Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NNTATLCLGHHAVANGTLVKTMSDDQIEVTNATELVQSISMGKICNKSYRILDGRNCTLIDAMLGDPHCDAFQYESWDLF
IERSNAFSNCYPYDIPDYASLRSIVASSGTVEFTAEGFTWTGVTQNGRSGACKRGSADSFFSRLNWLTKSGSSYPTLNVT
MPNNKNFDKLYIWGIHHPSSNQEQTKLYIQESGRVTVSTKRSQQTIIPNIGSRPLVRGQSGRISIYWTIVKPGDILMINS
NGNLVAPRGYFKLNTGKSSVMRSDVPIDICVSECITPNGSISNDKPFQNVNKVTYGKCPKYIRQNTLKLATGMRNVPEK

The query sequence (length=319) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4uny:C 330 319 0.9310 0.9000 0.9310 0.0 4unx:A, 4unx:C, 4unx:E, 4uny:A, 4uny:E, 4unz:A, 4unz:C, 4unz:E, 4uo1:A, 4uo1:C, 4uo1:E, 4uo2:A, 4uo2:C, 4uo2:E, 4uo5:A, 4uo5:C, 4uo5:E, 4uo6:A, 4uo7:A, 4uo7:C, 4uo7:E, 4uo8:A
2 4wa2:A 491 317 0.8307 0.5397 0.8360 0.0 6bkq:A, 6bkq:C, 6bkq:E, 6cex:A, 6cex:C, 6cex:E, 1mqm:A, 1mqm:D, 1mqm:G, 1mqn:A, 1mqn:D, 5t6n:A, 5t6n:E, 5t6n:C, 6tzb:A, 6tzb:C, 6tzb:E, 2vir:C, 2vis:C, 2vit:C, 5vtq:A, 5vtq:C, 5vtq:E, 5vtr:A, 5vtr:C, 5vtr:E, 5vtv:A, 5vtv:C, 5vtv:E, 5vtw:C, 5vtw:E, 5vtw:A, 5vty:A, 5vty:C, 5vty:E, 5vu4:A, 5vu4:C, 5vu4:E, 4wa2:B, 4wa2:C, 4wa2:E, 6y5j:E, 2ypg:A, 2ypg:C, 2ypg:E
3 1hge:A 328 319 0.8370 0.8140 0.8370 0.0 1hge:C, 1hge:E, 1hgg:A, 1hgg:C, 1hgg:E, 1hgh:A, 1hgh:C, 1hgh:E, 1hgi:A, 1hgi:C, 1hgi:E, 1hgj:A, 1hgj:C, 1hgj:E, 4hmg:A, 4hmg:C, 4hmg:E, 5hmg:A, 5hmg:C, 5hmg:E
4 8tj4:A 317 315 0.7994 0.8044 0.8095 0.0 8tj4:C, 8tj4:E, 8tj4:G, 8tj6:A, 8tj6:C, 8tj6:E, 8tj6:G, 8tj7:A
5 8tj8:A 317 315 0.7586 0.7634 0.7683 0.0
6 5xrs:G 321 319 0.7524 0.7477 0.7524 0.0 5xrs:A, 5xrs:C
7 6wzt:A 494 317 0.7273 0.4696 0.7319 0.0 6aos:A, 6aot:A, 6aou:A, 6aov:A, 6bkr:A, 6bks:A, 6bkt:A, 6cex:D, 6cex:B, 3eym:B, 3eym:D, 3eym:F, 8faw:A, 1hgg:B, 1hgg:D, 1hgg:F, 1hgh:B, 1hgh:D, 1hgh:F, 1htm:B, 1htm:D, 1htm:F, 6nsa:A, 6nsb:A, 6nsf:A, 6nsg:A, 5t6n:B, 5t6n:D, 5t6n:F, 8tj6:B, 8tj9:A, 8tja:A, 8tjb:A, 4uny:D, 4uo0:D, 8uwa:B, 4wea:A, 2yp3:A, 2yp4:A, 2yp5:A, 2yp8:A, 2yp9:A
