BioLiP

>protein
NPTAEEVLSWSQNFDKMMKAPAGRNLFREFLRTEYSEENLLFWLACEDLKKEQNKKVIEEKARMIYEDYISILSPKEVSL
DSRVREVINRNLLDPNPHMYEDAQLQIYTLMHRDSFPRFLNSQIYKSFVEST

The query sequence (length=132) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6am3:X	135	132	1.0000	0.9778	1.0000	1.00e-96	6am3:A
2	7y1p:B	139	133	0.3182	0.3022	0.3158	9.99e-15	1emu:A
3	2ges:A	308	42	0.1136	0.0487	0.3571	0.31	3aez:A, 3af0:A, 3af1:A, 3af2:A, 3af3:A, 3avo:A, 3avq:A, 4bfs:A, 4bft:A, 4bft:B, 4bfu:A, 4bfu:B, 4bfv:A, 4bfv:B, 4bfw:A, 4bfw:B, 4bfx:A, 4bfx:B, 4bfy:A, 4bfy:B, 4bfz:A, 4bfz:B, 2get:A, 2geu:A, 2gev:A, 2zs7:A, 2zs8:A, 2zs9:A, 2zsa:A, 2zsb:A, 2zsd:A, 2zse:A, 2zsf:A
4	6vrc:A	1007	64	0.1439	0.0189	0.2969	0.34
5	6vrb:A	1031	64	0.1439	0.0184	0.2969	0.37
6	6pjx:A	542	114	0.1818	0.0443	0.2105	0.44	4tnb:A, 4tnd:A, 8uap:A, 8uaq:A, 4wnk:A
7	8juj:B	380	33	0.0985	0.0342	0.3939	1.1	8juj:A
8	1gk0:B	522	58	0.1136	0.0287	0.2586	1.3	2adv:C, 1gk0:D, 1gk1:B, 1gk1:D, 1jvz:B, 1jw0:B
9	3ugt:C	427	33	0.1061	0.0328	0.4242	6.5	4eo4:A, 4eo4:B, 4eo4:C, 4eo4:D, 3ugq:A, 3ugt:A, 3ugt:B, 3ugt:D, 3uh0:A, 4yye:A, 4yye:B
10	3q7g:A	203	35	0.0909	0.0591	0.3429	8.0	3pmr:A, 3pmr:B, 3q7g:B, 3q7l:A, 3q7l:B, 3qmk:A, 3qmk:B, 4rda:A, 4rda:B
11	8jfk:B	1033	31	0.0985	0.0126	0.4194	8.7	8jfk:N, 8jfk:J, 8jfk:F, 8jfl:B, 8jfl:N, 8jfl:F, 8jfl:J, 8xya:B
12	3c4w:B	519	37	0.1136	0.0289	0.4054	9.4	3c4w:A, 3c4x:A, 3c4x:B, 3c4z:A, 3c50:A, 3c50:B, 3c51:A, 4l9i:A, 4l9i:B, 7mt8:G, 7mt9:G, 7mta:G, 7mtb:G, 4pni:A, 3qc9:A, 3qc9:B, 3qc9:C, 3qc9:D, 3t8o:A, 4wbo:A, 4wbo:B, 4wbo:C, 4wbo:D
13	1oxu:A	353	60	0.1364	0.0510	0.3000	9.8	1oxu:B, 1oxu:C, 1oxv:A, 1oxv:B, 1oxv:D

[Back]