Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PALLRLSDHLLANYKKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIMYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWTPEDFDNVTKLSIP
TDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIPYVYVHHRGEVQNYKPLQLVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINITLWR
SPEEVRSDKSIFINQGEWELLEVFPQFKEFSIDISNSYAEMKFYVIIRRRPLFYAVSLLLPSIFLMVVDIVGFCLPPDSG
ERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKWLRVGYVLDRLLFRIYLLA
VLAYSITLVTLWSIW

The query sequence (length=335) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8frw:A 395 389 1.0000 0.8481 0.8612 0.0 8aw2:A, 8aw2:E, 8aw2:B, 8aw2:C, 8aw2:D, 8c21:B, 8c21:C, 8cc6:A, 8cc6:B, 8cc6:C, 8cc6:D, 8cc6:E, 8cc7:A, 8cc7:B, 8cc7:C, 8cc7:D, 8cc7:E, 6dg7:A, 6dg7:B, 6dg7:C, 6dg7:D, 6dg7:E, 6dg8:A, 6dg8:E, 6dg8:B, 6dg8:C, 6dg8:D, 8frw:E, 8frw:B, 8frw:C, 8frw:D, 8frx:A, 8frx:E, 8frx:B, 8frx:C, 8frx:D, 8frz:A, 8frz:B, 8frz:C, 8frz:D, 8frz:E, 8fsb:E, 8fsb:A, 8fsb:B, 8fsb:C, 8fsb:D, 8fsp:A, 8fsp:B, 8fsp:C, 8fsp:D, 8fsp:E, 8fsz:A, 8fsz:E, 8fsz:B, 8fsz:C, 8fsz:D, 6hin:A, 6hin:B, 6hin:C, 6hin:D, 6hin:E, 6hio:A, 6hio:B, 6hio:E, 6hio:C, 6hio:D, 6hiq:A, 6hiq:E, 6hiq:B, 6hiq:C, 6hiq:D, 6his:A, 6his:E, 6his:B, 6his:C, 6his:D, 6np0:A, 6np0:E, 6np0:B, 6np0:C, 6np0:D, 6w1j:A, 6w1j:E, 6w1j:B, 6w1j:C, 6w1j:D, 6w1m:A, 6w1m:E, 6w1m:B, 6w1m:C, 6w1m:D, 6w1y:A, 6w1y:E, 6w1y:B, 6w1y:C, 6w1y:D, 6y1z:A, 6y1z:B, 6y1z:D, 6y1z:E, 6y1z:C, 6y5a:A, 6y5a:E, 6y5a:C, 6y5a:B, 6y5a:D
2 8c20:D 355 355 0.9821 0.9268 0.9268 0.0 8c20:B
3 8bla:A 211 210 0.5493 0.8720 0.8762 1.89e-139 8bla:E, 8bla:B, 8bla:C, 8bla:D, 8blb:A, 8blb:E, 8blb:B, 8blb:C, 8blb:D
4 8v8c:B 374 315 0.3254 0.2914 0.3460 2.86e-56 8v8c:A
5 7ekp:A 396 315 0.3254 0.2753 0.3460 6.03e-56 8cau:A, 8cau:B, 8cau:C, 8cau:D, 8cau:E, 8ci1:A, 8ci1:B, 8ci1:C, 8ci1:D, 8ci1:E, 7eki:A, 7eki:B, 7eki:C, 7eki:D, 7eki:E, 7ekp:B, 7ekp:C, 7ekp:D, 7ekp:E, 7ekt:A, 7ekt:E, 7ekt:B, 7ekt:C, 7ekt:D, 7koo:A, 7koo:B, 7koo:C, 7koo:D, 7koo:E, 7koq:A, 7koq:B, 7koq:C, 7koq:D, 7koq:E, 7kox:A, 7kox:B, 7kox:C, 7kox:D, 7kox:E, 8ut1:A, 8ut1:B, 8ut1:C, 8ut1:D, 8ut1:E, 8utb:A, 8utb:B, 8utb:C, 8utb:D, 8utb:E, 8uzj:A, 8uzj:B, 8uzj:E, 8uzj:C, 8uzj:D, 8v80:A, 8v80:B, 8v80:C, 8v80:D, 8v80:E, 8v82:A, 8v82:B, 8v82:E, 8v82:C, 8v82:D, 8v86:A, 8v86:E, 8v86:B, 8v86:C, 8v86:D, 8v88:A, 8v88:B, 8v88:C, 8v88:D, 8v88:E, 8v89:A, 8v89:B, 8v89:C, 8v89:D, 8v89:E, 8v8a:A, 8v8a:B, 8v8a:E, 8v8a:C, 8v8a:D, 8v8c:C, 8v8c:D, 8v8c:E, 8v8d:A, 8v8d:B, 8v8d:E, 8v8d:C, 8v8d:D
