Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NSVENLFDTYKLNDTITLKNRILMAPLTRCMADANLVPTDDMVAYYARRAEAGLIISEATIIRPDAQGYPNTPGIFTQAQ
IAGWRKVTDAVHANGGKIFVQLWHTGRVAHPHFFGGGDVLAPSAQKIEGSVPRMRELTYVTPKAVTVEDIQGLVRDYAKA
AENVIEAGFDGVEIHGANGYLIDQFLHHDSNRRTDEYGGTPVNMSRFALEVVDAIIARIGHDRTGLRISPGAYFNMASDS
RDRVVFDYLLPELEKRDLAFVHIGIFDDSIEFDYLGGTASSYVRAHYGKTLVGVGSYSAETASKAIAEDKFDLIAIGRPF
IANPDYVAKVRNSEELVAYSDEMLASLI

The query sequence (length=348) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4b5n:A 354 348 1.0000 0.9831 1.0000 0.0 5k0r:A, 5k1k:A, 5k1m:A, 5k1q:A, 5k1u:A, 5k1w:A
2 4ab4:A 349 328 0.4339 0.4327 0.4604 2.45e-90 4ab4:B, 4aeo:A, 4aeo:B
3 6s32:D 352 342 0.4339 0.4290 0.4415 1.94e-88 6s32:A, 6s32:B, 6s32:C
4 6uff:A 362 326 0.4310 0.4144 0.4601 4.74e-88 6uff:B, 6uff:C, 6uff:D, 6uff:E, 6uff:F, 6uff:G, 6uff:H
5 8e5i:A 357 336 0.4195 0.4090 0.4345 8.63e-87
6 3gka:B 351 335 0.4167 0.4131 0.4328 2.21e-83 3gka:A
7 7bn6:B 381 344 0.4080 0.3727 0.4128 4.42e-83 7bn6:A, 7bo0:A, 7bo0:B, 6s0g:B, 6s23:A, 6s23:B, 6s31:A
8 7tnb:AAA 353 333 0.3793 0.3739 0.3964 8.00e-81
9 1gvr:A 364 349 0.4080 0.3901 0.4069 8.48e-81 2aba:A, 2abb:A, 3f03:K, 6gi7:A, 6gi8:A, 6gi9:A, 6gia:A, 1gvo:A, 1gvq:A, 1gvs:A, 1h50:A, 1h51:A, 1h60:A, 1h61:A, 1h62:A, 1h63:A, 3kft:A, 3kft:B, 5lgx:A, 5lgz:A, 3p62:A, 3p67:A, 3p74:A, 3p7y:A, 3p80:A, 3p81:A, 3p82:A, 3p84:A, 3p8i:A, 3p8j:A, 1vyp:X, 1vyr:A, 1vys:X
10 8bpp:A 362 348 0.4224 0.4061 0.4224 1.28e-80 8bpp:B, 8bpp:C, 8bpq:A, 8bpq:B, 8bpq:C
11 2gou:A 365 351 0.4282 0.4082 0.4245 1.98e-80 4aws:A, 4awt:A, 4awu:A, 2gq8:A, 2gq9:A, 2gqa:A
12 4jic:A 370 361 0.4195 0.3946 0.4044 5.04e-79 4jic:B, 4jic:C, 4jip:A, 4jiq:A, 5n6g:A
13 5dy2:A 378 357 0.4023 0.3704 0.3922 4.07e-76 5dxx:A, 5dxy:A, 5dy3:A
14 1gwj:A 374 348 0.4224 0.3930 0.4224 8.40e-76 3gx9:A, 2r14:A
15 7tmb:A 362 347 0.3937 0.3785 0.3948 1.41e-74 7tmb:B, 7tmb:C, 7tmb:D, 7tmb:E, 7tmb:F
16 1icp:A 358 330 0.3707 0.3603 0.3909 4.64e-74 3hgr:A, 3hgr:B, 1icp:B, 1icq:A, 1icq:B, 1ics:A, 1ics:B
17 8fw1:A 362 327 0.4080 0.3923 0.4343 6.89e-74 8fw1:B, 8fw1:C, 6myw:A, 6myw:B, 6myw:C, 6myw:D, 6o08:A, 8vcn:A
18 9em0:A 376 356 0.3851 0.3564 0.3764 3.87e-72 8aua:A, 8aua:B, 8aub:A, 8aub:B, 8aue:A, 8aue:B, 8auj:A, 8auj:B, 8aul:A, 8aul:B, 8aum:A, 8aum:B, 8aun:A, 8aun:B, 8auo:B, 8auo:A, 8auq:A, 8auq:B, 9em0:B, 9em2:B, 9em2:A, 9em3:A, 9em4:B, 9em4:A, 9em5:A, 9em6:B, 9em6:A, 3hgo:A, 3hgo:B, 3hgs:A, 3hgs:B, 2hs6:A, 2hs6:B, 2hs8:A, 2hs8:B, 2hsa:B, 2hsa:A, 8qmx:A, 8qmx:B, 8qn1:A, 8qn1:B, 8qn1:C, 8qn1:D, 8qn3:A, 8qn3:B, 8qn9:B, 8s8v:A, 8s8v:B, 8s8y:B, 8s8y:A
