Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NVVSAPMPGKVLRVLVRVGDRVRVGQGLLVLEAMKMENEIPSPRDGVVKRILVKEGEAVDTGQPLIELG

The query sequence (length=69) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2ejf:C 69 69 1.0000 1.0000 1.0000 2.49e-42
2 5vyz:C 1083 69 0.4928 0.0314 0.4928 3.16e-15 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
3 8jxn:J 541 64 0.4203 0.0536 0.4531 3.33e-15
4 5vyz:A 1144 68 0.4928 0.0297 0.5000 3.39e-15 5vyw:D, 5vyz:B, 5vyz:D, 5vz0:A, 5vz0:B, 5vz0:D, 7zyy:A, 7zyy:C, 7zyy:B, 7zyy:D, 7zyz:A, 7zz0:A, 7zz1:A, 7zz2:A, 7zz3:A, 7zz3:C, 7zz3:B, 7zz3:D, 7zz4:A, 7zz5:A, 7zz6:D, 7zz6:A, 7zz8:A, 7zz8:C, 7zz8:D, 7zz8:B
5 8j78:I 651 64 0.4203 0.0445 0.4531 3.76e-15 8j78:C, 8j7d:D, 8j7d:F, 8j7d:I, 8j7d:L, 8jaw:A, 8jaw:C, 8jaw:E, 8jaw:F, 8jaw:H, 8jaw:K, 8k2v:A, 8k2v:B, 8k2v:C, 8k2v:D, 8k2v:E, 8k2v:F
6 3bg5:A 1137 66 0.4638 0.0281 0.4848 1.95e-14 3bg5:C, 8gk8:A, 8gk8:B, 3hb9:A, 3hb9:C, 3hbl:A, 3hbl:C, 4hnt:A, 4hnt:C, 4hnu:A, 4hnu:C, 4hnv:A, 4hnv:C
7 3bg5:B 1074 66 0.4638 0.0298 0.4848 1.96e-14 3bg5:D, 8gk8:C, 3hb9:B, 3hb9:D, 3hbl:B, 3hbl:D, 4hnt:B, 4hnt:D, 4hnu:B, 4hnu:D, 4hnv:D, 3ho8:A, 3ho8:C, 3ho8:B
8 4hnv:B 1033 66 0.4638 0.0310 0.4848 2.16e-14 8gk8:D
9 5ks8:F 482 67 0.4638 0.0664 0.4776 7.09e-14
10 5ks8:C 603 67 0.4638 0.0531 0.4776 8.79e-14
11 5ks8:D 580 67 0.4638 0.0552 0.4776 9.58e-14
12 4qsh:C 1081 67 0.4493 0.0287 0.4627 4.01e-13 4qsh:A, 4qsh:D, 4qsh:B, 4qsk:A, 4qsk:B
13 2b8g:A 72 68 0.4203 0.4028 0.4265 1.33e-12 1z6h:A
14 1bdo:A 80 73 0.4058 0.3500 0.3836 1.22e-11 2bdo:A
15 7ybu:A 670 68 0.4203 0.0433 0.4265 3.52e-11 7ybu:B, 7ybu:D, 7ybu:F, 7ybu:H, 7ybu:J
16 8sgx:X 657 64 0.4203 0.0441 0.4531 4.89e-10 8sgx:S, 8sgx:Z, 8sgx:V, 8sgy:V, 8sgy:B, 8sgy:S, 8sgy:Z, 8sgy:Y, 8sgz:V, 8sgz:Z, 8sgz:X, 8sgz:S, 8sgz:B, 8sgz:Y
17 8pn8:G 213 64 0.3623 0.1174 0.3906 5.58e-10 8pn7:G, 8pn7:H, 8pn7:I, 8pn7:J, 8pn7:K, 8pn7:L, 8pn8:H, 8pn8:I, 8pn8:J, 8pn8:K, 8pn8:L, 6ybq:G, 6ybq:H, 6ybq:I, 6ybq:J, 6ybq:K, 6ybq:L
