Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NMPMTERIRAGKLFTDMCEGLPEKRLRGKTLMYEFNHSHPSEVEKRESLIKEMFATVGENAWVEPPVYFSYGSNIHIGRN
FYANFNLTIVDDYTVTIGDNVLIAPNVTLSVTGHPVHHELRKNGEMYSFPITIGNNVWIGSHVVINPGVTIGDNSVIGAG
SIVTKDIPPNVVAAGVPCRVIREINDRDKHYYFKDYKVESS

The query sequence (length=201) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1kru:A 201 201 1.0000 1.0000 1.0000 2.76e-150 1kqa:A, 1kqa:B, 1kqa:C, 1krr:A, 1krr:B, 1krr:C, 1kru:B, 1kru:C, 1krv:A, 1krv:C, 1krv:B
2 4isx:A 186 185 0.4328 0.4677 0.4703 1.39e-57 4isx:B
3 5u2k:A 190 186 0.3930 0.4158 0.4247 2.70e-49 5v0z:A, 5v0z:C, 5v0z:B, 3v4e:A, 3v4e:C, 3v4e:B
4 3igj:C 188 182 0.3582 0.3830 0.3956 3.38e-45 3igj:A, 3igj:B
5 3nz2:J 185 185 0.3134 0.3405 0.3405 2.04e-36 3ect:A, 3nz2:A, 3nz2:C, 3nz2:B, 3nz2:D, 3nz2:E, 3nz2:F, 3nz2:G, 3nz2:H, 3nz2:I, 3nz2:K, 3nz2:L
6 1khr:A 206 124 0.2239 0.2184 0.3629 4.37e-12 3dho:A, 3dho:C, 3dho:B, 3dho:D, 3dho:F, 3dho:E, 1khr:B, 1khr:C, 1khr:D, 1khr:E, 1khr:F, 1kk4:A, 1kk4:B, 1kk4:C, 1kk4:D, 1kk4:E, 1kk4:F, 1mr9:A, 1mr9:C, 1mr9:B, 1mr9:X, 1mr9:Z, 1mr9:Y, 1mrl:A, 1mrl:B, 1mrl:C
7 8j40:A 209 52 0.1294 0.1244 0.5000 1.87e-11
8 7s3u:A 145 117 0.2090 0.2897 0.3590 5.10e-11 7s3w:A, 7s41:A, 7s42:A, 7s43:A, 7s44:A, 7s45:A
9 7uuk:C 276 55 0.1244 0.0906 0.4545 1.81e-10 7jm1:A, 7jm1:C, 7jm1:B, 7jm2:A, 7jm2:C, 7jm2:B, 7uuj:A, 7uuj:C, 7uuj:B, 7uuk:A, 7uuk:B, 7uul:A, 7uul:B, 7uul:D, 7uul:C, 7uul:F, 7uul:E, 7uum:A, 7uun:A, 7uuo:B
10 4hus:A 212 53 0.1294 0.1226 0.4906 2.70e-10 4hur:A, 4hur:B, 4hur:C, 4hus:C, 6x3c:A, 6x3c:F, 6x3c:B, 6x3c:C, 6x3c:D, 6x3c:E, 6x3j:A, 6x3j:B, 6x3j:D, 6x3j:C, 6x3j:E, 6x3j:F
11 6wye:A 261 113 0.1741 0.1341 0.3097 4.09e-09 7ra4:A, 7ra4:C, 7ra4:B, 6wye:C, 6wye:B, 6wye:D, 6wye:F, 6wye:E
12 4mzu:F 294 119 0.1692 0.1156 0.2857 1.17e-08 4mzu:A, 4mzu:C, 4mzu:E, 4mzu:B, 4mzu:D, 4mzu:G, 4mzu:I, 4mzu:K, 4mzu:H, 4mzu:J, 4mzu:L, 4zu4:A, 4zu4:B, 4zu4:C
13 7txp:A 209 134 0.1791 0.1722 0.2687 1.41e-08 7txq:A, 7txs:A
