Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PEFWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHR
STSVSRNQQIFLRDIE

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8dgo:B 218 96 0.9792 0.4312 0.9792 2.46e-64 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
2 4jmh:A 200 63 0.6354 0.3050 0.9683 2.62e-40 4jmg:A
3 4jmh:A 200 29 0.2917 0.1400 0.9655 1.43e-12 4jmg:A
4 5gjh:A 97 91 0.5417 0.5361 0.5714 4.88e-32 5gjh:C
5 1r1p:B 100 94 0.5521 0.5300 0.5638 7.80e-32 1r1p:A, 1r1p:D, 1r1p:C, 1r1q:A, 1r1q:B, 1r1s:A, 1r1s:C, 1r1s:E, 1r1s:G
6 2ci9:A 102 87 0.3542 0.3333 0.3908 1.21e-16 2ci9:B
7 7uy0:A 448 85 0.3958 0.0848 0.4471 2.01e-14 7uy0:B, 7uy3:A
8 2cia:A 98 82 0.3229 0.3163 0.3780 6.06e-14
9 4xey:B 359 80 0.3333 0.0891 0.4000 4.64e-13 7n9g:C, 4wa9:A
10 1aot:F 106 85 0.3438 0.3113 0.3882 3.64e-12 1aou:F, 2mrk:A, 4u1p:A
11 1y57:A 452 85 0.3646 0.0774 0.4118 4.09e-12 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
12 1lck:A 164 90 0.3854 0.2256 0.4111 1.07e-11 1bhf:A, 1cwd:L, 1cwe:A, 1cwe:C, 1fbz:A, 1fbz:B, 2iim:A, 1ijr:A, 1lcj:A, 1lkk:A, 1lkl:A, 1x27:A, 1x27:B, 1x27:C, 1x27:D, 1x27:E, 1x27:F
13 8ssn:B 386 81 0.3125 0.0777 0.3704 1.62e-11
14 2fo0:A 466 81 0.3125 0.0644 0.3704 1.62e-11 1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
15 5mo4:A 429 81 0.3125 0.0699 0.3704 1.86e-11 3cs9:B, 3cs9:C, 2hz0:B, 6npe:B, 6npu:B, 6npv:B, 3pyy:B, 8ssn:A
16 6kc4:A 101 79 0.3021 0.2871 0.3671 1.89e-11 6kc4:C, 6kc4:E, 6kc4:G, 6kc4:I, 6kc4:K
17 8dgq:A 272 81 0.3229 0.1140 0.3827 3.73e-11 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
18 8dgq:A 272 83 0.2396 0.0846 0.2771 2.97e-10 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
19 2lnw:A 113 81 0.2917 0.2478 0.3457 5.02e-11 7rnv:A, 4roj:A, 4roj:B, 4roj:C, 7wfy:C
20 6crg:B 462 84 0.3542 0.0736 0.4048 5.81e-11 6bn5:A
21 6crg:B 462 76 0.3229 0.0671 0.4079 3.10e-08 6bn5:A
22 7t1u:B 107 99 0.3750 0.3364 0.3636 1.09e-10 7t1u:A
23 7r7l:A 490 80 0.3125 0.0612 0.3750 2.40e-10 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
24 7r7l:A 490 76 0.3229 0.0633 0.4079 5.55e-10 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
25 1xa6:A 399 79 0.2812 0.0677 0.3418 2.51e-10
26 3cxl:A 402 79 0.2812 0.0672 0.3418 5.76e-10
27 1qcf:A 450 86 0.3438 0.0733 0.3837 7.67e-10 1ad5:B, 1ad5:A, 2c0i:A, 2c0i:B, 2c0o:A, 2c0o:B, 2c0t:A, 2c0t:B, 5h09:A, 5h0b:A, 5h0e:A, 5h0g:A, 5h0h:A, 2hck:B, 2hck:A, 2hk5:A, 3vry:A, 3vry:B, 3vrz:A, 3vrz:B, 3vs0:A, 3vs0:B, 3vs1:B, 3vs2:A, 3vs2:B, 3vs3:A, 3vs3:B, 3vs4:B, 3vs4:A, 3vs5:A, 3vs5:B, 3vs6:A, 3vs6:B, 3vs7:A, 5zj6:A, 5zj6:B
28 2rmx:A 118 99 0.3542 0.2881 0.3434 7.89e-10 2yu7:A