8 5xla:A 490 316 0.5549 0.3612 0.5601 5.13e-138 3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
9 6twi:E 323 317 0.4201 0.4149 0.4227 4.62e-86 4cyw:A, 4cyw:C, 4cyw:E, 4cyz:A, 4cyz:E, 4cz0:A, 4cz0:E, 4cz0:C, 4d00:A, 4d00:C, 4d00:E, 4qy1:E, 4qy1:G, 4qy1:I, 4qy1:U, 4qy2:E, 5tgu:C, 5tgu:E, 5tgu:A, 5tgv:A, 5tgv:C, 5tgv:E, 5th1:A, 5th1:C, 5th1:E, 5thc:E, 5thc:C, 6tva:A, 6tva:C, 6tva:E, 6tvb:A, 6tvb:C, 6tvb:E, 6tvd:A, 6tvd:C, 6tvd:E, 6tvd:G, 6tvd:I, 6tvd:K, 6tvf:A, 6tvf:C, 6tvf:E, 6tvf:G, 6tvf:K, 6tvf:I, 6tvr:K, 6tvs:C, 6tvs:E, 6tvs:K, 6tvt:A, 6tvt:C, 6tvt:E, 6twi:A, 6twi:C, 6twv:C, 6twv:E, 6twv:K, 6twv:G, 6twv:I, 6txo:A, 6txo:C, 6txo:E, 6ty1:A, 6ty1:C, 6ty1:E, 6ty1:G, 6ty1:I, 6ty1:K, 4xqo:A, 4xqo:C, 4xqu:A, 4xqu:C, 4xqu:E
10 5tg9:A 325 323 0.4075 0.4000 0.4025 3.20e-83 5tg9:C
11 4n5k:A 318 317 0.4044 0.4057 0.4069 7.13e-83 4bsb:A, 4bsc:A, 4bsd:A, 4bse:A, 4bsf:A, 4bsh:A, 4bsi:A, 6d8d:A, 6d8d:C, 6d8d:E, 4dj7:A, 4dj7:C, 4dj7:E, 4dj8:A, 4dj8:C, 4dj8:E, 6idb:A, 6idz:A, 4kom:A, 4kon:A, 4lkg:A, 4lkg:C, 4lkg:E, 4lkh:A, 4lkj:A, 4lkk:A, 4ln6:A, 4ln6:C, 4ln6:E, 4ln6:G, 4ln6:I, 4ln6:K, 4ln8:A, 4ln8:C, 4ln8:E, 4ln8:G, 4ln8:I, 4ln8:K, 4n5k:C, 4n60:A, 4n60:C, 4n61:A, 4n61:C, 4n62:A, 4n62:C, 4n63:A, 4n63:C, 4n64:A, 4n64:C, 5t6s:A, 5t6s:C, 5t6s:E, 5t6s:I, 5t6s:K, 5t6s:G, 5vjl:A, 5vjm:A
12 7t1v:A 315 316 0.4138 0.4190 0.4177 8.59e-82 7t1v:C, 7t1v:E
13 3m5h:A 310 319 0.4075 0.4194 0.4075 2.17e-80 3m5h:C, 3m5h:E, 3m5i:A, 3m5i:C, 3m5i:E, 3m5j:A, 3m5j:C, 3m5j:E
14 1rv0:L 324 323 0.3887 0.3827 0.3839 3.21e-77 1rvt:H, 1rvt:J, 1rvt:L
15 6cf7:A 322 321 0.3793 0.3758 0.3769 1.05e-75 6lks:A, 6lks:K, 6lks:G, 6lks:I
