BioLiP

>protein
PDGEVDPAVWGKAYPTEYEMWKKTKSKYKRGFDADHVTYDKLSEFPYMALLFNGWGFGIAYNEPRGHANMVRDQLEIDSA
RLKSGGVCLTCKTPYAPKLEKEMGIDYFKTPFKDVLAKIPEKHKTLGVACIDCHDNKDMSLRISRGFTLGEALKKLGVDQ
AKLSRQEMRSLVCAQCHVTYNIPKDADKKSIGVYFPWQGSKMGNISVENIIKQIRSDASVGEWTQTVTGFKLGFIRHPEY
ELFSNNSVHWKAGAACTDCHMPYTVSDHRVMSPLKNDMKACIQCHTEKPEWLRDQVIAIQDRTVSLMLRSGYATATVAKL
FEKAHAAQAQGKQIDKALYDRAKDLYEEAFYRCVFIGAENSVGFHNPTEAMRVLGDATAFATKAEALLRQALAKAGVDVP
LTVNLELNKYLDQRGEKKLTFDPKVEIKDPYGVQVRF

The query sequence (length=437) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8bcx:D	444	443	0.9908	0.9752	0.9774	0.0	8bcx:A, 8bcx:B, 8bcx:C
2	6v0a:B	444	444	0.6682	0.6577	0.6577	0.0	6v0a:A, 6v0a:C, 6v0a:D, 6v0a:E, 6v0a:F
3	2j7a:B	498	407	0.3021	0.2651	0.3243	6.72e-51	2j7a:A, 2j7a:D, 2j7a:E, 2j7a:G, 2j7a:H, 2j7a:J, 2j7a:K, 2j7a:M, 2j7a:N, 2j7a:P, 2j7a:Q, 2vr0:A, 2vr0:B, 2vr0:D, 2vr0:E
4	1oah:B	482	370	0.2563	0.2324	0.3027	3.82e-47	1oah:A
5	6p73:A	439	403	0.2952	0.2938	0.3201	1.85e-45	6p73:B, 3ubr:A, 3ubr:B
6	1qdb:A	473	413	0.2975	0.2748	0.3148	2.30e-45	1qdb:B, 1qdb:C
7	3bnf:A	471	422	0.2952	0.2739	0.3057	8.32e-45	3bng:A, 3bnh:A, 3bnj:A, 2e80:A, 2e81:A, 1fs7:A, 1fs8:A, 1fs9:A
8	1gu6:A	441	417	0.2700	0.2676	0.2830	4.99e-37	1gu6:G, 1gu6:C, 1gu6:E, 3l1t:A, 3l1t:B, 3l1t:C, 3l1t:D, 2rdz:A, 2rdz:B, 2rdz:C, 2rdz:D, 2rf7:A, 2rf7:B, 2rf7:C, 2rf7:D, 3tor:A, 3tor:D, 3tor:B, 3tor:C, 4wjy:A, 4wjy:B
9	8rv0:Y	495	471	0.2723	0.2404	0.2527	2.75e-28	8rvm:YYY, 8rxu:AAA, 8rxu:MMM, 8rxu:YYY
10	3f29:B	520	438	0.2449	0.2058	0.2443	5.56e-21	3d1i:A, 3d1i:B, 3f29:A, 3fo3:A, 3fo3:B, 3gm6:A, 3gm6:B, 4l38:A, 4l38:B, 4l3x:A, 4l3x:B, 4l3y:A, 4l3y:B, 4l3z:A, 4l3z:B, 3lg1:A, 3lg1:B, 3lgq:A, 3lgq:B, 3mmo:A, 3mmo:B, 2ot4:A, 2ot4:B, 3owm:A, 3owm:B, 4q0t:A, 4q0t:B, 4q17:A, 4q17:B, 4q1o:A, 4q1o:B, 4q4u:A, 4q4u:B, 4q5b:A, 4q5b:B, 4q5c:A, 4q5c:B, 3rkh:A, 3rkh:B, 3s7w:A, 3s7w:B, 3sce:A, 3sce:B, 3uu9:A, 3uu9:B, 2zo5:A, 2zo5:B
11	3sxq:A	519	416	0.2197	0.1850	0.2308	3.97e-15	3sxq:B, 3ttb:A, 3ttb:B
12	6i5b:A	484	152	0.0892	0.0806	0.2566	0.13	6i5b:B
13	7opk:A	649	75	0.0549	0.0370	0.3200	0.47
14	6btm:A	221	91	0.0595	0.1176	0.2857	0.49
15	2e84:A	513	257	0.1396	0.1189	0.2374	0.78
16	6f0k:A	207	59	0.0481	0.1014	0.3559	1.0
17	5acn:A	754	85	0.0572	0.0332	0.2941	1.2	1aco:A, 6acn:A, 7acn:A, 8acn:A, 1ami:A, 1amj:A, 1b0j:A, 1b0k:A, 1b0m:A, 1c96:A, 1c97:A, 1fgh:A, 1nis:A, 1nit:A
18	8f5f:A	326	36	0.0320	0.0429	0.3889	1.4	4dzy:A, 4e00:A, 4e01:A, 4e02:A, 8egd:A, 8egf:A, 8egq:A, 8egu:A, 8f4q:A, 8f5f:B, 8f5j:A, 8f5s:A, 8f5s:B, 1gjv:A, 1gkz:A, 4h7q:A, 4h81:A, 4h85:A, 3tz0:A, 3tz2:A, 3tz4:A, 3tz5:A, 3vad:A
19	6dtu:A	375	50	0.0320	0.0373	0.2800	2.4	6dtu:B, 2gha:A, 2gha:B
20	7wrx:H	594	63	0.0435	0.0320	0.3016	2.8	7wrx:A, 7wrx:B, 7wrx:C, 7wrx:D, 7wrx:E, 7wrx:F, 7wrx:G, 7wrx:I, 7wrx:J, 7wrx:K, 7wrx:L
21	2ozy:A	142	47	0.0366	0.1127	0.3404	6.2	2p0b:A
22	2owq:B	224	49	0.0343	0.0670	0.3061	8.4	8j86:B, 8j8f:B, 8j8g:B, 4lzb:A, 4lzb:B, 4lzb:C, 4lzb:D, 4lzb:E, 4lzb:F, 4lzb:G, 4lzb:H, 4lzb:I, 4lzb:J, 4lzb:K, 4lzb:L, 2owq:A, 4qcb:B, 4qcb:A, 8wpe:C, 8wpf:C, 8wpk:C, 8wpp:C, 4ygm:B, 4ygm:A, 4yig:A, 4yig:E, 4yig:I
23	2b7r:A	568	91	0.0526	0.0405	0.2527	10.0	2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A

[Back]