Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PDVDECALGANPCEHAGKCLNTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECISNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVYCEIN
TDECASSPCLHNGRCVDKINEFLCQCPKGFSGHLCQS

The query sequence (length=117) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4xlw:C 118 114 0.9744 0.9661 1.0000 6.25e-80 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
2 4d0f:A 125 115 0.8889 0.8320 0.9043 1.75e-75 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
3 4d0f:A 125 46 0.1538 0.1440 0.3913 5.95e-06 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
4 5mwb:A 118 116 0.6581 0.6525 0.6638 8.32e-55
5 5uk5:A 194 77 0.6581 0.3969 1.0000 5.27e-50 2rqz:A, 2rr2:A
6 5uk5:A 194 112 0.4103 0.2474 0.4286 2.30e-23 2rqz:A, 2rr2:A
7 5uk5:A 194 114 0.3590 0.2165 0.3684 5.21e-18 2rqz:A, 2rr2:A
8 7alj:A 115 114 0.5726 0.5826 0.5877 7.06e-44
9 7alj:A 115 79 0.3248 0.3304 0.4810 7.94e-21
10 7alj:A 115 37 0.1453 0.1478 0.4595 0.004
11 5fm9:A 154 115 0.3932 0.2987 0.4000 1.74e-23 5fma:A, 5fma:B
12 4xbm:B 401 109 0.3761 0.1097 0.4037 1.18e-21
13 4xbm:B 401 93 0.3419 0.0998 0.4301 5.29e-18
14 4xbm:B 401 105 0.3419 0.0998 0.3810 4.55e-16
15 4d90:A 127 125 0.3846 0.3543 0.3600 9.02e-16 4d90:B
16 4d90:A 127 90 0.2479 0.2283 0.3222 0.001 4d90:B
17 6pog:B 236 127 0.3932 0.1949 0.3622 9.79e-12
18 6pog:B 236 117 0.3162 0.1568 0.3162 8.29e-07
19 6pog:B 236 81 0.2308 0.1144 0.3333 5.08e-06
20 5l0t:B 40 42 0.1966 0.5750 0.5476 4.07e-10 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
21 5l0t:B 40 37 0.1624 0.4750 0.5135 1.09e-08 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
22 5l0t:B 40 37 0.1453 0.4250 0.4595 2.72e-06 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
23 1emn:A 82 75 0.2906 0.4146 0.4533 1.74e-08 1emo:A
24 1emn:A 82 72 0.2051 0.2927 0.3333 0.003 1emo:A
25 1xkb:A 91 72 0.2222 0.2857 0.3611 1.99e-08 3k9x:A
26 1xkb:A 91 64 0.1795 0.2308 0.3281 1.30e-04 3k9x:A
27 1xkb:A 91 35 0.1282 0.1648 0.4286 2.84e-04 3k9x:A
28 7pfp:A 563 80 0.2821 0.0586 0.4125 2.34e-08 7pfp:C, 7q3n:U
29 7pfp:A 563 110 0.2821 0.0586 0.3000 7.29e-07 7pfp:C, 7q3n:U
30 6r2w:L 143 42 0.1538 0.1259 0.4286 1.02e-06 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
31 6r2w:L 143 36 0.1282 0.1049 0.4167 0.001 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
32 6r2w:L 143 84 0.2308 0.1888 0.3214 0.021 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
