Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NTKYNKEFLLYLAGFVDGDGSIIAQIKPNQSYKFKHQLSLTFQVTQKTQRRWFLDKLVDEIGVGYVRDRGSVSDYILSEI
KPLHNFLTQLQPFLKLKQKQANLVLKIIEQLPSAKESPDKFLEVCTWVDQIAALNDSKTRKTTSETVRAVLD

The query sequence (length=152) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3mxa:A 301 151 0.9408 0.4751 0.9470 1.77e-101 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
2 3mxa:A 301 148 0.9276 0.4684 0.9527 4.04e-98 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
3 1mow:A 248 145 0.9211 0.5645 0.9655 8.92e-101 1mow:D, 1mow:G, 1mow:J
4 5a72:B 158 142 0.3487 0.3354 0.3732 1.68e-24 5a72:A, 5a74:A, 5a74:B, 5a77:A, 5a77:B, 5a78:A, 5a78:B
5 2fld:A 161 129 0.3421 0.3230 0.4031 9.50e-23 3ko2:A, 3ko2:B, 3ko2:F, 3ko2:G, 1m5x:A, 1m5x:B, 3mis:A, 3mis:B
6 3fd2:A 338 129 0.3421 0.1538 0.4031 2.75e-22 2fld:B, 3mip:A, 3mip:B
7 3fd2:A 338 129 0.3421 0.1538 0.4031 2.75e-22 2fld:B, 3mip:A, 3mip:B
8 4lox:A 300 85 0.1579 0.0800 0.2824 2.31e-06 5e5o:A, 5e5s:A, 5e63:A, 5e67:A, 4z1z:A, 4z1z:B, 4z20:A, 4z20:D
9 4lox:A 300 61 0.1053 0.0533 0.2623 0.59 5e5o:A, 5e5s:A, 5e63:A, 5e67:A, 4z1z:A, 4z1z:B, 4z20:A, 4z20:D
10 6bci:A 292 84 0.1513 0.0788 0.2738 5.67e-06 6bce:A, 6bcf:D, 6bcf:A, 6bcf:G, 6bcf:J, 6bcg:D, 6bcg:A, 6bcg:G, 6bcg:J, 6bch:A, 6bch:D, 6bch:H, 6bch:L, 6bcn:A, 6bcn:C, 6bcn:G, 6bcn:J, 6bct:A, 3r7p:A
11 4yhx:A 294 59 0.1316 0.0680 0.3390 8.74e-06
12 4yhx:A 294 59 0.1118 0.0578 0.2881 0.028
13 4lq0:A 298 86 0.1447 0.0738 0.2558 2.51e-05
14 6bd0:A 300 58 0.1118 0.0567 0.2931 4.02e-04 6bda:A, 6bdb:A, 3qqy:A, 6uvw:A, 6uvw:D, 6uwg:A, 6uwh:A, 6uwj:A
15 6bd0:A 300 59 0.1053 0.0533 0.2712 0.025 6bda:A, 6bdb:A, 3qqy:A, 6uvw:A, 6uvw:D, 6uwg:A, 6uwh:A, 6uwj:A
16 3e54:A 159 111 0.1842 0.1761 0.2523 4.02e-04 3e54:B
17 4yit:D 277 93 0.1447 0.0794 0.2366 0.005 4yit:A
18 4yit:D 277 96 0.1382 0.0758 0.2188 1.3 4yit:A
19 4efj:B 291 54 0.1184 0.0619 0.3333 0.006 4efj:A, 4z1x:B, 4z1x:A
20 4efj:B 291 111 0.1645 0.0859 0.2252 0.68 4efj:A, 4z1x:B, 4z1x:A
21 7rcf:A 290 57 0.1118 0.0586 0.2982 0.006 7rcc:D, 7rcc:A, 7rcc:G, 7rcd:A, 7rce:A, 7rcg:A
22 5esp:A 292 55 0.0921 0.0479 0.2545 0.009 5esp:B
