Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NPVHILAKKGEVAERVLVVGDPGRARLLSTLLQNPKLTNENRGFLVYTGKYNGETVSIATHGIGGPSIAIVLEELAMLGA
NVFIRYGTTGALVPYINLGEYIIVTGASYNQGGLFYQYLRDNACVASTPDFELTNKLVTSFSKRNLKYYVGNVFSSDAFY
AEDEEFVKKWSSRGNIAVEMECATLFTLSKVKGWKSATVLVVSDNLAKITKEELEKSVMDGAKAVLDTLTS

The query sequence (length=231) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1jdv:C 235 235 1.0000 0.9830 0.9830 1.38e-168 1jds:A, 1jds:B, 1jds:C, 1jds:D, 1jds:E, 1jds:F, 1jdt:A, 1jdt:B, 1jdt:C, 1jdv:A, 1jdv:B, 1jdv:D, 1jdv:E, 1jdv:F, 1jdz:A, 1jdz:B, 1jdz:C, 1je0:A, 1je0:B, 1je0:C, 1je1:A, 1je1:B, 1je1:C, 1je1:D, 1je1:E, 1je1:F, 1jp7:A, 1jp7:B, 1jp7:C, 1jpv:A, 1jpv:B, 1jpv:C
2 1odi:A 234 235 0.4026 0.3974 0.3957 1.11e-47 1odi:B, 1odi:C, 1odi:D, 1odi:E, 1odi:F, 1odj:A, 1odj:B, 1odj:C, 1odj:D, 1odj:E, 1odj:F, 1odl:A, 1odl:F, 1odl:B, 1odl:C, 1odl:D, 1odl:E
3 4mch:A 243 228 0.3247 0.3086 0.3289 1.39e-37
4 4r2w:D 251 216 0.3117 0.2869 0.3333 1.10e-34 7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
5 2isc:D 238 229 0.3463 0.3361 0.3493 3.82e-34 2i4t:A, 2i4t:B, 2i4t:C, 2isc:A, 2isc:B, 2isc:C, 2isc:E, 2isc:F, 1z34:A, 1z35:A, 1z36:A, 1z37:A, 1z38:A, 1z39:A
6 5efo:B 253 197 0.2727 0.2490 0.3198 1.11e-33 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
7 3uaw:A 233 232 0.3593 0.3562 0.3578 1.29e-33 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
8 3u40:D 241 217 0.3420 0.3278 0.3641 3.70e-31 3u40:A, 3u40:B, 3u40:C, 3u40:E, 3u40:F
9 3occ:F 238 205 0.3030 0.2941 0.3415 4.41e-31 1a69:A, 1a69:B, 1a69:C, 5i3c:A, 5i3c:B, 5i3c:C, 5iu6:A, 5iu6:B, 5iu6:C, 1k9s:A, 1k9s:D, 1k9s:B, 1k9s:E, 1k9s:C, 1k9s:F, 3occ:A, 3occ:B, 3occ:C, 3occ:D, 3occ:E, 3ooe:A, 3ooe:B, 3ooe:C, 3ooe:D, 3ooe:E, 3ooe:F, 3opv:A, 3opv:B, 3opv:C, 3opv:D, 3opv:E, 3opv:F, 3opv:G, 3opv:H, 3opv:I, 3opv:J, 3opv:K, 3opv:L, 1oty:A, 1oty:B, 1oty:C, 1ou4:A, 1ou4:B, 1ou4:C, 1oum:A, 1oum:B, 1oum:C, 1ov6:A, 1ov6:B, 1ov6:C, 1ovg:A, 1ovg:B, 1ovg:C, 1pk7:A, 1pk7:B, 1pk7:C, 1pk9:A, 1pk9:B, 1pk9:C, 1pke:A, 1pke:B, 1pke:C, 1pr0:A, 1pr0:B, 1pr0:C, 1pr1:A, 1pr1:B, 1pr1:C, 1pr2:A, 1pr2:B, 1pr2:C, 1pr4:A, 1pr4:B, 1pr4:C, 1pr5:A, 1pr5:B, 1pr5:C, 1pr6:A, 1pr6:B, 1pr6:C, 1pw7:A, 1pw7:B, 1pw7:C, 4ts3:A, 4ts3:D, 4ts3:B, 4ts3:C, 4ts3:E, 4ts3:F, 4ts9:A, 4ts9:C, 4ts9:B, 4tta:A, 4tta:B, 4tta:C, 4tta:F, 4tta:D, 4tta:E, 4tti:A, 4tti:B, 4tti:C, 4tti:F, 4tti:D, 4tti:E, 4ttj:A, 4ttj:D, 4ttj:B, 3ut6:A, 3ut6:B, 3ut6:C, 6xz2:B, 6xz2:C
