Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIILQMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGSVSQAEWVRAGATTVPL
LVLLGLE

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6iie:A 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 2.56e-59
2 5b8i:B 171 77 0.3218 0.1637 0.3636 7.80e-08
3 6tz8:B 174 76 0.2989 0.1494 0.3421 9.89e-06 6tz8:E
4 6tz8:B 174 68 0.2299 0.1149 0.2941 3.0 6tz8:E
5 2bec:A 181 71 0.2644 0.1271 0.3239 1.04e-05
6 6tz6:E 146 74 0.2874 0.1712 0.3378 1.77e-05 6tz6:B
7 2l1w:A 149 73 0.2874 0.1678 0.3425 2.74e-05 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
8 2l1w:A 149 72 0.2299 0.1342 0.2778 0.13 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
9 2kn2:A 92 73 0.2874 0.2717 0.3425 3.08e-05
10 7u0u:A 195 70 0.3218 0.1436 0.4000 6.20e-05 6tz7:B
11 4il1:A 529 69 0.2529 0.0416 0.3188 8.32e-05 1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
12 1jba:A 189 81 0.2759 0.1270 0.2963 2.01e-04
13 1osa:A 148 72 0.2644 0.1554 0.3194 2.24e-04 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
14 1osa:A 148 64 0.2184 0.1284 0.2969 0.28 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
15 7u0t:A 190 70 0.2529 0.1158 0.3143 2.49e-04
16 2ct9:B 198 70 0.2414 0.1061 0.3000 2.56e-04 2ct9:A, 2e30:A
17 8ebs:J 149 64 0.2644 0.1544 0.3594 2.71e-04 2a4j:A, 8ebt:J, 8ebv:J, 8ebw:J, 8ebx:J, 2ggm:A, 2ggm:B, 2k2i:A, 2obh:A, 2obh:B
18 1bjf:A 181 86 0.2874 0.1381 0.2907 5.97e-04 1bjf:B
19 1rfj:A 148 73 0.2529 0.1486 0.3014 6.96e-04 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
20 1rfj:A 148 65 0.1724 0.1014 0.2308 0.22 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
21 1ggz:A 144 72 0.2644 0.1597 0.3194 0.001
22 1ggz:A 144 63 0.1954 0.1181 0.2698 0.12
23 2l4h:A 184 70 0.1724 0.0815 0.2143 0.001 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
24 2n6a:A 162 82 0.2874 0.1543 0.3049 0.002
25 2n6a:A 162 63 0.1724 0.0926 0.2381 0.28
26 5g4p:A 184 86 0.2874 0.1359 0.2907 0.002 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
27 1uhn:A 189 69 0.1839 0.0847 0.2319 0.003 2zfd:A
28 3kf9:A 149 65 0.2414 0.1409 0.3231 0.003 3kf9:C
29 3kf9:A 149 65 0.1954 0.1141 0.2615 0.15 3kf9:C
30 4y5q:A 449 79 0.2529 0.0490 0.2785 0.004 9d8s:A, 3igo:A, 3mwu:A, 3ncg:A, 2wei:A
31 4y5q:A 449 53 0.1379 0.0267 0.2264 9.9 9d8s:A, 3igo:A, 3mwu:A, 3ncg:A, 2wei:A
32 2ggz:A 165 82 0.2874 0.1515 0.3049 0.004 2ggz:B
33 6hr1:A 406 72 0.2529 0.0542 0.3056 0.005 6hr1:B
34 6hr1:A 406 63 0.1724 0.0369 0.2381 0.24 6hr1:B