33 5vyg:B 43 38 0.1538 0.4186 0.4737 1.02e-06 5vyg:A, 5vyg:C
34 5vyg:B 43 39 0.1453 0.3953 0.4359 4.10e-05 5vyg:A, 5vyg:C
35 5vyg:B 43 40 0.1368 0.3721 0.4000 0.004 5vyg:A, 5vyg:C
36 3h5c:B 312 68 0.2137 0.0801 0.3676 1.27e-06
37 3h5c:B 312 67 0.1966 0.0737 0.3433 2.99e-04
38 3h5c:B 312 33 0.1368 0.0513 0.4848 0.002
39 1lmj:A 86 77 0.2222 0.3023 0.3377 3.30e-06
40 8eph:A 91 35 0.1538 0.1978 0.5143 9.24e-06 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
41 8eph:A 91 74 0.2137 0.2747 0.3378 9.34e-06 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
42 8eph:A 91 77 0.2308 0.2967 0.3506 3.26e-04 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
43 5ky2:B 40 37 0.1453 0.4250 0.4595 1.29e-05 5ky3:B
44 5ky2:B 40 39 0.1453 0.4250 0.4359 0.007 5ky3:B
45 5ky2:B 40 36 0.1197 0.3500 0.3889 0.009 5ky3:B
46 2bo2:A 140 86 0.2393 0.2000 0.3256 2.16e-05 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
47 2bo2:A 140 44 0.1624 0.1357 0.4318 1.39e-04 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
48 2bo2:A 140 85 0.1966 0.1643 0.2706 0.086 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
49 8em7:A 4378 72 0.1966 0.0053 0.3194 2.52e-05 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
50 8em7:A 4378 78 0.2308 0.0062 0.3462 7.02e-05 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
51 8em7:A 4378 89 0.2137 0.0057 0.2809 0.058 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
52 8em7:A 4378 44 0.1368 0.0037 0.3636 2.1 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
53 8em7:A 4378 81 0.2222 0.0059 0.3210 7.2 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
54 8em4:A 3818 72 0.1966 0.0060 0.3194 2.64e-05 8em4:B
55 8em4:A 3818 78 0.2308 0.0071 0.3462 8.75e-05 8em4:B
56 8em4:A 3818 89 0.2137 0.0065 0.2809 0.070 8em4:B
57 8em4:A 3818 44 0.1368 0.0042 0.3636 2.2 8em4:B
58 8em4:A 3818 81 0.2222 0.0068 0.3210 9.2 8em4:B
59 5uk5:B 308 93 0.2393 0.0909 0.3011 5.88e-05 4cbz:A, 4cc0:A, 4cc0:B, 4cc1:A, 4cc1:B
60 5uk5:B 308 55 0.1709 0.0649 0.3636 0.047 4cbz:A, 4cc0:A, 4cc0:B, 4cc1:A, 4cc1:B
61 5uk5:B 308 30 0.1197 0.0455 0.4667 0.73 4cbz:A, 4cc0:A, 4cc0:B, 4cc1:A, 4cc1:B
62 6pol:B 129 79 0.2222 0.2016 0.3291 3.31e-04 6pol:D, 6pol:F
63 1z6c:A 87 71 0.2393 0.3218 0.3944 4.33e-04
64 2w86:A 147 145 0.3675 0.2925 0.2966 0.001
65 3poy:A 1005 44 0.1453 0.0169 0.3864 0.002 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