23 5esp:A 292 94 0.1513 0.0788 0.2447 0.025 5esp:B
24 5thg:A 294 59 0.1053 0.0544 0.2712 0.014 5thg:D
25 5thg:A 294 81 0.1250 0.0646 0.2346 0.060 5thg:D
26 5t8d:A 292 56 0.0987 0.0514 0.2679 0.036 5v0q:A
27 5t2h:A 296 55 0.1053 0.0541 0.2909 0.11
28 6uw0:B 295 95 0.1316 0.0678 0.2105 0.24 6uw0:A, 6uwk:A
29 5t2n:A 291 59 0.0987 0.0515 0.2542 0.25
30 5t2o:A 293 61 0.0921 0.0478 0.2295 1.8
31 5t2o:A 293 60 0.0921 0.0478 0.2333 8.0
32 2ex5:A 207 70 0.1250 0.0918 0.2714 4.5 2ex5:B
33 8ffv:B 644 102 0.2171 0.0512 0.3235 4.6 8agi:A, 8agi:B, 8agj:A, 8agj:B, 8agl:A, 8agl:B, 4awo:A, 4awo:B, 4awp:A, 4awp:B, 4awq:A, 4awq:B, 3b24:A, 3b24:B, 3b25:A, 3b26:A, 3b27:A, 3b28:A, 3b28:B, 4b7p:A, 6b99:A, 6b9a:A, 3bm9:A, 3bmy:A, 4bqg:A, 4bqj:A, 2bsm:A, 2bt0:A, 2bt0:B, 1byq:A, 2byh:A, 2byi:A, 2bz5:A, 2bz5:B, 2ccs:A, 2cct:A, 2ccu:A, 6ceo:A, 5cf0:A, 4cwf:A, 4cwn:A, 4cwo:A, 4cwp:A, 4cwq:A, 4cwr:A, 4cws:A, 4cwt:A, 6cyg:A, 6cyg:B, 6cyh:A, 3d0b:A, 7d1v:A, 7d22:A, 7d24:A, 7d25:A, 7d26:A, 7dmc:A, 4eeh:A, 4eft:A, 4efu:A, 4egh:A, 4egi:A, 4egk:A, 6ei5:A, 3eko:A, 3eko:B, 3ekr:A, 3ekr:B, 6el5:A, 6eln:A, 6elo:A, 6elp:A, 8eoa:B, 8eob:A, 8eob:B, 6ey8:A, 6ey9:A, 6eya:A, 6eyb:A, 6f1n:A, 4fcp:A, 4fcp:B, 4fcq:A, 4fcr:A, 6fcj:A, 8ffv:A, 8ffw:A, 8ffw:B, 5fnc:A, 5fnd:A, 5fnf:A, 3ft5:A, 3ft8:A, 2fwy:A, 2fwz:A, 8fx4:A, 5ggz:B, 5ggz:A, 5ggz:D, 5ggz:C, 6gp8:A, 6gpf:A, 6gph:A, 6gpo:A, 6gpp:A, 6gpr:A, 6gpt:A, 6gpy:A, 6gq6:A, 6gqr:A, 6gqs:A, 6gqu:A, 6gr1:A, 6gr3:A, 6gr5:A, 5h22:A, 2h55:A, 8h77:B, 3hek:A, 3hek:B, 3hhu:A, 3hhu:B, 6hhr:A, 3hyy:A, 3hyz:A, 3hyz:B, 4hy6:A, 3hz1:A, 3hz5:A, 3inw:A, 3inx:A, 5j20:A, 5j27:A, 5j2x:A, 5j64:A, 5j6l:A, 5j6m:A, 5j6n:A, 5j82:A, 5j86:A, 5j8m:A, 5j8m:B, 5j8u:A, 5j8u:B, 5j9x:A, 4jql:A, 3k97:A, 3k98:A, 3k98:B, 3k99:A, 3k99:B, 3k99:C, 3k99:D, 7krj:A, 7krj:B, 7l7i:A, 7l7i:B, 7l7j:A, 7l7j:B, 4l8z:A, 4l90:A, 4l91:A, 4l93:A, 4l93:B, 4l94:A, 5lny:A, 5lnz:A, 5lo0:A, 5lo1:A, 5lo5:A, 5lo6:A, 5lq9:A, 5lr1:A, 5lr7:A, 5lrl:A, 5lrz:A, 6lr9:A, 5ls1:A, 6lsz:A, 7lsz:A, 6lt8:A, 6lti:A, 6ltk:A, 7lt0:A, 4lwe:A, 4lwf:A, 4lwg:A, 4lwh:A, 4lwi:A, 5m4e:A, 5m4h:A, 3mnr:P, 6n8x:A, 4nh7:A, 