10 3qpb:C 254 213 0.3160 0.2874 0.3427 1.08e-30 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
11 4dae:A 232 233 0.3203 0.3190 0.3176 2.67e-30 4d8v:A, 4d8v:B, 4d9h:A, 4d9h:B, 4da0:A, 4da6:A, 4da7:A, 4da8:A, 4dab:A, 4dan:A, 4dan:B, 4dao:A, 4dao:B, 4dar:A
12 2hn9:A 253 201 0.2771 0.2530 0.3184 2.16e-29 3c74:A, 3c74:F, 3c74:B, 3c74:C, 3c74:D, 3c74:E, 4e1v:A, 4e1v:E, 4e1v:F, 4e1v:D, 4e1v:C, 4e1v:B, 4e1v:H, 4e1v:G, 3fwp:B, 3fwp:D, 3fwp:C, 3fwp:E, 3fwp:A, 3fwp:F, 2hn9:B, 2hn9:D, 2hn9:F, 2hrd:A, 2hrd:B, 2hrd:C, 2hrd:D, 2hrd:E, 2hrd:F, 2hwu:A, 2hwu:B, 2hwu:C, 2hwu:D, 2hwu:E, 2hwu:F, 3kvv:A, 3kvv:B, 3kvv:C, 3kvv:D, 3kvv:E, 3kvv:F, 2oec:B, 2oec:F, 2pga:B, 2pga:D, 2pga:F, 2rj3:A, 2rj3:D, 2rj3:F, 2rj3:E, 2rj3:B, 1rxc:A, 1rxc:B, 1rxc:C, 1rxc:D, 1rxc:E, 1rxc:F, 1rxc:I, 1rxc:J, 1rxc:K, 1rxc:L, 1rxs:A, 1rxs:a, 1rxs:B, 1rxs:b, 1rxs:C, 1rxs:c, 1rxs:D, 1rxs:d, 1rxs:E, 1rxs:e, 1rxs:F, 1rxs:R, 1rxs:G, 1rxs:P, 1rxs:H, 1rxs:h, 1rxs:I, 1rxs:i, 1rxs:J, 1rxs:j, 1rxs:K, 1rxs:k, 1rxs:L, 1rxs:l, 1rxs:M, 1rxs:m, 1rxs:O, 1rxs:N, 1rxs:Q, 1rxs:o, 1rxu:A, 1rxu:B, 1rxu:C, 1rxu:D, 1rxu:E, 1rxu:F, 1rxu:G, 1rxu:H, 1rxu:I, 1rxu:J, 1rxu:K, 1rxu:L, 1rxu:M, 1rxu:N, 1rxu:O, 1rxu:P, 1rxu:Q, 1rxu:R, 1rxy:A, 1rxy:B, 1sj9:B, 1tgv:A, 1tgv:B, 1tgy:A, 1tgy:B, 1u1c:A, 1u1c:B, 1u1c:C, 1u1c:D, 1u1c:E, 1u1c:F, 1u1d:A, 1u1d:B, 1u1d:C, 1u1d:D, 1u1d:E, 1u1d:F, 1u1e:A, 1u1e:B, 1u1e:C, 1u1e:D, 1u1e:E, 1u1e:F, 1u1f:A, 1u1f:B, 1u1f:C, 1u1f:D, 1u1f:E, 1u1f:F, 1u1g:A, 1u1g:B, 1u1g:C, 1u1g:D, 1u1g:E, 1u1g:F, 1y1q:C, 1y1r:D, 1y1r:B, 1y1s:A, 1y1s:D, 1y1s:F, 1y1s:E, 1y1s:B, 1zl2:B, 1zl2:D, 1zl2:F
13 6f4w:A 233 213 0.3117 0.3090 0.3380 4.56e-29 6f4w:D, 6f4w:B, 6f4w:E, 6f4w:C, 6f4w:F, 6f4x:A, 6f4x:D, 6f4x:B, 6f4x:E, 6f4x:C, 6f4x:F, 5lu0:A, 5lu0:B, 5lu0:C, 5lu0:E, 5mx4:C, 5mx6:A, 5mx6:B, 5mx6:C, 5mx6:D, 5mx6:F, 5mx8:A, 7ooy:B, 7ooz:B, 7op9:A, 7op9:B, 7op9:C, 7op9:D, 7op9:E, 7op9:F, 7op9:G, 7op9:H, 7op9:I, 7op9:J, 7op9:K, 7op9:L, 7opa:C, 7opa:H
14 3of3:A 240 231 0.2900 0.2792 0.2900 6.04e-24 3of3:B, 3of3:C, 3of3:D, 3of3:E, 3of3:F, 3of3:G, 3of3:H, 3of3:I, 3of3:J, 3of3:K, 3of3:L, 1vhw:A, 1vhw:D, 1vhw:B, 1vhw:F, 1vhw:C, 1vhw:E
15 3mb8:A 248 201 0.2424 0.2258 0.2786 1.56e-19 3mb8:B
