BioLiP

>protein
NRIKTINDHINPRDLSLTEIAKHNTEEDCWVIIKDIVYDLTKFLPDHPGGKKAIILFAGKDATEEFDMLHPPNVLKKYLT
PEVVLGPVKK

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4b8n:B	90	90	1.0000	1.0000	1.0000	2.03e-62	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
2	1kbi:A	504	80	0.4778	0.0853	0.5375	4.99e-25	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
3	2i89:A	90	73	0.3556	0.3556	0.4384	1.45e-16	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
4	1awp:A	86	71	0.3667	0.3837	0.4648	1.91e-16	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
5	2ibj:A	86	74	0.3667	0.3837	0.4459	1.38e-15
6	3ozz:B	82	72	0.3556	0.3902	0.4444	6.06e-15
7	3lf5:A	87	79	0.2889	0.2989	0.3291	6.75e-14	3lf5:B
8	1hko:A	104	74	0.3444	0.2981	0.4189	2.76e-13	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
9	2i96:A	108	52	0.3000	0.2500	0.5192	3.72e-13	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
10	1aw3:A	94	74	0.3444	0.3298	0.4189	7.84e-13	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
11	3ner:B	91	71	0.3111	0.3077	0.3944	8.78e-13	3ner:A
12	1cxy:A	81	53	0.2111	0.2346	0.3585	2.97e-12
13	1x3x:A	82	75	0.3556	0.3902	0.4267	2.08e-11	1x3x:B
14	8tgb:A	108	69	0.2444	0.2037	0.3188	1.60e-10	8tgb:B
15	7bwh:A	88	74	0.2333	0.2386	0.2838	4.67e-08
16	1mj4:A	79	42	0.1778	0.2025	0.3810	1.73e-04
17	1sox:A	463	63	0.2778	0.0540	0.3968	4.23e-04	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
18	3c4w:B	519	51	0.1667	0.0289	0.2941	0.97	3c4w:A, 3c4x:A, 3c4x:B, 3c4z:A, 3c50:A, 3c50:B, 3c51:A, 4l9i:A, 4l9i:B, 7mt8:G, 7mt9:G, 7mta:G, 7mtb:G, 4pni:A, 3qc9:A, 3qc9:B, 3qc9:C, 3qc9:D, 3t8o:A, 4wbo:A, 4wbo:B, 4wbo:C, 4wbo:D
19	7tuv:A	672	34	0.1000	0.0134	0.2647	4.0
20	4xru:C	424	27	0.1111	0.0236	0.3704	4.4	4xru:F
21	2a9r:A	118	52	0.1556	0.1186	0.2692	4.5	2a9o:A, 2a9p:A, 6eb7:A, 6ebr:A, 1nxp:A, 1nxt:A
22	8yif:A	537	35	0.1556	0.0261	0.4000	4.5	8yie:A, 8yie:B
23	7d7q:B	310	43	0.1667	0.0484	0.3488	7.1	7cj3:A, 7cj3:B, 7d7q:A
24	2old:A	217	47	0.1333	0.0553	0.2553	10.0	6b5p:L, 6b5r:L, 6b5t:L, 8d36:L, 8fo3:G, 8fo3:E, 8fo4:A, 8fo4:C, 7l2c:D, 2old:B, 2omb:A, 2omb:B, 2omb:C, 2omb:D, 2omn:A, 2omn:B, 6pbv:A, 6pbv:C, 6pbw:C, 7re7:L, 7yi6:B, 7yi6:E

[Back]