BioLiP

>protein
NVSWNGTNVFGKSANLTFKFLQSVSSIPSGDTGFVKFNAEQIEQAKLSLQSWSDVANLTFTEVTGNKSANITFGNYTRDA
SGNLDYGTQAYAYYPGNYQGAGSSWYNYNQSNIRNPGSEEYGRQTFTHEIGHALGLAHPGYNGHYGGAPMIDDIAAIQRL
YGANMTTRTGDSVYGFNSNTDRDFYTATDSSKALIFSVWDAGGTDTFDFSGYSNNQRINLNEGSFSDVGGLKGNVSIAHG
VTIENAIGGSGNDILVGNSADNILQGGAGNDVLYGGAGADTLYGGAGRDTFVYGSGQDSTVAAYDWIADFQKGIDKIDLS
AFRNEGQLSFVQDQFTGKGQEVMLQWDAANSITNLWLHEAGHSSVDFLVRIVGQAAQSDIIV

The query sequence (length=382) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3hda:P	382	382	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3hbv:P
2	1go7:P	462	419	0.9974	0.8247	0.9093	0.0	1go8:P, 3hb2:P, 3hbu:P, 1k7g:A, 1k7i:A, 1k7q:A
3	1af0:A	470	429	0.6492	0.5277	0.5781	1.95e-163	5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A
4	1akl:A	470	381	0.5157	0.4191	0.5171	4.85e-119	1jiw:P, 1kap:P, 3vi1:A, 3vi1:B
5	6ixx:A	463	415	0.5314	0.4384	0.4892	9.70e-119	1g9k:A, 1h71:P, 1o0q:A, 1o0t:A, 1om6:A, 1om7:A, 1om8:A, 1omj:A, 3u1r:A
6	2ml1:A	153	90	0.1021	0.2549	0.4333	6.94e-10
7	7usl:C	715	56	0.0785	0.0420	0.5357	3.11e-09
8	7usl:C	715	52	0.0733	0.0392	0.5385	6.44e-07
9	7usl:C	715	96	0.0890	0.0476	0.3542	1.22e-04
10	7usl:C	715	44	0.0602	0.0322	0.5227	8.30e-04
11	7usl:C	715	45	0.0602	0.0322	0.5111	0.017
12	7usl:C	715	45	0.0576	0.0308	0.4889	0.11
13	7usl:C	715	49	0.0524	0.0280	0.4082	1.7
14	8ja4:A	480	105	0.1073	0.0854	0.3905	6.58e-09	8ja6:A, 8jaz:B, 8jaz:A, 8xfq:A, 8xfr:A
15	1hv5:E	165	140	0.1230	0.2848	0.3357	4.44e-08	1hv5:A, 1hv5:B, 1hv5:C, 1hv5:D, 1hv5:F
16	7rah:E	360	53	0.0733	0.0778	0.5283	3.02e-07
17	7rah:E	360	114	0.0942	0.1000	0.3158	3.37e-05
18	7rah:E	360	63	0.0524	0.0556	0.3175	7.5
19	6sus:A	258	56	0.0733	0.1085	0.5000	3.37e-07	5cvw:A, 5cxl:A, 5cxl:B
20	6sus:A	258	76	0.0812	0.1202	0.4079	7.60e-04	5cvw:A, 5cxl:A, 5cxl:B
21	2ml3:A	181	73	0.0916	0.1934	0.4795	6.95e-07
22	2jsd:A	160	166	0.1257	0.3000	0.2892	3.82e-06
23	1su3:B	416	193	0.1387	0.1274	0.2746	2.62e-04	966c:A, 4auo:A, 4auo:B, 1ayk:A, 2ayk:A, 3ayk:A, 4ayk:A, 1cge:A, 1cgf:A, 1cgf:B, 1cgl:A, 1cgl:B, 2clt:A, 2clt:B, 1hfc:A, 2j0t:A, 2j0t:B, 2j0t:C, 3shi:A, 3shi:G, 3shi:M, 1su3:A, 2tcl:A
