4y6l:A, 4y6l:B, 4y6o:A, 4y6o:B, 4y6q:D
16 1q17:C 295 246 0.2664 0.2475 0.2967 2.15e-14 7f4e:A, 7f51:A, 2od2:A, 2od7:A, 2od9:A, 1q14:A, 1q17:A, 1q17:B, 1q1a:A, 2qqf:A, 2qqg:A, 1szc:A, 1szd:A
17 5y2f:A 297 243 0.2044 0.1886 0.2305 9.06e-13 8ak5:A, 8ak5:B, 8ak6:A, 8ak6:B, 8ak7:A, 8ak7:B, 8ak8:A, 8ak8:B, 8ak9:A, 8ak9:B, 8aka:A, 8aka:B, 8akb:A, 8akb:B, 8akc:A, 8akc:B, 8akd:A, 8akd:B, 8ake:A, 8ake:B, 8akf:A, 8akf:B, 8akg:A, 8akg:B, 8bl0:A, 8bl0:B, 8bl1:A, 8bl1:B, 7cl0:A, 7cl1:A, 8cnm:A, 8cnm:B, 8cno:A, 8cno:B, 8f86:K, 8g57:K, 9g7h:A, 9g7h:B, 6hoy:A, 6hoy:B, 8i2b:A, 8i2b:B, 3k35:A, 3k35:B, 3k35:C, 3k35:D, 3k35:E, 3k35:F, 5mf6:A, 5mf6:B, 5mfp:A, 5mfp:B, 5mfz:A, 5mfz:B, 5mgn:A, 5mgn:B, 3pki:A, 3pki:B, 3pki:C, 3pki:D, 3pki:E, 3pki:F, 3pkj:A, 3pkj:B, 3pkj:C, 3pkj:D, 3pkj:E, 3pkj:F, 6qcd:A, 6qcd:B, 6qce:A, 6qce:B, 6qch:A, 6qch:B, 6qcj:A, 6qcj:B, 5x16:A, 6xuy:A, 6xuy:B, 6xv1:A, 6xv1:B, 6xv6:A, 6xv6:B, 6xv6:C, 6xv6:D, 6xv6:E, 6xv6:F, 6xvg:A, 6xvg:B, 6xvg:C, 6xvg:D, 6xvg:E, 6xvg:F, 3zg6:A, 6zu4:A, 6zu4:B
18 5btr:C 322 252 0.2336 0.1988 0.2540 5.84e-12
19 5ol0:B 263 240 0.2372 0.2471 0.2708 1.25e-11
20 6iso:I 248 141 0.1533 0.1694 0.2979 3.46e-06
21 8of4:L 237 193 0.1423 0.1646 0.2021 4.12e-06
22 4zpj:A 371 100 0.0949 0.0701 0.2600 0.099
23 3ejx:D 301 98 0.1022 0.0930 0.2857 0.48 3ejx:A, 3ejx:B, 3ejx:C, 3ejx:E, 3ejx:F, 3ekm:A, 3ekm:B, 3ekm:C, 3ekm:D, 3ekm:E, 3ekm:F
24 7p8w:A 502 80 0.0949 0.0518 0.3250 1.0 9bdj:A, 9bdj:B, 9bdj:C, 9bdj:D, 4blc:A, 4blc:B, 4blc:C, 4blc:D, 7cat:A, 7cat:B, 8cat:A, 8cat:B, 1dgb:A, 1dgb:B, 1dgb:C, 1dgb:D, 1dgf:A, 1dgf:B, 1dgf:C, 1dgf:D, 1dgg:A, 1dgg:B, 1dgg:C, 1dgg:D, 1dgh:A, 1dgh:B, 1dgh:C, 1dgh:D, 7di8:A, 7di8:B, 7di8:C, 7di8:D, 8el9:A, 8el9:B, 8el9:C, 8el9:D, 1f4j:A, 1f4j:B, 1f4j:C, 1f4j:D, 5gkn:A, 5gkn:B, 5gkn:C, 5gkn:D, 8hid:A, 8hid:B, 