BioLiP

>protein
NPALQLHDWVEYYRPFAANGQSAPALGKNDSQLGICVLEPDGTMIHAGDWNVSFTMQSISKVISFIAACMSRGIPYVLDR
VDVEPKPFNPMINAGALTIASILPGESAYEKLEFLYSVMETLIGKRPRIHEEVFRSEWETAHRNRALAYYLKETNFLEAE
VEETLEVYLKQCAMESTTEDIALIGLILAHDGYHPIRHEQVIPKDVAKLAKALMLTCGMYNASGKYAAFVGVPAKSGVSG
GIMALVPPSQPFQSGCGIGIYGPAIDEYGNSLTGGMLLKHMAQEWELSIF

The query sequence (length=290) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2osu:A	306	296	1.0000	0.9477	0.9797	0.0	3brm:A, 3brm:B, 2osu:B
2	3ihb:A	450	288	0.3448	0.2222	0.3472	6.41e-52	3age:A, 3age:B, 3iha:A, 3iha:B, 3ihb:B
3	5uqe:D	507	270	0.3172	0.1815	0.3407	3.73e-38	8bsk:A, 8bsl:A, 8bsl:B, 8bsl:C, 8bsl:D, 8bsm:A, 8bsn:A, 3czd:A, 8ec6:A, 8ec6:B, 8ec6:C, 8ec6:D, 8ec6:E, 8ec6:F, 8ec6:G, 8ec6:H, 5fi2:A, 5fi2:D, 5fi6:A, 5fi6:B, 5fi6:C, 5fi6:D, 5fi7:A, 5fi7:C, 8gwr:B, 5hl1:A, 5hl1:D, 5hl1:B, 5hl1:C, 5i94:A, 5i94:D, 5i94:B, 5i94:C, 4jkt:B, 4jkt:C, 4jkt:A, 4jkt:D, 8jub:A, 8jub:B, 8jub:C, 8jub:D, 8jue:A, 8jue:B, 8jue:C, 8jue:D, 5jyo:D, 5jyo:E, 5jyo:B, 5jyo:C, 5jyo:F, 5jyp:A, 6lox:A, 6lox:D, 6lox:B, 6lox:C, 4o7d:A, 7ren:A, 7ren:B, 7ren:C, 7ren:D, 7rgg:A, 7rgg:B, 7rgg:C, 7rgg:D, 7sbm:A, 7sbm:B, 7sbm:C, 7sbm:D, 7sbn:A, 7sbn:B, 7sbn:C, 7sbn:D, 3ss4:A, 3ss4:B, 3ss4:C, 3ss4:D, 3ss5:A, 3ss5:B, 3ss5:C, 3ss5:D, 8szj:A, 8szj:B, 8szj:C, 8szj:D, 8szj:E, 8szj:G, 8szj:I, 8szj:K, 8szj:F, 8szj:H, 8szj:J, 8szj:L, 6ujg:C, 6ujg:H, 6ujg:D, 6ujg:G, 6ujg:B, 6ujg:E, 6ujg:A, 6ujg:F, 6ujm:A, 6ujm:B, 6ujm:C, 6ujm:D, 6uk6:A, 6uk6:B, 6uk6:C, 6uk6:D, 6ukb:A, 6ukb:B, 6ul9:B, 6ul9:D, 6ula:A, 6ula:B, 6ula:C, 6ula:D, 6ula:F, 6ula:H, 6ula:E, 6ula:G, 6ulj:A, 6ulj:B, 6ulj:C, 6ulj:D, 6umc:C, 6umc:B, 6umd:B, 6umd:D, 6ume:A, 6ume:D, 6umf:A, 6umf:B, 6umf:C, 6umf:D, 3unw:A, 3unw:B, 3unw:C, 3unw:D, 3uo9:A, 3uo9:B, 3uo9:C, 3uo9:D, 5uqe:A, 5uqe:B, 5uqe:C, 5uqe:F, 3voz:A, 3vp0:A, 3vp1:A, 3vp2:A, 3vp3:A, 3vp4:A, 5w2j:B, 5wj6:A, 5wj6:C
4	8t0z:A	409	270	0.2966	0.2103	0.3185	2.57e-35	8t0z:B, 8t0z:C, 8t0z:D, 8t0z:E, 8t0z:G, 8t0z:I, 8t0z:K, 8t0z:F, 8t0z:H, 8t0z:J, 8t0z:L
5	2dji:A	590	89	0.0759	0.0373	0.2472	2.7	1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
6	5irm:C	770	72	0.0759	0.0286	0.3056	4.7	5irl:A, 5irm:A, 5irn:A
7	8cbl:E	692	67	0.0655	0.0275	0.2836	6.1
8	6tej:B	585	101	0.1069	0.0530	0.3069	7.8
9	5xxb:J	166	84	0.0931	0.1627	0.3214	8.6

[Back]