6 6pv7:A 387 303 0.2806 0.2429 0.3102 4.57e-52 6pv7:D, 6pv8:A, 6pv8:D
7 8ssz:A 393 299 0.2836 0.2417 0.3177 1.24e-50 8ssz:D, 8st0:A, 8st0:D, 8st1:A, 8st1:B, 8st1:D, 8st2:A, 8st2:B, 8st2:D, 8st3:A, 8st3:D, 8st4:A, 8st4:D
8 9avv:D 429 298 0.3045 0.2378 0.3423 2.99e-50 9avu:D, 9awj:D, 9awk:D
9 6usf:A 464 299 0.2836 0.2047 0.3177 1.35e-49 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
10 8ssz:B 384 300 0.2866 0.2500 0.3200 5.61e-48 6cnj:B, 6cnj:C, 6cnj:E, 6cnk:C, 6cnk:E, 5kxi:B, 5kxi:E, 8st0:B, 8st2:C, 8st2:E, 8st3:B, 8st3:E, 8st4:B, 8st4:E, 6ur8:B, 6usf:E
11 8byi:A 320 325 0.2746 0.2875 0.2831 5.31e-47 8byi:B, 8byi:C, 8byi:D, 8byi:E
12 7qko:A 396 301 0.2537 0.2146 0.2824 1.04e-46 8esk:A, 8esk:D, 8f2s:A, 8f2s:D, 8f6y:D, 8f6y:A, 8f6z:D, 8f6z:A, 7qko:D, 7ql5:A, 7ql5:D, 7ql6:A, 7ql6:D, 7smm:A, 7smm:D, 7smq:D, 7smq:A, 7smr:A, 7smr:D, 7sms:A, 7sms:D, 7smt:A, 7smt:D, 6uwz:A, 6uwz:D, 7z14:D, 7z14:A
13 9awk:A 402 282 0.2597 0.2164 0.3085 6.80e-46 9avu:A, 9avu:C, 9avv:C, 9awj:A, 9awj:C, 9awk:C
14 8f6y:C 409 300 0.2776 0.2274 0.3100 4.52e-44 8f6z:C, 7smm:C, 7smq:C, 7smr:C, 7sms:C, 7smt:C
15 7ql6:C 427 295 0.2716 0.2131 0.3085 6.90e-44 8esk:B, 8f2s:B, 8f6y:B, 8f6z:B, 7ql5:C, 7smq:B, 7sms:B
16 6pv7:B 388 300 0.2687 0.2320 0.3000 4.75e-42 6pv7:C, 6pv7:E, 6pv8:B, 6pv8:C, 6pv8:E
17 8f6y:E 412 295 0.2418 0.1966 0.2746 4.09e-38 8esk:E, 8f2s:E, 8f6z:E, 7ql5:E, 7smq:E, 7sms:E, 7smt:E
18 9awj:B 408 298 0.2448 0.2010 0.2752 6.06e-38
19 9avu:B 413 284 0.2478 0.2010 0.2923 6.17e-36
20 8zfk:D 412 317 0.2627 0.2136 0.2776 1.59e-35 8zfk:E, 8zfk:A, 8zfk:B, 8zfk:C
21 5fjv:B 207 209 0.1910 0.3092 0.3062 2.14e-30 5fjv:A, 5fjv:E, 5fjv:C, 5fjv:D
22 8eis:A 292 264 0.2149 0.2466 0.2727 1.71e-28 8eis:E, 8eis:B, 8eis:C, 8eis:D
23 6hy7:A 210 209 0.1940 0.3095 0.3110 1.09e-27 4uxu:A, 4uxu:B
24 5afm:B 207 207 0.1672 0.2705 0.2705 6.84e-18 5afh:A, 5afh:B, 5afh:C, 5afh:D, 5afh:E, 5afj:A, 5afj:B, 5afj:C, 5afj:D, 5afj:E, 5afk:A, 5afk:B, 5afk:C, 5afk:D, 5afk:E, 5afl:A, 5afl:B, 5afl:C, 5afl:D, 5afl:E, 5afm:A, 5afm:C, 5afm:D, 5afm:E, 5afn:A, 5afn:B, 5afn:C, 5afn:D, 5afn:E, 5oug:A, 5oug:E, 5oug:B, 5oug:C, 5oug:D, 5ouh:A, 5ouh:B, 5ouh:C, 5ouh:D, 5ouh:E, 5oui:A, 3sq6:A, 3sq6:B, 3sq6:C, 3sq6:D, 3sq6:E, 3sq6:F, 3sq6:G, 3sq6:H, 3sq6:I, 3sq6:J
25 9eqg:E 345 308 0.2478 0.2406 0.2695 8.06e-17 7a5v:A, 4cof:A, 9eqg:B, 8foi:B, 8foi:E, 8g4n:E, 8g4n:B, 8g4x:B, 8g4x:E, 8g5f:E, 8g5f:B, 8g5g:E, 8g5g:B, 8g5h:B, 8g5h:E, 6hug:E, 6huj:E, 6huj:B, 6huk:B, 6huk:E, 6huo:B, 6huo:E, 6hup:B, 6hup:E, 7pbd:B, 7qn7:B, 7qn7:C, 7qn7:D, 7qn8:A, 7qn8:B, 7qn8:C, 7qn8:D, 7qn9:B, 7qn9:C, 7qn9:D, 7qna:B, 7qnb:B, 7qnc:B, 7qnc:C, 7qnc:D, 7qnd:A, 7qnd:B, 7qnd:C, 7qnd:D