16 3enz:C 246 203 0.2381 0.2236 0.2709 1.94e-17 6aqs:A, 2bsx:A, 3enz:A, 3enz:B, 3enz:D, 3enz:E, 3enz:F, 3fow:A, 3fow:B, 1nw4:A, 1nw4:B, 1nw4:C, 1nw4:D, 1nw4:E, 1nw4:F, 3phc:A, 3phc:B, 3phc:C, 3phc:D, 3phc:E, 3phc:F, 1q1g:A, 1q1g:B, 1q1g:C, 1q1g:D, 1q1g:E, 1q1g:F, 1sq6:A, 8w7h:A, 5znc:A, 5zni:A
17 6k8p:A 294 105 0.1558 0.1224 0.3429 3.47e-11 6k5h:A, 6k5h:D, 6k5h:B, 6k5h:C, 6k5k:A, 6k5k:C, 6k5k:B, 6k5k:D, 6k8p:B, 6k8p:C, 6k8p:D
18 3bje:A 327 78 0.1126 0.0795 0.3333 1.53e-07 3bje:B
19 4g89:A 233 164 0.1905 0.1888 0.2683 0.005 4g89:B
20 4f2p:B 239 169 0.1861 0.1799 0.2544 0.008 3df9:A, 3df9:B, 4f1w:A, 4f1w:B, 4f2p:A, 4f2w:A, 4f2w:B, 4f3c:A, 4f3c:B, 4f3k:A, 4f3k:B, 1jys:A, 1jys:B, 1nc1:A, 1nc1:B, 1nc3:A, 1nc3:B, 3o4v:A, 3o4v:B, 4wkc:A, 1y6q:A, 1y6q:B, 1y6r:A, 1y6r:B, 4yml:A, 1z5n:A, 1z5n:B, 1z5o:A, 1z5o:B
21 3p0f:A 293 176 0.2121 0.1672 0.2784 0.010 3p0e:A, 3p0e:B, 3p0e:C, 3p0e:D, 3p0e:E, 3p0e:F, 2xrf:A, 2xrf:B, 2xrf:C
22 5ue1:A 233 152 0.1775 0.1760 0.2697 0.033 5ue1:B
23 3bl6:A 230 145 0.1775 0.1783 0.2828 0.034
24 4g41:B 236 188 0.1775 0.1737 0.2181 0.040
25 4wkb:A 237 167 0.1645 0.1603 0.2275 0.071 3dp9:A, 3dp9:C, 4wkb:B, 4x24:A, 4x24:B
26 6po4:A 233 148 0.1299 0.1288 0.2027 0.13 6po4:B, 6po4:C, 6po4:D, 6po4:E, 6po4:F
27 1t8y:F 461 180 0.1775 0.0889 0.2278 0.15 1t8s:A, 1t8s:B, 1t8s:C, 1t8s:D, 1t8s:E, 1t8s:F, 1t8y:C, 1t8y:B, 1t8y:E, 1t8y:A
28 3ku4:B 293 182 0.1775 0.1399 0.2253 0.26 3ku4:A, 3ku4:C, 3ku4:D, 3kuk:A, 3kuk:B, 3kvr:A, 3kvr:B, 3kvy:A, 3kvy:B
29 7nds:A 294 106 0.1385 0.1088 0.3019 0.32 7ndr:D
30 4txl:C 290 91 0.1212 0.0966 0.3077 0.41 4txl:D, 4txl:A, 4txl:B, 4txm:A, 4txm:B, 4txn:A, 4txn:B, 4txn:C, 4txn:D
31 5dk6:A 242 211 0.2035 0.1942 0.2227 0.49
32 3eue:A 295 46 0.0866 0.0678 0.4348 0.53 3euf:A, 3euf:B, 3euf:C, 3euf:D, 3nbq:A, 3nbq:B, 3nbq:C, 3nbq:D
33 8eop:A 1687 18 0.0563 0.0077 0.7222 1.3
34 8ee6:A 1808 18 0.0563 0.0072 0.7222 1.3 8edw:A
35 7qhm:D 576 52 0.0606 0.0243 0.2692 2.8 7q21:D, 7q21:d, 7qhm:Q, 7qho:D, 7qho:Q
36 5b1y:B 243 26 0.0476 0.0453 0.4231 7.3 5b1y:A
37 6gzv:C 238 95 0.1126 0.1092 0.2737 7.9 6zcl:C
38 2p3i:A 161 58 0.0736 0.1056 0.2931 9.8 1kqr:A, 2p3j:A, 2p3k:A, 3tb0:A
39 1h8l:A 380 59 0.0823 0.0500 0.3220 9.9 1qmu:A
40 4coq:B 226 29 0.0476 0.0487 0.3793 9.9 4c3t:A, 4c3t:B, 4coq:A, 4uov:A, 4uov:B, 4uov:C, 4uov:D, 4uov:E, 4uov:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218