24	5gwd:A	239	97	0.0864	0.1381	0.3402	0.001	5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
25	1fbl:A	367	140	0.1126	0.1172	0.3071	0.001
26	3a6z:C	616	54	0.0654	0.0406	0.4630	0.002	3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
27	3a6z:C	616	83	0.0707	0.0438	0.3253	0.002	3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
28	3a6z:C	616	60	0.0681	0.0422	0.4333	0.21	3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
29	3a6z:C	616	52	0.0576	0.0357	0.4231	0.40	3a6z:A, 3a70:A, 3a70:C, 2z8x:A, 2z8z:A, 2zj6:A, 2zj7:A, 2zvd:A, 2zvd:C
30	1bzs:A	165	145	0.1178	0.2727	0.3103	0.003	1a85:A, 1a86:A, 3dng:A, 3dng:B, 3dpe:A, 3dpf:A, 3dpf:B, 5h8x:A, 1i73:A, 1i76:A, 1jan:A, 1jao:A, 1jap:A, 1jaq:A, 1jh1:A, 1jj9:A, 1kbc:A, 1kbc:B, 1mmb:A, 1mnc:A, 2oy2:A, 2oy2:F, 2oy4:A, 2oy4:F, 4qkz:A, 3tt4:A, 1zp5:A, 1zs0:A, 1zvx:A
31	1rm8:A	169	151	0.1047	0.2367	0.2649	0.003
32	5juh:A	137	59	0.0654	0.1825	0.4237	0.005
33	8h78:A	168	133	0.1073	0.2440	0.3083	0.010	3ayu:A, 8h78:B, 1hov:A, 1qib:A, 7xgj:A, 7xgj:B, 7xgj:C, 7xjo:A, 7xjo:B
34	2qua:A	615	84	0.0654	0.0407	0.2976	0.059	2qub:A, 2qub:C, 2qub:E, 2qub:G, 2qub:I, 2qub:K
35	2qua:A	615	53	0.0681	0.0423	0.4906	0.064	2qub:A, 2qub:C, 2qub:E, 2qub:G, 2qub:I, 2qub:K
36	1q3a:B	160	170	0.1178	0.2812	0.2647	0.074	4ilw:D, 4ilw:F, 1q3a:A, 1q3a:C, 3v96:B
37	1slm:A	226	172	0.1152	0.1947	0.2558	0.099	1b3d:A, 1b3d:B, 1b8y:A, 1biw:A, 1biw:B, 1bm6:A, 1bqo:A, 1bqo:B, 1c3i:A, 1c3i:B, 1c8t:A, 1c8t:B, 1caq:A, 1ciz:A, 1cqr:A, 1cqr:B, 2d1o:A, 2d1o:B, 1d5j:A, 1d5j:B, 1d7x:A, 1d7x:B, 1d8f:A, 1d8f:B, 1d8m:A, 1d8m:B, 4dpe:A, 4dpe:B, 1g05:A, 1g05:B, 1g49:A, 1g49:B, 1g4k:A, 1g4k:B, 1g4k:C, 4g9l:A, 4g9l:B, 1hfs:A, 1hy7:A, 1hy7:B, 4ja1:A, 4ja1:B, 2jnp:A, 2jt5:A, 2jt6:A, 6mav:A, 6n9d:A, 3ohl:A, 3oho:A, 1qia:A, 1qia:B, 1qia:C, 1qia:D, 1qic:A, 1qic:B, 1qic:C, 1qic:D, 7s7l:A, 7s7m:A, 1sln:A, 2srt:A, 1uea:A, 1uea:C, 1ums:A, 1umt:A, 1usn:A, 2usn:A, 3usn:A