26 8dd2:A 334 321 0.2537 0.2545 0.2648 1.77e-16 6a96:B, 4cof:B, 4cof:C, 4cof:D, 4cof:E, 6d6t:A, 6d6t:C, 6d6u:A, 6d6u:C, 8dd2:C, 8dd3:A, 8dd3:C, 6dw1:B, 6dw1:E, 7pbd:E, 7pbz:B, 7pbz:C, 7pbz:E, 7pc0:C, 8pvb:A, 6qfa:B, 6qfa:A, 6qfa:C, 6qfa:D, 6qfa:E, 8sgo:A, 8sgo:C, 8si9:A, 8si9:C, 8sid:A, 8sid:C, 7t0z:C, 8vqy:A, 8vqy:C, 8vrn:A, 8vrn:C, 6x3s:A, 6x3s:C, 6x3t:A, 6x3t:C, 6x3u:A, 6x3u:C, 6x3v:A, 6x3v:C, 6x3w:A, 6x3w:C, 6x3x:A, 6x3x:C, 6x3z:A, 6x3z:C, 6x40:A, 6x40:C
27 8eiz:A 315 295 0.2090 0.2222 0.2373 1.79e-15 8eiz:B, 8eiz:C, 8eiz:D, 8eiz:E
28 6dw0:E 319 316 0.2358 0.2476 0.2500 2.64e-15 6dw0:B
29 3rhw:A 340 291 0.2149 0.2118 0.2474 3.36e-15 3rhw:E, 3rhw:B, 3rhw:C, 3rhw:D, 3ri5:A, 3ri5:E, 3ri5:B, 3ri5:C, 3ri5:D, 3ria:A, 3ria:B, 3ria:C, 3ria:D, 3ria:E, 3rif:A, 3rif:B, 3rif:E, 3rif:C, 3rif:D
30 8fe1:E 346 304 0.2299 0.2225 0.2533 4.10e-14 5bkg:E, 8dn5:E, 7l31:E, 7mly:E, 7tu9:E
31 7kuy:E 338 305 0.2328 0.2308 0.2557 4.39e-14 5bkf:E
32 7t0z:E 334 296 0.2209 0.2216 0.2500 2.06e-13 6d6u:E, 8dd2:E, 8dd3:E, 6dw0:D, 9eqg:C, 8foi:D, 8g4n:D, 8g4o:D, 8g4x:D, 8g5g:D, 8g5h:D, 6hug:C, 6huj:C, 6huo:C, 6hup:C, 7qne:C, 8sgo:E, 8si9:E, 8sid:E, 7t0w:E, 8vqy:E, 8vrn:E, 6x3s:E, 6x3t:E, 6x3u:E, 6x3v:E, 6x3w:E, 6x3x:E, 6x3z:E, 6x40:E
33 5o8f:B 332 298 0.2328 0.2349 0.2617 3.40e-13 5o8f:C, 5o8f:D, 5o8f:E, 5o8f:A
34 8oq6:A 336 301 0.2090 0.2083 0.2326 5.45e-13 8op9:A, 8op9:B, 8op9:E, 8op9:C, 8op9:D, 8oq6:B, 8oq6:C, 8oq6:D, 8oq6:E, 8oq7:A, 8oq7:B, 8oq7:C, 8oq7:D, 8oq7:E, 8oq8:A, 8oq8:E, 8oqa:A, 8oqa:B, 8oqa:C, 8oqa:D, 8oqa:E, 8rh4:A, 8rh4:E, 8rh4:B, 8rh4:C, 8rh4:D, 8rh7:E, 8rh7:D, 8rh7:A, 8rh7:B, 8rh7:C, 8rh8:A, 8rh8:B, 8rh8:E, 8rh8:C, 8rh8:D, 8rh9:B, 8rhg:A, 8rhg:E, 8rhg:B, 8rhg:C, 8rhg:D
35 8bhg:B 334 296 0.2299 0.2305 0.2601 7.05e-13 6dw1:D
36 8f4v:A 264 103 0.1015 0.1288 0.3301 1.05e-12 8f4v:E, 8f4v:B, 8f4v:C, 8f4v:D
37 6vm0:A 362 321 0.2299 0.2127 0.2399 8.97e-12 5bkf:A, 5bkf:B, 5bkf:C, 5bkf:D, 5bkg:A, 5bkg:B, 5bkg:C, 5cfb:A, 5cfb:B, 5cfb:C, 5cfb:E, 8dn2:A, 8dn2:C, 8dn2:D, 8dn5:D, 8dn5:B, 8dn5:C, 8dn5:A, 8fe1:A, 8fe1:B, 8fe1:D, 8fe1:C, 3jad:A, 3jad:E, 3jad:B, 3jad:C, 3jad:D, 3jaf:A, 3jaf:B, 3jaf:C, 3jaf:D, 3jaf:E, 7m6n:A, 7m6n:B, 7m6n:D, 7m6n:E, 7m6n:C, 7m6o:A, 7m6o:E, 7m6o:B, 7m6o:C, 7m6o:D, 7m6p:A, 7m6p:E, 7m6p:B, 7m6p:C, 7m6p:D, 7m6q:A, 7m6q:B, 7m6q:E, 7m6q:C, 7m6q:D, 7m6r:A, 7m6r:E, 7m6r:B, 7m6r:C, 7m6r:D, 7m6s:A, 7m6s:B, 7m6s:C, 7m6s:D, 7m6s:E, 7mly:A, 