4nh7:B, 4nh8:A, 5nyh:A, 5nyi:A, 3o0i:A, 4o04:A, 4o05:A, 4o07:A, 4o09:A, 4o0b:A, 5oci:A, 5od7:A, 5odx:A, 6olx:A, 1osf:A, 3ow6:A, 3owb:A, 3owd:A, 3qdd:A, 2qf6:A, 2qf6:B, 2qf6:C, 2qf6:D, 2qfo:A, 2qg0:A, 2qg0:B, 2qg2:A, 8qmo:A, 3qtf:A, 4r3m:A, 3r4m:A, 3r4n:A, 3r4n:B, 3r4o:A, 3r4o:B, 3r4p:A, 3r4p:B, 3r91:A, 3r92:A, 3rkz:A, 3rlp:A, 3rlp:B, 3rlq:A, 3rlq:B, 3rlr:A, 3rlr:B, 7ry1:A, 7ry1:B, 7ry1:C, 7s90:A, 7s95:A, 7s98:A, 7s99:A, 7s9f:A, 7s9g:A, 7s9h:A, 7s9i:A, 3t0z:A, 3t10:A, 3t1k:A, 3t1k:B, 3t2s:A, 3t2s:B, 5t21:A, 6tn4:AAA, 6tn5:AAA, 3tuh:A, 3tuh:B, 4u93:A, 6u98:A, 6u99:A, 6u9a:A, 6u9b:A, 7ur3:A, 2uwd:A, 1uy6:A, 1uy7:A, 1uy8:A, 1uy9:A, 1uyc:A, 1uyd:A, 1uye:A, 1uyf:A, 1uyg:A, 1uyh:A, 1uyi:A, 1uyk:A, 2vci:A, 2vcj:A, 3vha:A, 3vhc:A, 3vhd:A, 3vhd:B, 5vyy:A, 8w4v:A, 4w7t:A, 8w8k:A, 8w8k:B, 3wha:A, 3wha:B, 2wi1:A, 2wi2:A, 2wi2:B, 2wi3:A, 2wi4:A, 2wi5:A, 2wi6:A, 2wi7:A, 3wq9:A, 2xab:A, 2xab:B, 2xdk:A, 2xdl:A, 2xds:A, 2xdu:A, 2xdx:A, 2xhr:A, 2xht:A, 2xhx:A, 4xip:A, 4xiq:A, 4xir:A, 4xit:A, 2xjg:A, 2xjj:A, 2xjj:B, 2xjx:A, 2xk2:A, 5xqd:A, 5xqe:A, 5xr5:A, 5xr9:A, 5xrb:A, 5xrd:A, 5xre:A, 7y04:A, 7y04:B, 1yc1:A, 1yc3:A, 1yc4:A, 1yet:A, 2ye2:A, 2ye3:A, 2ye4:A, 2ye5:A, 2ye6:A, 2ye7:A, 2ye8:A, 2ye9:A, 2yea:A, 2yeb:A, 2yec:A, 2yed:A, 2yee:A, 2yef:A, 2yeg:B, 2yeh:A, 2yei:A, 2yej:A, 2yi0:A, 2yi5:A, 2yi6:A, 2yi7:A, 2yjw:A, 2yjx:A, 2yk2:A, 2yk9:A, 2ykb:A, 2ykc:A, 2yke:A, 2yki:A, 2ykj:A, 4ykq:A, 4ykr:A, 4ykt:A, 4yku:A, 4ykw:A, 4ykw:B, 4ykx:A, 4yky:A, 4ykz:A, 5zr3:A, 5zr3:C, 5zr3:E, 5zr3:G, 7zr0:B, 7zr5:B, 7zr6:B, 7zub:A
34 4cdn:A 463 47 0.0987 0.0324 0.3191 5.9 4cdm:A, 7f8t:A, 8kcm:A, 5o86:A, 5o8d:A, 5o8e:A, 8oet:A, 8oy3:A, 8oy4:A, 8oy5:A, 8oy6:A, 8oy7:A, 8oy8:A, 8oy9:A, 8oya:A, 8oyb:A, 8oyc:A, 7viw:A, 7vix:A, 7viy:A, 7viz:A, 7vj0:A, 7vj1:A, 7vj2:A, 7vj3:A, 7vj4:A, 7vj5:A, 7vj6:A, 7vj7:A, 7vj8:A, 7vj9:A, 7vja:A, 7vjb:A, 7vjc:A, 7vje:A, 7vjg:A, 7vjh:A, 7vji:A, 7vjj:A, 7vjk:A, 2xry:A, 2xrz:A, 7yc7:A, 7ycm:A, 7ycp:A, 7ycr:A, 7yd6:A, 7yd7:A, 7yd8:A, 7ydz:A, 7ye0:A, 7yeb:A, 7yec:A, 7yee:A, 7yei:A, 7yej:A, 7yek:A, 7yel:A, 7yem:A, 5zcw:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218