29 2ror:A 138 83 0.2917 0.2029 0.3373 8.23e-10 2lct:A, 2mc1:A
30 5xzr:A 519 47 0.2396 0.0443 0.4894 1.19e-09 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
31 5xzr:A 519 76 0.3125 0.0578 0.3947 4.08e-09 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
32 1ju5:A 109 51 0.2188 0.1927 0.4118 1.28e-09
33 8t7c:A 1001 87 0.2917 0.0280 0.3218 3.24e-09
34 3ps5:A 529 76 0.2917 0.0529 0.3684 1.22e-08 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
35 3ps5:A 529 101 0.3646 0.0662 0.3465 1.82e-08 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
36 2l4k:A 120 85 0.2708 0.2167 0.3059 2.09e-08 5d0j:A, 5d0j:D, 5eel:C, 5eel:F, 5eel:A, 5eel:B, 5eel:E, 5eel:D, 5eeq:A, 5eeq:B, 7mp3:A, 7mp3:C, 1mw4:A, 3pqz:A, 3pqz:B, 3pqz:D, 3pqz:C, 5tyi:A, 5tyi:B, 5tyi:C, 5tyi:D, 5u06:A, 5u06:B, 5u06:C, 5u06:D, 5u1q:A, 5u1q:B, 5u1q:C, 5u1q:D, 4x6s:A, 4x6s:B
37 1i3z:A 103 79 0.2812 0.2621 0.3418 2.12e-08
38 7t8t:A 1086 87 0.2604 0.0230 0.2874 3.58e-08
39 7t8t:A 1086 94 0.3229 0.0285 0.3298 2.88e-05
40 6pbc:A 1070 87 0.2604 0.0234 0.2874 4.10e-08
41 6pbc:A 1070 94 0.3229 0.0290 0.3298 2.66e-05
42 7z3j:A 1119 87 0.2604 0.0223 0.2874 4.11e-08 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
43 7z3j:A 1119 101 0.3646 0.0313 0.3465 1.97e-06 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
44 1fu5:A 111 86 0.3125 0.2703 0.3488 4.37e-08 1oo4:A
45 1tce:A 107 78 0.2812 0.2523 0.3462 6.84e-08
46 3vs7:B 427 85 0.3229 0.0726 0.3647 6.96e-08 4lud:B, 4lud:A, 4lue:B, 4lue:A, 3vs1:A
47 4k2r:A 551 77 0.2917 0.0508 0.3636 1.04e-07 2oq1:A, 2ozo:A, 1u59:A, 4xz0:A, 4xz1:A
48 4k2r:A 551 60 0.2292 0.0399 0.3667 5.42e-04 2oq1:A, 2ozo:A, 1u59:A, 4xz0:A, 4xz1:A
49 6bn5:B 448 76 0.3125 0.0670 0.3947 1.16e-07
50 6bn5:B 448 81 0.3021 0.0647 0.3580 2.41e-04
51 1pic:A 112 82 0.3125 0.2679 0.3659 3.45e-07 5aul:A, 7cio:A, 1h9o:A
52 1a81:E 220 82 0.2917 0.1273 0.3415 6.94e-07 1a81:G, 1a81:K
53 1a81:E 220 78 0.2604 0.1136 0.3205 5.91e-05 1a81:G, 1a81:K
54 4fl2:A 555 60 0.2396 0.0414 0.3833 1.12e-06 1a81:A, 1a81:C, 1a81:I, 8bi2:A, 5c26:A, 5c27:A, 1csy:A, 1csz:A, 5cxh:A, 5cxz:A, 5cy3:A, 4dfl:A, 4dfn:A, 3emg:A, 4f4p:A, 4fl1:A, 4fl3:A, 3fqe:A, 3fqh:A, 3fqh:B, 3fqs:A, 4fyn:A, 4fyo:A, 4fz6:A, 4fz7:A, 4gfg:A, 5ghv:A, 5ghv:B, 6hm6:A, 6hm7:A, 4i0r:A, 4i0s:A, 4i0t:A, 5lma:A, 5lmb:A, 5lmb:B, 4puz:A, 4puz:B, 4pv0:A, 4px6:A, 7q5t:EEE, 7q5t:CCC, 7q5t:DDD, 7q5t:AAA, 7q5t:BBB, 7q5t:FFF, 7q5u:FFF, 7q5u:DDD, 7q5u:BBB, 7q5u:CCC, 7q5u:EEE, 7q5u:AAA, 7q5w:BBB, 7q5w:DDD, 7q5w:FFF, 7q5w:EEE, 7q5w:AAA, 7q5w:CCC, 8rrq:A, 8rrz:A, 4rss:A, 4rx7:A, 4rx8:A, 4rx9:A, 3srv:A, 3srv:B, 6ssb:A, 5t68:A, 5t68:B, 5tiu:A, 5tr6:A, 5tt7:A, 3tub:A, 3tuc:A, 3tud:A, 3vf8:A, 3vf9:A, 6vov:A, 6vov:B, 4wnm:A, 8x5k:A, 1xbb:A, 1xbc:A, 4xg3:A, 4xg3:B, 4xg4:A, 4xg6:A, 4xg7:A, 4xg8:A, 4xg8:C, 4xg9:A, 4xg9:B, 5y5t:A, 5y5u:A, 5y5u:B, 4yjo:A, 4yjp:A, 4yjq:A, 4yjr:A, 4yjs:A, 4yjt:A, 4yju:A, 4yjv:A, 6zc0:A, 6zcp:A, 6zcq:A, 6zcr:A, 6zcs:A, 6zcu:A, 6zcx:A, 6zcy:A
