Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PALRLTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAAHLLNDALAIREKTL
GKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRALEIY
ATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGENKPIWMHAEEREESACKVDSPTVNTTL
RSLGALYRRQGKLEAAHTLEDCASRSR

The query sequence (length=267) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5fjy:A 267 267 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6f9i:A, 6f9i:B, 5fjy:B, 3zfw:A, 3zfw:B
2 8chy:A 272 255 0.2734 0.2684 0.2863 4.50e-12 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
3 8chy:A 272 255 0.2734 0.2684 0.2863 4.50e-12 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
4 8chy:A 272 194 0.2172 0.2132 0.2990 9.03e-11 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
5 8chy:A 272 154 0.1685 0.1654 0.2922 2.14e-05 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
6 1na0:B 119 112 0.1423 0.3193 0.3393 2.88e-08 1na3:A, 1na3:B
7 1na0:B 119 118 0.1461 0.3277 0.3305 7.85e-07 1na3:A, 1na3:B
8 1na0:B 119 139 0.1498 0.3361 0.2878 0.001 1na3:A, 1na3:B
9 7y4i:A 822 202 0.1835 0.0596 0.2426 1.15e-06 8dti:A, 8dti:B
10 7y4i:A 822 176 0.1536 0.0499 0.2330 0.002 8dti:A, 8dti:B
11 7y4i:A 822 213 0.1873 0.0608 0.2347 0.28 8dti:A, 8dti:B
12 7yeh:A 1020 107 0.1423 0.0373 0.3551 2.24e-06 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
13 7yeh:A 1020 154 0.1648 0.0431 0.2857 3.41e-05 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
14 7yeh:A 1020 195 0.1948 0.0510 0.2667 0.012 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
15 7yeh:A 1020 171 0.1461 0.0382 0.2281 0.044 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
16 3kd7:A 102 112 0.1348 0.3529 0.3214 5.06e-06 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
17 3kd7:A 102 112 0.1124 0.2941 0.2679 4.5 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
18 3kd7:A 102 30 0.0487 0.1275 0.4333 9.9 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
19 8jal:B 573 197 0.1835 0.0855 0.2487 1.30e-05 8jal:A, 8jaq:A, 8jaq:B, 8jaq:J, 8jaq:K, 8jar:A, 8jar:B, 8jas:A, 8jas:B, 8jas:K, 8jas:J, 8jau:A, 8jau:B, 8jav:A, 8jav:B, 8jav:J, 8jav:K
20 8jal:B 573 100 0.1011 0.0471 0.2700 0.067 8jal:A, 8jaq:A, 8jaq:B, 8jaq:J, 8jaq:K, 8jar:A, 8jar:B, 8jas:A, 8jas:B, 8jas:K, 8jas:J, 8jau:A, 8jau:B, 8jav:A, 8jav:B, 8jav:J, 8jav:K
21 5lwv:A 711 70 0.1049 0.0394 0.4000 2.52e-05 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
22 5lwv:A 711 75 0.1049 0.0394 0.3733 9.65e-05 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
