Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PDQRAQKKGDIILGGLFPIHFGVAAKDQDLKSRPESVECIRYNFRGFRWLQAMIFAIEEINSSPALLPNLTLGYRIFDTC
NTVSKALEATLSFVAQNKIDSIPSTIAVVGATGSGVSTAVANLLGLFYIPQVSYASSSRLLSNKNQFKSFLRTIPNDEHQ
ATAMADIIEYFRWNWVGTIAADDDYGRPGIEKFREEAEERDICIDFSELISQYSDEEEIQHVVEVIQNSTAKVIVVFSSG
PDLEPLIKEIVRRNITGKIWLASEAWASSSLIAMPQYFHVVGGTIGFALKAGQIPGFREFLKKVHPRKSVHNGFAKEFWE
ETFNCHLRPLCTGDENISSVETPYIDYTHLRISYNVYLAVYSIAHALQDIYTCLPGRGLFTNGSCADIKKVEAWQVLKHL
RHLNFTNNMGEQVTFDECGDLVGNYSIINWHLSPEDGSIVFKEVGYYNVYAKKGERLFINEEKILWSGFSREVPFSNCSR
DCLAGTRKGIIEGEPTCCFECVECPDGEYSDETDASACNKCPDDFWSNENHTSCIAKEIEFLSWTEPFGIALTLFAVLGI
FLTAFVLGVFIKFRNTPIVKATNRELSYLLLFSLLCCFSSSLFFIGEPQDWTCRLRQPAFGISFVLCISCILVKTNRVLL
VFEAKIPTSWWGLNLQFLLVFLCTFMQIVICVIWLYTAPPSSYRNQELEDEIIFITCHEGSLMALGFLIGYTCLLAAICF
FFAFKSRKLPENFNEAKFITFSMLIFFIVWISFIPAYASTYGKFVSAVEVIAILAASFGLLACIFFNKIYIILFKP

The query sequence (length=796) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8szh:A 835 810 1.0000 0.9533 0.9827 0.0 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
2 8szi:B 802 798 0.9862 0.9788 0.9837 0.0 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
3 7dtv:A 779 806 0.9573 0.9782 0.9454 0.0 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
4 5k5t:A 578 577 0.6746 0.9291 0.9307 0.0
5 8jd6:R 774 810 0.3354 0.3450 0.3296 1.39e-134 7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
6 8jd5:2 785 808 0.3379 0.3427 0.3329 3.36e-133 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
7 8jcu:3 765 810 0.3530 0.3673 0.3469 1.27e-130 6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
8 7epb:A 779 819 0.3329 0.3402 0.3236 1.29e-126 7epb:B, 7mtq:A
9 8tao:B 771 803 0.3128 0.3230 0.3101 1.16e-121 7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
10 6n51:B 793 816 0.3178 0.3190 0.3100 1.94e-120 6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
11 8tr2:A 745 801 0.3329 0.3557 0.3308 1.28e-119 2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
12 7dge:A 784 815 0.3141 0.3189 0.3067 1.16e-117 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
13 7mtq:B 744 803 0.3291 0.3522 0.3263 1.35e-117 8jd4:2
14 5c5c:A 432 448 0.1809 0.3333 0.3214 2.25e-67
15 6e5v:B 447 473 0.1922 0.3423 0.3235 2.27e-65 6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
16 5x2n:C 433 472 0.1834 0.3372 0.3093 1.76e-60 5x2m:A, 5x2m:C, 5x2n:A, 5x2o:A, 5x2o:C, 5x2p:A, 5x2p:C, 5x2q:A, 5x2q:C
17 3mq4:A 386 426 0.1771 0.3653 0.3310 1.04e-56
18 5x2n:B 459 485 0.1834 0.3181 0.3010 5.84e-55 5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
19 5x2m:D 422 475 0.1671 0.3152 0.2800 1.14e-38 5x2p:D
20 4or2:B 366 262 0.1005 0.2186 0.3053 2.09e-34 4or2:A