55 4fl2:A 555 78 0.2604 0.0450 0.3205 3.97e-05 1a81:A, 1a81:C, 1a81:I, 8bi2:A, 5c26:A, 5c27:A, 1csy:A, 1csz:A, 5cxh:A, 5cxz:A, 5cy3:A, 4dfl:A, 4dfn:A, 3emg:A, 4f4p:A, 4fl1:A, 4fl3:A, 3fqe:A, 3fqh:A, 3fqh:B, 3fqs:A, 4fyn:A, 4fyo:A, 4fz6:A, 4fz7:A, 4gfg:A, 5ghv:A, 5ghv:B, 6hm6:A, 6hm7:A, 4i0r:A, 4i0s:A, 4i0t:A, 5lma:A, 5lmb:A, 5lmb:B, 4puz:A, 4puz:B, 4pv0:A, 4px6:A, 7q5t:EEE, 7q5t:CCC, 7q5t:DDD, 7q5t:AAA, 7q5t:BBB, 7q5t:FFF, 7q5u:FFF, 7q5u:DDD, 7q5u:BBB, 7q5u:CCC, 7q5u:EEE, 7q5u:AAA, 7q5w:BBB, 7q5w:DDD, 7q5w:FFF, 7q5w:EEE, 7q5w:AAA, 7q5w:CCC, 8rrq:A, 8rrz:A, 4rss:A, 4rx7:A, 4rx8:A, 4rx9:A, 3srv:A, 3srv:B, 6ssb:A, 5t68:A, 5t68:B, 5tiu:A, 5tr6:A, 5tt7:A, 3tub:A, 3tuc:A, 3tud:A, 3vf8:A, 3vf9:A, 6vov:A, 6vov:B, 4wnm:A, 8x5k:A, 1xbb:A, 1xbc:A, 4xg3:A, 4xg3:B, 4xg4:A, 4xg6:A, 4xg7:A, 4xg8:A, 4xg8:C, 4xg9:A, 4xg9:B, 5y5t:A, 5y5u:A, 5y5u:B, 4yjo:A, 4yjp:A, 4yjq:A, 4yjr:A, 4yjs:A, 4yjt:A, 4yju:A, 4yjv:A, 6zc0:A, 6zcp:A, 6zcq:A, 6zcr:A, 6zcs:A, 6zcu:A, 6zcx:A, 6zcy:A
56 1ka6:A 107 56 0.1979 0.1776 0.3393 1.69e-06 1d4t:A, 1d4w:A, 1d4w:B, 1ka7:A, 1m27:A
57 7r8w:A 113 83 0.2188 0.1858 0.2530 2.84e-06 8cz9:A, 7r8x:A
58 2hdx:A 108 79 0.2188 0.1944 0.2658 3.47e-06 2hdx:B, 2hdx:C, 2hdx:D, 2hdx:E, 2hdx:F
59 3bkb:A 373 81 0.2917 0.0751 0.3457 2.02e-05 3cbl:A, 4e93:A, 6jmf:A, 7t1k:A, 7t1l:A, 7t1l:B
60 2etz:A 108 89 0.2812 0.2500 0.3034 3.41e-05 2eu0:A
61 5swo:B 267 87 0.2917 0.1049 0.3218 5.37e-04 5gji:A, 2iuh:A, 2iui:A, 2iui:B, 7rns:A, 5sxk:B
62 6i5n:D 151 77 0.2292 0.1457 0.2857 0.001 7zls:D
63 3cd3:A 353 42 0.1875 0.0510 0.4286 0.002
64 6i5j:D 169 83 0.2292 0.1302 0.2651 0.069 6i4x:A, 6i5j:A, 6i5n:A, 7m6t:A, 7zlm:A, 7zlm:D, 7zlm:G, 7zlm:J, 7zln:A, 7zlo:A, 7zlp:A, 7zlr:A, 7zls:A, 7zls:G, 7zls:J
65 6c5x:A 151 76 0.2292 0.1457 0.2895 0.13
66 2vif:A 131 51 0.1771 0.1298 0.3333 0.31
67 7qqg:D 496 38 0.1667 0.0323 0.4211 1.3
68 7qqg:B 623 38 0.1667 0.0257 0.4211 1.5 7qqg:A, 7qqg:C, 7qqh:A, 7qqh:B, 7qqh:C, 7qqh:D
69 8wvd:A 450 75 0.2292 0.0489 0.2933 1.5 6l8z:A
70 4gl9:F 126 56 0.1562 0.1190 0.2679 6.0 4gl9:G, 4gl9:E, 4gl9:H, 2hmh:A
71 8cjf:B 638 50 0.1667 0.0251 0.3200 7.3 8cjd:A, 8cjd:B, 8cje:A, 8cje:B, 8cje:C, 8cje:D, 8cjf:A, 8cjg:A, 8cjg:B, 8jz2:A, 8jz3:A, 8jz4:A, 8jz5:A, 8jz6:A
72 4oau:C 692 37 0.1354 0.0188 0.3514 8.9 4g8l:A, 4g8l:B, 4g8l:C, 4g8l:D, 4oav:B, 4oav:D, 1wdy:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218