7mly:B, 7mly:C, 7mly:D, 6plo:A, 6plo:B, 6plo:C, 6plo:D, 6plo:E, 6plp:A, 6plp:B, 6plp:C, 6plp:D, 6plp:E, 6plq:A, 6plq:B, 6plq:C, 6plq:D, 6plq:E, 6plu:A, 6plu:B, 6plu:E, 6plu:C, 6plu:D, 6plv:A, 6plv:B, 6plv:C, 6plv:D, 6plv:E, 6plw:A, 6plw:B, 6plw:C, 6plw:D, 6plw:E, 6plx:A, 6plx:E, 6plx:B, 6plx:C, 6plx:D, 6ply:A, 6ply:B, 6ply:E, 6ply:C, 6ply:D, 6plz:A, 6plz:B, 6plz:C, 6plz:D, 6plz:E, 6pm4:A, 6pm4:E, 6pm4:B, 6pm4:C, 6pm4:D, 6pm5:A, 6pm5:B, 6pm5:C, 6pm5:D, 6pm5:E, 6pm6:A, 6pm6:B, 6pm6:D, 6pm6:E, 6pm6:C, 5tin:A, 5tin:C, 5tin:E, 5tio:C, 5tio:A, 5tio:B, 5tio:E, 7tu9:A, 7tu9:D, 7tu9:C, 7tu9:B, 7tvi:A, 7tvi:D, 7tvi:C, 7tvi:B, 7u2m:A, 7u2m:B, 7u2m:C, 7u2m:D, 7u2m:E, 7u2n:A, 7u2n:B, 7u2n:D, 7u2n:E, 7u2n:C, 7u2o:A, 7u2o:B, 7u2o:C, 7u2o:D, 7u2o:E, 6ubt:A, 6ubt:E, 6ubt:B, 6ubt:C, 6ubt:D, 6ud3:A, 6ud3:E, 6ud3:C, 6ud3:B, 6ud3:D, 5vdh:A, 5vdh:B, 5vdh:C, 5vdh:E, 5vdi:A, 5vdi:C, 5vdi:D, 5vdi:E, 6vm0:E, 6vm0:B, 6vm0:D, 6vm0:C, 6vm2:A, 6vm2:E, 6vm2:B, 6vm2:D, 6vm2:C, 6vm3:A, 6vm3:E, 6vm3:B, 6vm3:C, 6vm3:D
38 7qn7:A 335 296 0.2030 0.2030 0.2297 3.78e-11 7qn9:A, 7qna:A, 7qnc:A
39 8bha:A 336 300 0.2179 0.2173 0.2433 4.05e-11 8bgi:A, 8bgi:E, 8bgi:B, 8bgi:C, 8bgi:D, 8bha:E, 8bha:B, 8bha:C, 8bha:D, 8bhb:A, 8bhb:E, 8bhb:B, 8bhb:C, 8bhb:D, 8bhg:A, 8bhg:E, 8bhg:C, 8bhg:D, 8bhi:A, 8bhi:E, 8bhi:B, 8bhi:C, 8bhi:D, 8bhk:A, 8bhk:B, 8bhk:C, 8bhk:D, 8bhk:E, 8bhm:A, 8bhm:E, 8bhm:B, 8bhm:C, 8bhm:D, 8bho:A, 8bho:E, 8bho:B, 8bho:C, 8bho:D, 8bhq:A, 8bhq:E, 8bhq:B, 8bhq:C, 8bhq:D, 8bhr:A, 8bhr:E, 8bhr:B, 8bhr:C, 8bhr:D, 8bhs:A, 8bhs:E, 8bhs:B, 8bhs:C, 8bhs:D
40 5tin:B 343 293 0.1970 0.1924 0.2253 8.33e-11 5cfb:D, 7kuy:A, 7kuy:B, 7kuy:C, 7kuy:D, 7l31:A, 7l31:B, 7l31:C, 7l31:D, 5tin:D, 5tio:D, 5vdh:D, 5vdi:B
41 4zjs:B 206 154 0.1284 0.2087 0.2792 1.07e-10 4zjs:D, 4zjs:E
42 7qnd:E 324 297 0.2030 0.2099 0.2290 2.33e-10 7qnc:E
43 9eqg:D 353 315 0.2239 0.2125 0.2381 5.84e-10 6d6t:B, 6d6t:D, 6d6u:B, 6d6u:D, 8dd2:D, 8dd2:B, 8dd3:D, 8dd3:B, 6dw0:A, 6dw0:C, 6dw1:C, 6dw1:A, 9eqg:A, 8foi:A, 8foi:C, 8g4n:A, 8g4n:C, 8g4o:C, 8g4x:A, 8g5f:C, 8g5g:A, 8g5h:C, 6hug:A, 6hug:D, 6huj:A, 6huj:D, 6huk:A, 6huk:D, 6huo:A, 6huo:D, 6hup:A, 6hup:D, 6i53:A, 6i53:D, 7pbd:A, 7qne:A, 7qne:D, 8sgo:B, 8sgo:D, 8si9:B, 8si9:D, 8sid:B, 8sid:D, 7t0w:D, 7t0z:D, 7t0z:B, 8vqy:B, 8vqy:D, 8vrn:D, 8vrn:B, 6x3s:D, 6x3s:B, 6x3t:D, 6x3t:B, 6x3u:D, 6x3v:D, 6x3w:D, 6x3w:B, 6x3x:D, 6x3x:B, 6x3z:D, 6x3z:B, 6x40:D, 6x40:B
44 8g4x:C 343 298 0.2239 0.2187 0.2517 1.36e-09 8g5f:A, 8g5g:C, 8g5h:A
