BioLiP

>protein
PDPMKNTCKLLVVADHRFYRYMGRGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTAWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPQEVKPGEKH
YNMAKSYPNEEKDAWDVKMLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYVGSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKN
IYLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELGHNFGAEHDPDGLAECAPNEDQGGKYVMYPIAVSGDHENNKMFSQCSKQS
IYKTIESKAQECFQERSN

The query sequence (length=258) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8snl:A	656	257	0.9884	0.3887	0.9922	0.0	2a8h:A, 2a8h:B, 3b92:A, 1bkc:A, 1bkc:C, 1bkc:E, 1bkc:I, 3cki:A, 2ddf:A, 2ddf:B, 3e8r:A, 3e8r:B, 3edz:A, 3edz:B, 3ewj:A, 3ewj:B, 2fv5:A, 2fv5:B, 2fv9:A, 2fv9:B, 3g42:A, 3g42:B, 3g42:C, 3g42:D, 2i47:A, 2i47:B, 2i47:C, 2i47:D, 3kmc:A, 3kmc:B, 3kme:A, 3kme:B, 3l0t:A, 3l0t:B, 3l0v:A, 3l0v:B, 3le9:A, 3le9:B, 3lea:A, 3lea:B, 3lgp:A, 3lgp:B, 3o64:A, 3o64:B, 2oi0:A, 8snm:B, 8snn:A, 8sno:A, 1zxc:A, 1zxc:B
2	8esv:A	446	257	0.3527	0.2040	0.3541	4.35e-39	6bdz:A, 6be6:B, 6be6:A, 6be6:C, 6be6:D
3	1r54:A	206	137	0.1550	0.1942	0.2920	6.91e-08	1r55:A
4	1bsw:A	197	231	0.2132	0.2792	0.2381	1.29e-05	1bud:A
5	1wni:A	198	240	0.2093	0.2727	0.2250	1.30e-05
6	4j4m:B	200	245	0.2287	0.2950	0.2408	2.44e-05	4j4m:A
7	1kuf:A	201	121	0.1473	0.1891	0.3140	1.72e-04	1kug:A, 1kui:A, 1kuk:A
8	4dd8:D	208	246	0.2132	0.2644	0.2236	2.57e-04	4dd8:A, 4dd8:B, 4dd8:C
9	1qua:A	197	240	0.2209	0.2893	0.2375	3.66e-04
10	3k7n:A	396	192	0.1938	0.1263	0.2604	6.66e-04
11	2rjq:A	292	251	0.2403	0.2123	0.2470	0.004	3b8z:A, 3b8z:B, 3hy7:A, 3hy7:B, 3hy9:A, 3hy9:B, 3hyg:A, 3hyg:B, 3ljt:A, 6yjm:A, 6yjm:B
12	2jih:B	286	254	0.2364	0.2133	0.2402	0.005	2jih:A, 3q2g:A, 3q2g:B, 3q2h:A, 3q2h:B, 2v4b:A, 2v4b:B
13	3hdb:A	417	136	0.1550	0.0959	0.2941	0.009
14	3dsl:A	416	138	0.1473	0.0913	0.2754	0.011	3dsl:B
15	3k7l:A	409	198	0.1860	0.1174	0.2424	0.022
16	2e3x:A	416	120	0.1434	0.0889	0.3083	0.035
17	1dth:A	202	197	0.2016	0.2574	0.2640	0.040	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
18	4q1l:A	202	201	0.1667	0.2129	0.2139	0.053
19	1yp1:A	199	120	0.1240	0.1608	0.2667	0.095
20	2aig:P	201	194	0.1705	0.2189	0.2268	0.12	3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
21	2ero:A	426	235	0.2093	0.1268	0.2298	0.13	2ero:B, 2erp:A, 2erp:B, 2erq:A, 2erq:B
22	1nd1:A	202	192	0.1744	0.2228	0.2344	0.23	2w12:A, 2w13:A, 2w14:A, 2w15:A
23	4xl1:E	229	39	0.0659	0.0742	0.4359	0.51
24	1bqq:M	174	25	0.0543	0.0805	0.5600	1.0	1buv:M, 5h0u:A, 3ma2:D, 3ma2:A
25	2dw1:A	415	139	0.1550	0.0964	0.2878	1.1	2dw0:A, 2dw0:B, 2dw1:B, 2dw2:B, 2dw2:A
26	2mze:A	250	74	0.0969	0.1000	0.3378	1.1	2ddy:A, 8jud:A, 8juf:A, 8jug:A, 8k4z:A, 1mmp:A, 1mmp:B, 1mmq:A, 1mmr:A, 2mzh:A, 2mzi:A, 5ue2:A, 5ue5:A, 7wxx:A, 2y6c:A, 2y6d:A
27	3gbo:A	200	191	0.1550	0.2000	0.2094	1.4
28	1rm8:A	169	25	0.0543	0.0828	0.5600	1.4
29	5o37:A	261	74	0.0891	0.0881	0.3108	1.6	5o2j:A
30	3b2z:F	293	255	0.2209	0.1945	0.2235	1.8	3b2z:A, 3b2z:B, 3b2z:C, 3b2z:D, 3b2z:E, 3b2z:G, 3b2z:H, 2rjp:A, 2rjp:B, 2rjp:C, 2rjp:D, 4wk7:A, 4wke:A, 4wki:A
31	6qig:A	581	71	0.0698	0.0310	0.2535	1.9	3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
32	2b5o:A	292	45	0.0736	0.0651	0.4222	2.2	2b5o:B
33	2x7m:A	180	15	0.0426	0.0611	0.7333	2.2
34	8dek:B	441	17	0.0426	0.0249	0.6471	6.0	8dek:A, 8df2:A, 8df2:B, 8df2:C, 8df2:D

[Back]