38	4fu4:A	368	182	0.1309	0.1359	0.2747	0.13	830c:A, 830c:B, 456c:A, 456c:B, 4a7b:A, 4a7b:B, 5b5o:A, 5b5o:B, 5b5p:A, 5b5p:B, 5bot:A, 5bot:B, 5boy:A, 5boy:B, 5bpa:A, 5bpa:B, 1cxv:A, 1cxv:B, 2d1n:A, 2d1n:B, 2e2d:A, 3elm:A, 3elm:B, 1eub:A, 1fls:A, 1fm1:A, 4fu4:B, 4fvl:A, 4fvl:B, 4g0d:A, 4g0d:B, 4g0d:C, 4g0d:D, 6hv2:A, 3i7g:A, 3i7g:B, 3i7i:A, 3i7i:B, 4jp4:A, 4jp4:B, 4jpa:A, 4jpa:B, 7ju8:A, 7ju8:B, 3kec:A, 3kec:B, 3kej:A, 3kej:B, 3kek:A, 3kek:B, 3kry:A, 3kry:B, 3kry:C, 3kry:D, 4l19:A, 4l19:B, 3ljz:A, 3ljz:B, 3ljz:C, 3ljz:D, 3o2x:A, 3o2x:B, 3o2x:C, 3o2x:D, 2ow9:A, 2ow9:B, 2ozr:A, 2ozr:B, 2ozr:C, 2ozr:D, 2ozr:E, 2ozr:F, 2ozr:G, 2ozr:H, 1pex:A, 2pjt:A, 2pjt:B, 2pjt:C, 2pjt:D, 3tvc:A, 5uwk:A, 5uwk:B, 5uwl:A, 5uwl:B, 5uwm:A, 5uwm:B, 5uwn:A, 5uwn:B, 5uwn:C, 5uwn:D, 5uwn:E, 3wv1:A, 3wv1:B, 3wv2:A, 3wv2:B, 3wv3:A, 3wv3:B, 1xuc:A, 1xuc:B, 1xud:A, 1xud:B, 1xur:A, 1xur:B, 2yig:A, 2yig:B, 1you:A, 1you:B, 1ztq:A, 1ztq:B, 1ztq:C, 1ztq:D, 3zxh:A, 3zxh:B
39	2ml2:A	161	89	0.0916	0.2174	0.3933	0.29
40	3ba0:A	365	143	0.1126	0.1178	0.3007	0.35	8b2n:A, 8b2n:C, 5cxa:A, 5czm:A, 5d2b:A, 5d3c:A, 4efs:A, 3ehx:A, 3ehy:A, 6ekn:A, 6ela:A, 6ela:B, 6ela:C, 6ela:D, 6enm:A, 6enm:B, 6eox:A, 3f15:A, 3f16:A, 3f17:A, 3f18:A, 3f19:A, 3f1a:A, 4gql:A, 4gr0:A, 4gr3:A, 4gr8:A, 4guy:A, 4h30:A, 4h30:B, 4h49:A, 4h49:B, 4h49:C, 4h49:D, 4h76:A, 4h84:A, 4h84:B, 2hu6:A, 4i03:A, 5i0l:A, 5i0l:B, 5i2z:A, 5i2z:B, 5i2z:C, 5i2z:D, 5i3m:A, 5i3m:B, 5i3m:C, 5i3m:D, 5i43:A, 5i43:B, 5i43:C, 5i43:D, 5i4o:A, 5i4o:C, 5i4o:B, 5i4o:D, 4ijo:A, 1jiz:A, 1jiz:B, 1jk3:A, 2jxy:A, 2k2g:A, 2k9c:A, 2krj:A, 5l79:A, 5l7f:A, 5l7f:B, 5lab:A, 3lik:A, 3lil:A, 3lir:A, 3ljg:A, 3lk8:A, 3lka:A, 2mlr:A, 2mls:A, 3n2u:A, 3n2v:A, 5n5j:A, 5n5k:A, 2n8r:A, 3nx7:A, 1os2:A, 1os2:B, 1os2:C, 1os2:D, 1os2:E, 1os2:F, 1os9:A, 1os9:B, 1os9:C, 1os9:D, 1os9:E, 1os9:F, 7ovy:A, 2oxu:A, 2oxw:A, 2oxz:A, 2poj:A, 6rd0:A, 8rij:A, 6rly:A, 1rmz:A, 1ros:A, 1ros:B, 3rts:A, 3rtt:A, 3ts4:A, 3tsk:A, 1utt:A, 1utz:A, 1utz:B, 3uvc:A, 3uvc:B, 2w0d:A, 2w0d:B, 2w0d:C, 2w0d:D, 2wo8:A, 2wo8:B, 2wo8:C, 2wo8:D, 2wo9:A, 2wo9:B, 2wo9:C, 2wo9:D, 2woa:A, 2woa:B, 2woa:C, 2woa:D, 1y93:A, 1ycm:A, 2z2d:A, 1z3j:A
41	1zm5:A	293	138	0.0864	0.1126	0.2391	0.39	2cdm:A, 2cdm:C, 1omh:A, 1osb:A, 1osb:C, 4pcb:A, 4pcb:C, 1qx0:A, 1s6m:A