19 2q3r:A 351 340 0.3707 0.3675 0.3794 4.39e-72 1vji:A
20 2q3o:B 367 350 0.3678 0.3488 0.3657 3.84e-71 2g5w:A, 2g5w:B, 2q3o:A, 1q45:A, 1q45:B
21 4a3u:A 355 326 0.3937 0.3859 0.4202 1.56e-70 4a3u:B
22 4qnw:A 369 349 0.3736 0.3523 0.3725 4.09e-64
23 3aty:A 379 342 0.3736 0.3430 0.3801 6.20e-63 3aty:B, 3atz:A, 3atz:B, 3atz:C, 3atz:D, 4e2b:A, 4e2d:A, 4e2d:B, 4e2d:C, 4e2d:D
24 5v4v:A 397 363 0.3994 0.3501 0.3829 2.89e-61 5v4p:A, 5v4p:B, 5v4v:B
25 6agz:A 386 353 0.3678 0.3316 0.3626 1.88e-60 6agz:B
26 4ot7:A 308 327 0.3621 0.4091 0.3853 2.33e-58
27 1bwk:A 399 358 0.3563 0.3108 0.3464 1.77e-54 7bn7:A, 7bn7:B, 7bn7:C, 7bn7:D, 1bwl:A, 4gbu:A, 4ge8:A, 4gwe:A, 4gxm:A, 4h4i:A, 4h6k:A, 1k02:A, 1k03:A, 4k7v:A, 4k7y:A, 4k8e:A, 4k8h:A, 1oya:A, 1oyb:A, 1oyc:A, 3rnd:A, 3tx9:A, 3txz:A, 4yil:A, 4ync:A
28 4tmc:A 399 357 0.3678 0.3208 0.3585 2.19e-54 4tmb:A, 4tmb:B, 4tmb:C, 4tmb:D, 4tmc:B, 4tmc:C, 4tmc:D
29 4df2:A 404 348 0.3477 0.2995 0.3477 5.96e-53 4m5p:A, 4qai:A, 4qai:B, 4qai:C, 4qai:D, 4qai:E, 4qai:F, 3tjl:A, 3upw:A
30 4rnu:C 385 274 0.3075 0.2779 0.3905 5.39e-52 4rnu:A, 4rnu:B, 4rnu:D, 4rnv:A, 4rnv:B, 4rnv:C, 4rnv:D, 4rnw:A, 4rnw:B
31 4rnu:C 385 32 0.0402 0.0364 0.4375 9.4 4rnu:A, 4rnu:B, 4rnu:D, 4rnv:A, 4rnv:B, 4rnv:C, 4rnv:D, 4rnw:A, 4rnw:B
32 1z41:A 337 349 0.3247 0.3353 0.3238 5.58e-39 1z41:B, 1z42:A, 1z42:B, 1z44:A, 1z44:B, 1z48:A, 1z48:B
33 3kru:A 335 333 0.2960 0.3075 0.3093 1.34e-38 3kru:B, 3kru:C, 3kru:D, 3krz:A, 3krz:B, 3krz:C, 3krz:D
34 8e5h:A 368 346 0.3132 0.2962 0.3150 8.85e-38
35 3gr7:A 340 327 0.3132 0.3206 0.3333 1.39e-36 3gr7:B, 3gr8:A, 3gr8:B
36 8auh:A 365 344 0.2960 0.2822 0.2994 3.10e-34 8a8i:B, 8a8i:D, 8au8:A, 8au8:B, 8au9:B, 8au9:A, 8auf:A, 8auf:B, 8aug:A, 8aug:B, 8auh:B, 8aui:A, 8aui:B, 5cpl:A, 5cpl:B, 5cpm:A, 5cpm:B, 5cpn:A, 5cpn:B, 5cpo:A, 5cpo:B, 2h8x:A, 2h8z:A, 2h90:A, 3l5l:A, 3l5m:A, 3l65:A, 3l66:A, 3l67:A, 3l68:A, 5lni:A, 5lnj:A, 3n14:A, 3n19:B, 3n19:D, 5n6q:A, 5n6q:B, 4uth:A, 4uti:A, 4utj:A, 4utk:A, 4utl:A, 4utm:A
37 4rnx:A 390 212 0.2356 0.2103 0.3868 3.64e-34 4rnx:B
38 4rnx:A 390 111 0.1178 0.1051 0.3694 3.98e-15 4rnx:B
39 1ps9:A 671 346 0.2960 0.1535 0.2977 9.85e-31
40 8pun:A 356 348 0.2989 0.2921 0.2989 2.75e-30 8pun:B, 8pun:C, 8pun:D
41 5ocs:A 369 347 0.3017 0.2846 0.3026 7.35e-30 5ocs:C