21 7epe:A 389 100 0.0490 0.1003 0.3900 2.49e-16 7epf:A
22 7epe:A 389 132 0.0590 0.1208 0.3561 1.17e-14 7epf:A
23 6ffh:A 414 141 0.0603 0.1159 0.3404 1.31e-15 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
24 6ffh:A 414 99 0.0440 0.0845 0.3535 2.25e-13 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
25 7lzh:A 798 249 0.0779 0.0777 0.2490 3.32e-11 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
26 7cum:B 675 133 0.0477 0.0563 0.2857 1.15e-09 7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
27 6uo8:B 696 133 0.0477 0.0546 0.2857 1.18e-09 7ca3:B, 7eb2:D
28 4tlm:C 750 178 0.0578 0.0613 0.2584 2.21e-09 4tll:C
29 4tlm:A 796 178 0.0578 0.0578 0.2584 3.01e-09 6e7r:A, 6e7r:C, 6e7s:A, 6e7s:C, 6e7t:A, 6e7t:C, 6e7u:A, 6e7u:C, 6e7v:A, 6e7v:C, 6e7w:A, 6e7w:C, 6e7x:A, 6e7x:C, 5ewj:A, 5ewj:C, 5ewl:A, 5ewl:C, 5ewm:A, 5ewm:C, 8g18:A, 8g18:C, 3qel:A, 3qem:A, 3qem:C, 4tll:A, 5tq2:A, 5un1:G, 5un1:A, 5un1:C
30 7yfr:A 691 178 0.0540 0.0622 0.2416 1.15e-08 7yfr:C
31 7yfr:A 691 71 0.0289 0.0333 0.3239 1.5 7yfr:C
32 7eor:B 770 365 0.0967 0.1000 0.2110 2.50e-08 8e96:A, 8e96:C, 7eor:D, 4pe5:A, 4pe5:C, 8usw:A, 8usw:C
33 7yfg:C 659 365 0.0980 0.1184 0.2137 3.66e-08 2a5t:A, 5dex:A, 5h8f:B, 5h8h:B, 5h8n:B, 5h8q:B, 5i2k:B, 5i2n:B, 5i56:A, 5i57:A, 5i59:A, 5kcj:B, 5kdt:B, 4kfq:A, 4kfq:B, 4nf4:A, 4nf5:A, 4nf6:A, 4nf8:A, 6ovd:A, 6ove:A, 1pb7:A, 1pb8:A, 1pb9:A, 1pbq:A, 5tp9:B, 5tpa:B, 5u8c:A, 6usu:A, 6usv:A, 6uz6:A, 6uzg:A, 6uzr:A, 6uzw:A, 6uzx:A, 5vih:A, 5vii:A, 5vij:A, 1y1m:A, 1y1z:A, 1y20:A, 7yfg:A, 7yfh:A, 7yfh:C
34 7yfl:A 708 150 0.0465 0.0523 0.2467 4.69e-08 7yfl:C
35 9arh:A 802 181 0.0515 0.0511 0.2265 2.64e-07 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
36 9arh:A 802 72 0.0276 0.0274 0.3056 5.9 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
37 6uo8:A 689 207 0.0641 0.0740 0.2464 1.25e-06 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
38 9b36:A 842 250 0.0741 0.0701 0.2360 1.50e-05 9b35:A, 9b35:B, 9b35:C, 9b35:D, 9b36:C, 9b36:D, 9b36:B, 9b37:A, 9b37:D, 9b37:B, 9b37:C, 9b39:A, 9b39:B, 9b39:C, 9b39:D, 8fwq:A, 8fwq:D, 8fwq:B, 8fwq:C, 8fws:A, 8fws:D, 8fws:B, 8fws:C, 8fwu:A, 8fwu:B, 8fwu:C, 8fwu:D, 8fww:A, 8fww:D, 8fww:B, 8fww:C, 3h6g:A, 3h6g:B, 3h6h:A, 3h6h:B
39 4uqq:A 693 250 0.0741 0.0851 0.2360 1.69e-05 9b38:A, 9b38:B, 9b38:C, 9b38:D, 4uqq:B, 4uqq:C, 4uqq:D
