Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PCDSRGQRMWWAFLASSMVTFFGGLFIILLWRTLKYLWEVGWMTSVKDWAGVMISAQTLTGRVLVVLVFALSIGALVIYF
IDSSNPIESCQNFYKDFTLQIDMAFNVFFLLYFGLRFIAANDKLWFWLEVNSVVDFFTVPPVFVSVYLNRSWLGLRFLRA
LRLIQFSEILQFLNILKTSNSIKLVNLLSIFISTWLTAAGFIHLVENSGDPWENFQNNQALTYWECVYLLMVTMSTVGYG
DVYAKTTLGRLFMVFFILGGLAMFASYVPEIIELIGNRKKYGGSYSAVSGRKHIVVCGHITLESVSNFLKDFLHKDRDDV
NVEIVFLHNISPNLELEALFKRHFTQVEFYQGSVLNPHDLARVKIESADACLILANKYCADPDAEDASNIMRVISIKNYH
PKIRIITQMLQYHNKAHLLNIPSWNWKEGDDAICLAELKLGFIAQSCLAQGLSTMLANLFSMRSFIKIEEDTWQKYYLEG
VSNEMYTEYLSSAFVGLSFPTVCELCFVKLKLLMISRILINPGNGTLGFFIASDAKEVKRAFFYCKKKYDSTGMFHWCAP
KEIEKVILTRSEAAMTVLSGHVVVCIFGDVSSALIGLRNLVMPLRASNFHYHELKHIVFVGSIEYLKREWETLHNFPKVS
ILPGTPLSRADLRAVNINLCDMCVILSANQNNIDDTSLQDKECILASLNIKSMQFDTTGVNIPIITELVNDTNVQFLDQD
DDDDPDTELYLTQPFACGTAFAVSVLDSLMSATYFNDNILTLIRTLVTGGATPELEALIAEENALRGGYSTPQTLANRDR
CRVAQLALLDGPFADLGDGGCYGDLFCKALKTYNMLCFGIYRLRDAHLSTPSQCTKRYVITNPPYEFELVPTDLIFCLMQ
FD

The query sequence (length=882) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8ghf:A 910 892 0.9932 0.9626 0.9821 0.0 8ghf:B, 8ghf:C, 8ghf:D, 3mt5:A, 8s3e:A, 8s3e:B, 8s3e:C, 8s3e:D, 3u6n:A, 3u6n:B, 3u6n:C, 3u6n:D, 3u6n:E, 3u6n:F, 3u6n:G, 3u6n:H, 6v22:A, 6v22:B, 6v22:C, 6v22:D, 6v38:A, 6v38:B, 6v38:C, 6v38:D, 6v5a:A, 7ynz:A, 7ynz:C, 7ynz:E, 7ynz:G, 7yo0:A, 7yo0:C, 7yo0:E, 7yo0:G, 7yo1:A, 7yo1:C, 7yo1:E, 7yo1:G, 7yo3:A, 7yo5:A, 7yo5:B, 7yo5:C, 7yo5:D
2 6v35:A 914 914 0.9909 0.9562 0.9562 0.0 6v35:D, 6v35:B, 6v35:C, 8z3s:A, 8z3s:B, 8z3s:C, 8z3s:D
3 7pxe:A 885 889 0.6746 0.6723 0.6693 0.0 7pxe:B, 7pxe:C, 7pxe:D, 7pxf:A, 7pxf:B, 7pxf:C, 7pxf:D, 7pxg:A, 7pxg:B, 7pxg:C, 7pxg:D, 7pxh:A, 7pxh:B, 7pxh:C, 7pxh:D
4 7rjt:A 902 912 0.6440 0.6297 0.6228 0.0 7rjt:B, 7rjt:C, 7rjt:D, 7rk6:A, 7rk6:B, 7rk6:C, 7rk6:D, 5tj6:A
5 8hir:A 918 742 0.2018 0.1939 0.2399 3.55e-36 8hir:B, 8hir:C, 8hir:D, 8hk6:A, 8hk6:B, 8hk6:C, 8hk6:D, 8hkf:A, 8hkf:B, 8hkf:C, 8hkf:D, 8hkk:A, 8hkk:B, 8hkk:C, 8hkk:D, 8hkm:A, 8hkm:B, 8hkm:C, 8hkm:D, 8hkq:D, 8hkq:A, 8hkq:C, 8hkq:B
6 6oly:C 318 224 0.0669 0.1855 0.2634 3.30e-08 2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
7 7e8e:D 459 182 0.0556 0.1068 0.2692 2.14e-07 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
8 5wie:B 390 175 0.0488 0.1103 0.2457 2.19e-06 4jta:B, 4jtc:B, 4jtd:B, 3lnm:B, 2r9r:B
9 4jta:Q 363 176 0.0488 0.1185 0.2443 2.22e-06 4jtc:H, 4jtd:H, 2r9r:H
