BioLiP

>protein
PFPYEFRELNPEEDKLVKANLGAFPTTYVKLGPKGYMVYRPYLKDAANIYNMPLRPTDVFVASYQRSGTTMTQELVWLIE
NDLNFEAAKTYMSLRYIYLDGFMIYDPEKQEEYNDILPNPENLDMERYLGLLEYSSRPGSSLLAAVPPTEKRFVKTHLPL
SLMPPNMLDTVKMVYLARDPRDVAVSSFHHARLLYLLNKQSNFKDFWEMFHRGLYTLTPYFEHVKEAWAKRHDPNMLFLF
YEDYLKDLPGSIARIADFLGKKLSEEQIQRLSEHLNFEKFKNNGAVNMEDYREIGILADGEHFIRKGKAGCWRDYFDEEM
TKQAEKWIKDNLKDTDLRYPNM

The query sequence (length=342) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1x8k:A	344	342	1.0000	0.9942	1.0000	0.0	1fmj:A, 1fmj:B, 1fml:A, 1fml:B, 1x8j:A, 1x8j:B, 1x8k:B, 1x8l:A, 1x8l:B
2	7r0s:A	336	343	0.3363	0.3423	0.3353	5.38e-69	7r0s:B, 7r0u:A, 7r0u:B
3	4jvl:A	292	306	0.2485	0.2911	0.2778	4.92e-35	1g3m:A, 1g3m:B, 1hy3:A, 1hy3:B, 4jvl:B, 4jvm:A, 4jvm:B, 4jvn:A, 4jvn:B
4	2gwh:B	288	292	0.2427	0.2882	0.2842	1.16e-33	2gwh:A
5	7v1o:A	288	318	0.2515	0.2986	0.2704	6.14e-33	7v1o:B
6	1aqy:A	283	307	0.2398	0.2898	0.2671	1.16e-32	1aqu:A, 1aqu:B, 1aqy:B, 1bo6:A, 1bo6:B
7	3ckl:B	296	283	0.2573	0.2973	0.3110	1.25e-32	3ckl:A, 2z5f:A, 2z5f:B
8	2zyt:X	291	300	0.2398	0.2818	0.2733	4.37e-29	2zpt:X, 2zvp:X, 2zvq:X, 2zyu:X, 2zyv:X, 2zyw:X
9	2h8k:A	245	221	0.2018	0.2816	0.3122	8.32e-29	2h8k:B, 2reo:A
10	2h8k:A	245	35	0.0380	0.0531	0.3714	1.2	2h8k:B, 2reo:A
11	3u3k:A	289	285	0.2222	0.2630	0.2667	5.13e-27	2a3r:A, 2a3r:B, 2d06:A, 2d06:B, 4gra:A, 4gra:B, 1ls6:A, 3qvu:A, 3qvu:B, 3qvv:A, 3qvv:B, 3u3j:A, 3u3j:B, 3u3k:B, 3u3m:A, 3u3o:A, 3u3r:A, 1z28:A, 1z29:A
12	3bfx:A	253	286	0.2076	0.2806	0.2483	7.50e-26	3bfx:B
13	1j99:A	284	195	0.1608	0.1937	0.2821	1.15e-22	1efh:A, 1efh:B, 3f3y:A, 3f3y:B, 3f3y:C, 3f3y:D, 4ifb:A, 4ifb:B, 1ov4:A, 2qp3:A, 2qp4:A
14	5x2b:L	283	191	0.1520	0.1837	0.2723	6.85e-22	5x2b:C, 5x2b:A, 5x2b:B, 5x2b:D, 5x2b:E, 5x2b:F, 5x2b:G, 5x2b:H, 5x2b:I, 5x2b:J, 5x2b:K
15	1q20:A	294	173	0.1491	0.1735	0.2948	5.41e-21	1q1q:A, 1q1z:A, 1q22:A
16	8k9y:A	322	295	0.2310	0.2453	0.2678	8.95e-21	8k9y:B
17	5mek:A	322	296	0.2427	0.2578	0.2804	4.99e-19	5mex:A
18	7eov:A	274	184	0.1491	0.1861	0.2772	1.40e-17	7d1x:A, 7d1x:B
19	3mg9:A	255	185	0.1433	0.1922	0.2649	0.004	3mgc:A
20	2atx:A	186	79	0.0643	0.1183	0.2785	0.005	2atx:B
21	3mgb:A	286	228	0.1754	0.2098	0.2632	0.026	3mgb:B
22	1t8t:B	271	109	0.0906	0.1144	0.2844	0.029	1t8t:A, 1t8u:B, 1t8u:A, 6xkg:A, 6xkg:B, 6xl8:A, 6xl8:B
23	4v3p:LT	189	66	0.0556	0.1005	0.2879	0.82	8ip8:LA, 8ipa:LA, 8ipb:LA, 8jiv:CR, 4v7e:CR
24	4egm:B	394	60	0.0526	0.0457	0.3000	1.1	6c2d:A, 6c3h:A, 6c3j:A, 8d1c:A, 8d39:A, 4dnz:A, 4dnz:B, 4dnz:C, 4dnz:D, 4do1:A, 4do1:B, 4do1:C, 4do1:D, 8dyb:A, 8e5j:A, 4egm:A, 4egm:C, 4egm:D, 4egn:A, 4egn:B, 4egn:C, 4egn:D, 4ego:A, 4ego:B, 4ego:C, 4ego:D, 4egp:A, 4egp:B, 8g35:A, 8g36:A, 8gly:A, 8glz:A, 8gm1:A, 8gm2:A, 8hgb:A, 8hgc:A, 7jw5:A, 7jxb:A, 7kcs:A, 5kdb:A, 5kdy:A, 5kdz:A, 5kt1:A, 7n14:A, 7n60:A, 6oow:A, 6oox:A, 6pq6:A, 6pqd:A, 6pqs:A, 6pqw:A, 6prr:A, 6prs:A, 7r8s:A, 7r8t:A, 7reh:A, 8taw:A, 8tay:A, 7tnd:A, 7tnf:A, 7tnu:A, 8tnk:A, 7tp5:A, 7tp6:A, 7tqm:A, 7trt:A, 7tru:A, 7tzm:A, 7tzn:A, 7tzw:A, 7tzx:A, 7tzy:A, 7u00:A, 6u30:A, 6u31:A, 6u3k:A, 5u6t:A, 5u6u:A, 5u6w:A, 7udf:A, 6unn:A, 5uvb:A, 8vf0:A, 8vf3:A, 8vfp:A, 8vfr:A, 6vjx:A, 8vkf:A, 8vl0:A, 6wzp:A, 5yqa:A, 5yqh:A, 5yqh:C, 5yqh:B, 5yqh:D
25	2c1z:A	439	46	0.0409	0.0319	0.3043	1.3	2c1x:A, 2c9z:A
26	4dnj:A	399	75	0.0643	0.0551	0.2933	5.0	2fr7:A
27	5z9o:A	373	36	0.0409	0.0375	0.3889	5.5	5z9o:B
28	1iug:A	348	174	0.1257	0.1236	0.2471	6.3	1iug:B
29	8e3s:A	503	119	0.0965	0.0656	0.2773	7.9	8fzr:A
30	4gox:A	275	99	0.0760	0.0945	0.2626	8.7
31	8c10:A	297	44	0.0351	0.0404	0.2727	9.0
32	4v9f:G	254	45	0.0409	0.0551	0.3111	9.0	2qa4:G
33	5aih:A	125	31	0.0322	0.0880	0.3548	9.1	5aih:B, 5aii:F

[Back]