Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NRDIAQVVTENNKNYLVLYASQTGTAEDYAKKFSKELVAKFNLNVMCADVENYDFESLNDVPVIVSIFISTYGEGDFPDG
AVNFEDFICNAEAGALSNLRYNMFGLGNSTYEFFNGAAKKAEKHLSAAGAIRLGKLGEADDGAGTTDEDYMAWKDSILEV
LKDELHLDEQEAKFTSQFQYTVLNEITDSMSLGEPSAHYLPSHQLNRNADGIQLGPFDLSQPYIAPIVKSRELFSSNDRN
CIHSEFDLSGSNIKYSTGDHLAVWPSNPLEKVEQFLSIFNLDPETIFDLKPLDPTVKVPFPTPTTIGAAIKHYLEITGPV
SRQLFSSLIQFAPNADVKEKLTLLSKDKDQFAVEITSKYFNIADALKYLSDGAKWDTVPMQFLVESVPQMTPRYYSISSS
SLSEKQTVHVTSIVENFPNPELPDAPPVVGVTTNLLRNIQLAQNNVNIAETNLPVHYDLNGPRKLFANYKLPVHVRRSNF
RLPSNPSTPVIMIGPGTGVAPFRGFIRERVAFLESQKKGGNNVSLGKHILFYGSRNTDDFLYQDEWPEYAKKLDGSFEMV
VAHSRLPNTKKVYVQDKLKDYEDQVFEMINNGAFIYVCGDAKGMAKGVSTALVGILSRGKSITTDEATELIKMLKTSGRY
QEDVW

The query sequence (length=645) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2bf4:A 645 645 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2bf4:B, 2bn4:A, 2bn4:B, 2bpo:A, 2bpo:B
2 6t1t:A 635 655 0.5194 0.5276 0.5115 0.0 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
3 3fjo:A 603 654 0.5070 0.5423 0.5000 0.0 3qfs:A, 3qft:A
4 6j79:A 816 654 0.3395 0.2684 0.3349 6.49e-100 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
5 5gxu:A 552 649 0.3116 0.3641 0.3097 2.06e-86 5gxu:B
6 7suz:A 389 434 0.2186 0.3625 0.3249 2.24e-67 7sux:A, 7sv0:A
7 6efv:A 530 640 0.2853 0.3472 0.2875 8.74e-62 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
8 1tll:A 630 678 0.2775 0.2841 0.2640 4.38e-50 1f20:A, 1tll:B
9 8dme:A 1034 649 0.2698 0.1683 0.2681 7.50e-48 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
10 2qtl:A 448 439 0.2031 0.2924 0.2984 3.68e-33 2qtz:A
11 5h59:A 311 137 0.0806 0.1672 0.3796 3.41e-18 5h5j:A, 5h5j:C, 1jb9:A, 3lo8:A, 3lvb:A, 5vw2:A, 5vw3:A, 5vw4:A, 5vw5:A, 5vw6:A, 5vw7:A, 5vw8:A, 5vw9:A, 5vwa:A, 5vwb:A
12 2b5o:A 292 219 0.0977 0.2158 0.2877 1.66e-13 2b5o:B
13 3vo2:A 296 141 0.0636 0.1385 0.2908 2.66e-13 3vo1:A, 3vo1:B, 3vo2:B
14 1gaw:B 305 234 0.0915 0.1934 0.2521 5.29e-13 1gaq:A, 1gaq:C, 1gaw:A, 3w5u:A, 3w5u:C, 3w5u:E, 3w5u:G, 3w5v:A, 3w5v:C
15 1ewy:A 303 170 0.0806 0.1716 0.3059 8.82e-13 1b2r:A, 1bjk:A, 2bmw:A, 4bpr:A, 1bqe:A, 2bsa:A, 4c43:A, 1e62:A, 1e63:A, 1e64:A, 1ewy:B, 1gjr:A, 1go2:A, 1gr1:A, 1h42:A, 1h85:A, 1ogi:A, 1ogj:A, 1qgy:A, 1qgz:A, 1qh0:A, 1que:A, 1quf:A, 2vyq:A, 2vzl:A, 1w34:A, 1w35:A, 1w87:A, 1w87:B, 2x3u:A, 3zbt:A, 3zbu:A, 3zc3:A, 3zc3:B
16 1ewy:A 303 45 0.0202 0.0429 0.2889 2.6 1b2r:A, 1bjk:A, 2bmw:A, 4bpr:A, 1bqe:A, 2bsa:A, 4c43:A, 1e62:A, 1e63:A, 1e64:A, 1ewy:B, 1gjr:A, 1go2:A, 1gr1:A, 1h42:A, 1h85:A, 1ogi:A, 1ogj:A, 1qgy:A, 1qgz:A, 1qh0:A, 1que:A, 1quf:A, 2vyq:A, 2vzl:A, 1w34:A, 1w35:A, 1w87:A, 1w87:B, 2x3u:A, 3zbt:A, 3zbu:A, 3zc3:A, 3zc3:B
