Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NQSVVVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQLLWHRAQYEPLFHMLSGPEAYVFTCINQTAEQQELEDEQRRLCDVQPFL
PVLRLVAREGDRVKKLINSQISLLIGKGLHEFDSLCDPEVNDFRAKMCQFCEEAAARRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPSNR
ALLVNVKFEGSEESFTFQVSTKDVPLALMACALRKKATVRQVEQPEDYTLQVNGRHEYLYGSYPLCQFQYICSCLHSGLT
PHLTMVHSSSILAMRDESSVSLWSLEQPFRIELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVSVCSEPVWKQR
LEFDINICDLPRMARLCFALYAVIEKAADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTD
SAAALLICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHTEEEQLQLREILEGELYEHEKDLVWKLRHEVQEHFPEALARLLLVTKWN
KHEDVAQMLYLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDCHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDR
ALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLILEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKLSSQKTPKPQTKELMH
LCMRQEAYLEALSHLQSPLDPSTLLAEVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEESVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLW
KQEGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLRSDTIANIQLNNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGI
GDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHGLLFLHLFA
LMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVN

The query sequence (length=933) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7lq1:A 950 953 0.9893 0.9716 0.9685 0.0 5ae8:A, 5ae9:A, 6eyz:A, 6ez6:A, 6g6w:A, 6hi1:A, 6hi2:A, 6hi9:A, 5l72:A, 7lm2:A, 6oco:A, 7pop:A, 7por:A, 7pos:A, 7pot:A, 6pyr:A, 6q6y:A, 6q73:A, 6q74:A, 6tnr:A, 6tns:A, 5vlr:A, 6zaa:A, 6zac:A, 6zad:A
2 6pyu:A 930 941 0.9850 0.9882 0.9766 0.0 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A
3 2wxl:A 823 851 0.8189 0.9283 0.8978 0.0 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
4 5o83:A 794 844 0.7985 0.9383 0.8827 0.0 4ajw:B, 6dgt:A, 5is5:A, 7r2b:A, 4v0i:B
5 4ajw:A 765 842 0.7696 0.9386 0.8527 0.0 4v0i:A
6 2y3a:A 976 976 0.5991 0.5727 0.5727 0.0
7 4bfr:A 855 871 0.5391 0.5883 0.5775 0.0 4bfr:B
8 5itd:A 995 991 0.4437 0.4161 0.4178 0.0 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
9 4ykn:A 1205 1000 0.4416 0.3419 0.4120 0.0 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
10 5dxh:D 981 977 0.4362 0.4149 0.4166 0.0 8gua:A, 6oac:A
11 5swp:A 1060 1027 0.4437 0.3906 0.4031 0.0 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
12 5ubr:A 887 900 0.4030 0.4239 0.4178 0.0 5dxt:A, 7k6n:A
13 7k71:A 843 873 0.3944 0.4365 0.4215 0.0 8gud:A
14 1e7u:A 872 876 0.3376 0.3612 0.3596 5.91e-151 4anv:A, 3ibe:A
15 3zw3:A 831 870 0.3312 0.3718 0.3552 1.14e-150 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
16 1e8w:A 851 874 0.3301 0.3619 0.3524 2.68e-146 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
17 8sob:A 1005 1022 0.3655 0.3393 0.3337 8.49e-146 8soa:A, 8soc:A
18 7jx0:A 801 794 0.3076 0.3583 0.3615 1.74e-138 3qjz:A
19 8sod:A 941 988 0.3494 0.3464 0.3300 2.98e-131 8soe:A
20 7bi6:A 829 818 0.2765 0.3112 0.3154 1.44e-103 8a9i:A, 7bi9:A, 7z74:A, 7z75:A
21 7bi2:A 1021 684 0.2529 0.2311 0.3450 1.54e-99
22 6ykg:AAA 559 526 0.1661 0.2773 0.2947 3.62e-69 5anl:A, 5enn:A, 5enn:B, 6i3u:A, 3ls8:A, 3ls8:B, 4oys:A, 4ph4:B, 7rsj:A, 7rsp:A, 7rsp:B, 7rsv:A, 7rsv:B, 8rxr:A, 8rxr:B, 4uwf:A, 4uwg:A, 4uwh:A, 4uwk:A, 4uwl:A