18 8rth:A 666 54 0.3768 0.0390 0.4815 4.21e-09 8rth:C, 8rth:E, 8rth:G, 8rth:I, 8rth:K
19 7wtb:B 1147 53 0.3623 0.0218 0.4717 5.51e-09 3bg3:A, 3bg3:B, 3bg3:C, 3bg3:D, 3bg9:A, 3bg9:B, 3bg9:C, 3bg9:D, 8j7o:A, 8j7o:B, 8j7o:C, 8j7o:E, 7wta:C, 7wta:B, 7wta:D, 7wta:A, 7wtb:C, 7wtb:A, 7wtb:D, 7wtc:C, 7wtc:A, 7wtc:B, 7wtc:D, 7wtd:C, 7wtd:D, 7wte:C, 7wte:D
20 8hwl:A 941 53 0.3623 0.0266 0.4717 5.70e-09 8hwl:B, 8hwl:C, 8hwl:E
21 3n6r:G 646 64 0.3623 0.0387 0.3906 1.18e-08 3n6r:I, 3n6r:K
22 3n6r:A 591 64 0.3623 0.0423 0.3906 1.36e-08 3n6r:C, 3n6r:E
23 3va7:A 1130 61 0.2899 0.0177 0.3279 2.20e-06
24 3tw6:B 1129 59 0.3623 0.0221 0.4237 9.50e-06 4jx4:A, 4jx4:B, 4jx4:C, 4jx4:D, 4jx5:A, 4jx5:B, 4jx5:C, 4jx5:D, 4jx6:A, 4jx6:B, 4jx6:C, 4jx6:D, 4loc:A, 4loc:B, 4loc:C, 4loc:D, 4m6v:A, 4m6v:B, 4m6v:C, 4m6v:D, 4mfd:A, 4mfd:B, 4mfd:C, 4mfd:D, 4mfe:A, 4mfe:B, 4mfe:C, 4mfe:D, 4mim:A, 4mim:B, 4mim:C, 4mim:D, 3tw6:C, 3tw6:D
25 2qf7:A 1076 58 0.3188 0.0204 0.3793 1.58e-05 3tw6:A
26 5csl:A 2050 57 0.2754 0.0093 0.3333 6.71e-04
27 5csl:A 2050 48 0.2029 0.0068 0.2917 0.90
28 1hqm:D 1175 37 0.2029 0.0119 0.3784 0.31 1i6v:D
29 4xln:J 1367 37 0.2029 0.0102 0.3784 0.32 3aoh:D, 3aoh:N, 3aoi:D, 3aoi:N, 6asg:D, 4gzy:D, 4gzz:D, 5i2d:D, 5i2d:O, 4mq9:D, 7rdq:D, 4wqt:D, 4wqt:I, 4wqt:N, 4xlp:J, 4xlq:J, 4xlr:J, 4xls:J
30 6ihv:A 221 26 0.1739 0.0543 0.4615 0.33 6ihu:A
31 6ihr:A 257 26 0.1739 0.0467 0.4615 0.34 5f1m:A, 6ihl:A, 6ihs:A, 6iht:A, 6ihw:A
32 5tjg:D 1475 37 0.2029 0.0095 0.3784 0.35
33 5c22:B 267 30 0.2029 0.0524 0.4667 0.39
34 4bay:A 670 55 0.2174 0.0224 0.2727 0.87 3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
35 3eql:D 1321 37 0.1884 0.0098 0.3514 1.5 3eql:N, 8hsg:J, 8hsh:J, 8hsl:J, 8hsr:J, 6m6a:D, 6m6b:D, 6m6c:D, 2o5i:D, 2o5i:N, 2ppb:D, 2ppb:N
36 3aoh:I 1289 37 0.1884 0.0101 0.3514 1.5 3aoi:I
37 4wqs:N 1288 37 0.1884 0.0101 0.3514 1.5
38 2a68:D 1392 37 0.1884 0.0093 0.3514 1.6 2a68:N, 2a69:D, 2a69:N, 2a6e:D, 2a6e:N, 2a6h:D, 2a6h:N, 2be5:D, 2be5:N, 2cw0:D, 2cw0:N, 1iw7:D, 1iw7:N, 1smy:D, 1smy:N, 1zyr:D, 1zyr:N