35 2lv7:A 100 74 0.2759 0.2400 0.3243 0.006
36 6dmw:E 113 72 0.2529 0.1947 0.3056 0.007
37 6dmw:E 113 61 0.1839 0.1416 0.2623 0.050
38 3o78:A 402 72 0.2529 0.0547 0.3056 0.007 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
39 3o78:A 402 63 0.2184 0.0473 0.3016 0.19 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
40 2f2p:A 169 73 0.2529 0.1302 0.3014 0.007 2f2o:B, 2f2p:B
41 2f2p:A 169 63 0.2184 0.1124 0.3016 0.31 2f2o:B, 2f2p:B
42 3u0k:A 397 72 0.2529 0.0554 0.3056 0.009
43 3u0k:A 397 63 0.1954 0.0428 0.2698 0.42
44 6u2m:A 464 72 0.2529 0.0474 0.3056 0.010 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
45 6u2m:A 464 64 0.1724 0.0323 0.2344 0.16 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
46 8jp5:C 101 65 0.2069 0.1782 0.2769 0.012 3a4u:B, 8jp4:C, 8jp4:D, 8jp4:G, 8jp4:H, 8jp5:D, 8jp5:G, 8jp5:H, 8jp6:C, 8jp6:D, 8jp6:G, 8jp6:H, 8jp7:C, 8jp7:D, 8jp7:G, 8jp7:H, 8jp8:C, 8jp8:D, 8jp8:G, 8jp8:H, 8jp9:C, 8jp9:D, 8jp9:G, 8jp9:H, 8jpg:C, 8jpg:G, 8jpg:D, 8jpg:H, 3lcp:C, 3lcp:D, 2vrg:A, 4ygb:B, 4ygb:D, 4ygc:B, 4ygc:D, 4ygd:B, 4ygd:F, 4ygd:H, 4yge:B, 4yge:D, 4yge:F
47 6xu4:A 389 71 0.2299 0.0514 0.2817 0.013 6xu4:B, 6xu4:E
48 6xu4:A 389 63 0.2299 0.0514 0.3175 0.28 6xu4:B, 6xu4:E
49 6xyr:A 348 73 0.2529 0.0632 0.3014 0.013
50 6xyr:A 348 63 0.1724 0.0431 0.2381 0.45
51 6tj5:A 131 72 0.2184 0.1450 0.2639 0.013
52 8b6q:A 466 71 0.2529 0.0472 0.3099 0.014 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
53 8b6q:A 466 64 0.1724 0.0322 0.2344 0.28 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
54 2r2i:A 184 70 0.2414 0.1141 0.3000 0.017
55 6xw2:A 387 72 0.2529 0.0568 0.3056 0.021
56 5d43:A 150 65 0.2299 0.1333 0.3077 0.022 5d43:B
57 2doq:B 149 71 0.2299 0.1342 0.2817 0.022 2doq:A, 2doq:C, 4mbe:D, 4mbe:A
58 2kz2:A 93 73 0.2529 0.2366 0.3014 0.042
59 7pjd:B 184 70 0.2414 0.1141 0.3000 0.043 7pjd:A, 7pjd:C, 7pjd:D, 7pjd:E, 7pjd:F
60 3qrx:A 145 63 0.2069 0.1241 0.2857 0.045 1oqp:A
61 6k67:B 83 63 0.1954 0.2048 0.2698 0.052 6k67:D
62 5e37:A 313 80 0.2299 0.0639 0.2500 0.062 5e37:C
63 5e37:A 313 75 0.2414 0.0671 0.2800 4.0 5e37:C
64 7vus:B 68 71 0.2529 0.3235 0.3099 0.068 7vur:A, 7vur:B, 7vus:A, 7vus:C, 7vus:D, 7vut:A, 7vut:B, 7vuu:A, 7vuu:B, 7vuu:C, 7vuu:D
65 1omr:A 201 32 0.1494 0.0647 0.4062 0.068 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
66 5coc:A 124 64 0.2184 0.1532 0.2969 0.071
67 5h7d:E 113 63 0.2184 0.1681 0.3016 0.074 5h7d:F, 5h7d:G, 5h7d:H, 5h7d:K, 5h7d:L, 5h7d:O, 5h7d:P
68 1h4b:A 84 83 0.2529 0.2619 0.2651 0.083