14 2wle:C 211 105 0.1692 0.1611 0.3238 1.70e-08 2wle:A, 2wle:B, 2wlf:A, 2wlf:C, 2wlf:B, 2wlg:A, 2wlg:C, 2wlg:B
15 6pxa:E 221 90 0.1493 0.1357 0.3333 1.90e-08 6pxa:A, 6pxa:B, 6pxa:C, 6pxa:D, 6pxa:F, 6pxa:G, 6pxa:H, 6pxa:I, 6pxa:J, 6pxa:K, 6pxa:L, 5ux9:A, 5ux9:B, 5ux9:C, 5ux9:D
16 1t3d:A 262 140 0.2040 0.1565 0.2929 2.09e-08 7e3y:A, 7e3y:C, 7e3y:B, 8i04:A, 8i04:C, 8i04:B, 8i06:A, 8i06:B, 8i09:A, 8i09:B, 8i09:C, 8i09:D, 8i09:E, 8i09:F, 8i09:G, 8i09:H, 8i09:I, 8i09:J, 8i09:K, 8i09:L, 6jvu:A, 6jvu:C, 6jvu:B, 6jvu:D, 6jvu:F, 6jvu:E, 1t3d:B, 1t3d:C
17 4n69:A 243 105 0.1741 0.1440 0.3333 2.36e-08 4n69:B, 4n6b:A, 4n6b:E, 4n6b:B, 4n6b:C, 4n6b:D, 4n6b:F
18 6sc4:B 178 120 0.1891 0.2135 0.3167 3.19e-08 6sc4:A, 6sc4:C, 6sc4:D, 6sc4:E
19 4hzd:A 250 117 0.1891 0.1520 0.3248 3.33e-08 4hzc:F, 4hzc:J
20 1hm8:A 458 123 0.1990 0.0873 0.3252 3.91e-08 4aaw:A, 4ac3:A, 1g97:A, 1hm8:B, 1hm9:A, 1hm9:B, 7kr9:A
21 2xat:A 208 61 0.1144 0.1106 0.3770 4.37e-08
22 8gpm:A 193 61 0.1393 0.1451 0.4590 6.83e-08 8gpp:A, 8gpp:B, 8gpp:C
23 4eaa:A 210 153 0.1791 0.1714 0.2353 8.74e-08 4ea7:A, 4ea8:A, 4ea9:A, 4eab:A
24 4h7o:A 258 105 0.1642 0.1279 0.3143 1.65e-07 4h7o:C, 4h7o:B
25 6pub:A 210 61 0.1194 0.1143 0.3934 2.20e-07 6u9c:A, 6u9c:B, 6u9c:C
26 3gvd:I 272 140 0.1940 0.1434 0.2786 2.43e-07 3gvd:A, 3gvd:C, 3gvd:B, 3gvd:D, 3gvd:F, 3gvd:E, 3gvd:G, 3gvd:H, 3gvd:J, 3gvd:K, 3gvd:L
27 7zw9:A 173 141 0.2040 0.2370 0.2908 4.60e-07
28 4n27:A 175 57 0.1144 0.1314 0.4035 7.06e-07 4n27:B, 4n27:C, 4n27:D, 4n27:E, 4n27:F
29 7l7y:AAA 217 131 0.1741 0.1613 0.2672 1.91e-06 7l7z:AAA, 7l81:AAA, 7l82:AAA
30 3vnp:A 171 135 0.2090 0.2456 0.3111 2.19e-06 3vnp:B, 3vnp:C
31 2fko:A 173 68 0.1244 0.1445 0.3676 4.31e-06 1v3w:A, 1v67:A
32 8vr7:E 180 51 0.1045 0.1167 0.4118 9.23e-06 8vr6:A, 8vr7:A, 8vr7:B, 8vr7:C, 8vr7:D, 8vr7:F
33 3fsb:A 260 132 0.1940 0.1500 0.2955 1.10e-05 3fs8:A, 3fs8:B, 3fsb:B, 3fsc:A, 3fsc:B
34 3mqg:C 192 127 0.1642 0.1719 0.2598 1.39e-05 3mqg:A, 3mqg:B, 3mqg:D, 3mqg:E, 3mqg:F, 3mqh:A, 3mqh:C, 3mqh:B, 3mqh:D, 3mqh:F, 3mqh:E
