BioLiP

>protein
NSLTPSEIENLRNALAAVQADKTDAGYQKIASFHGMPLSCQYPDGTAFACCQHGMVTFPHWHRLYMKQMEDALKAKGAKI
GIPYWDWTTAFHSLPILVTEPKNNPFHHGYIDVADTKTTRDPRPQSFFYRQIAFALEQRDFCDFEIQFEMGHNAIHSWVG
GPSPYGMSTLHYTSYDPLFYVHHSNTDRIWAIWQALQKYRGLPYNSANCEINKLKKPMMPFSSEDNPNEVTKAHSTGYKS
FDYQQLNYEYDNLNFHGMTIPQLEVHLKKIQEKDRVFAGFLLRAIGQSADVNFDVTFGGTFCVLGGDYEMPWAFDRLFLY
DISKSLVHLRLDAHDDFDIKVTIMGIDGKSLPPNLLPSPTILFKPG

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4yd9:L	366	366	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4yd9:C, 4yd9:a, 4yd9:F, 4yd9:R, 4yd9:I, 4yd9:O, 4yd9:U, 4yd9:X, 4yd9:d
2	1js8:A	382	375	0.7678	0.7356	0.7493	0.0	1js8:B
3	4bed:B	1734	383	0.5874	0.1240	0.5614	1.72e-149	4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
4	4bed:B	1734	390	0.4836	0.1021	0.4538	7.80e-105	4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
5	4bed:B	1734	399	0.4699	0.0992	0.4311	4.79e-104	4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
6	4bed:B	1734	386	0.4180	0.0882	0.3964	1.18e-89	4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
7	8tnv:A	393	385	0.5437	0.5064	0.5169	6.15e-146	8tnv:B
8	4bed:A	1664	396	0.4891	0.1076	0.4520	6.07e-112	4bed:C
9	4bed:A	1664	392	0.4781	0.1052	0.4464	1.53e-107	4bed:C
10	4bed:A	1664	394	0.4699	0.1034	0.4365	1.00e-99	4bed:C
11	4bed:A	1664	398	0.4508	0.0992	0.4146	4.84e-92	4bed:C
12	1lnl:A	408	396	0.4699	0.4216	0.4343	7.71e-111	1lnl:B, 1lnl:C
13	4yd9:B	825	398	0.4617	0.2048	0.4246	3.57e-110	4yd9:E, 4yd9:H, 4yd9:K, 4yd9:N, 4yd9:Q, 4yd9:T, 4yd9:W, 4yd9:Z, 4yd9:c
14	4yd9:B	825	398	0.4781	0.2121	0.4397	3.58e-107	4yd9:E, 4yd9:H, 4yd9:K, 4yd9:N, 4yd9:Q, 4yd9:T, 4yd9:W, 4yd9:Z, 4yd9:c
15	4yd9:A	1656	388	0.4781	0.1057	0.4510	3.97e-108	4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
16	4yd9:A	1656	398	0.4836	0.1069	0.4447	2.69e-105	4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
17	4yd9:A	1656	399	0.4481	0.0990	0.4110	1.76e-96	4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
18	4yd9:A	1656	397	0.4454	0.0984	0.4106	5.07e-96	4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
19	5m6b:C	514	240	0.1831	0.1304	0.2792	3.45e-13
20	8hpi:A	289	272	0.1803	0.2284	0.2426	6.17e-11	4d87:A, 4d87:B, 6ei4:A, 6ei4:B, 4hd4:A, 4hd4:B, 4hd6:A, 4hd6:B, 4hd7:A, 4hd7:B, 8hpi:B, 5i38:A, 5i38:B, 5i3a:A, 5i3a:B, 5i3b:A, 5i3b:B, 4j6t:A, 4j6t:B, 4j6v:A, 4j6v:B, 3nm8:A, 3nm8:B, 3npy:A, 3npy:B, 3nq0:A, 3nq0:B, 3nq1:A, 3nq1:B, 3nq5:A, 3nq5:B, 3ntm:A, 3ntm:B, 5oae:A, 5oae:B, 4p6r:A, 4p6r:B, 4p6s:A, 4p6s:B, 4p6t:A, 4p6t:B, 6qxd:A, 6qxd:B
