BioLiP

>protein
PEAVARLGRVRWTQQRHAEAAVLLQQASDAAPEHPGIALWLGHALEDAGQAEAAAAAYTRAHQLLPEEPYITAQLLNWRR
RLCDWRALDVLSAQVRAAVAQGVGAVEPFAFLSEDASAAEQLACARTRAQAIAASVRPLAPTRVRSKGPLRVGFVSNGFG
AHPTGLLTVALFEALQRRQPDLQMHLFATSGDDGSTLRTRLAQASTLHDVTALGHLATAKHIRHHGIDLLFDLRGWGGGG
RPEVFALRPAPVQVNWLAYPGTSGAPWMDYVLGDAFALPPALEPFYSEHVLRLQGAFQPSDTSRVVAEPPSRTQCGLPEQ
GVVLCCFNNSYKLNPQSMARMLAVLREVPDSVLWLLSGPGEADARLRAFAHAQGVDAQRLVFMPKLPHPQYLARYRHADL
FLDTHPYNAHTTASDALWTGCPVLTTPGETFAARVAGSLNHHLGLDEMNVADDAAFVAKAVALASDPAALTALHARVDVL
RRASGVFHMDGFADDFGALLQALARRHGWLGI

The query sequence (length=512) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2jlb:A	548	512	1.0000	0.9343	1.0000	0.0	2jlb:B, 2vsn:A, 2vsn:B, 2xgm:A, 2xgm:B, 2xgo:A, 2xgs:A, 2xgs:B
2	5djs:A	520	332	0.2129	0.2096	0.3283	1.41e-37	5djs:B, 5djs:C, 5djs:D
3	7y4i:A	822	355	0.1973	0.1229	0.2845	6.08e-32	8dti:A, 8dti:B
4	5lwv:A	711	189	0.1309	0.0942	0.3545	7.15e-31	5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
5	5lwv:A	711	267	0.1621	0.1167	0.3109	2.19e-27	5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
6	7yeh:A	1020	182	0.1289	0.0647	0.3626	1.38e-30	4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
7	7yeh:A	1020	333	0.1836	0.0922	0.2823	3.26e-28	4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
8	5a01:A	681	308	0.1680	0.1263	0.2792	1.56e-28	5a01:B, 5a01:C
9	5a01:A	681	190	0.1309	0.0984	0.3526	1.02e-27	5a01:B, 5a01:C
10	8p0o:A	622	244	0.1094	0.0900	0.2295	6.98e-04	8p0o:B, 8p0p:A, 8p0p:B, 8p0q:A, 8p0q:B
11	3q3h:A	620	232	0.1016	0.0839	0.2241	0.017	8j30:A, 8j30:B
12	3q3h:B	595	226	0.0996	0.0857	0.2257	0.066
13	1dfo:B	417	51	0.0312	0.0384	0.3137	0.94	1dfo:A, 1dfo:D, 1dfo:C, 1eqb:A, 1eqb:B, 1eqb:D, 1eqb:C, 3g8m:A
14	7x5o:B	412	37	0.0234	0.0291	0.3243	1.8	7v3d:A, 7v3d:B, 7x5n:A, 7x5n:B, 7x5o:A
15	9cp7:A	436	86	0.0488	0.0573	0.2907	1.9	9cp7:B, 9cp8:A, 9cp8:B, 9cp9:A, 9cp9:B, 8v35:A, 8v36:A, 8v37:A
16	4n0w:A	416	55	0.0312	0.0385	0.2909	2.2	4n0w:B, 4n0w:C, 4n0w:D, 4ot8:A, 4ot8:C, 4ot8:B, 4ot8:D, 4otl:A, 4otl:B, 4otl:D, 4otl:C
17	4ayb:B	1103	146	0.0664	0.0308	0.2329	3.0	3hkz:B, 3hkz:J, 2pmz:B, 2pmz:R, 4v8s:AR, 4v8s:BB, 2waq:B, 2wb1:B, 2wb1:R, 2y0s:B, 2y0s:R
18	6uld:A	428	61	0.0391	0.0467	0.3279	4.0	6uld:B
19	9boh:A	402	37	0.0234	0.0299	0.3243	5.7	9boh:B, 9bow:A, 9bow:B, 9bpe:A, 9bpe:B, 2dkj:A, 2dkj:B, 8ssy:A, 8ssy:B, 8sui:B
20	5dhi:A	536	74	0.0410	0.0392	0.2838	9.9	5dhk:A, 4di5:A, 5eas:A, 5eat:A, 5eau:A, 1hx9:A, 1hxa:A, 1hxc:A, 1hxg:A, 5ik0:A, 5ik6:A, 5ik9:A, 5ika:A, 5ikh:A, 5il3:A, 5il8:A, 5ild:A, 5ilh:A, 5ili:A, 5ily:A, 3lz9:A, 3m00:A, 3m01:A, 3m02:A, 4rnq:A

[Back]