45 4afh:A 213 214 0.1701 0.2676 0.2664 9.88e-08 4afg:A, 4afg:B, 4afg:E, 4afg:D, 4afg:C, 4afh:B, 4afh:C, 4afh:D, 4afh:E, 4b5d:A, 4b5d:B, 4b5d:C, 4b5d:D, 4b5d:E
46 6d6t:E 302 269 0.1970 0.2185 0.2454 1.10e-07
47 4ire:B 313 276 0.1701 0.1821 0.2065 3.74e-07 6emx:A, 6emx:B, 6emx:C, 6emx:D, 6emx:E, 4f8h:A, 4f8h:B, 4f8h:E, 4f8h:C, 4f8h:D, 4hfc:A, 4hfc:B, 4hfc:C, 4hfc:D, 4hfd:A, 4hfd:B, 4hfd:C, 4hfd:D, 4hfd:E, 4hfe:D, 4hfh:A, 4hfh:B, 4hfh:C, 4hfh:D, 4hfh:E, 4hfi:A, 4hfi:E, 6hj3:A, 6hj3:E, 6hj3:B, 6hj3:C, 6hj3:D, 6hja:A, 6hja:B, 6hja:C, 6hja:D, 6hja:E, 6hji:A, 6hji:C, 6hji:D, 6hji:E, 4il4:A, 4il4:D, 4il4:E, 4il9:A, 4il9:B, 4il9:C, 4il9:E, 4ilb:A, 4ilb:B, 4ilb:C, 4ilb:E, 4ilc:B, 4ilc:C, 4ilc:E, 4ire:A, 4ire:C, 4ire:D, 4ire:E, 5iux:A, 5iux:E, 5iux:C, 5iux:D, 5l47:C, 5l4h:C, 5l4h:D, 5l4h:E, 5mur:B, 5mur:E, 5mvm:A, 5mvm:E, 5mvm:B, 5mvm:C, 5mvm:D, 5mvn:B, 5mvn:C, 5mvn:D, 5mvn:E, 5mzq:A, 5mzq:B, 5mzq:C, 5mzq:D, 5mzq:E, 5mzr:A, 5mzr:C, 5mzr:D, 5mzr:E, 5mzt:A, 5mzt:E, 5mzt:B, 5mzt:C, 5mzt:D, 3p4w:A, 3p4w:B, 3p4w:C, 3p4w:D, 3p4w:E, 3p50:A, 3p50:B, 3p50:C, 3p50:D, 3p50:E, 4qh1:A, 4qh1:E, 4qh1:B, 4qh1:C, 4qh1:D
48 5osa:A 313 275 0.1821 0.1949 0.2218 1.30e-06 5osa:C, 5osa:E, 5osb:A, 5osb:E, 5osb:B, 5osb:C, 5osb:D, 5osc:A, 5osc:B, 5osc:C, 5osc:D, 5osc:E
49 5j5f:E 218 180 0.1284 0.1972 0.2389 2.78e-05 4alx:A, 4alx:B, 4alx:C, 4alx:D, 4alx:E, 4alx:F, 4alx:G, 4alx:H, 4alx:I, 4alx:J, 5bp0:A, 5bp0:B, 5bp0:C, 5bp0:D, 5bp0:E, 5bp0:F, 5bp0:G, 5bp0:H, 5bp0:I, 5bp0:J, 7dji:A, 7dji:B, 7dji:C, 7dji:D, 7dji:E, 1i9b:A, 1i9b:B, 1i9b:C, 1i9b:D, 1i9b:E, 5j5f:A, 5j5f:B, 5j5f:C, 5j5f:D, 5j5f:F, 5j5f:G, 5j5f:H, 5j5f:I, 5j5f:J, 5j5g:A, 5j5g:B, 5j5g:C, 5j5g:D, 5j5g:E, 5j5g:F, 5j5g:G, 5j5g:J, 5j5g:H, 5j5g:I, 5j5h:A, 5j5h:E, 5j5h:B, 5j5h:C, 5j5h:D, 5j5h:F, 5j5h:J, 5j5h:G, 5j5h:H, 5j5h:I, 5j5i:A, 5j5i:B, 5j5i:E, 5j5i:C, 5j5i:D, 5j5i:F, 5j5i:G, 5j5i:J, 5j5i:H, 5j5i:I, 7n0w:A, 7n0w:C, 7n0y:B, 7n0y:E, 7n43:A, 7n43:B, 7n43:C, 7n43:D, 7n43:E, 7ndp:B, 7ndp:C, 7ndp:D, 7ndp:E, 7ndp:A, 7ndp:G, 7ndp:H, 7ndp:I, 7ndp:J, 7ndv:A, 7ndv:B, 7ndv:C, 7ndv:D, 7ndv:E, 7ndv:F, 7ndv:G, 7ndv:J, 7ndv:H, 7ndv:I, 4nzb:E, 4nzb:A, 4nzb:B, 4nzb:C, 4nzb:I, 4nzb:J, 4nzb:K, 4nzb:L, 4nzb:M, 4nzb:N, 8p11:D, 8p11:E, 8p11:F, 8p11:G, 8p11:H, 8p11:I, 8p1e:D, 8p1e:E, 8p1e:I, 8p1e:J, 8p1f:A, 8p1f:E, 8p1f:G, 8p1f:H, 8p1f:I, 8p22:A, 8p22:B, 8p22:C, 8p22:D, 8p22:E, 8p22:F, 8p22:J, 8p22:G, 8p22:H, 8p22:I, 7pd6:AaA, 7pd6:BaB, 7pd6:CaC, 7pd6:DaD, 7pd6:EaE, 7pd6:FaF, 7pd6:JJJ, 7pd6:GaG, 7pd6:HaH, 7pd6:IaI, 7pdb:AaA, 7pdb:BaB, 7pdb:CaC, 7pdb:DaD, 7pdb:EaE, 7pdr:AaA, 7pdr:BaB, 7pdr:CaC, 7pdr:DaD, 