23 2x6k:A 550 512 0.1758 0.2982 0.3203 9.13e-63 2x6f:A, 2x6f:B, 2x6i:A, 2x6i:B, 2x6j:A, 2x6j:B, 2x6k:B
24 6bq1:E 1510 460 0.1275 0.0788 0.2587 3.95e-27 6bq1:A
25 4d0l:E 479 229 0.0740 0.1441 0.3013 5.86e-26 5c4g:E, 4d0l:A, 4d0l:C, 4d0m:A, 4d0m:C, 4d0m:G, 4d0m:I, 4d0m:M, 4d0m:O, 4d0m:Q, 4d0m:S, 4d0m:W, 4d0m:Y, 4d0m:c, 4d0m:g, 5euq:E, 5fbl:A, 5fbq:A, 5fbr:A, 5fbv:A, 5fbw:A, 6gl3:A, 8q6f:A, 8q6g:A, 8q6h:A, 8vof:A, 4wae:A, 4wag:A
26 7nfc:A 3562 241 0.0718 0.0188 0.2780 3.34e-13 8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
27 7nfe:A 3585 239 0.0707 0.0184 0.2762 8.75e-13
28 8eza:L 3720 248 0.0718 0.0180 0.2702 2.30e-12 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
29 7k1n:A 3634 248 0.0718 0.0184 0.2702 2.34e-12 7z88:A
30 6zhe:A 3768 248 0.0718 0.0178 0.2702 2.40e-12
31 7k1k:A 3604 248 0.0718 0.0186 0.2702 2.44e-12 7k1b:A
32 7k0y:A 3669 248 0.0718 0.0183 0.2702 2.44e-12
33 7su3:A 3802 248 0.0718 0.0176 0.2702 2.45e-12
34 7k1j:A 3584 248 0.0718 0.0187 0.2702 2.46e-12 7k19:A
35 7otm:A 3656 248 0.0718 0.0183 0.2702 2.57e-12 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
36 6zha:A 3707 248 0.0718 0.0181 0.2702 2.57e-12 6zh8:A
37 7sud:A 3740 248 0.0718 0.0179 0.2702 2.57e-12
38 7z87:A 3689 248 0.0718 0.0182 0.2702 2.59e-12
39 6zhe:F 3731 248 0.0718 0.0180 0.2702 2.61e-12
40 7k17:B 3645 248 0.0718 0.0184 0.2702 2.63e-12 7k17:A
41 7sgl:A 3852 248 0.0718 0.0174 0.2702 2.71e-12
42 8ez9:L 3662 248 0.0718 0.0183 0.2702 2.72e-12 8ez9:C
43 8ezb:C 3724 248 0.0718 0.0180 0.2702 2.75e-12 8ezb:L
44 5y3r:C 3636 248 0.0718 0.0184 0.2702 2.84e-12
45 8rch:A 2036 254 0.0740 0.0339 0.2717 2.11e-11 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
46 6zwm:B 2185 254 0.0740 0.0316 0.2717 2.18e-11 6zwm:A
47 6s8f:F 2571 221 0.0654 0.0237 0.2760 2.45e-11 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
48 6bcu:A 2204 254 0.0740 0.0313 0.2717 2.72e-11 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
49 3jbz:A 960 254 0.0740 0.0719 0.2717 2.79e-11
50 8bot:A 3528 239 0.0697 0.0184 0.2720 1.00e-10
51 8oxm:A 2748 230 0.0643 0.0218 0.2609 2.76e-09 8oxm:B
52 7ni5:A 2791 230 0.0643 0.0215 0.2609 2.77e-09 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
53 7sic:A 2773 230 0.0643 0.0216 0.2609 2.96e-09 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
54 6sl1:A 2652 278 0.0761 0.0268 0.2554 1.22e-07 6sky:A, 6sky:B
55 6skz:A 2638 278 0.0761 0.0269 0.2554 1.30e-07 6sl0:A, 6sl0:B
56 7pw9:A 1952 111 0.0354 0.0169 0.2973 5.16e-06 7pw4:A, 7pw5:A, 7pw6:A, 7pw7:A, 7pw8:A, 6z3r:A
57 6syt:A 1896 111 0.0343 0.0169 0.2883 5.00e-05
58 6z2w:E 2325 146 0.0332 0.0133 0.2123 0.015 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
59 5erm:B 314 91 0.0236 0.0701 0.2418 1.9 5er8:B, 5erm:A
60 5er8:A 294 91 0.0236 0.0748 0.2418 1.9
61 8hla:B 215 59 0.0182 0.0791 0.2881 4.5 8hh0:A, 8hh0:B, 8hla:K, 8hla:L, 8hla:C, 8hla:F, 8hla:A, 8hla:D, 8hla:E, 8hla:G, 8hla:H, 8hla:I, 8hla:J
62 6nlx:C 335 72 0.0193 0.0537 0.2500 5.6 6nlx:B, 6nlx:D, 5ur0:A, 5ur0:B, 5ur0:C, 5ur0:D
63 6rq7:B 479 132 0.0354 0.0689 0.2500 7.2
64 3tbo:A 54 28 0.0118 0.2037 0.3929 8.2
65 6dgd:A 704 96 0.0300 0.0398 0.2917 8.6 6dgd:B, 4nl4:H
66 4nl8:A 549 96 0.0300 0.0510 0.2917 9.3
67 8xgc:M 379 44 0.0214 0.0528 0.4545 9.4
68 7nky:O 427 44 0.0214 0.0468 0.4545 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218