21	4z11:A	513	49	0.0574	0.0409	0.4286	9.13e-09	4z0y:A, 4z0y:B, 4z0y:D, 4z0y:C, 4z0z:A, 4z0z:B, 4z0z:C, 4z0z:D, 4z10:A, 4z10:C, 4z10:B, 4z10:D, 4z10:E, 4z10:F, 4z11:B, 4z11:C, 4z11:D, 4z12:A, 4z12:B, 4z13:A, 4z13:B, 4z14:D, 4z14:B, 4z14:H, 4z14:F, 4z14:C, 4z14:E, 4z14:G, 4z14:A
22	5zrd:A	534	109	0.0820	0.0562	0.2752	8.41e-08	5zrd:B, 5zrd:C, 5zrd:D
23	5zrd:A	534	191	0.1311	0.0899	0.2513	0.073	5zrd:B, 5zrd:C, 5zrd:D
24	4oua:B	557	264	0.1831	0.1203	0.2538	1.02e-07	5m6b:B, 5m6b:A, 5m6b:D, 4oua:A
25	5zre:B	474	55	0.0574	0.0443	0.3818	1.22e-07	5zre:A, 5zre:C
26	5zre:B	474	175	0.1311	0.1013	0.2743	3.80e-04	5zre:A, 5zre:C
27	6jua:A	533	119	0.1011	0.0694	0.3109	2.13e-07	6jub:A, 6jud:A
28	6jua:A	533	98	0.0820	0.0563	0.3061	0.008	6jub:A, 6jud:A
29	6ju4:B	560	119	0.1011	0.0661	0.3109	2.49e-07	6ju4:A, 6ju5:A, 6ju5:B, 6jua:B, 6jub:B, 6juc:A, 6juc:B, 6jud:B, 3w6w:B
30	6ju4:B	560	106	0.0820	0.0536	0.2830	0.027	6ju4:A, 6ju5:A, 6ju5:B, 6jua:B, 6jub:B, 6juc:A, 6juc:B, 6jud:B, 3w6w:B
31	3w6w:A	583	119	0.1011	0.0635	0.3109	2.49e-07	6ju7:A, 6ju7:B, 6ju8:A, 6ju8:B, 6ju9:A, 6ju9:B
32	3w6w:A	583	107	0.0820	0.0515	0.2804	0.037	6ju7:A, 6ju7:B, 6ju8:A, 6ju8:B, 6ju9:A, 6ju9:B
33	6j2u:B	273	258	0.1612	0.2161	0.2287	4.16e-07
34	5ce9:A	339	52	0.0601	0.0649	0.4231	7.20e-07	5ce9:B
35	6z1s:A	381	209	0.1475	0.1417	0.2584	1.30e-06
36	6els:A	459	231	0.1366	0.1089	0.2165	1.77e-06	6elt:A, 6elv:A
37	2y9w:A	391	272	0.1749	0.1637	0.2353	2.05e-06	2y9w:B, 2y9x:A, 2y9x:B, 2y9x:C, 2y9x:D
38	1bug:A	336	50	0.0601	0.0655	0.4400	8.27e-06	1bug:B
39	5z0f:A	279	72	0.0601	0.0789	0.3056	1.36e-05	2ahk:A, 2ahl:A, 3aws:A, 3awt:A, 3awu:A, 3awv:A, 3aww:A, 3awx:A, 3awy:A, 3awz:A, 3ax0:A, 7cit:A, 7ciy:A, 1wx2:A, 1wx4:A, 5z0d:A, 5z0e:A, 5z0g:A, 5z0h:A, 5z0i:A, 5z0j:A, 5z0k:A, 5z0l:A, 5z0m:A, 2zmx:A, 2zmy:A, 2zmz:A, 2zwd:A, 2zwe:A, 2zwf:A, 2zwg:A
40	8bbq:A	324	52	0.0601	0.0679	0.4231	4.40e-05	8bbq:B, 8bbr:A, 8bbr:B
41	8bbq:A	324	40	0.0410	0.0463	0.3750	0.20	8bbq:B, 8bbr:A, 8bbr:B
42	6hqi:A	444	60	0.0628	0.0518	0.3833	1.25e-04
43	4j3r:A	372	112	0.0765	0.0753	0.2500	0.025	6gsg:A, 4j3p:A, 4j3q:A, 4j3q:B, 5or3:A, 5or3:B, 5or3:C, 5or3:D, 5or4:A, 5or4:B, 5or4:C, 5or4:D
44	8ibk:A	546	78	0.0628	0.0421	0.2949	0.050	8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
45	6x67:C	478	37	0.0355	0.0272	0.3514	2.3	5lme:A, 6x67:D, 6x68:C, 6x68:D
46	7nfe:B	475	66	0.0546	0.0421	0.3030	8.2	8bot:B
47	6jam:A	406	82	0.0574	0.0517	0.2561	8.3	6j9w:A, 6j9y:A, 6jad:A, 6jag:A, 6jah:A, 6jai:A, 6jan:A, 6jao:A, 6jap:A, 6jaq:A, 6jar:A, 6jaz:A, 6jb0:A, 6jb4:A, 6jba:A, 6jbb:A, 6jbe:A
48	8bqs:CN	62	20	0.0246	0.1452	0.4500	9.6	8gym:2n, 8gym:2N

[Back]