7pdr:EaE, 7pe5:AaA, 7pe5:BaB, 7pe5:CaC, 7pe5:DaD, 7pe5:EaE, 7pe6:AaA, 7pe6:BaB, 7pe6:CaC, 7pe6:DaD, 7pe6:EaE, 8q1t:A, 8q1t:B, 8q1t:C, 8q1t:F, 8q1t:G, 4qaa:A, 4qaa:B, 4qaa:C, 4qaa:D, 4qaa:E, 4qaa:F, 4qaa:G, 4qaa:H, 4qaa:I, 4qaa:J, 4qab:A, 4qab:B, 4qab:C, 4qab:D, 4qab:E, 4qab:F, 4qab:G, 4qab:H, 4qab:I, 4qab:J, 4qac:A, 4qac:B, 4qac:C, 4qac:D, 4qac:E, 4qac:F, 4qac:G, 4qac:H, 4qac:I, 4qac:J, 5t90:A, 5t90:C, 5t90:B, 5t90:E, 5t90:D, 3u8j:B, 3u8j:A, 3u8j:C, 3u8j:D, 3u8j:E, 3u8j:F, 3u8j:J, 3u8j:G, 3u8j:I, 3u8j:H, 3u8k:A, 3u8k:B, 3u8k:C, 3u8k:D, 3u8k:E, 3u8k:F, 3u8k:G, 3u8k:H, 3u8k:I, 3u8k:J, 3u8k:K, 3u8k:L, 3u8k:M, 3u8k:N, 3u8k:O, 3u8k:P, 3u8k:Q, 3u8k:R, 3u8k:S, 3u8k:T, 3u8l:A, 3u8l:B, 3u8l:C, 3u8l:D, 3u8l:E, 3u8l:F, 3u8l:G, 3u8l:H, 3u8l:I, 3u8l:J, 3u8m:A, 3u8m:B, 3u8m:C, 3u8m:D, 3u8m:E, 3u8m:F, 3u8m:G, 3u8m:H, 3u8m:I, 3u8m:J, 3u8m:K, 3u8m:L, 3u8m:M, 3u8m:N, 3u8m:O, 3u8m:P, 3u8m:Q, 3u8m:R, 3u8m:S, 3u8m:T, 3u8n:A, 3u8n:B, 3u8n:C, 3u8n:D, 3u8n:E, 3u8n:F, 3u8n:G, 3u8n:H, 3u8n:I, 3u8n:J, 3u8n:K, 3u8n:L, 3u8n:M, 3u8n:N, 3u8n:O, 3u8n:P, 3u8n:Q, 3u8n:R, 3u8n:S, 3u8n:T, 4um1:A, 4um1:B, 4um1:C, 4um1:D, 4um1:E, 4um3:A, 4um3:B, 4um3:C, 4um3:D, 4um3:E, 4um3:F, 4um3:G, 4um3:H, 4um3:I, 4um3:J, 4um3:K, 4um3:L, 4um3:M, 4um3:N, 4um3:O, 4um3:P, 4um3:Q, 4um3:R, 4um3:S, 4um3:T, 4um3:U, 4um3:V, 4um3:W, 4um3:X, 4um3:Y, 4um3:Z, 4um3:a, 4um3:b, 4um3:c, 4um3:d, 4um3:e, 4um3:f, 4um3:g, 4um3:h, 4um3:i, 4um3:j, 4um3:k, 4um3:l, 4um3:m, 4um3:n, 1uv6:C, 1uv6:D, 1uv6:F, 1uv6:J, 1uw6:A, 1uw6:B, 1uw6:C, 1uw6:D, 1uw6:E, 1uw6:F, 1uw6:G, 1uw6:H, 1uw6:I, 1uw6:J, 1uw6:K, 1uw6:L, 1uw6:M, 1uw6:N, 1uw6:O, 1uw6:P, 1uw6:Q, 1uw6:R, 1uw6:S, 1uw6:T, 3wip:A, 3wip:B, 3wip:C, 3wip:D, 3wip:E, 3wip:F, 3wip:G, 3wip:H, 3wip:I, 3wip:J, 3wth:A, 3wth:B, 3wth:C, 3wth:D, 3wth:E, 3wti:A, 3wti:B, 3wti:C, 3wti:D, 3wti:E, 3wtj:A, 3wtj:B, 3wtj:C, 3wtj:D, 3wtj:E, 3wtk:A, 3wtk:E, 3wtk:B, 3wtk:C, 3wtk:D, 3wtl:A, 3wtl:B, 3wtl:C, 3wtl:D, 3wtl:E, 3wtm:A, 3wtm:E, 3wtm:B, 3wtm:C, 3wtm:D, 3wtn:A, 3wtn:B, 3wtn:C, 3wtn:D, 3wtn:E, 3wtn:F, 3wtn:G, 3wtn:H, 3wtn:I, 3wtn:J, 3wto:A, 3wto:B, 3wto:C, 3wto:D, 3wto:E, 5y2q:D, 5y2q:A, 5y2q:E, 5y2q:B, 5y2q:C, 3zdg:A, 3zdg:B, 3zdg:C, 3zdg:D, 3zdg:E, 3zdg:F, 3zdg:G, 3zdg:H, 3zdg:I, 3zdg:J, 3zdg:K, 3zdg:L, 3zdg:M, 3zdg:N, 3zdg:O, 3zdg:P, 3zdg:Q, 3zdg:R, 3zdg:S, 3zdg:T, 3zdh:A, 3zdh:B, 3zdh:C, 3zdh:D, 3zdh:E, 3zdh:F, 3zdh:G, 3zdh:H, 3zdh:I, 3zdh:J, 2zju:A, 2zju:B, 2zju:C, 2zju:D, 2zju:E, 2zjv:A, 2zjv:B, 2zjv:C, 2zjv:D, 2zjv:E, 4zjt:A, 4zjt:B, 4zjt:C, 4zjt:D, 4zjt:E, 4zjt:F, 4zjt:G, 4zjt:H, 4zjt:I, 4zjt:J, 4zk1:A, 4zk1:B, 4zk1:C, 4zk1:D, 4zk1:E, 4zk1:F, 4zk1:G, 4zk1:H, 4zk1:I, 4zk1:J, 4zr6:A, 4zr6:B, 4zr6:C, 4zr6:D, 4zr6:E, 4zru:A, 4zru:B, 4zru:C, 4zru:D, 4zru:E, 4zru:F, 4zru:G, 4zru:H, 4zru:I, 4zru:J