16 3htp:A 324 321 0.3793 0.3735 0.3769 8.10e-74 4gxx:A, 3htq:A, 3htt:A, 4juh:A, 4juj:A, 4juj:C, 5vmc:A, 5vmc:C, 5vmc:E, 5vmf:A, 5vmf:C, 5vmf:E, 5vmg:A, 5vmg:C, 5vmg:E, 5vmj:A, 5vmj:C, 5vmj:E, 2wrg:J, 2wrh:H, 2wrh:J, 2wrh:L
17 8vql:A 325 321 0.3730 0.3662 0.3707 3.23e-72 1rvx:A, 1rvx:C, 1rvx:E, 1rvx:G, 1rvx:I, 1rvx:K, 1rvz:A, 1rvz:C, 1rvz:E, 1rvz:G, 1rvz:I, 1rvz:K, 8sd2:A, 8sd4:A, 8vqm:A, 8vqn:A, 8vqq:A, 5w5s:A, 5w5u:A, 5w6i:A, 5w6r:A, 5w6r:C, 5w6r:E, 5w6r:G, 5w6t:A, 5w6u:A, 6wcr:A
18 8txm:A 326 322 0.3856 0.3773 0.3820 1.93e-71 4jtv:A, 4jtv:C, 4jtv:E, 4jtv:I, 4jtv:K, 4jtv:G, 4ju0:A, 4ju0:C, 4ju0:E, 4ju0:G, 4ju0:I, 4ju0:K, 4lvh:G, 4lvh:J, 3ube:A, 3ube:C, 3ube:E, 3ube:I, 3ube:K, 3ube:G, 3ubj:C, 3ubj:G, 3ubj:I, 3ubj:K, 3ubn:A, 3ubn:C, 3ubn:E, 3ubn:G, 3ubn:I, 3ubn:K, 3ubq:C, 3ubq:I, 3ubq:K, 6xq0:D, 6xq0:A
19 5bqy:A 324 323 0.3918 0.3858 0.3870 2.93e-70 5bqy:E, 5bqz:A, 5bqz:E
20 5e34:A 323 319 0.3574 0.3529 0.3574 2.71e-69 5e35:A
21 8zdv:A 320 317 0.3511 0.3500 0.3533 4.65e-69 8zdv:B, 8zdv:C
22 6n41:A 483 319 0.3574 0.2360 0.3574 6.08e-68 6cf7:B, 7jpd:D, 8sd2:B, 8sd4:B, 7uyi:E, 8vql:B, 8vqm:B, 8vqn:B, 8vqq:B, 5w5s:B, 5w5u:B, 5w6i:B, 5w6r:B, 5w6r:D, 5w6r:F, 5w6r:H, 5w6t:B, 5w6u:B, 6wcr:B, 2wrg:M
23 6ntf:A 491 324 0.3542 0.2301 0.3488 4.39e-67 5ajm:A, 4bgx:A, 4bgy:A, 4bh0:A, 4bh0:C, 4bh0:E, 4bh1:A, 4bh1:C, 4bh1:E, 4bh3:A, 4bh4:A, 6cf5:A, 6cf5:C, 6cf5:E, 6cfg:A, 4cqq:A, 4cqr:A, 4cqu:A, 4cqw:A, 4cqw:C, 4cqw:E, 4cqx:A, 4cqx:C, 4cqx:E, 4cqy:A, 4cqy:C, 4cqy:E, 4cqz:A, 5e2z:C, 5e2z:A, 5e2z:E, 5e30:C, 5e30:A, 5e30:E, 6e7h:C, 2fk0:Q, 1jsn:A, 1jso:A, 4k63:A, 4k63:C, 4k63:E, 4k63:G, 4k64:A, 4k64:C, 4k66:A, 4k66:C, 4k67:A, 4k67:C, 4k67:E, 4k67:G, 4kdn:A, 4kdn:C, 4kdo:C, 4kdo:A, 4n5z:A, 6p3s:U, 6p3s:H, 6vmz:A, 6vmz:C, 6vmz:E, 8zdw:H, 8zdw:C, 8zdw:A, 3znk:A, 3znk:C, 3znk:E, 3znl:A, 3znl:C, 3znl:E, 3znm:A, 3znm:C, 3znm:E, 3zp0:E, 3zp1:E, 3zp2:E, 3zp3:E, 3zp6:E, 3zpb:E