35 3r8y:A 203 151 0.2587 0.2562 0.3444 2.89e-05 3r8y:C, 3r8y:D, 3r8y:F
36 4eqy:G 260 101 0.1592 0.1231 0.3168 6.03e-04
37 4eqy:G 260 28 0.0697 0.0538 0.5000 7.7
38 4ihh:E 340 34 0.0945 0.0559 0.5588 6.13e-04 4ihf:D, 4ihf:E, 4ihf:F, 4ihf:A, 4ihf:B, 4ihf:C, 4ihg:E, 4ihg:C, 4ihg:B, 4ihg:D, 4ihh:A, 4ihh:C, 4ihh:B, 4ihh:D, 4ihh:F, 6p83:A, 6p83:C, 6p83:B, 6p84:A, 6p84:C, 6p84:B, 6p85:A, 6p85:C, 6p85:B, 6p86:A, 6p86:C, 6p86:B, 6p87:A, 6p87:C, 6p87:B, 6p88:A, 6p88:C, 6p88:B, 6p89:A, 6p89:C, 6p89:B, 6p8a:A, 6p8a:C, 6p8a:B, 6p8b:A, 6p8b:C, 6p8b:B
39 4ihh:E 340 137 0.1443 0.0853 0.2117 7.6 4ihf:D, 4ihf:E, 4ihf:F, 4ihf:A, 4ihf:B, 4ihf:C, 4ihg:E, 4ihg:C, 4ihg:B, 4ihg:D, 4ihh:A, 4ihh:C, 4ihh:B, 4ihh:D, 4ihh:F, 6p83:A, 6p83:C, 6p83:B, 6p84:A, 6p84:C, 6p84:B, 6p85:A, 6p85:C, 6p85:B, 6p86:A, 6p86:C, 6p86:B, 6p87:A, 6p87:C, 6p87:B, 6p88:A, 6p88:C, 6p88:B, 6p89:A, 6p89:C, 6p89:B, 6p8a:A, 6p8a:C, 6p8a:B, 6p8b:A, 6p8b:C, 6p8b:B
40 3vbm:E 193 172 0.2090 0.2176 0.2442 0.001 3vbi:A, 3vbi:E, 3vbi:C, 3vbj:A, 3vbj:C, 3vbj:E, 3vbk:A, 3vbk:E, 3vbk:C, 3vbl:A, 3vbl:C, 3vbl:E, 3vbm:A, 3vbm:C, 3vbn:A, 3vbn:E, 3vbn:C, 3vbp:A, 3vbp:E, 3vbp:C
41 3d8v:A 478 42 0.0896 0.0377 0.4286 0.001 3dj4:A, 4g3p:A, 4g3q:A, 4g3s:A, 4g87:A, 6ge9:A, 4hcq:A, 4k6r:A, 2qkx:A, 3spt:A, 3st8:A
42 1ssq:D 257 126 0.1642 0.1284 0.2619 0.001 1ssq:A, 1sst:A, 1sst:B, 1sst:C
43 3foq:A 439 42 0.0896 0.0410 0.4286 0.001
44 6ive:A 168 121 0.1542 0.1845 0.2562 0.002 6ive:B, 6ive:C, 6ive:D, 6ive:E, 6ive:F
45 7aqq:z 233 187 0.2338 0.2017 0.2513 0.002 7a23:q, 7a23:p, 7a24:q, 7a24:p, 7ar7:z, 7ar8:z, 7arb:z, 8bef:z, 8bpx:z, 8bq5:z, 8bq6:z
46 3tio:F 177 60 0.1045 0.1186 0.3500 0.003 3tio:A, 3tio:B, 3tio:C, 3tio:D, 3tio:E, 3tis:A, 3tis:B, 3tis:C
47 4fce:A 441 42 0.0796 0.0363 0.3810 0.006
48 2oi6:B 452 128 0.1741 0.0774 0.2734 0.010 4aa7:A, 4aa7:B, 1fwy:A, 1fwy:B, 1hv9:A, 1hv9:B, 2oi5:A, 2oi5:B, 2oi6:A, 2oi7:A, 2oi7:B, 3twd:A, 3twd:B
49 4r37:A 255 173 0.2139 0.1686 0.2486 0.012