50 3sio:C 221 154 0.1075 0.1629 0.2338 3.34e-04 4aft:A, 4aft:B, 4aft:C, 4aft:D, 4aft:E, 4bfq:A, 4bfq:B, 4bfq:C, 4bfq:D, 4bfq:E, 4bqt:A, 4bqt:B, 4bqt:C, 4bqt:D, 4bqt:E, 2br8:A, 2br8:B, 2br8:C, 2br8:D, 2br8:E, 5brx:A, 5brx:C, 5brx:D, 5brx:F, 5brx:J, 5brx:H, 5brx:I, 5bw2:A, 5bw2:E, 5bw2:B, 5bw2:C, 5bw2:D, 2byp:A, 2byp:E, 2byp:B, 2byp:C, 2byp:D, 2byq:A, 2byq:B, 2byq:C, 2byq:D, 2byq:E, 2byr:A, 2byr:E, 2byr:B, 2byr:C, 2byr:D, 2byr:F, 2byr:J, 2byr:G, 2byr:H, 2byr:I, 2bys:A, 2bys:E, 2bys:B, 2bys:C, 2bys:D, 2bys:F, 2bys:J, 2bys:G, 2bys:H, 2bys:I, 3c79:A, 3c79:E, 3c79:B, 3c79:C, 3c79:D, 3c84:A, 3c84:E, 3c84:B, 3c84:C, 3c84:D, 2c9t:A, 2c9t:B, 2c9t:C, 2c9t:D, 2c9t:E, 2c9t:F, 2c9t:G, 2c9t:H, 2c9t:I, 2c9t:J, 5co5:A, 5co5:G, 5co5:B, 5co5:D, 5co5:I, 4dbm:A, 4dbm:E, 4dbm:B, 4dbm:C, 7egr:A, 7egr:B, 7egr:C, 7egr:D, 7egr:E, 7egr:F, 7egr:J, 7egr:G, 7egr:H, 7egr:I, 4ez1:B, 4ez1:C, 4ez1:A, 4ez1:E, 4ez1:D, 4frr:A, 4frr:E, 4frr:B, 4frr:C, 4frr:D, 4frr:F, 4frr:J, 4frr:G, 4frr:H, 4frr:I, 5jme:A, 5jme:B, 5jme:E, 5jme:C, 5jme:D, 5kzu:C, 5kzu:D, 5lxb:B, 5lxb:C, 5lxb:D, 5lxb:E, 5lxb:A, 5lxb:G, 5lxb:H, 5lxb:I, 5lxb:J, 6m4x:A, 6m4x:G, 6m4x:B, 6m4x:D, 6m4x:I, 6m4z:A, 6m4z:G, 6m4z:B, 6m4z:D, 6m4z:I, 5o87:A, 5o87:B, 5o87:C, 5o87:D, 5o87:E, 5o87:F, 5o87:G, 5o87:H, 5o87:I, 5o87:J, 5o8t:A, 5o8t:B, 5o8t:C, 5o8t:D, 5o8t:E, 3peo:A, 3peo:E, 3peo:B, 3peo:C, 3peo:D, 3peo:F, 3peo:G, 3peo:J, 3peo:H, 3peo:I, 2pgz:A, 2pgz:B, 2pgz:E, 2ph9:A, 2ph9:C, 2ph9:D, 2ph9:E, 3pmz:B, 3pmz:C, 3pmz:D, 3pmz:E, 8q1m:A, 8q1m:E, 8q1m:B, 8q1m:D, 6qkk:A, 6qkk:B, 6qkk:C, 6qkk:D, 6qkk:E, 6qkk:F, 6qkk:G, 6qkk:H, 6qkk:I, 6qkk:J, 6qqo:A, 6qqo:B, 6qqo:C, 6qqo:D, 6qqo:E, 6qqo:F, 6qqo:G, 6qqo:H, 6qqo:I, 6qqo:J, 6qqp:A, 6qqp:B, 6qqp:C, 6qqp:D, 6qqp:E, 6qqp:F, 6qqp:G, 6qqp:H, 6qqp:I, 6qqp:J, 8qtl:A, 8qtl:E, 8qtl:B, 8qtl:C, 8qx2:A, 8qx2:C, 8qx2:E, 6sgv:A, 6sgv:B, 6sgv:C, 6sgv:D, 6sgv:E, 6sgv:F, 6sgv:G, 6sgv:H, 6sgv:I, 6sgv:J, 3sh1:A, 3sh1:G, 3sh1:E, 3sh1:B, 3sh1:F, 3sh1:C, 3sh1:J, 3sh1:D, 3sh1:H, 3sh1:I, 6sh0:A, 6sh0:E, 6sh0:B, 6sh0:C, 6sh0:D, 6sh0:F, 6sh0:J, 6sh0:G, 6sh0:H, 6sh0:I, 3sio:A, 3sio:E, 3sio:B, 3sio:D, 3sio:F, 3sio:J, 3sio:G, 3sio:H, 3sio:I, 6t9r:AAA, 6t9r:DDD, 6t9r:BBB, 6t9r:EEE, 6t9r:FFF, 6t9r:HHH, 6t9r:GGG, 6t9r:III, 6t9r:JJJ, 5tsf:A, 5tsf:B, 5tsf:C, 5tsf:D, 5tvh:A, 5tvh:E, 5tvh:B, 5tvh:C, 2uz6:A, 2uz6:B, 2uz6:C, 