BioLiP

>protein
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIG
ANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTE
PTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSN
MGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIP
TGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAF
QIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGT
VALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST

The query sequence (length=533) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4gwm:A	561	533	0.9775	0.9287	0.9775	0.0	7aq1:A, 7aq1:B, 7auw:A, 7auw:C, 4gwm:B, 4gwn:A
2	7uac:H	546	539	0.4690	0.4579	0.4638	3.14e-165	7uab:E, 7uab:H, 7uae:A, 7uaf:B, 7uaf:A, 7uaf:C, 7uaf:D, 7uai:E, 7uai:B, 7uai:C, 7uai:D
3	7uab:A	481	527	0.3921	0.4345	0.3966	5.07e-113	7uab:D
4	3lqb:A	198	182	0.1482	0.3990	0.4341	1.09e-41
5	8a28:A	382	352	0.2120	0.2958	0.3210	2.41e-41	8a28:B
6	3vtg:A	200	183	0.1445	0.3850	0.4208	9.73e-39
7	6bsl:A	201	192	0.1295	0.3433	0.3594	2.59e-34	6bsl:B, 6bsm:A, 6btn:A, 6btn:B, 6bto:A, 6bto:B, 6btp:A, 6btp:B, 6btq:A, 6btq:B, 3edg:A, 3edh:A
8	3edi:A	195	191	0.1295	0.3538	0.3613	7.39e-28
9	3lq0:A	235	204	0.1370	0.3106	0.3578	6.79e-26	1ast:A, 6ht9:A, 6ht9:C, 1iaa:A, 1iab:A, 1iac:A, 1iae:A, 1qji:A, 1qjj:A, 6saz:A, 6saz:C
10	5yc1:F	164	167	0.0882	0.2866	0.2814	2.95e-10	5yc1:D, 5yc1:A
11	5l73:A	174	131	0.0732	0.2241	0.2977	1.06e-07	5l73:B
12	1ca9:A	191	85	0.0563	0.1571	0.3529	5.28e-06	1ca9:E, 1ca9:B, 1czy:A, 1czy:C, 1czz:A, 1czz:B, 1d00:A, 1d00:B, 1d00:F, 1d00:C, 1d00:D, 1d00:E, 1d00:G, 1d00:H, 1d01:D, 1d01:E, 1d01:F, 1d0a:A, 1d0a:B, 1d0a:C, 1d0a:D, 1d0a:E, 1d0a:F, 1d0j:A, 1d0j:C, 1d0j:D, 1d0j:E, 1d0j:F, 1qsc:A, 1qsc:B, 1qsc:C, 8t5q:A, 8t5q:B, 8t5q:D
13	6myd:A	155	162	0.0844	0.2903	0.2778	1.04e-05	6myd:C
14	1fll:A	205	166	0.0807	0.2098	0.2590	3.80e-05	1fll:B, 4ghu:A, 2gkw:A, 1kzz:A, 1l0a:A, 1rf3:A, 8t5p:A, 8t5p:B, 8t5p:D, 1zms:A
15	4z8m:B	158	177	0.0844	0.2848	0.2542	2.03e-04	6a33:A, 1lb5:A, 1lb6:A, 4z8m:A, 5zuj:A
16	5gwd:A	239	127	0.0657	0.1464	0.2756	2.6	5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
17	4ccl:B	372	67	0.0413	0.0591	0.3284	4.1	4ccl:A, 4lit:A, 4liv:A, 4nub:A
18	4blt:A	305	46	0.0263	0.0459	0.3043	4.2	4blr:A, 4blr:B, 4blr:C, 4bls:A, 4bls:B, 4bls:C, 4blt:B, 4blt:C, 2vhc:A, 2vhc:C, 2vhc:B, 2vhj:A, 2vhj:B, 2vhj:C, 2vhq:A, 2vhq:B, 2vhq:C, 2vht:A, 2vht:B, 2vht:C, 2vhu:A, 2vhu:B, 2vhu:C, 1w44:A, 1w44:B, 1w44:C, 1w46:A, 1w46:B, 1w46:C, 1w47:A, 1w47:B, 1w47:C, 1w48:A, 1w48:B, 1w48:C, 1w49:A, 1w49:B, 1w49:C, 1w4a:A, 1w4a:B, 1w4a:C, 1w4b:A, 1w4b:B, 1w4b:C
19	7ssj:A	219	78	0.0432	0.1050	0.2949	7.6	3ehf:A, 3ehf:D, 3ehg:A, 3ehh:A, 3ehh:B, 3ehj:A, 3ehj:B, 3gie:A, 3gie:B, 3gif:A, 3gig:A, 3gig:B, 5iuj:A, 5iuj:B, 5iuj:D, 5iuj:E, 5iuk:A, 5iuk:B, 5iuk:D, 5iuk:E, 5iul:A, 5iul:B, 5iul:D, 5iul:E, 5ium:A, 5ium:B, 7ssi:A, 7ssi:B, 7ssi:D, 7ssi:E, 7ssj:C, 7ssj:D
20	8s1u:H	518	37	0.0281	0.0290	0.4054	9.1

[Back]