Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NLYFQGMTETFAFQAEINQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDACDKIRYQSLTDPSVLGESPRLCIRVVPDKENKTL
TVEDNGIGMTKADLVNNLGTIARSGTKAFMEALEAGGDMSMIGQFGVGFYSAYLVADRVTVTSKNNSDESYVWESSAGGT
FTITSTPESDMKRGTRITLHLKEDQMEYLEPRRLKELIKKHSEFIGYDIELMVE

The query sequence (length=214) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3u67:A 218 214 0.9953 0.9771 0.9953 9.00e-159 3h80:A, 3q5j:A, 3q5k:A, 3q5l:A, 3q5l:B, 3q5l:C, 3q5l:D
2 3o6o:A 209 209 0.8598 0.8804 0.8804 1.25e-138 3o6o:B, 3omu:A, 3omu:B, 3opd:A, 3opd:B, 3opd:C
3 4gqt:A 209 206 0.6916 0.7081 0.7184 1.74e-111 4gqt:B
4 3k60:A 216 208 0.7009 0.6944 0.7212 1.27e-110
5 2jki:B 223 208 0.7009 0.6726 0.7212 1.61e-109 2jki:A, 2jki:C, 4x9l:A, 2xcm:A, 2xcm:B
6 6cjs:A 218 214 0.6916 0.6789 0.6916 2.15e-106 6cjj:A, 6cjl:A, 6cjl:B, 6cjp:A, 6cjr:A
7 8ffv:B 644 206 0.7009 0.2329 0.7282 1.52e-105 8agi:A, 8agi:B, 8agj:A, 8agj:B, 8agl:A, 8agl:B, 4awo:A, 4awo:B, 4awp:A, 4awp:B, 4awq:A, 4awq:B, 3b24:A, 3b24:B, 3b25:A, 3b26:A, 3b27:A, 3b28:A, 3b28:B, 4b7p:A, 6b99:A, 6b9a:A, 3bm9:A, 3bmy:A, 4bqg:A, 4bqj:A, 2bsm:A, 2bt0:A, 2bt0:B, 1byq:A, 2byh:A, 2byi:A, 2bz5:A, 2bz5:B, 2ccs:A, 2cct:A, 2ccu:A, 6ceo:A, 5cf0:A, 4cwf:A, 4cwn:A, 4cwo:A, 4cwp:A, 4cwq:A, 4cwr:A, 4cws:A, 4cwt:A, 6cyg:A, 6cyg:B, 6cyh:A, 3d0b:A, 7d1v:A, 7d22:A, 7d24:A, 7d25:A, 7d26:A, 7dmc:A, 4eeh:A, 4eft:A, 4efu:A, 4egh:A, 4egi:A, 4egk:A, 6ei5:A, 3eko:A, 3eko:B, 3ekr:A, 3ekr:B, 6el5:A, 6eln:A, 6elo:A, 6elp:A, 8eoa:B, 8eob:A, 8eob:B, 6ey8:A, 6ey9:A, 6eya:A, 6eyb:A, 6f1n:A, 4fcp:A, 4fcp:B, 4fcq:A, 4fcr:A, 6fcj:A, 8ffv:A, 8ffw:A, 8ffw:B, 5fnc:A, 5fnd:A, 5fnf:A, 3ft5:A, 3ft8:A, 2fwy:A, 2fwz:A, 8fx4:A, 5ggz:B, 5ggz:A, 5ggz:D, 5ggz:C, 6gp8:A, 6gpf:A, 6gph:A, 6gpo:A, 6gpp:A, 6gpr:A, 6gpt:A, 6gpy:A, 6gq6:A, 6gqr:A, 6gqs:A, 6gqu:A, 6gr1:A, 6gr3:A, 6gr5:A, 5h22:A, 2h55:A, 8h77:B, 3hek:A, 3hek:B, 3hhu:A, 3hhu:B, 6hhr:A, 3hyy:A, 3hyz:A, 3hyz:B, 4hy6:A, 3hz1:A, 3hz5:A, 3inw:A, 3inx:A, 5j20:A, 5j27:A, 5j2x:A, 5j64:A, 5j6l:A, 5j6m:A, 5j6n:A, 5j82:A, 5j86:A, 5j8m:A, 5j8m:B, 5j8u:A, 5j8u:B, 5j9x:A, 4jql:A, 3k97:A, 3k98:A, 