17 1qfy:A 308 141 0.0682 0.1429 0.3121 1.34e-11 4af6:A, 4af6:B, 4af7:A, 4af7:B, 3mhp:A, 3mhp:B, 1qfy:B, 1qfz:A, 1qfz:B, 1qg0:A, 1qg0:B, 1qga:A, 1qga:B, 1sm4:A, 1sm4:B, 2xnc:A, 2xnc:B
18 1bx0:A 296 138 0.0667 0.1453 0.3116 3.06e-10 1bx1:A, 1fnb:A, 1fnc:A, 1fnd:A, 1frn:A, 1frq:A
19 3hr4:A 189 138 0.0651 0.2222 0.3043 3.95e-10 3hr4:C, 3hr4:E, 3hr4:G
20 4h2d:A 158 128 0.0667 0.2722 0.3359 3.13e-09 4h2d:B
21 3jqp:D 269 124 0.0512 0.1227 0.2661 2.59e-08 3jqp:A, 3jqp:B, 3jqp:C, 3jqp:E, 3jqp:F, 3jqq:A, 3jqq:B, 3jqq:C, 3jqq:D, 3jqq:E, 3jqq:F, 3jqr:A, 2ok7:A, 2ok7:B, 2ok7:C, 2ok7:D, 2ok7:E, 2ok7:F, 2ok8:A, 2ok8:B, 2ok8:C, 2ok8:D
22 2rc5:A 306 138 0.0636 0.1340 0.2971 2.74e-07 2rc5:B, 2rc5:C, 2rc5:D, 2rc6:A, 2rc6:B, 2rc6:C, 2rc6:D
23 4oxx:A 153 149 0.0620 0.2614 0.2685 2.45e-05
24 6gaq:A 146 115 0.0558 0.2466 0.3130 8.37e-05 6gaq:B
25 2m6s:A 149 72 0.0388 0.1678 0.3472 3.24e-04
26 5tgz:A 439 163 0.0651 0.0957 0.2577 0.002 7v3z:A, 5xr8:A, 5xra:A
27 4heq:A 145 118 0.0481 0.2138 0.2627 0.002 4heq:B
28 5v57:A 645 160 0.0620 0.0620 0.2500 0.003 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
29 7k15:A 455 133 0.0574 0.0813 0.2782 0.008
30 7ddz:A 437 120 0.0543 0.0801 0.2917 0.027
31 5lji:A 145 117 0.0465 0.2069 0.2564 0.032 5lji:C
32 2x4h:C 131 81 0.0372 0.1832 0.2963 0.058 2x4h:A, 2x4h:B, 2x4h:D
33 5zkp:A 436 161 0.0651 0.0963 0.2609 0.061
34 1krh:A 337 113 0.0450 0.0861 0.2566 0.065 1krh:B
35 7epe:A 389 120 0.0543 0.0900 0.2917 0.082 7epf:A
36 6li0:A 441 194 0.0698 0.1020 0.2320 0.095 6li1:A
37 2bmv:A 163 92 0.0388 0.1534 0.2717 0.17 1fue:A, 2w5u:A, 2w5u:B
38 3kap:A 147 147 0.0589 0.2585 0.2585 0.27 3kaq:A
39 7qty:A 279 62 0.0279 0.0645 0.2903 0.58 7qu0:A
40 8pqi:A 299 84 0.0295 0.0635 0.2262 1.6 6joi:A
41 5ogx:A 333 81 0.0341 0.0661 0.2716 1.6
42 6hqk:A 403 75 0.0233 0.0372 0.2000 3.1 6hql:A, 6hqm:A, 6hqn:A, 6hqo:A, 6hqp:A, 6hqq:A, 6hqr:A, 6hqs:A, 6hqt:A, 5ncb:A, 5omr:A, 5oms:A, 5omu:A, 6ych:A, 6yci:A, 6ycj:A, 6yck:A, 6ycl:A, 6ycm:A, 6ycn:A, 6yco:A, 6ycp:A, 6yct:A
43 6ysw:A 707 65 0.0295 0.0269 0.2923 3.4
44 7qu5:A 280 57 0.0264 0.0607 0.2982 4.1 7qu3:A
45 8a1y:F 408 65 0.0264 0.0417 0.2615 5.4 8a1t:F, 8a1u:F, 8a1v:F, 8a1w:F, 8a1x:F, 8acw:F, 8acy:F, 8ad0:F, 8ad3:A, 8ad3:B, 8ad4:A, 8ad4:B, 8ad5:A, 8ad5:B, 4u9u:A, 4u9u:B, 4uaj:A, 7xk3:F, 7xk4:F, 7xk5:F, 7xk6:F, 7xk7:F
46 6o0a:A 383 72 0.0295 0.0496 0.2639 5.6
47 2r9z:B 453 81 0.0388 0.0552 0.3086 6.4 2r9z:A, 2rab:A, 2rab:B
48 2r6h:C 289 64 0.0264 0.0588 0.2656 7.3 2r6h:A, 2r6h:B, 2r6h:D
49 7o9k:u 133 57 0.0264 0.1278 0.2982 9.3 7a5h:u, 7a5j:u, 8k2b:u, 7o9m:u, 7odr:u, 7ods:u, 7odt:u, 7of0:u, 7of2:u, 7of3:u, 7of5:u, 7of7:u, 7oi7:u, 7oi8:u, 7oi9:u, 7oic:u, 7oid:u, 7oie:u, 5ool:u, 5oom:u, 7pd3:u, 8pk0:u, 7po4:za, 8qsj:u, 8qu5:u

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218