BioLiP

>protein
NLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLW
DQSLKPCVKLTPLCVTYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPV
VSTQLLLNGSLAEEEVMIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTI
IRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPIQGVIRCVSNITGL
ILTRDGGSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCK

The query sequence (length=367) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6cm3:D	372	372	0.9973	0.9839	0.9839	0.0	6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
2	7txd:A	397	396	0.9946	0.9194	0.9217	0.0	7txd:E
3	8d0y:G	455	449	0.9837	0.7934	0.8040	0.0	5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
4	6opp:A	389	384	0.8202	0.7738	0.7839	0.0	6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
5	6meo:G	398	398	0.8011	0.7387	0.7387	0.0	6met:G
6	4xmp:G	337	350	0.7929	0.8635	0.8314	0.0
7	8czz:A	440	440	0.8011	0.6682	0.6682	0.0	8czz:E, 8czz:I
8	7n6u:B	595	445	0.8093	0.4992	0.6674	0.0	5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
9	6ch9:G	448	443	0.8256	0.6763	0.6840	0.0	6mug:G
10	8d53:G	446	441	0.8065	0.6637	0.6712	0.0
11	6edu:D	401	409	0.8065	0.7382	0.7237	0.0	6edu:E, 6edu:F
12	6x5b:A	353	371	0.7793	0.8102	0.7709	0.0	6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
13	7lu9:e	461	458	0.7929	0.6312	0.6354	0.0	7lu9:f
14	4r4n:B	342	354	0.7684	0.8246	0.7966	0.0	4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
15	4j6r:G	343	357	0.7684	0.8222	0.7899	0.0
16	4laj:A	343	356	0.7357	0.7872	0.7584	0.0	4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
17	5w4l:G	357	367	0.7221	0.7423	0.7221	0.0	6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
18	8fae:A	468	463	0.7793	0.6111	0.6177	0.0	8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
19	3tgs:A	345	357	0.7084	0.7536	0.7283	0.0	5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
20	6pwu:A	615	470	0.7793	0.4650	0.6085	0.0	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
21	5te4:G	341	354	0.6975	0.7507	0.7232	0.0
22	5fa2:A	336	348	0.6649	0.7262	0.7011	0.0
23	8tgw:A	387	423	0.7248	0.6873	0.6288	1.99e-179
24	1gc1:G	297	304	0.6294	0.7778	0.7599	6.28e-170
25	5fyj:G	479	305	0.5559	0.4259	0.6689	1.37e-139
26	5fyj:G	479	96	0.2343	0.1795	0.8958	2.20e-56
27	7mxd:A	472	309	0.5395	0.4195	0.6408	4.95e-139	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
28	7mxd:A	472	101	0.2398	0.1864	0.8713	2.05e-57	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
29	6tyb:G	345	366	0.3188	0.3391	0.3197	3.24e-51	3fus:A
30	7t4g:A	493	308	0.2589	0.1927	0.3084	8.96e-38	7t4g:C, 7t4g:E
31	7t4g:A	493	104	0.1281	0.0953	0.4519	7.60e-20	7t4g:C, 7t4g:E
32	7ana:AAA	475	61	0.0490	0.0379	0.2951	0.11	7ana:BBB, 7anb:AAA, 7anb:BBB
33	6rmw:C	386	55	0.0436	0.0415	0.2909	0.67	6rmd:D, 6rme:A, 6rme:B, 6rme:C, 6rme:D, 6rme:E, 6rme:F, 6rme:G, 6rme:H, 6rmw:A, 6rmw:B, 6rmw:D, 6rmw:E, 6rmw:F, 6rmw:G, 6rmw:H
34	6tpq:B	183	84	0.0572	0.1148	0.2500	1.4	6tpq:A, 6z2b:B
35	2bdz:A	212	84	0.0599	0.1038	0.2619	3.9	2bdz:D, 2bdz:B, 2bdz:C
36	7rsw:B	125	28	0.0327	0.0960	0.4286	4.6
37	4dzh:A	439	145	0.0954	0.0797	0.2414	5.7
38	4z67:A	309	70	0.0490	0.0583	0.2571	6.6	6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
39	5wn9:H	236	143	0.0899	0.1398	0.2308	7.4
40	1ece:A	358	52	0.0436	0.0447	0.3077	7.5	1ece:B

[Back]