23 5lwv:A 711 154 0.1573 0.0591 0.2727 0.002 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
24 5lwv:A 711 195 0.1948 0.0731 0.2667 0.046 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
25 5a01:A 681 75 0.1086 0.0426 0.3867 1.34e-04 5a01:B, 5a01:C
26 5a01:A 681 70 0.0974 0.0382 0.3714 5.80e-04 5a01:B, 5a01:C
27 5a01:A 681 200 0.2060 0.0808 0.2750 0.006 5a01:B, 5a01:C
28 5a01:A 681 154 0.1610 0.0631 0.2792 0.010 5a01:B, 5a01:C
29 4gpk:J 347 144 0.1273 0.0980 0.2361 0.001 4gpk:A, 4gpk:B, 4gpk:C, 4gpk:D, 4gpk:E, 4gpk:F, 4gpk:G, 4gpk:H, 4gpk:I, 4gpk:K, 4gpk:L
30 4gpk:J 347 88 0.0974 0.0749 0.2955 0.045 4gpk:A, 4gpk:B, 4gpk:C, 4gpk:D, 4gpk:E, 4gpk:F, 4gpk:G, 4gpk:H, 4gpk:I, 4gpk:K, 4gpk:L
31 1elr:A 128 74 0.0787 0.1641 0.2838 0.016 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
32 1elr:A 128 33 0.0375 0.0781 0.3030 4.2 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
33 3cv0:A 300 135 0.1273 0.1133 0.2519 0.030 3cvl:A, 3cvn:A, 3cvp:A, 3cvq:A
34 7jya:A 370 48 0.0599 0.0432 0.3333 0.21 7jya:B, 7jya:C
35 4m59:A 687 104 0.1124 0.0437 0.2885 0.25 4m59:B, 4oe1:A, 4oe1:B
36 1fch:A 302 126 0.1199 0.1060 0.2540 0.36 1fch:B, 9gag:A
37 5el2:A 125 39 0.0487 0.1040 0.3333 0.49 5el2:B, 4fqt:A, 4fqt:B, 3n7h:A, 3n7h:B, 3ogn:A, 3ogn:B
38 3k1e:B 116 39 0.0524 0.1207 0.3590 0.56
39 6rxy:Cz 275 32 0.0524 0.0509 0.4375 0.95 6rxz:Cz
40 8ij1:D 627 100 0.0974 0.0415 0.2600 1.6 8ij1:I, 8je1:I, 8je2:D, 7roy:A, 7roy:C, 8wqa:B, 8wqa:D, 8wqb:J, 8wqd:D, 8wqe:B, 8wqf:J, 8wqh:D, 8wqh:H, 8wqi:D
41 8dgf:A 1541 17 0.0412 0.0071 0.6471 3.7 8dgf:B, 8dgf:C, 8dgf:D
42 6xyw:BG 364 94 0.1049 0.0769 0.2979 4.9
43 4cgw:A 115 63 0.0824 0.1913 0.3492 5.0
44 4b7f:A 515 41 0.0524 0.0272 0.3415 6.4 4b7f:B, 4b7f:C, 4b7f:D, 4b7g:A, 4b7g:B, 4b7g:C, 4b7g:D, 4b7h:A, 4b7h:B, 4b7h:C, 4b7h:D
45 7zq5:u 91 57 0.0712 0.2088 0.3333 6.4 7zq6:u
46 7yb9:A 430 85 0.0899 0.0558 0.2824 6.5 7bmi:A, 7bmj:A, 7bmj:C, 7e6j:A, 5jqy:A, 5jtc:A, 5jz6:A, 5jz8:A, 5jza:A, 5jzu:A, 6q9f:A, 6q9i:A, 6rk9:A, 6rk9:B, 7yb8:A, 7yba:A, 7ybb:A, 7ybc:A, 6yyu:A, 6yyv:A, 6yyw:A, 6yyx:A, 6yyy:A, 6z6q:A, 6z6r:A
47 8ee6:A 1808 40 0.0524 0.0077 0.3500 6.7 8edw:A
48 6zxf:y 233 66 0.0637 0.0730 0.2576 8.1
49 6fdp:A 120 40 0.0637 0.1417 0.4250 8.2 4cgw:B, 6fdt:A
50 7b7z:A 340 67 0.0674 0.0529 0.2687 8.3 7b80:A, 6i7g:A, 6i7g:B, 6i7i:A, 6i7k:A, 6i7l:A, 4u07:A, 4u07:B, 4u0s:A, 4u0s:B, 4u0u:A, 4u0u:B, 4u0z:A, 4u0z:B, 4u0z:C, 4u0z:D, 4u0z:E, 4u0z:F, 4u0z:G, 4u0z:H, 6zmd:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218