10 7cr7:A 354 111 0.0397 0.0989 0.3153 1.28e-05 7cr1:A, 7cr1:B, 7cr1:C, 7cr1:D, 7cr2:B, 7cr2:C, 7cr2:D, 7cr2:A, 7cr4:A, 7cr4:B, 7cr4:D, 7cr4:F, 7cr7:G, 7cr7:B, 7cr7:D, 8ijk:A, 8ijk:C, 8ijk:B, 8ijk:D, 8izy:A, 8izy:B, 8izy:D, 8izy:C, 8j01:G, 8j01:A, 8j01:B, 8j01:D, 8j02:G, 8j02:A, 8j02:B, 8j02:D, 8j03:A, 8j03:D, 8j03:G, 8j03:I, 8j04:A, 8j04:G, 8j04:B, 8j04:D, 8w4u:A, 8w4u:B, 8w4u:D, 8w4u:G
11 8x43:A 327 111 0.0397 0.1070 0.3153 1.35e-05 8j00:A, 8j00:B, 8j00:C, 8j00:D, 8x43:G, 8x43:C, 8x43:E
12 3rbz:A 289 223 0.0635 0.1938 0.2511 2.57e-05 3rbz:B, 3rbz:C, 3rbz:D
13 7ssy:A 346 166 0.0476 0.1214 0.2530 1.17e-04 7ssy:B, 7ssy:C, 7ssy:D, 7wf3:B, 7wf3:D, 7wf3:F, 7wf3:H
14 8quc:A 395 191 0.0578 0.1291 0.2670 2.19e-04 8f1c:A, 8f1c:B, 8f1c:C, 8f1c:D, 8f1d:A, 8f1d:B, 8f1d:C, 8f1d:D, 7phi:C, 7phi:B, 7phi:D, 8quc:B, 8quc:D, 8quc:C, 8qud:A, 8qud:B, 8qud:C, 8qud:D
15 8ctn:B 96 47 0.0159 0.1458 0.2979 0.002 8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
16 7vnr:A 333 111 0.0374 0.0991 0.2973 0.003 7vnr:C, 7vnr:E, 7vnr:G
17 7byl:A 354 111 0.0374 0.0932 0.2973 0.003 7byl:C, 7byl:E, 7byl:G, 7bym:A, 7bym:C, 7bym:E, 7bym:G, 7byn:A, 7byn:C, 7byn:E, 7byn:G, 7vnp:A, 7vnp:C, 7vnp:G, 7vnp:E, 7vnq:A, 7vnq:C, 7vnq:E, 7vnq:G
18 4uuj:C 111 77 0.0238 0.1892 0.2727 0.004 2bob:C, 2dwd:C, 2dwe:C, 2h8p:C, 2h8p:D, 2hfe:C, 2hfe:D, 2hg5:C, 2hg5:D, 2hvj:C, 3ifx:A, 3ifx:B, 3ifx:C, 3ifx:D, 2jk5:C, 7m2h:C, 7m2h:F, 3stz:C, 8thn:C, 2w0f:C
19 3um7:A 259 76 0.0227 0.0772 0.2632 0.007 4i9w:A, 7lj4:A, 7lj5:A, 7lja:A, 7ljb:A, 4rue:A, 4rue:B, 4ruf:A, 4ruf:B, 3um7:B, 4wfe:A, 4wff:A, 4wfg:A, 4wfh:A
20 3um7:A 259 59 0.0249 0.0849 0.3729 1.1 4i9w:A, 7lj4:A, 7lj5:A, 7lja:A, 7ljb:A, 4rue:A, 4rue:B, 4ruf:A, 4ruf:B, 3um7:B, 4wfe:A, 4wff:A, 4wfg:A, 4wfh:A
21 6v1x:A 446 166 0.0465 0.0919 0.2470 0.070 6v1x:B, 6v1x:C, 6v1x:D, 6v1y:A, 6v1y:B, 6v1y:C, 6v1y:D, 6v1y:M, 6v1y:N, 6v1y:O, 6v1y:P
22 8qz3:B 266 70 0.0261 0.0865 0.3286 0.10 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
23 8qz3:B 266 65 0.0159 0.0526 0.2154 1.4 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
24 5wie:H 328 146 0.0397 0.1067 0.2397 0.27 3lnm:D
25 8vt9:A 406 87 0.0261 0.0567 0.2644 0.31 6cjq:A, 6cjq:B, 6cjq:C, 6cjq:D, 6cjt:A, 6cjt:B, 6cjt:C, 6cjt:D, 6cju:A, 6cju:B, 6cju:C, 6cju:D, 4d7s:A, 4d7s:B, 4d7t:A, 7rsh:A, 7rsh:B, 7rsh:C, 7rsh:D, 7rtf:A, 7rtf:B, 7rtf:C, 7rtf:D, 7rtj:A, 7rtj:B, 7rtj:C, 7rtj:D, 7tj5:A, 7tj5:B, 7tj5:C, 7tj5:D, 7tj6:A, 7tj6:B, 7tj6:C, 7tj6:D, 7tkt:A, 7tkt:B, 7tkt:C, 7tkt:D, 8vt9:D, 8vt9:B, 8vt9:C, 8vta:A, 8vta:B, 8vta:C, 8vta:D, 8vtb:A, 8vtb:B, 8vtb:C, 8vtb:D, 6vxz:A, 6vxz:B, 6vxz:C, 6vxz:D