2uz6:D, 2uz6:E, 2uz6:F, 2uz6:G, 2uz6:H, 2uz6:I, 2uz6:J, 2w8f:A, 2w8f:B, 2w8f:F, 2w8g:A, 2w8g:B, 2w8g:D, 2w8g:E, 2wn9:A, 2wn9:B, 2wn9:C, 2wn9:D, 2wnc:A, 2wnc:E, 2wnc:B, 2wnc:C, 2wnc:D, 2wnj:A, 2wnj:B, 2wnj:C, 2wnj:D, 2wnl:A, 2wnl:E, 2wnl:B, 2wnl:D, 2wnl:F, 2wnl:J, 2wnl:G, 2wnl:I, 4wv9:A, 4wv9:D, 4wv9:E, 2wzy:A, 2wzy:E, 2wzy:B, 2wzy:C, 2wzy:D, 2wzy:F, 2wzy:J, 2wzy:G, 2wzy:H, 2wzy:I, 2x00:A, 2x00:E, 2x00:B, 2x00:C, 2x00:D, 5xgl:A, 5xgl:G, 5xgl:B, 5xgl:D, 5xgl:I, 4xhe:A, 4xhe:E, 4xhe:C, 4xhe:D, 4xhe:F, 4xhe:J, 4xhe:G, 4xhe:H, 4xhe:I, 4xk9:A, 4xk9:E, 4xk9:B, 4xk9:C, 4xk9:D, 4xk9:F, 4xk9:J, 4xk9:G, 4xk9:H, 4xk9:I, 2xnt:A, 2xnt:B, 2xnt:C, 2xnt:D, 2xnt:F, 2xnt:G, 2xnt:H, 2xnt:I, 2xnt:J, 2xnu:C, 2xnv:A, 2xnv:B, 2xnv:C, 2xnv:D, 2xnv:E, 2xnv:F, 2xnv:G, 2xnv:H, 2xnv:I, 2xnv:J, 2xys:A, 2xys:B, 2xys:C, 2xys:D, 2xys:E, 2xyt:B, 2xyt:C, 2xyt:D, 2xyt:E, 2xyt:F, 2xyt:G, 2xyt:H, 2xyt:I, 2xz5:A, 2xz5:B, 2xz5:E, 2xz5:C, 2xz5:D, 2xz6:D, 2y54:A, 2y54:B, 2y54:C, 2y54:D, 2y54:E, 2y56:A, 2y56:B, 2y56:C, 2y56:D, 2y56:E, 2y57:A, 2y57:B, 2y57:C, 2y57:D, 2y57:E, 2y58:A, 2y58:B, 2y58:C, 2y58:D, 2y58:E, 2yme:A, 2yme:B, 2yme:C, 2yme:D, 2yme:E, 2yme:F, 2yme:G, 2yme:H, 2yme:I, 2yme:J
51 8qx2:B 217 156 0.1104 0.1705 0.2372 0.001 5ain:A, 5ain:B, 5ain:C, 5ain:D, 5ain:E, 4dbm:D, 5ke4:A, 5ke4:E, 5ke4:B, 5ke4:C, 5ke4:D, 5oa0:A, 5oa0:B, 5oa0:C, 5oa0:D, 5oa0:E, 5oaj:D, 5oaj:E, 5oaj:F, 5oaj:J, 5oal:A, 5oal:B, 5oal:C, 5oal:D, 5oal:E, 5oal:F, 5oal:G, 5oal:H, 5oal:I, 5oal:J, 5oal:K, 5oal:L, 5oal:O, 5oal:M, 5oal:N, 5oan:B, 5oan:C, 5oan:D, 5oan:E, 5obg:A, 5obg:B, 5obg:C, 5obg:D, 5obg:E, 5obh:A, 5obh:B, 5obh:C, 5obh:D, 5obh:E, 8q1m:C, 8qtl:D, 8qx2:D, 5syo:B, 5syo:C, 5syo:E, 6t9r:CCC, 5tsf:E, 5tvc:A, 5tvc:B, 5tvc:C, 5tvc:D, 5tvc:E, 5tvh:D, 2wn9:E, 2wnj:E, 4wv9:B, 4xhe:B, 2ymd:A, 2ymd:B, 2ymd:C, 2ymd:D, 2ymd:E, 2ymd:F, 2ymd:G, 2ymd:H, 2ymd:I, 2ymd:J, 4zk4:A, 4zk4:B, 4zk4:C, 4zk4:D, 4zk4:E
52 5zl1:A 306 97 0.0687 0.0752 0.2371 0.065 5zl1:B, 5zl1:C, 5zl1:D
53 8i7h:A 297 49 0.0507 0.0572 0.3469 0.27 8i7h:B, 8i7h:C, 8i7h:D
54 6hiv:Cv 1059 85 0.0627 0.0198 0.2471 3.2 6hiw:Cv, 6hiy:Cv, 7pub:Cv
55 2a7r:A 338 34 0.0358 0.0355 0.3529 4.0 2a7r:B, 2a7r:C, 2bzn:A, 2bzn:B, 2bzn:C, 2bzn:D, 2bzn:E, 2bzn:F, 2bzn:G, 2bzn:H, 2c6q:A, 2c6q:B, 2c6q:D, 2c6q:C, 2c6q:E, 2c6q:F, 2c6q:H, 2c6q:G
56 6l88:A 195 61 0.0507 0.0872 0.2787 6.4 6l88:B, 6l88:C, 6l88:D
57 2gbf:A 730 42 0.0448 0.0205 0.3571 7.4 4ffw:A, 4ffw:B, 2gbg:A, 2gbi:A, 2i3z:A, 2oae:A, 5vta:A, 5vta:B, 5vta:C, 5vta:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218