3k98:B, 3k99:A, 3k99:B, 3k99:C, 3k99:D, 7krj:A, 7krj:B, 7l7i:A, 7l7i:B, 7l7j:A, 7l7j:B, 4l8z:A, 4l90:A, 4l91:A, 4l93:A, 4l93:B, 4l94:A, 5lny:A, 5lnz:A, 5lo0:A, 5lo1:A, 5lo5:A, 5lo6:A, 5lq9:A, 5lr1:A, 5lr7:A, 5lrl:A, 5lrz:A, 6lr9:A, 5ls1:A, 6lsz:A, 7lsz:A, 6lt8:A, 6lti:A, 6ltk:A, 7lt0:A, 4lwe:A, 4lwf:A, 4lwg:A, 4lwh:A, 4lwi:A, 5m4e:A, 5m4h:A, 3mnr:P, 6n8x:A, 4nh7:A, 4nh7:B, 4nh8:A, 5nyh:A, 5nyi:A, 3o0i:A, 4o04:A, 4o05:A, 4o07:A, 4o09:A, 4o0b:A, 5oci:A, 5od7:A, 5odx:A, 6olx:A, 1osf:A, 3ow6:A, 3owb:A, 3owd:A, 3qdd:A, 2qf6:A, 2qf6:B, 2qf6:C, 2qf6:D, 2qfo:A, 2qg0:A, 2qg0:B, 2qg2:A, 8qmo:A, 3qtf:A, 4r3m:A, 3r4m:A, 3r4n:A, 3r4n:B, 3r4o:A, 3r4o:B, 3r4p:A, 3r4p:B, 3r91:A, 3r92:A, 3rkz:A, 3rlp:A, 3rlp:B, 3rlq:A, 3rlq:B, 3rlr:A, 3rlr:B, 7ry1:A, 7ry1:B, 7ry1:C, 7s90:A, 7s95:A, 7s98:A, 7s99:A, 7s9f:A, 7s9g:A, 7s9h:A, 7s9i:A, 3t0z:A, 3t10:A, 3t1k:A, 3t1k:B, 3t2s:A, 3t2s:B, 5t21:A, 6tn4:AAA, 6tn5:AAA, 3tuh:A, 3tuh:B, 4u93:A, 6u98:A, 6u99:A, 6u9a:A, 6u9b:A, 7ur3:A, 2uwd:A, 1uy6:A, 1uy7:A, 1uy8:A, 1uy9:A, 1uyc:A, 1uyd:A, 1uye:A, 1uyf:A, 1uyg:A, 1uyh:A, 1uyi:A, 1uyk:A, 2vci:A, 2vcj:A, 3vha:A, 3vhc:A, 3vhd:A, 3vhd:B, 5vyy:A, 8w4v:A, 4w7t:A, 8w8k:A, 8w8k:B, 3wha:A, 3wha:B, 2wi1:A, 2wi2:A, 2wi2:B, 2wi3:A, 2wi4:A, 2wi5:A, 2wi6:A, 2wi7:A, 3wq9:A, 2xab:A, 2xab:B, 2xdk:A, 2xdl:A, 2xds:A, 2xdu:A, 2xdx:A, 2xhr:A, 2xht:A, 2xhx:A, 4xip:A, 4xiq:A, 4xir:A, 4xit:A, 2xjg:A, 2xjj:A, 2xjj:B, 2xjx:A, 2xk2:A, 5xqd:A, 5xqe:A, 5xr5:A, 5xr9:A, 5xrb:A, 5xrd:A, 5xre:A, 7y04:A, 7y04:B, 1yc1:A, 1yc3:A, 1yc4:A, 1yet:A, 2ye2:A, 2ye3:A, 2ye4:A, 2ye5:A, 2ye6:A, 2ye7:A, 2ye8:A, 2ye9:A, 2yea:A, 2yeb:A, 2yec:A, 2yed:A, 2yee:A, 2yef:A, 2yeg:B, 2yeh:A, 2yei:A, 2yej:A, 2yi0:A, 2yi5:A, 2yi6:A, 2yi7:A, 2yjw:A, 2yjx:A, 2yk2:A, 2yk9:A, 2ykb:A, 2ykc:A, 2yke:A, 2yki:A, 2ykj:A, 4ykq:A, 4ykr:A, 4ykt:A, 4yku:A, 4ykw:A, 4ykw:B, 4ykx:A, 4yky:A, 4ykz:A, 5zr3:A, 5zr3:C, 5zr3:E, 5zr3:G, 7zr0:B, 7zr5:B, 7zr6:B, 7zub:A
8 7k9s:A 211 207 0.6729 0.6825 0.6957 2.14e-104 7k9s:B, 7k9s:C, 7k9s:D, 7k9s:E, 7k9s:F, 7k9u:A, 7k9u:B, 7k9v:A, 7k9v:B, 7k9w:A, 7k9w:B
9 4xd8:A 216 209 0.6776 0.6713 0.6938 2.25e-103 4xc0:A, 4xcj:A, 4xcl:A, 4xdm:A
