BioLiP

>protein
NVAHGLAWSYYIGYLRLILPELQARIRTYNQLRGAVSQRLYILLPLDCGVPDNLSMADPNIRFLDKLPQQTGDRAGIKDR
VYSNSIYELLENGQRAGTCVLEYATPLQTLFAMSQYSQAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPESQNNCRLIAYQEPA
DDSSFSLSQEVLRHLRQE

The query sequence (length=178) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ik3:A	328	183	1.0000	0.5427	0.9727	1.31e-126	8a2h:A, 8a2h:B, 8a2i:A, 8a2i:B, 8a2j:A, 8a2j:B, 8a2k:A, 8a2k:B, 8a2x:A, 7a90:A, 8b2j:A, 8b2j:B, 5bqx:A, 6cff:A, 6cy7:A, 6dnk:A, 6dxg:A, 6dxl:A, 6dxl:B, 4ef4:A, 4ef4:B, 4emt:A, 4emt:B, 4emu:B, 4f5d:A, 4f5d:B, 4f5w:A, 4f5y:A, 4f5y:B, 4f9g:C, 8flk:A, 8flk:B, 8flk:C, 8flk:D, 8flm:A, 8flm:B, 8flm:C, 8flm:D, 8gjx:A, 8gjx:B, 8gt6:A, 8gt6:B, 8ik3:C, 8ik3:E, 8ik3:G, 8ik3:F, 8ik3:H, 4ksy:A, 7kvx:A, 7kvz:A, 7kw1:A, 4loh:A, 4loh:B, 4loi:A, 4loi:B, 7mhc:A, 6mx0:B, 6mx3:B, 6mxe:A, 6mxe:B, 7ob3:A, 8orw:A, 8p01:A, 8p45:A, 7q3b:A, 7q85:A, 4qxo:A, 4qxp:A, 4qxp:B, 4qxq:A, 4qxq:B, 4qxr:A, 4qxr:B, 6s26:A, 6s26:B, 6s27:A, 6s86:A, 6s86:B, 7sho:B, 7shp:A, 7shp:B, 7shp:C, 7shp:D, 7sii:A, 7sii:B, 7sii:C, 7sii:D, 7ssm:A, 8sth:A, 8sti:A, 8t5k:B, 8t5l:B, 7t9u:A, 7t9v:A, 7t9v:B, 6ukm:A, 6uku:A, 6ukv:A, 6ukv:B, 6ukw:A, 6ukw:B, 6ukx:A, 6ukx:B, 6uky:A, 6ukz:A, 6ukz:B, 6ul0:A, 7x9p:A, 7x9q:A, 6xf3:A, 6xf3:B, 6xf4:A, 6xf4:B, 6xnp:A, 6xnp:B, 6y99:A, 6ydb:A, 6ydz:A, 6yea:A, 6ywa:A, 6ywa:B, 6ywb:A, 6z0z:A, 6z15:A, 7zku:A, 7zku:B, 7zv0:A, 7zvk:A, 7zvk:B, 7zwl:A, 7zwl:B, 7zxb:A
2	4f9g:A	170	182	0.8933	0.9353	0.8736	1.45e-106	6mx3:A
3	6a06:A	188	183	0.8258	0.7819	0.8033	1.42e-105	6a03:A, 6a03:B, 6a04:A, 6a04:B, 6a05:A, 6a05:B, 6a06:B, 6iyf:A, 6iyf:B
4	5grm:B	190	182	0.7978	0.7474	0.7802	5.59e-103	5grm:A, 4jc5:A, 4jc5:B, 4kby:A, 4kby:B, 4loj:A, 4loj:B, 4lok:A, 4lok:B, 4lol:A, 4lol:B, 6xnn:A, 6xnn:B, 4yp1:A, 4yp1:B
5	6nt7:A	294	182	0.5056	0.3061	0.4945	2.76e-47	6nt7:B, 6nt8:A, 6nt8:B, 6nt8:D, 6nt8:E
6	8gjz:B	182	171	0.3483	0.3407	0.3626	7.28e-36	8efm:A, 8efm:B, 8gjz:A
7	8efn:A	175	155	0.3315	0.3371	0.3806	6.48e-35	8efn:D
8	5cfl:A	187	182	0.3539	0.3369	0.3462	1.58e-29	5cfl:B, 5cfm:A, 5cfm:B, 5cfn:A, 5cfn:B, 5cfp:A, 5cfp:B, 5cfq:A, 5cfq:B, 5cfr:A, 5cfr:B
9	6wt7:A	331	184	0.3315	0.1782	0.3207	3.76e-29
10	7mwz:D	301	169	0.2921	0.1728	0.3077	1.01e-07
11	7mwz:B	352	169	0.2921	0.1477	0.3077	1.11e-07	7mwz:A, 7mwz:C
12	3zq4:A	550	73	0.1124	0.0364	0.2740	1.6	3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
13	1ecx:B	365	53	0.0843	0.0411	0.2830	1.7	1ecx:A, 1eg5:A, 1eg5:B
14	6xux:A	879	62	0.1011	0.0205	0.2903	4.8
15	3u5z:B	320	30	0.0449	0.0250	0.2667	4.9	3u5z:C, 3u5z:D, 3u5z:E, 3u5z:L, 3u5z:M, 3u5z:N, 3u5z:O, 3u60:B, 3u60:C, 3u60:D, 3u60:E, 3u61:C, 3u61:D, 3u61:E, 3u61:B, 8uh7:B, 8uh7:C, 8uh7:D, 8uh7:E, 8uk9:B, 8uk9:C, 8uk9:D, 8uk9:E, 8uk9:K, 8uk9:L, 8uk9:M, 8uk9:N, 8unf:E, 8unf:D, 8unf:C, 8unf:B, 8unh:B, 8unh:E
16	4hix:L	219	48	0.0899	0.0731	0.3333	5.5	2eh8:L, 7eyc:L, 7eyc:B, 8fas:B, 8fg0:D, 8fg0:B, 4jn2:A, 4jn2:L, 7o33:L, 6obd:A, 6obd:L, 4ojf:L, 3u0t:C, 3u0t:A, 6x8p:L, 6x8q:L, 6x8s:L, 6x8u:L

[Back]