42	1bqq:M	174	110	0.0785	0.1724	0.2727	0.48	1buv:M, 5h0u:A, 3ma2:D, 3ma2:A
43	3d31:A	348	47	0.0471	0.0517	0.3830	0.64	3d31:B
44	8k5v:B	232	131	0.1073	0.1767	0.3130	0.88	5cuh:A, 5cuh:B, 6esm:A, 1gkc:A, 1gkc:B, 1gkd:A, 1gkd:B, 4h1q:A, 4h1q:B, 4h2e:A, 4h2e:B, 4h3x:A, 4h3x:B, 4h82:A, 4h82:B, 4h82:C, 4h82:D, 4hma:A, 4hma:B, 5i12:A, 4jij:A, 4jij:B, 4jqg:A, 4jqg:B, 8k5v:A, 8k5w:A, 8k5w:B, 8k5x:A, 8k5x:B, 8k5y:A, 8k5y:B, 2ovx:A, 2ovx:B, 2ovz:A, 2ovz:B, 2ow0:A, 2ow0:B, 2ow1:A, 2ow1:B, 2ow2:A, 2ow2:B, 5th6:A, 5th6:B, 5th6:C, 5th6:D, 5th9:A, 5th9:B, 5th9:C, 5ue3:A, 5ue3:B, 5ue4:A, 5ue4:B, 4wzv:A, 4wzv:B, 4xct:A
45	1gxd:A	624	52	0.0550	0.0337	0.4038	1.5	1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
46	2c0b:L	488	59	0.0471	0.0369	0.3051	1.6	2vmk:C, 2vrt:A, 2vrt:B
47	1l6j:A	405	44	0.0471	0.0444	0.4091	1.7
48	2mze:A	250	53	0.0497	0.0760	0.3585	1.9	2ddy:A, 8jud:A, 8juf:A, 8jug:A, 8k4z:A, 1mmp:A, 1mmp:B, 1mmq:A, 1mmr:A, 2mzh:A, 2mzi:A, 5ue2:A, 5ue5:A, 7wxx:A, 2y6c:A, 2y6d:A
49	4l63:A	249	35	0.0445	0.0683	0.4857	2.8	4l6t:A
50	6z7p:A	1025	117	0.1021	0.0380	0.3333	3.7	8bqe:B, 8bqe:C, 8bqe:E, 8bqe:D, 8bqe:F, 8bqe:A, 5n8p:A, 5n8p:B, 5n8p:C, 5n8p:D, 5n8p:E, 5n8p:F, 5n97:A, 5n97:B, 5n97:C, 5n97:D, 5n97:E, 5n97:F, 7peo:A, 6t72:A
51	2zl2:A	174	67	0.0524	0.1149	0.2985	3.8	2zl2:B, 2zl2:C, 2zl2:E, 2zl2:F, 2zl2:G, 2zl2:H, 2zl2:K, 2zl2:M, 2zl2:N, 2zl4:A, 2zl4:B, 2zl4:C, 2zl4:D, 2zl4:E, 2zl4:F, 2zl4:G, 2zl4:H, 2zl4:I, 2zl4:J, 2zl4:K, 2zl4:L, 2zl4:M, 2zl4:N
52	1wni:A	198	32	0.0288	0.0556	0.3438	4.0
53	3gbo:A	200	27	0.0314	0.0600	0.4444	4.7
54	6hwm:E	195	146	0.0838	0.1641	0.2192	4.7	6hwm:A, 6hwm:B, 6hwm:C, 6hwm:D, 6hwm:F, 6hwm:G, 6hwn:A, 6hwn:B, 6hwn:C, 6hwn:D, 6hwn:E, 6hwn:F, 6hwn:G
55	4q1l:A	202	27	0.0288	0.0545	0.4074	5.5
56	4j4m:B	200	14	0.0262	0.0500	0.7143	6.0	4j4m:A
57	6ces:A	300	27	0.0314	0.0400	0.4444	7.3	8dhb:B, 6s6a:A, 6s6a:B, 6s6d:A, 6s6d:B, 6sb0:C, 6sb0:I, 6sb2:C, 6sb2:I, 7t3a:K, 7t3b:D, 7t3c:D, 7t3c:K, 6u62:B, 6ulg:F, 7ux2:B, 7ux2:I, 7uxc:D, 7uxc:K, 7uxh:F, 7uxh:M, 7uxh:V, 7uxh:c, 6wj2:F, 6wj3:F

[Back]