50 3r3r:A 184 60 0.1045 0.1141 0.3500 0.012
51 3bss:A 194 49 0.0697 0.0722 0.2857 0.014 3bsy:A, 3bsy:C, 3bsy:B, 5t2y:A, 5t2y:B, 5tyh:A, 2vhe:A, 2vhe:B
52 3pmo:A 357 117 0.1741 0.0980 0.2991 0.032 6uec:A
53 6jlz:I 430 147 0.1841 0.0860 0.2517 0.035
54 4e1k:A 450 42 0.0697 0.0311 0.3333 0.073 4knr:A, 4knx:A, 4kpx:A, 4kpz:A, 4kql:A, 2v0i:A, 2v0j:A, 2v0k:A, 2v0l:A, 2vd4:A, 2w0v:A, 2w0w:A
55 2iu8:A 346 55 0.0945 0.0549 0.3455 0.17 2iu8:B, 2iu8:C, 2iu9:A, 2iu9:B, 2iu9:C, 2iua:A, 2iua:C
56 7bw9:A 280 121 0.1741 0.1250 0.2893 0.19 7bw9:B, 7bw9:C
57 3ixc:A 166 67 0.0846 0.1024 0.2537 0.20
58 3i3a:A 259 103 0.1244 0.0965 0.2427 0.20 3i3a:B, 3i3a:C, 3i3x:A, 3i3x:B, 3i3x:C
59 7okc:A 264 83 0.1045 0.0795 0.2530 0.27 2aq9:A, 6hy2:X, 4j09:A, 2jf3:A, 6p9p:A, 6p9q:A, 6p9r:A, 6p9s:A, 6p9t:A, 2qia:A, 2qiv:X
60 7okc:A 264 60 0.1095 0.0833 0.3667 3.4 2aq9:A, 6hy2:X, 4j09:A, 2jf3:A, 6p9p:A, 6p9q:A, 6p9r:A, 6p9s:A, 6p9t:A, 2qia:A, 2qiv:X
61 2ggq:A 401 79 0.1294 0.0648 0.3291 1.0 5z09:A, 5z09:B, 5z09:C, 5z09:D
62 4m99:A 206 47 0.0746 0.0728 0.3191 1.4 4m99:B, 4m99:C
63 8bef:x 210 52 0.0746 0.0714 0.2885 1.8 8bpx:x, 8bq5:x, 8bq6:x
64 2qpp:B 219 65 0.1144 0.1050 0.3538 2.3 2q32:A, 2q32:B, 2qpp:A, 2rgz:A, 2rgz:B, 5uc9:A, 5uc9:B, 5uc9:C, 5uc9:D
65 7ojp:Z 261 101 0.1343 0.1034 0.2673 2.9 5dep:A, 5dep:B, 5dep:D, 5dep:E, 5dep:F, 5dg3:A, 5dg3:B, 5dg3:C, 5dg3:D, 5dg3:E, 7oj6:A, 7oj6:B, 7oj6:C, 7ojp:A, 7ojp:B, 7ojp:C, 7ojp:D, 7ojp:E, 7ojp:F, 7ojp:G, 7ojp:H, 7ojp:I, 7ojp:J, 7ojp:K, 7ojp:L, 7ojp:M, 7ojp:N, 7ojp:O, 7ojp:P, 7ojp:Q, 7ojp:R, 7ojp:S, 7ojp:T, 7ojp:U, 7ojp:V, 7ojp:W, 7ojp:X, 7ojp:Y, 7ojp:a, 7ojp:b, 7ojp:c, 7ojp:d, 7ojq:A, 7ojq:B, 7ojq:C, 7ojw:A, 7ojw:B, 7ojw:C, 7ojy:A, 7ojy:B, 7ojy:C, 7ok1:A, 7ok1:B, 7ok1:C, 7ok2:1, 7ok2:Y, 7ok2:Z, 7ok2:2, 7ok2:4, 7ok2:3, 7ok2:A, 7ok2:B, 7ok2:C, 7ok2:D, 7ok2:E, 7ok2:F, 7ok2:G, 7ok2:I, 7ok2:H, 7ok2:J, 7ok2:L, 7ok2:K, 7ok2:M, 7ok2:N, 7ok2:O, 7ok2:P, 7ok2:Q, 7ok2:R, 7ok2:S, 7ok2:T, 7ok2:U, 7ok2:V, 