66 3poy:A 1005 34 0.1197 0.0139 0.4118 0.003 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
67 3poy:A 1005 40 0.1197 0.0139 0.3500 0.15 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
68 3poy:A 1005 40 0.1197 0.0139 0.3500 0.16 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
69 3poy:A 1005 32 0.1026 0.0119 0.3750 0.48 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
70 3poy:A 1005 30 0.0855 0.0100 0.3333 1.5 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
71 1uzj:A 162 33 0.1453 0.1049 0.5152 0.005 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
72 1uzj:A 162 55 0.1624 0.1173 0.3455 1.1 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
73 1g1q:A 160 28 0.1111 0.0813 0.4643 0.009 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
74 1g1q:A 160 33 0.1111 0.0813 0.3939 0.40 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
75 4c16:A 280 36 0.1282 0.0536 0.4167 0.010 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
76 4c16:A 280 53 0.1368 0.0571 0.3019 0.100 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
77 4c16:A 280 33 0.0940 0.0393 0.3333 1.5 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
78 8jxj:A 570 89 0.2222 0.0456 0.2921 0.011 8jxj:B
79 5ms9:A 177 33 0.1453 0.0960 0.5152 0.016
80 5ms9:A 177 128 0.2821 0.1864 0.2578 0.057
81 5ms9:A 177 66 0.2051 0.1356 0.3636 0.32
82 4rs0:A 557 36 0.1197 0.0251 0.3889 0.055 6bl3:A, 6bl3:B, 6bl3:C, 6bl3:D, 6bl4:A, 6bl4:B, 6bl4:C, 6bl4:D, 4cox:A, 4cox:B, 4cox:C, 4cox:D, 5cox:A, 5cox:B, 5cox:C, 5cox:D, 6cox:A, 6cox:B, 1cvu:B, 1cvu:A, 1cx2:A, 1cx2:B, 1cx2:C, 1cx2:D, 1ddx:A, 1ddx:B, 1ddx:C, 1ddx:D, 4e1g:A, 4e1g:B, 8et0:A, 8et0:B, 5fdq:A, 5fdq:B, 4fm5:A, 4fm5:B, 4fm5:C, 4fm5:D, 3hs5:A, 3hs5:B, 3hs6:A, 3hs6:B, 3hs7:A, 3hs7:B, 5jvy:A, 5jvy:B, 5jvz:A, 5jvz:B, 5jw1:A, 5jw1:B, 3krk:A, 3krk:B, 3ln0:A, 3ln0:B, 3ln0:C, 3ln0:D, 3ln1:A, 3ln1:B, 3ln1:C, 3ln1:D, 4m10:A, 4m10:B, 4m10:C, 4m10:D, 4m11:A, 4m11:B, 4m11:C, 4m11:D, 3mdl:A, 3mdl:B, 3mqe:A, 3mqe:B, 3mqe:C, 3mqe:D, 3nt1:A, 3nt1:B, 3ntb:A, 3ntb:B, 3ntb:C, 3ntb:D, 3ntg:A, 3ntg:B, 3ntg:C, 3ntg:D, 6ofy:A, 6ofy:B, 3olt:A, 3olt:B, 3olu:A, 3olu:B, 4otj:A, 4otj:B, 4otj:C, 4otj:D, 4oty:A, 4oty:B, 3pgh:A, 3pgh:B, 3pgh:C, 3pgh:D, 4ph9:A, 4ph9:B, 1pxx:A, 1pxx:B, 1pxx:C, 1pxx:D, 3q7d:A, 3q7d:B, 3qh0:A, 3qh0:B, 3qmo:A, 3qmo:B, 3rr3:A, 3rr3:B, 3rr3:C, 3rr3:D, 4rrw:A, 4rrw:B, 4rrw:C, 4rrw:D, 4rrx:A, 4rrx:B, 4rrz:A, 4rrz:B, 4rrz:C, 4rrz:D, 4rut:A, 4rut:B, 4rut:C, 4rut:D, 3tzi:A, 3tzi:B, 6v3r:A, 6v3r:B, 6v3r:C, 6v3r:D, 5w58:A, 4z0l:A, 4z0l:B, 4z0l:C, 4z0l:D