42 8j59:B 388 356 0.2989 0.2680 0.2921 1.36e-27 8j59:A
43 7qfx:C 413 349 0.2845 0.2397 0.2837 4.94e-27 7qfx:B, 7qfx:E, 7qfx:G
44 7fev:A 443 214 0.1925 0.1512 0.3131 7.28e-24
45 6qkg:B 664 352 0.2701 0.1416 0.2670 1.65e-23 6qkg:A, 6qkr:A, 6qkr:B, 6qkx:A
46 7blf:A 406 227 0.1954 0.1675 0.2996 5.42e-23 7blf:B
47 6de6:A 689 347 0.2960 0.1495 0.2968 1.79e-20
48 7o0t:A 354 225 0.2126 0.2090 0.3289 9.98e-20 7o0t:B, 7o0t:C, 7o0t:D
49 6de6:B 652 336 0.2874 0.1534 0.2976 1.80e-19
50 8uat:F 351 215 0.1925 0.1909 0.3116 2.86e-19 3hf3:A, 3hf3:B, 3hf3:C, 3hf3:D, 3hgj:A, 3hgj:B, 3hgj:C, 3hgj:D, 5nux:A, 5nux:B, 5nux:C, 5nux:D, 5ogt:A, 5ogt:B, 5ogt:C, 5ogt:D, 8uaj:A, 8uaj:B, 8uaj:C, 8uaj:D, 8uat:B, 8uat:C, 8uat:D, 8uat:E, 8uat:G, 8uat:H, 8uat:A
51 1djn:A 729 338 0.2644 0.1262 0.2722 9.90e-17 1djn:B, 1djq:A, 1djq:B, 1o94:A, 1o94:B, 1o95:A, 1o95:B, 2tmd:A, 2tmd:B
52 3k30:A 684 268 0.2241 0.1140 0.2910 6.80e-15 3k30:B
53 6l6j:A 669 337 0.2443 0.1271 0.2522 1.57e-11
54 3i6v:A 218 104 0.0862 0.1376 0.2885 1.3
55 7ood:c 210 52 0.0517 0.0857 0.3462 1.5 7p6z:c, 7pah:c, 7pai:c, 7paj:c, 7pak:c, 7pal:c, 7pam:c, 7pan:c, 7pao:c, 7paq:c, 7par:c, 7pas:c, 7pat:c, 7pau:c, 7ph9:c, 7pha:c, 7phb:c, 7phc:c, 7pi8:c, 7pi9:c, 7pia:c, 7pib:c, 7pic:c, 7pio:c, 7pip:c, 7piq:c, 7pir:c, 7pis:c, 7pit:c
56 6k8w:A 545 47 0.0489 0.0312 0.3617 1.9 6k8w:B
57 6dzi:E 209 91 0.0718 0.1196 0.2747 3.1 6dzp:E, 8fr8:M, 8kab:E, 5o60:E, 5o61:E, 7s0s:F, 8v9j:E, 8v9k:E, 8v9l:E, 8whx:G, 8why:G, 8wi7:G, 8wi8:G, 8wib:G, 8wic:G, 7xam:E, 5xym:E, 8xz3:E, 7y41:E, 5zeb:E, 5zep:E, 5zet:E
58 5vhe:A 871 91 0.0690 0.0276 0.2637 4.1 6up3:A, 6up4:A, 5vhc:D, 5vhd:D
59 3c5q:A 394 134 0.0977 0.0863 0.2537 4.7 2qgh:A
60 5ah2:C 382 46 0.0517 0.0471 0.3913 6.1 5ah2:A, 5ah2:B, 5ah2:D, 5ah4:A, 5ah4:B
61 5ot1:A 572 250 0.1580 0.0962 0.2200 6.9
62 3gnr:A 478 36 0.0431 0.0314 0.4167 7.5 3wba:A, 3wbe:A
63 2e6l:A 186 51 0.0517 0.0968 0.3529 7.6
64 2c4w:A 168 102 0.0690 0.1429 0.2353 8.4 4b6r:A, 4b6r:C, 4b6r:B, 4b6s:A, 4b6s:C, 4b6s:B, 2c57:A, 2c57:B, 2c57:C, 2c57:D, 2c57:E, 2c57:F, 2c57:G, 2c57:H, 2c57:I, 2c57:J, 2c57:K, 2c57:L, 1j2y:A, 2wks:A, 2wks:B, 2wks:C, 2wks:F, 2wks:D, 2wks:E, 2xb9:A, 2xb9:B, 2xd9:A, 2xd9:B, 2xd9:C, 2xda:A
65 5iqr:8 615 120 0.0690 0.0390 0.2000 9.4
66 6if8:B 228 28 0.0374 0.0570 0.4643 9.9 6if8:A, 6if8:C, 6if8:D, 6k2q:A, 6k2q:B, 6k2q:C, 6k2q:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218