7ok2:X, 7ok2:W, 7oka:A, 7oka:C, 7oka:B, 7oka:D, 7oka:E, 7oka:F, 7oka:G, 7oka:H, 7oka:I, 7oka:M, 7oka:N, 7oka:O, 7oka:J, 7oka:K, 7oka:L, 7oka:P, 7oka:Q, 7oka:R, 7oka:S, 7oka:T, 7oka:U, 7oka:V, 7oka:W, 7oka:X, 7oka:Y, 7oka:Z, 7oka:a, 7oka:b, 7oka:d, 7oka:c, 7okb:A, 7okb:B, 7okb:C, 7okb:D, 7okb:E, 7okb:F, 7okb:G, 7okb:H, 7okb:I, 7okb:M, 7okb:N, 7okb:O, 7okb:J, 7okb:K, 7okb:L, 7okb:P, 7okb:Q, 7okb:R, 7okb:S, 7okb:T, 7okb:U, 7okb:V, 7okb:W, 7okb:X, 7okb:Y, 7okb:Z, 7okb:a, 7okb:b, 7okb:c, 7okb:d, 7t5r:A, 7t5r:B, 7t5r:C, 7t5r:D, 7t5r:F, 7t5r:E, 7t5s:A, 7t5s:B, 7t5s:C, 7t5s:D, 7t5s:F, 7t5s:E, 7t5x:A, 7t5x:B, 7t5x:C, 7t5x:D, 7t5x:F, 7t5x:E, 7t5z:A, 7t5z:B, 7t5z:C, 7t5z:D, 7t5z:E, 7t5z:F, 7t60:A, 7t60:B, 7t60:C, 7t60:D, 7t60:F, 7t60:E, 7t61:A, 7t61:B, 7t61:C, 7t61:D, 7t61:E, 7t61:F, 6uee:A, 6uee:C, 6uee:B, 6uee:D, 6uee:E, 6uee:F, 6ueg:A, 6ueg:C, 6ueg:B, 6ueg:D, 6ueg:E, 6ueg:F
66 3ppv:A 184 46 0.0796 0.0870 0.3478 3.0 3zqk:A, 3zqk:B, 3zqk:C
67 7b3n:B 170 73 0.0846 0.1000 0.2329 3.9 7b3n:A, 7b3n:C, 7b3n:D, 7b3n:E
68 7z8m:V 182 69 0.1095 0.1209 0.3188 4.3
69 3o0n:A 607 29 0.0498 0.0165 0.3448 4.7 1xjm:B
70 1xje:A 627 29 0.0498 0.0159 0.3448 4.7 3o0n:B, 3o0o:A, 3o0o:B, 3o0q:A, 3o0q:B, 1xje:B, 1xjf:A, 1xjf:B, 1xjg:A, 1xjg:B, 1xjj:A, 1xjj:B, 1xjk:A, 1xjk:B, 1xjm:A, 1xjn:A, 1xjn:B, 1xjn:C, 1xjn:D
71 2kpn:A 97 34 0.0498 0.1031 0.2941 5.2
72 6jly:E 414 86 0.1194 0.0580 0.2791 5.3 6jly:F, 6jlz:E, 6jlz:F
73 8e62:C 183 75 0.1045 0.1148 0.2800 6.2 8e62:A, 8e62:B, 8e62:D, 8e62:E, 8e62:F
74 1qrl:A 214 70 0.0896 0.0841 0.2571 6.9 3otm:A, 3otz:A, 3ou9:A, 3oup:A, 3ow5:A, 1qq0:A, 1qre:A, 1qrf:A, 1qrg:A, 1qrm:A, 1thj:A, 1thj:B, 1thj:C
75 3p47:A 270 94 0.1194 0.0889 0.2553 7.8 3q1x:A
76 7s2z:B 173 26 0.0647 0.0751 0.5000 8.1 6o0w:A, 7s2z:A, 7s2z:C, 7s2z:D
77 7s78:H 933 41 0.0746 0.0161 0.3659 9.4 6b1t:E, 6b1t:F, 6b1t:D, 6b1t:A, 6b1t:C, 6cgv:A, 6cgv:C, 7s78:D, 7s78:F, 7s78:E, 7s78:G, 7s78:J, 7s78:L

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218