83 4rs0:A 557 32 0.0940 0.0197 0.3438 0.20 6bl3:A, 6bl3:B, 6bl3:C, 6bl3:D, 6bl4:A, 6bl4:B, 6bl4:C, 6bl4:D, 4cox:A, 4cox:B, 4cox:C, 4cox:D, 5cox:A, 5cox:B, 5cox:C, 5cox:D, 6cox:A, 6cox:B, 1cvu:B, 1cvu:A, 1cx2:A, 1cx2:B, 1cx2:C, 1cx2:D, 1ddx:A, 1ddx:B, 1ddx:C, 1ddx:D, 4e1g:A, 4e1g:B, 8et0:A, 8et0:B, 5fdq:A, 5fdq:B, 4fm5:A, 4fm5:B, 4fm5:C, 4fm5:D, 3hs5:A, 3hs5:B, 3hs6:A, 3hs6:B, 3hs7:A, 3hs7:B, 5jvy:A, 5jvy:B, 5jvz:A, 5jvz:B, 5jw1:A, 5jw1:B, 3krk:A, 3krk:B, 3ln0:A, 3ln0:B, 3ln0:C, 3ln0:D, 3ln1:A, 3ln1:B, 3ln1:C, 3ln1:D, 4m10:A, 4m10:B, 4m10:C, 4m10:D, 4m11:A, 4m11:B, 4m11:C, 4m11:D, 3mdl:A, 3mdl:B, 3mqe:A, 3mqe:B, 3mqe:C, 3mqe:D, 3nt1:A, 3nt1:B, 3ntb:A, 3ntb:B, 3ntb:C, 3ntb:D, 3ntg:A, 3ntg:B, 3ntg:C, 3ntg:D, 6ofy:A, 6ofy:B, 3olt:A, 3olt:B, 3olu:A, 3olu:B, 4otj:A, 4otj:B, 4otj:C, 4otj:D, 4oty:A, 4oty:B, 3pgh:A, 3pgh:B, 3pgh:C, 3pgh:D, 4ph9:A, 4ph9:B, 1pxx:A, 1pxx:B, 1pxx:C, 1pxx:D, 3q7d:A, 3q7d:B, 3qh0:A, 3qh0:B, 3qmo:A, 3qmo:B, 3rr3:A, 3rr3:B, 3rr3:C, 3rr3:D, 4rrw:A, 4rrw:B, 4rrw:C, 4rrw:D, 4rrx:A, 4rrx:B, 4rrz:A, 4rrz:B, 4rrz:C, 4rrz:D, 4rut:A, 4rut:B, 4rut:C, 4rut:D, 3tzi:A, 3tzi:B, 6v3r:A, 6v3r:B, 6v3r:C, 6v3r:D, 5w58:A, 4z0l:A, 4z0l:B, 4z0l:C, 4z0l:D
84 4rs0:A 557 38 0.1026 0.0215 0.3158 0.33 6bl3:A, 6bl3:B, 6bl3:C, 6bl3:D, 6bl4:A, 6bl4:B, 6bl4:C, 6bl4:D, 4cox:A, 4cox:B, 4cox:C, 4cox:D, 5cox:A, 5cox:B, 5cox:C, 5cox:D, 6cox:A, 6cox:B, 1cvu:B, 1cvu:A, 1cx2:A, 1cx2:B, 1cx2:C, 1cx2:D, 1ddx:A, 1ddx:B, 1ddx:C, 1ddx:D, 4e1g:A, 4e1g:B, 8et0:A, 8et0:B, 5fdq:A, 5fdq:B, 4fm5:A, 4fm5:B, 4fm5:C, 4fm5:D, 3hs5:A, 3hs5:B, 3hs6:A, 3hs6:B, 3hs7:A, 3hs7:B, 5jvy:A, 5jvy:B, 5jvz:A, 5jvz:B, 5jw1:A, 5jw1:B, 3krk:A, 3krk:B, 3ln0:A, 3ln0:B, 3ln0:C, 3ln0:D, 3ln1:A, 3ln1:B, 3ln1:C, 3ln1:D, 4m10:A, 4m10:B, 4m10:C, 4m10:D, 4m11:A, 4m11:B, 4m11:C, 4m11:D, 3mdl:A, 3mdl:B, 3mqe:A, 3mqe:B, 3mqe:C, 3mqe:D, 3nt1:A, 3nt1:B, 3ntb:A, 3ntb:B, 3ntb:C, 3ntb:D, 3ntg:A, 3ntg:B, 3ntg:C, 3ntg:D, 6ofy:A, 6ofy:B, 3olt:A, 3olt:B, 3olu:A, 3olu:B, 4otj:A, 4otj:B, 4otj:C, 4otj:D, 4oty:A, 4oty:B, 3pgh:A, 3pgh:B, 3pgh:C, 3pgh:D, 4ph9:A, 4ph9:B, 1pxx:A, 1pxx:B, 1pxx:C, 1pxx:D, 3q7d:A, 3q7d:B, 3qh0:A, 3qh0:B, 3qmo:A, 3qmo:B, 3rr3:A, 3rr3:B, 3rr3:C, 3rr3:D, 4rrw:A, 4rrw:B, 4rrw:C, 4rrw:D, 4rrx:A, 4rrx:B, 4rrz:A, 4rrz:B, 4rrz:C, 4rrz:D, 4rut:A, 4rut:B, 4rut:C, 4rut:D, 3tzi:A, 3tzi:B, 6v3r:A, 6v3r:B, 6v3r:C, 6v3r:D, 5w58:A, 4z0l:A, 4z0l:B, 4z0l:C, 4z0l:D