39 3dxj:D 1504 37 0.1884 0.0086 0.3514 1.7 6cuu:D, 5d4c:D, 5d4c:N, 5d4d:D, 5d4d:N, 5d4e:D, 5d4e:N, 3dxj:N, 5e17:D, 5e18:D, 7eh0:D, 7eh1:D, 7eh2:D, 7eh2:N, 4g7h:D, 4g7h:N, 4g7o:D, 4g7o:N, 4g7z:D, 4g7z:N, 6kqd:D, 6kqd:N, 6kqe:D, 6kqf:D, 6kqg:D, 6kqh:D, 6kql:D, 6kqm:D, 6kqn:D, 6l74:D, 6lts:D, 7mlb:D, 7mli:D, 7mlj:D, 4oin:D, 4oio:D, 4oip:D, 4oiq:D, 4oir:D, 6ovr:D, 6ovy:D, 6ow3:D, 6oy5:D, 6oy6:D, 6oy7:D, 6p70:D, 6p71:D, 4q4z:D, 4q5s:D, 5tmc:D, 5tmf:D, 5vo8:D, 5voi:D, 8w8n:D, 8w8o:D, 8w8p:D, 3wod:D, 6wox:D, 6woy:D, 5x21:D, 5x22:N, 5xj0:D, 4xln:D, 4xlp:D, 4xlq:D, 4xlr:D, 4xls:D, 1ynj:D, 1ynn:D
40 5x22:D 1438 37 0.1884 0.0090 0.3514 1.7
41 2dw4:A 634 49 0.1884 0.0205 0.2653 1.7
42 5csl:B 2072 48 0.2029 0.0068 0.2917 2.3 5ctb:A, 5ctb:C, 5ctc:A, 5ctc:B, 5ctc:C, 5cte:B, 5cte:C, 3h0s:A, 3k8x:A, 3k8x:B, 3k8x:C, 1od2:A, 1od2:B, 3pgq:A, 3pgq:C, 3tv5:A, 3tv5:B, 3tv5:C, 3tvu:A, 3tvu:B, 3tvu:C, 3tvw:A, 3tvw:B, 3tvw:C, 3tz3:A, 3tz3:B, 3tz3:C, 1w96:A, 1w96:B, 1w96:C, 4wyo:B, 4wyo:C, 4wz8:B, 4wz8:C
43 5csl:B 2072 36 0.1739 0.0058 0.3333 8.8 5ctb:A, 5ctb:C, 5ctc:A, 5ctc:B, 5ctc:C, 5cte:B, 5cte:C, 3h0s:A, 3k8x:A, 3k8x:B, 3k8x:C, 1od2:A, 1od2:B, 3pgq:A, 3pgq:C, 3tv5:A, 3tv5:B, 3tv5:C, 3tvu:A, 3tvu:B, 3tvu:C, 3tvw:A, 3tvw:B, 3tvw:C, 3tz3:A, 3tz3:B, 3tz3:C, 1w96:A, 1w96:B, 1w96:C, 4wyo:B, 4wyo:C, 4wz8:B, 4wz8:C
44 2i2x:A 459 56 0.2319 0.0349 0.2857 3.7 2i2x:C, 2i2x:E, 2i2x:G, 2i2x:I, 2i2x:K, 2i2x:M, 2i2x:O
45 6spf:P 114 29 0.1884 0.1140 0.4483 4.8 8cd1:P, 6spb:P, 6spd:P, 6spg:P, 7unr:R, 7unu:R, 7unv:R, 7unw:R
46 4v8p:BI 198 46 0.2029 0.0707 0.3043 6.3 4v8p:CI, 4v8p:EI, 4v8p:GI
47 3ttn:A 335 21 0.1449 0.0299 0.4762 8.3 3ttn:B
48 6itd:A 328 38 0.2029 0.0427 0.3684 9.1 6k36:A, 6k37:A, 6k38:A
49 7be8:A 219 49 0.2464 0.0776 0.3469 9.2 7be8:B, 7bha:A, 7bha:B, 7bhb:A, 7bhb:B, 7bhc:A, 7bhc:B, 5fnn:A, 5fnn:B, 5fnp:A, 5fnp:B, 5fny:A, 5fny:B, 7oyi:A, 7oyi:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218