10 8gft:A 639 207 0.6869 0.2300 0.7101 1.96e-102 8eoa:A, 5fwk:A, 5fwk:B, 5fwl:A, 5fwl:B, 5fwm:A, 5fwm:B, 5fwp:A, 5fwp:B, 8fx4:B, 8gae:A, 8gae:B, 8gft:B, 8h77:A, 6n8y:A, 3nmq:A, 8qmo:B, 5uc4:A, 5uc4:B, 5uc4:C, 5uc4:D, 5uch:A, 5uch:B, 5uch:C, 5uch:D, 5uci:A, 5uci:B, 5uci:C, 5uci:D, 5ucj:A, 5ucj:B, 5ucj:C, 5ucj:D, 7ulj:A, 7ulj:B, 7ulj:C, 7ulj:D, 1uym:A, 7z37:AP1, 7z37:BP1, 7z38:A, 7z38:B, 7zr0:A, 7zr5:A, 7zr6:A, 7zub:B
11 8u1l:A 638 208 0.6916 0.2320 0.7115 2.67e-102 8u1l:B, 8u1m:A, 8u1m:B, 8u1n:A, 8u1n:B
12 2cg9:B 618 205 0.6542 0.2265 0.6829 4.71e-96 1a4h:A, 1am1:A, 1amw:A, 4as9:A, 4asa:A, 4asb:A, 4asf:A, 4asg:A, 1bgq:A, 2brc:A, 2bre:A, 2bre:B, 3c11:A, 4ce1:A, 4ce2:A, 4ce3:A, 2cg9:A, 2cgf:A, 2fxs:A, 2iws:A, 2iwu:A, 2iwx:A, 8oxu:B, 8oxu:C, 2vw5:A, 2vw5:B, 2vw5:C, 2vw5:D, 2vwc:A, 2wep:A, 2weq:A, 2wer:A, 2wer:B, 2xd6:A, 6xlc:A, 6xlc:B, 6xld:A, 6xld:B, 6xle:A, 6xle:B, 6xlf:A, 6xlf:B, 6xlg:A, 6xlg:B, 6xlh:A, 6xlh:B, 2xx2:A, 2xx2:B, 2xx2:C, 2xx2:D, 2xx4:A, 2xx5:A, 2yga:A, 2yge:A, 2ygf:A, 1zw9:A, 1zwh:A
13 3peh:B 262 208 0.5561 0.4542 0.5721 2.86e-84 3peh:A, 3pej:A, 3pej:B
14 6cjp:B 185 200 0.5701 0.6595 0.6100 1.01e-82
15 3ied:A 224 221 0.5280 0.5045 0.5113 2.21e-70
16 5uls:A 650 205 0.5280 0.1738 0.5512 6.70e-67 6aol:A, 6aom:A, 6aom:B, 6asp:A, 6asp:B, 6asq:A, 6asq:B, 6baw:B, 6baw:A, 6baw:C, 6baw:D, 6c91:C, 6c91:B, 6cyi:A, 6d1x:A, 6d28:A, 2esa:A, 2exl:A, 2exl:B, 2fyp:A, 2fyp:B, 2gfd:A, 2gfd:B, 2gqp:A, 2gqp:B, 2h8m:A, 2h8m:B, 2hch:A, 2hch:B, 2hg1:A, 2hg1:B, 5in9:A, 5in9:B, 4nh9:A, 3o2f:A, 3o2f:B, 1qy8:A, 1qye:A, 1tbw:A, 1tc0:A, 1tc6:A, 5ttz:A, 5ttz:B, 1u0z:A, 1u0z:B, 1u2o:A, 1u2o:B, 5uls:B, 7ull:A, 7ull:B, 5wmt:A, 5wmt:B, 5wmt:C, 5wmt:D, 1ysz:A
17 2iop:A 618 208 0.4626 0.1602 0.4760 6.23e-63 2iop:B, 2iop:C, 2iop:D, 2ior:A, 1y4s:A, 1y4s:B
18 7kcl:B 614 211 0.4393 0.1531 0.4455 6.66e-54 7c04:A, 7c7b:A, 5f5r:A, 5f5r:B, 5hph:A, 5hph:B, 7kck:A, 7kck:B, 7kcl:A, 7kcm:A, 7kcm:B, 7klu:A, 7klu:B, 7klu:D, 7klu:C, 7klv:A, 7klv:B, 6xg6:A, 6xg6:B, 4z1i:A, 4z1i:B, 4z1i:C, 4z1i:D
19 5tth:A 671 209 0.4393 0.1401 0.4498 2.31e-53 6d14:A, 7exp:A, 4ipe:A, 4ivg:A, 4iyn:A, 4j0b:A, 4mli:A, 4mli:C, 4mls:A, 5tvu:A, 5tvw:A, 5tvx:A