26 7ryr:A 389 87 0.0261 0.0591 0.2644 0.39 7ru0:A, 7ru0:B, 7ru0:C, 7ru0:D, 7ryr:C, 7ryr:D, 7ryr:B, 7rys:A, 7rys:B, 7rys:C, 7rys:D
27 8qz1:A 242 65 0.0249 0.0909 0.3385 0.46 4bw5:C, 8qz1:B, 4xdj:C, 4xdk:C, 4xdk:D, 4xdl:C
28 4chv:D 343 109 0.0306 0.0787 0.2477 0.54 4chw:D, 3cl1:A, 3cl1:B, 3clp:A, 3clp:C, 2k0g:A, 4muv:A, 4muv:B, 1u12:A, 1u12:B, 1vp6:A, 1vp6:C
29 8de8:B 276 69 0.0227 0.0725 0.2899 0.67 8de7:B, 8de7:A, 8de8:A, 8de9:A, 8de9:B
30 2q67:A 104 47 0.0136 0.1154 0.2553 0.84 2q67:B, 2q68:A, 2q68:B, 2q69:A, 2q6a:A, 2q6a:B, 4ro2:C, 6v8y:A
31 2c4w:A 168 80 0.0249 0.1310 0.2750 0.99 4b6r:A, 4b6r:C, 4b6r:B, 4b6s:A, 4b6s:C, 4b6s:B, 2c57:A, 2c57:B, 2c57:C, 2c57:D, 2c57:E, 2c57:F, 2c57:G, 2c57:H, 2c57:I, 2c57:J, 2c57:K, 2c57:L, 1j2y:A, 2wks:A, 2wks:B, 2wks:C, 2wks:F, 2wks:D, 2wks:E, 2xb9:A, 2xb9:B, 2xd9:A, 2xd9:B, 2xd9:C, 2xda:A
32 4twk:B 241 63 0.0193 0.0705 0.2698 1.2
33 4gx0:D 376 172 0.0431 0.1011 0.2209 1.4 4gx0:A, 4gx1:A, 4gx1:D, 4gx2:A, 4gx2:D, 4gx5:A, 4gx5:D
34 6v3c:B 260 70 0.0215 0.0731 0.2714 1.5 6v36:A, 6v3c:A, 6v3i:A, 6w7b:A, 6w7d:A, 6w7e:A
35 7p4a:B 207 53 0.0227 0.0966 0.3774 1.6
36 7xnk:A 348 125 0.0317 0.0805 0.2240 1.6 7tci:A, 7tci:G, 7tci:E, 7tci:C, 4umo:A, 6v01:A, 6v01:J, 6v01:D, 6v01:G, 7xnk:C, 7xnk:E, 7xnk:G, 7xnl:A, 7xnl:C, 7xnl:E, 7xnl:G, 7xnn:B, 7xnn:G, 7xnn:C, 7xnn:E
37 7tbw:A 1928 124 0.0351 0.0161 0.2500 1.8
38 8aaj:A 357 56 0.0193 0.0476 0.3036 2.0 8aas:A, 8c5y:A, 8c5y:D, 8c5y:G, 8c5y:J, 8c5z:A, 8c5z:D, 8c5z:G, 8c5z:J, 8oej:A, 8oej:D, 8oel:A, 8oel:D
39 4gx2:B 548 173 0.0431 0.0693 0.2197 2.1 4gvl:A, 4gvl:B, 4gvl:D, 4gvl:C, 4gx0:B, 4gx0:C, 4gx1:B, 4gx1:C, 4gx2:C, 4gx5:B, 4gx5:C
40 6cq6:B 282 69 0.0204 0.0638 0.2609 3.5 6cq6:A, 6cq8:A, 6cq8:B, 6cq9:A, 6cq9:B, 4twk:A, 8ue2:A, 8ue2:B, 8ue9:A, 8ue9:B, 8uec:A, 8uec:B, 8uf6:A, 8uf6:B, 6v36:B, 6v37:A, 6v37:B, 6v3i:B, 6w7b:B, 6w7c:A, 6w7c:B, 6w7d:B, 6w7e:B, 6w82:A, 6w82:B, 6w83:A, 6w83:B, 6w84:A, 6w84:B, 6w85:A, 6w85:B, 6w86:A, 6w86:B, 6w87:A, 6w87:B, 6w88:A, 6w88:B, 6w8a:A, 6w8a:B, 6w8c:A, 6w8c:B, 6w8f:A, 6w8f:B
41 4xxf:A 249 27 0.0125 0.0442 0.4074 4.2
42 2zu8:A 373 65 0.0283 0.0670 0.3846 9.4 2zu8:B, 2zu9:B, 2zu9:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218