40 5kuh:A 636 250 0.0741 0.0928 0.2360 2.19e-05 4bdl:A, 4bdl:B, 4bdm:A, 4bdm:B, 4bdm:C, 4bdm:D, 4bdn:A, 4bdn:B, 4bdn:C, 4bdn:D, 4bdo:A, 4bdo:B, 4bdo:C, 4bdo:D, 4bdq:A, 4bdq:B, 4bdr:A, 4bdr:B, 5cmk:A, 5cmk:B, 5cmm:A, 3g3f:A, 3g3f:B, 3g3g:A, 3g3g:B, 3g3h:A, 3g3h:B, 3g3i:A, 3g3i:B, 3g3j:A, 3g3j:B, 3g3k:A, 3g3k:B, 4h8i:A, 2i0b:A, 2i0b:B, 2i0b:C, 2i0c:A, 2i0c:B, 5kuh:B, 5kuh:C, 5kuh:D, 3qxm:A, 3qxm:B, 8r32:A, 8r32:B, 1s50:A, 1s7y:A, 1s7y:B, 1s9t:A, 1s9t:B, 1sd3:A, 1sd3:B, 1tt1:A, 1tt1:B, 2xxr:A, 2xxr:B, 2xxt:A, 2xxt:B, 2xxu:A, 2xxu:B, 2xxv:A, 2xxv:B, 2xxw:A, 2xxw:B, 2xxx:A, 2xxx:B, 2xxx:C, 2xxx:D, 2xxy:A, 2xxy:B, 2xxy:C, 2xxy:D, 1yae:A, 1yae:B, 1yae:C, 1yae:D, 1yae:E
41 8gc2:D 760 250 0.0741 0.0776 0.2360 3.20e-05 8f0o:B, 8gc2:A, 8gc2:B, 8gc2:C, 8gc3:B, 8gc3:C, 8gc3:D, 8gc3:A, 8gc4:A, 8gc4:B, 8gc4:C, 8gc4:D, 8gc5:A, 8gc5:B, 8gc5:C, 8gc5:D, 5kuf:A, 5kuf:B, 5kuf:C, 5kuf:D
42 7she:A 541 314 0.0905 0.1331 0.2293 0.002 7she:B, 7shf:B
43 7n4y:B 2455 56 0.0239 0.0077 0.3393 0.15 7n4y:A
44 7s4l:C 231 123 0.0352 0.1212 0.2276 0.24 7s4l:H, 7s4l:I
45 4dqd:A 361 201 0.0503 0.1108 0.1990 0.54 3sg0:A
46 8sxz:c 699 70 0.0251 0.0286 0.2857 0.63 8sxz:b, 8sxz:f, 8sxz:g, 8sz8:b, 8sz8:c, 8sz8:f, 8sz8:g, 8t0k:b, 8t0k:c, 8t0k:f, 8t0k:g, 8t0r:b, 8t0r:c, 8t0r:f, 8t0r:g, 8tym:c, 8tym:f, 8tym:B, 8tym:C, 8tyn:c, 8tyn:f, 8tyn:C, 8tyn:F
47 9b4h:A 1908 37 0.0176 0.0073 0.3784 0.75 9b4h:B, 8wa2:A, 8wa2:D, 8wa2:F, 8wa2:B, 8wa2:C, 8wa2:E
48 9b4h:A 1908 38 0.0176 0.0073 0.3684 1.4 9b4h:B, 8wa2:A, 8wa2:D, 8wa2:F, 8wa2:B, 8wa2:C, 8wa2:E
49 9b4h:A 1908 37 0.0151 0.0063 0.3243 6.2 9b4h:B, 8wa2:A, 8wa2:D, 8wa2:F, 8wa2:B, 8wa2:C, 8wa2:E
50 6dlu:P 747 70 0.0251 0.0268 0.2857 1.2 2aka:B, 5d3q:A, 5d3q:B, 6dlu:B, 6s9a:B, 2x2e:A, 2x2e:D, 2x2f:A, 2x2f:D, 3zyc:A, 3zyc:D
51 7shf:A 296 230 0.0678 0.1824 0.2348 1.3
52 5hvn:A 354 84 0.0314 0.0706 0.2976 1.7
53 6so5:A 313 294 0.0729 0.1853 0.1973 1.8 7ru9:A, 7ru9:B, 7rua:A, 7rua:B, 7ruc:A, 7ruc:B
54 7ax3:D2 582 55 0.0226 0.0309 0.3273 2.9 7ax3:B2, 7ax3:B, 7ax3:D, 7ax3:F, 7ax3:H, 7ax3:J, 7ax3:M, 7ax3:O, 7ax3:Q, 7ax3:S, 7ax3:U, 7ax3:W, 7ax3:Y, 7ax3:E2, 7ax3:G2, 7ax3:H2, 7ax3:I2, 7ax3:J2
55 7pkq:b 241 51 0.0163 0.0539 0.2549 3.8
56 8xfc:D 517 23 0.0176 0.0271 0.6087 3.9 8wdb:D
57 2r2d:A 276 82 0.0239 0.0688 0.2317 4.3 2r2d:B, 2r2d:C, 2r2d:D, 2r2d:E, 2r2d:F
58 8dzg:A 420 36 0.0188 0.0357 0.4167 4.3 8dze:A, 8dze:B, 8dze:C, 8dze:D, 8dze:E, 8dze:F, 8dzf:A, 8dzf:B, 8dzf:C, 8dzf:D, 8dzf:E, 8dzf:F, 8dzg:B, 8dzg:C, 8dzg:D, 8dzg:E, 8dzg:F
59 5uow:B 795 60 0.0188 0.0189 0.2500 4.6
60 6njl:A 785 206 0.0540 0.0548 0.2087 4.8 8aym:C, 8aym:A, 7ldd:A, 7ldd:C, 7lde:A, 7lde:C, 6njl:C, 6njn:A, 7oca:A, 7oca:C, 7oce:A, 7oce:C, 6qkz:C
61 3l43:B 246 47 0.0188 0.0610 0.3191 5.0 3l43:A, 3l43:C, 3l43:D
62 8dk2:C 723 68 0.0289 0.0318 0.3382 5.3 8dk2:D
63 6raf:A 588 26 0.0176 0.0238 0.5385 7.3 6rag:A, 6rah:A, 6rai:A, 6raj:A, 6rak:A, 6ral:A, 6ram:A
64 8dk3:A 455 68 0.0289 0.0505 0.3382 7.6 8dk3:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218