24 4wss:E 489 325 0.3793 0.2474 0.3723 1.28e-63 4wss:C, 4wss:F
25 5t0b:A 330 324 0.3668 0.3545 0.3611 2.04e-62 5br3:A, 5br3:C, 5br6:A, 5br6:C, 5t0d:A, 5t0e:A, 4wsu:A, 4wsu:C, 4wsv:A, 4wsv:E, 4xke:A, 4xkf:A, 4xkg:A, 4yy1:A, 4yy1:C, 4yy7:A, 4yy7:C, 4yya:A, 4yyb:A
26 6iig:A 495 321 0.3605 0.2323 0.3583 1.34e-61 6cfg:B, 6ijt:A, 6in5:A, 6vmz:B, 6vmz:D, 6vmz:F, 5z88:A
27 1jsh:A 317 321 0.3448 0.3470 0.3427 4.24e-60 1jsi:A
28 2wr1:B 490 319 0.3511 0.2286 0.3511 5.06e-60 2wr1:C, 2wr2:B, 2wr2:C, 2wr3:A, 2wr4:A, 2wr7:A, 2wrb:A, 2wre:A, 2wre:B, 2wre:C, 2wrf:F, 2wrf:D
29 4kps:A 324 321 0.3197 0.3148 0.3178 2.30e-51 4kps:E
30 4mc5:C 497 324 0.3072 0.1972 0.3025 7.53e-38 8gv7:A, 4k3x:B, 4k3x:D, 4k3x:F, 4mc5:A, 4mc5:B, 7wvg:A
31 4m44:A 343 339 0.2351 0.2187 0.2212 3.09e-11 7kqg:A, 4m44:C, 4m44:E, 2rft:A, 2rfu:A
32 4nrk:C 341 339 0.2351 0.2199 0.2212 1.78e-10 4nrk:A, 4nrk:E, 4nrl:A, 4nrl:C, 4nrl:E
33 5w1x:A 422 97 0.0846 0.0640 0.2784 0.19 5w1x:B, 5w1x:E, 5w1x:F, 5w1x:G, 5w1x:J, 5w1x:L, 5w1x:N
34 5w1o:A 427 123 0.0972 0.0726 0.2520 0.36 5w1o:C, 5w1o:D
35 5y9e:E 420 56 0.0533 0.0405 0.3036 1.6 5y9e:A, 5y9e:B, 5y9e:C, 5y9e:D
36 4lks:A 157 80 0.0658 0.1338 0.2625 1.8 4lks:C, 4lqr:A, 4p5y:A
37 1f7r:A 133 29 0.0376 0.0902 0.4138 2.5 1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
38 7ohx:t 202 93 0.0752 0.1188 0.2581 3.1
39 1frg:H 220 25 0.0313 0.0455 0.4000 5.3 1him:L, 1him:M, 1hin:H, 1ifh:H
40 6k2l:A 248 38 0.0376 0.0484 0.3158 5.5 6k2l:B
41 4bq2:D 726 51 0.0533 0.0234 0.3333 6.3
42 4bq4:A 750 51 0.0533 0.0227 0.3333 6.5 4bq2:A, 4bq2:B, 4bq2:C, 4bq3:A, 4bq3:B, 4bq3:C, 4bq3:D, 4bq4:B, 4bq5:A, 4bq5:B
43 8emh:B 676 83 0.0752 0.0355 0.2892 7.9 8emh:A, 8emh:C, 8emh:F, 8emh:H, 8emh:I, 8emh:J, 8emh:K
44 2vad:A 217 48 0.0564 0.0829 0.3750 8.2

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218