20 7u4c:B 208 200 0.4112 0.4231 0.4400 3.43e-52 7u4c:A
21 5tth:B 621 209 0.4159 0.1433 0.4258 5.13e-49 6d14:B, 7exp:B, 4ipe:B, 4iyn:B, 4j0b:B, 5tvu:B, 5tvw:B, 5tvx:B
22 2o1u:A 578 191 0.4206 0.1557 0.4712 2.89e-46 2o1u:B, 2o1v:A, 2o1v:B, 1tbw:B, 1tc0:B, 1tc6:B, 1yt0:A
23 7u8v:A 454 209 0.3925 0.1850 0.4019 5.86e-44 7u8w:A, 7u8x:A, 7ulk:B, 5y3n:A
24 7c05:A 435 209 0.3645 0.1793 0.3732 8.98e-39 7c7c:A, 7u8u:A, 7u8u:B, 7ulk:A, 5y3o:A, 4z1f:A, 4z1g:A, 4z1h:A
25 1g5c:A 169 73 0.1121 0.1420 0.3288 0.29 1g5c:B, 1g5c:C, 1g5c:D, 1g5c:E, 1g5c:F
26 6n2m:A 142 69 0.0981 0.1479 0.3043 1.5 6e25:A, 6n2m:B
27 3sl2:A 145 92 0.1308 0.1931 0.3043 1.9
28 6fvt:L 388 64 0.0794 0.0438 0.2656 2.0 6ef0:L, 6ef1:L, 6ef2:L, 6ef3:L, 6fvu:L, 6fvv:L, 6fvw:L, 6fvx:L, 6fvy:L, 5mp9:L, 5mpa:L, 5mpb:L, 5mpc:L, 7qo4:L, 7qo5:L, 7qo6:L
29 3ddh:A 229 84 0.1121 0.1048 0.2857 2.2 3ddh:B
30 2v8c:A 139 25 0.0514 0.0791 0.4400 3.1 2v8f:A, 2v8f:B
31 9en2:A 241 135 0.1589 0.1411 0.2519 3.5 6fzv:D
32 2zbk:B 506 102 0.1262 0.0534 0.2647 3.5 2hkj:A, 1mu5:A, 1mx0:A, 1mx0:B, 1mx0:C, 1mx0:D, 1mx0:E, 1mx0:F, 1z59:A, 1z5a:A, 1z5a:B, 1z5b:A, 1z5b:B, 1z5c:A, 1z5c:B, 2zbk:D, 2zbk:F, 2zbk:H
33 3ddd:A 281 28 0.0514 0.0391 0.3929 3.6
34 8adj:A 515 158 0.1682 0.0699 0.2278 3.9 8adj:B, 8adj:C
35 1b63:A 333 93 0.1168 0.0751 0.2688 6.4 1b62:A, 1nhh:A, 1nhi:A, 1nhj:A, 7p8v:A, 7p8v:B
36 8any:X 244 74 0.0981 0.0861 0.2838 6.8 7a5f:X3, 7a5g:X3, 7a5h:X, 7a5i:X3, 7a5j:X, 7a5k:X3, 6i9r:X, 3j7y:X, 3j9m:X, 8k2a:Lb, 8k2b:Lb, 7l08:X, 7l20:X, 6nu2:X, 6nu3:X, 7o9k:X, 7o9m:X, 7odr:X, 7ods:X, 7odt:X, 7of0:X, 7of2:X, 7of3:X, 7of4:X, 7of5:X, 7of6:X, 7of7:X, 7og4:XX, 7oi6:X, 7oi7:X, 7oi8:X, 7oi9:X, 7oia:X, 7oib:X, 7oic:X, 7oid:X, 7oie:X, 8oir:BE, 8oit:BE, 5ool:X, 5oom:X, 7pd3:X, 8pk0:X, 7po4:X, 7qh6:X, 7qh7:X, 7qi4:X, 7qi5:X, 7qi6:X, 8qsj:X, 8qu1:X, 8qu5:X, 6vlz:X, 6vmi:X, 8xt0:Lb, 8xt1:Lb, 8xt2:Lb, 8xt3:Lb, 6zm5:X, 6zm6:X, 6zs9:XX, 6zsa:XX, 6zsb:XX, 6zsc:XX, 6zsd:XX, 6zse:XX, 6zsg:XX
37 4r1f:A 366 26 0.0514 0.0301 0.4231 8.4 1zxn:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218