85 2ygq:A 241 90 0.2479 0.1203 0.3222 0.090
86 7she:A 541 101 0.2222 0.0481 0.2574 0.12 7she:B, 7shf:B
87 2hox:B 427 53 0.1368 0.0375 0.3019 0.14 2hor:A, 2hox:C, 2hox:A, 2hox:D, 1lk9:B, 1lk9:A
88 5mw7:A 292 72 0.1795 0.0719 0.2917 0.19 5mw5:A, 5mwf:B, 5mwf:C, 5mwf:D, 5mwf:E, 5mwf:F, 5mwf:A
89 5mw7:A 292 35 0.1111 0.0445 0.3714 4.5 5mw5:A, 5mwf:B, 5mwf:C, 5mwf:D, 5mwf:E, 5mwf:F, 5mwf:A
90 1prh:A 554 39 0.1282 0.0271 0.3846 0.21 2ayl:B, 2ayl:A, 1cqe:A, 1cqe:B, 1diy:A, 1ebv:A, 1eqg:A, 1eqg:B, 1eqh:A, 1eqh:B, 1fe2:A, 1ht5:A, 1ht5:B, 1ht8:A, 1ht8:B, 1igx:A, 1igz:A, 7jxt:A, 7jxt:B, 3kk6:A, 3kk6:B, 3n8v:A, 3n8v:B, 3n8w:A, 3n8w:B, 3n8x:A, 3n8x:B, 3n8y:A, 3n8y:B, 3n8z:A, 3n8z:B, 4o1z:A, 4o1z:B, 2oye:P, 2oyu:P, 1pge:A, 1pge:B, 1pgf:A, 1pgf:B, 1pgg:A, 1pgg:B, 1prh:B, 1pth:A, 1pth:B, 1q4g:A, 1q4g:B, 1u67:A, 5u6x:A, 5u6x:B, 5wbe:A, 5wbe:B
91 1prh:A 554 36 0.1111 0.0235 0.3611 0.74 2ayl:B, 2ayl:A, 1cqe:A, 1cqe:B, 1diy:A, 1ebv:A, 1eqg:A, 1eqg:B, 1eqh:A, 1eqh:B, 1fe2:A, 1ht5:A, 1ht5:B, 1ht8:A, 1ht8:B, 1igx:A, 1igz:A, 7jxt:A, 7jxt:B, 3kk6:A, 3kk6:B, 3n8v:A, 3n8v:B, 3n8w:A, 3n8w:B, 3n8x:A, 3n8x:B, 3n8y:A, 3n8y:B, 3n8z:A, 3n8z:B, 4o1z:A, 4o1z:B, 2oye:P, 2oyu:P, 1pge:A, 1pge:B, 1pgf:A, 1pgf:B, 1pgg:A, 1pgg:B, 1prh:B, 1pth:A, 1pth:B, 1q4g:A, 1q4g:B, 1u67:A, 5u6x:A, 5u6x:B, 5wbe:A, 5wbe:B
92 5f1a:A 553 36 0.1111 0.0235 0.3611 0.32 5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
93 5b4x:B 479 107 0.2650 0.0647 0.2897 0.80 3a7q:B, 5b4x:D, 5b4y:B
94 4jzb:A 362 40 0.1111 0.0359 0.3250 0.84 4jzb:B, 4jzx:A, 4jzx:B, 4k10:A, 4k10:B, 4k10:D, 4k10:C, 6vjc:A, 6vjc:B, 6w7i:A, 6w7i:B, 6ww1:A, 6ww1:B
95 3cfw:A 156 36 0.1197 0.0897 0.3889 1.0 5vc1:A
96 3cfw:A 156 29 0.0855 0.0641 0.3448 3.0 5vc1:A
97 5ckn:A 278 36 0.1538 0.0647 0.5000 1.7 5cis:A, 5ckm:A, 5ckn:D, 1nt0:A, 1nt0:G
98 5b4x:A 710 83 0.2137 0.0352 0.3012 1.9 3a7q:A, 5b4x:C, 2e26:A
99 8dek:B 441 23 0.1026 0.0272 0.5217 2.0 8dek:A, 8df2:A, 8df2:B, 8df2:C, 8df2:D
100 7alt:A 270 52 0.1368 0.0593 0.3077 2.5 7alt:B
101 7alt:A 270 63 0.1795 0.0778 0.3333 4.8 7alt:B
102 3icq:T 949 37 0.1111 0.0137 0.3514 2.6 3icq:U
103 7pgn:B 438 52 0.1795 0.0479 0.4038 2.6 7pgm:B, 7pgn:A, 2wfx:B
104 1szb:A 167 37 0.1368 0.0958 0.4324 3.0 1szb:B
105 1n7d:A 639 101 0.2564 0.0469 0.2970 4.1 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
106 8jxc:A 1337 44 0.1282 0.0112 0.3409 5.2 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218