69 1v1f:A 188 70 0.1954 0.0904 0.2429 0.094 2ehb:A, 1v1g:A
70 2lhi:A 176 64 0.2414 0.1193 0.3281 0.097 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D
71 2lmt:A 148 70 0.1954 0.1149 0.2429 0.10 2lmu:A, 2lmv:A
72 8aht:A 140 71 0.2184 0.1357 0.2676 0.12 8aht:B
73 8aht:A 140 63 0.1839 0.1143 0.2540 0.15 8aht:B
74 7clt:A 102 67 0.2299 0.1961 0.2985 0.13 7ygv:A, 7ygw:A
75 5z1q:A 75 59 0.2069 0.2400 0.3051 0.14 5z1q:B, 5z1q:C
76 2opo:C 85 63 0.2414 0.2471 0.3333 0.15 2opo:A, 2opo:B, 2opo:D
77 2jnx:A 134 39 0.1839 0.1194 0.4103 0.18
78 2jnx:A 134 65 0.2299 0.1493 0.3077 0.48
79 1qx7:M 115 63 0.2184 0.1652 0.3016 0.20
80 1qx7:M 115 64 0.2529 0.1913 0.3438 0.29
81 5ukg:A 393 72 0.2414 0.0534 0.2917 0.20 5ukg:B
82 5ukg:A 393 63 0.1954 0.0433 0.2698 0.59 5ukg:B
83 1a75:B 108 69 0.2299 0.1852 0.2899 0.27 1a75:A
84 2lvj:A 77 69 0.2414 0.2727 0.3043 0.29 1k9u:A, 1k9u:B, 2lvk:A, 5otj:D, 5otj:C
85 4i2y:A 381 72 0.2414 0.0551 0.2917 0.35 4i2y:B
86 4i2y:A 381 64 0.1954 0.0446 0.2656 1.3 4i2y:B
87 8bav:C 264 67 0.2069 0.0682 0.2687 0.39 8bav:D
88 2m28:A 72 68 0.2069 0.2500 0.2647 0.41
89 8ban:C 251 67 0.2069 0.0717 0.2687 0.65 8ban:D, 8bbj:C, 8bbj:D
90 6gez:B 532 79 0.2299 0.0376 0.2532 0.69 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
91 1la0:A 161 22 0.1379 0.0745 0.5455 0.82 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
92 7ukh:I 181 75 0.2069 0.0994 0.2400 0.85 7ukh:J, 7ukh:K, 7ukh:L
93 3lij:A 465 71 0.2299 0.0430 0.2817 0.93 3l19:A, 3l19:B
94 5iz3:A 316 32 0.1264 0.0348 0.3438 1.0 5iz3:B
95 7jgi:A 125 22 0.1379 0.0960 0.5455 1.0 6mv3:A, 7uh9:A, 7uha:A, 5w88:A, 5wcl:A
96 3q5i:A 470 75 0.2299 0.0426 0.2667 1.1
97 3q5i:A 470 24 0.1034 0.0191 0.3750 9.9
98 6fie:B 255 22 0.1149 0.0392 0.4545 1.2
99 6fie:B 255 65 0.1839 0.0627 0.2462 3.0
100 2n7l:C 140 22 0.1379 0.0857 0.5455 1.2 7sc2:A, 7sc3:A
101 8c0t:A 281 71 0.2184 0.0676 0.2676 1.2
102 7sup:A 129 22 0.1379 0.0930 0.5455 1.2 7svc:A, 7swg:A, 7swi:A, 7sxc:A
103 4n5x:A 155 69 0.2184 0.1226 0.2754 1.2 4zcu:A, 4zcu:B, 4zcu:C, 4zcv:A, 4zcv:B, 4zcv:C, 4zcv:D
104 8osi:A 400 63 0.2069 0.0450 0.2857 1.3
105 8osi:A 400 63 0.2069 0.0450 0.2857 2.9
106 1jfk:A 134 35 0.1609 0.1045 0.4000 1.5 3li6:A, 3li6:D, 3li6:G, 3li6:J, 2m7m:A, 2m7n:A, 2nxq:A, 2nxq:B, 3ulg:A, 3ulg:B, 5xop:A, 5xop:B, 5xop:C, 5xop:D, 5xop:E, 5xop:F
107 1jfk:A 134 65 0.2184 0.1418 0.2923 2.0 3li6:A, 3li6:D, 3li6:G, 3li6:J, 2m7m:A, 2m7n:A, 2nxq:A, 2nxq:B, 3ulg:A, 3ulg:B, 5xop:A, 5xop:B, 5xop:C, 5xop:D, 5xop:E, 5xop:F
108 2bl0:B 145 72 0.2069 0.1241 0.2500 1.5
