Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NQQLAEETIDVTLPSRQISIGSKHPLTRTVEEIEDLFLGLGYEIVDGYEVEQDYYNFEALNLPKSHPARDMQDSFYITDE
ILMRTHTSPVQARTMEKRNGQGPVKIICPGKVYRRDSDDATHSHQFTQIEGLVVDKNIKMSDLKGTLELVAKKLFGADRE
IRLRPSYFPFTEPSVEVDVSWIEILGAGMVHPNVLEMAGFDSNEYSGFAFGMGPDRIAMLKYGIEDIRYFYTNDVRFLEQ
FKAVEDRGE

The query sequence (length=249) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2rhs:C 271 265 1.0000 0.9188 0.9396 0.0 2rhq:A, 2rhs:A
2 4p72:D 244 247 0.5502 0.5615 0.5547 2.32e-100 4p72:C, 4p73:C, 4p73:D, 4p74:C, 4p74:D, 4p75:C, 4p75:D
3 3pco:C 323 247 0.5422 0.4180 0.5466 5.39e-94 6oz5:A, 6oz5:C, 6p24:A, 6p26:A, 6p26:C, 3pco:A
4 6p8t:H 326 245 0.5462 0.4172 0.5551 9.41e-92 6p8t:C, 6p8t:D, 6p8t:G
5 7k98:A 343 246 0.4819 0.3499 0.4878 7.36e-79 7daw:A, 7db7:A, 7db8:A, 7k98:D, 7k9m:A, 7ka0:A, 7ka0:D, 7kab:A
6 1eiy:A 345 274 0.4779 0.3449 0.4343 1.04e-75 2akw:A, 2aly:A, 2amc:A, 1b70:A, 1b7y:A, 3hfz:A, 2iy5:A, 1jjc:A, 3teh:A, 4tva:A
7 7dpi:C 292 268 0.3092 0.2637 0.2873 8.22e-36 7dpi:A
8 7by6:A 299 268 0.3092 0.2575 0.2873 1.15e-35
9 3l4g:C 508 264 0.3173 0.1555 0.2992 2.66e-31 3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
10 5mgu:A 407 279 0.3333 0.2039 0.2975 1.01e-30 3cmq:A, 3hfv:A, 5mgh:A, 5mgw:A, 8p8x:A, 3teg:A, 3tup:A
11 2du4:A 466 259 0.2490 0.1330 0.2394 1.82e-10 2du3:B, 2du5:B, 2du6:B
12 2du3:A 534 143 0.1446 0.0674 0.2517 1.06e-05 2du5:A, 2du6:A
13 2du3:A 534 49 0.0643 0.0300 0.3265 1.0 2du5:A, 2du6:A
14 5x6c:A 539 162 0.1526 0.0705 0.2346 7.87e-04 5x6c:B
15 5x6c:A 539 57 0.0602 0.0278 0.2632 7.2 5x6c:B
16 7u0r:B 278 202 0.1807 0.1619 0.2228 0.006 8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
17 2zni:A 279 179 0.1687 0.1505 0.2346 0.057 2zni:B
18 7p84:C 408 90 0.0964 0.0588 0.2667 0.63 7p84:A, 7p8m:A, 7p8m:C
19 6nrz:A 517 77 0.0803 0.0387 0.2597 0.77 6nrz:B, 6ns0:A, 6ns0:B, 6o3f:A, 6o3f:B
20 8bh7:m 119 84 0.1044 0.2185 0.3095 0.82 7aso:4, 7asp:d, 8bh6:m, 8byv:m, 6fxc:Am, 6fxc:Bm, 5li0:m, 5nd8:m, 5nd9:m, 5ngm:Am, 7nhl:n, 7nhm:n, 8p2f:n, 8p2g:n, 8p2h:n, 7p48:m, 6s0x:m, 6s13:m, 5tcu:S4, 8y38:m, 8y39:m, 6yef:m
21 4cs3:A 270 57 0.0683 0.0630 0.2982 0.90 6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A
22 3p8v:A 294 81 0.0763 0.0646 0.2346 1.1 3p8v:B, 3p8y:A, 3p8y:B, 3reu:A, 3reu:B, 3rex:A, 3rex:B, 3rl6:A, 3rl6:B
23 3a2m:B 300 90 0.0964 0.0800 0.2667 1.9 3a2l:A, 3a2l:B, 3a2m:A
24 2d8l:A 363 99 0.0803 0.0551 0.2020 2.9 2gh4:A
25 8b6q:A 466 30 0.0482 0.0258 0.4000 4.0 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
26 8b6s:A 517 30 0.0482 0.0232 0.4000 4.3 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
27 6u2m:A 464 30 0.0482 0.0259 0.4000 4.6 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
28 2gke:A 274 59 0.0723 0.0657 0.3051 8.6 2gkj:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218