8hid:C, 8hid:D, 3j7b:A, 3j7b:B, 3j7b:C, 3j7b:D, 6jnt:A, 6jnt:B, 6jnt:C, 6jnt:D, 6jnu:A, 6jnu:B, 6jnu:C, 6jnu:D, 3nwl:A, 3nwl:B, 3nwl:C, 3nwl:D, 7p8w:B, 7p8w:C, 7p8w:D, 6pm7:A, 6pm7:B, 6po0:A, 6po0:B, 6po0:C, 6po0:D, 8pvd:A, 1qqw:A, 1qqw:B, 1qqw:C, 1qqw:D, 3re8:A, 3re8:B, 3re8:C, 3re8:D, 3rgp:A, 3rgp:B, 3rgp:C, 3rgp:D, 3rgs:A, 3rgs:B, 3rgs:C, 3rgs:D, 8sgv:B, 8sgv:A, 8sgv:C, 8sgv:D, 1tgu:A, 1tgu:B, 1tgu:C, 1tgu:D, 1th2:A, 1th2:B, 1th2:C, 1th2:D, 1th3:A, 1th3:B, 1th3:C, 1th3:D, 1th4:A, 1th4:B, 1th4:C, 1th4:D, 7vd9:A, 7vd9:B, 7vd9:C, 7vd9:D, 8wzh:B, 8wzh:A, 8wzh:C, 8wzh:D, 8wzj:B, 8wzj:A, 8wzj:C, 8wzj:D, 8wzk:B, 8wzk:A, 8wzk:C, 8wzk:D, 8wzm:B, 8wzm:A, 8wzm:C, 8wzm:D
25 6aon:A 473 108 0.1241 0.0719 0.3148 3.6 6aon:B
26 3hhs:B 656 118 0.1022 0.0427 0.2373 3.6
27 1w3w:A 311 109 0.1022 0.0900 0.2569 4.5
28 2bru:C 167 62 0.0693 0.1138 0.3065 5.9
29 6mez:B 359 30 0.0401 0.0306 0.3667 6.0 4bcl:A, 3eoj:A, 6mez:A, 3vdi:A
30 1b94:A 244 31 0.0365 0.0410 0.3226 7.0 1az0:A, 1az0:B, 2b0d:A, 2b0d:B, 2b0e:A, 2b0e:B, 1b94:B, 1b95:A, 1b95:B, 1b96:A, 1b96:B, 1b97:A, 1b97:B, 1bgb:A, 1bgb:B, 1bss:A, 1bss:B, 1bsu:A, 1bsu:B, 1bua:A, 1bua:B, 1eo3:A, 1eo3:B, 1eo4:A, 1eo4:B, 1eon:A, 1eon:B, 1eoo:A, 1eoo:B, 1eop:A, 1eop:B, 5f8a:A, 5f8a:B, 2ge5:A, 2ge5:B, 5hlk:A, 5hlk:B, 1rv5:A, 1rv5:B, 1rva:A, 1rva:B, 1rvb:A, 1rvb:B, 1rvc:A, 1rvc:B, 2rve:A, 2rve:B, 4rve:A, 4rve:B, 4rve:C, 1stx:A, 1stx:B, 1suz:A, 1suz:B, 1sx5:A, 1sx5:B, 1sx8:A, 1sx8:B
31 7d6v:C 264 67 0.0803 0.0833 0.3284 7.7 7d6x:C
32 5swp:A 1060 58 0.0584 0.0151 0.2759 8.1 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
33 5h59:A 311 55 0.0657 0.0579 0.3273 9.7 5h5j:A, 5h5j:C, 1jb9:A, 3lo8:A, 3lvb:A, 5vw2:A, 5vw3:A, 5vw4:A, 5vw5:A, 5vw6:A, 5vw7:A, 5vw8:A, 5vw9:A, 5vwa:A, 5vwb:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218