109 1s6j:A 87 65 0.1954 0.1954 0.2615 1.6
110 3fdq:A 140 32 0.1264 0.0786 0.3438 1.6 3fdq:B
111 7d3e:C 1380 35 0.1034 0.0065 0.2571 1.7 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
112 7d3e:C 1380 36 0.1379 0.0087 0.3333 3.3 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
113 8u87:A 621 88 0.2529 0.0354 0.2500 1.8 8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
114 8u87:A 621 59 0.1839 0.0258 0.2712 7.9 8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
115 8sw0:A 864 60 0.1954 0.0197 0.2833 2.1 8sw1:A
116 5x9a:B 198 85 0.2184 0.0960 0.2235 2.2 5x9a:A, 5ypx:A, 5ypx:B
117 7m2m:A 183 74 0.2069 0.0984 0.2432 2.3
118 1s1e:A 181 75 0.2184 0.1050 0.2533 2.3 2i2r:E, 2i2r:F, 2i2r:G, 2i2r:H, 2i2r:M, 2i2r:N, 2i2r:O, 2i2r:P, 2nz0:A, 2nz0:C, 1s6c:A
119 6jlh:A 261 67 0.2069 0.0690 0.2687 2.4 6jlh:C
120 3k21:A 178 63 0.1379 0.0674 0.1905 2.6
121 1fpw:A 190 84 0.2414 0.1105 0.2500 2.7 2ju0:A
122 3dd4:A 214 72 0.1839 0.0748 0.2222 2.9
123 3dd4:A 214 38 0.1494 0.0607 0.3421 9.0
124 3ox5:A 153 65 0.2069 0.1176 0.2769 2.9 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
125 1s6i:A 182 72 0.2299 0.1099 0.2778 3.1
126 3akb:A 166 60 0.1839 0.0964 0.2667 3.7 3aka:A
127 2bl0:C 142 63 0.1609 0.0986 0.2222 4.0
128 5i2l:A 105 67 0.2184 0.1810 0.2836 4.9 5h0p:A, 5i2o:A, 5i2q:A, 7ygy:A
129 5d6a:A 548 23 0.1494 0.0237 0.5652 5.0
130 4ih8:A 433 60 0.1954 0.0393 0.2833 5.1 5t6a:A, 5t6i:A, 5t6k:A
131 5nno:A 484 51 0.1724 0.0310 0.2941 5.2 5nno:B
132 4mvf:A 408 63 0.1609 0.0343 0.2222 5.4 3pm8:A, 3pm8:B
133 4ygd:D 62 64 0.1954 0.2742 0.2656 5.7 3wht:B, 3whu:B, 3wnx:B, 4ygc:F, 4ygc:H
134 6h68:M 396 39 0.1264 0.0278 0.2821 6.0 6rwe:M
135 5dvr:A 386 27 0.1034 0.0233 0.3333 6.6
136 4ieb:A 472 27 0.1034 0.0191 0.3333 6.7 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
137 2lcp:A 190 28 0.1264 0.0579 0.3929 7.0 5aeq:A, 5aeq:B, 5aer:A, 5afp:B, 5afp:A, 8ahy:B, 8alh:B, 8alm:B, 1g8i:A, 1g8i:B, 4guk:A, 4guk:C, 4guk:B, 4guk:D, 4ov2:A, 4ov2:B, 4ov2:C, 4ov2:D, 6qi4:B, 6qi4:C, 4yru:A, 4yru:B, 4yru:C, 4yru:D
138 5aan:A 183 28 0.1149 0.0546 0.3571 7.9 4by4:A, 4by4:B, 4by5:A, 4by5:B, 4by5:C, 4by5:D, 6epa:A, 5fyx:A, 5g08:A
139 7w7g:B 1711 47 0.1494 0.0076 0.2766 8.0
140 1nya:A 176 81 0.1954 0.0966 0.2099 9.0
141 6xqo:I 274 28 0.0920 0.0292 0.2857 9.1
142 4usl:A 173 24 0.1149 0.0578 0.4167 9.2 5mra:A, 5mra:B, 5mra:C, 5mra:D, 4u8d:A, 4u8d:B
143 5nkk:D 258 49 0.1839 0.0620 0.3265 9.3 5nkk:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218